MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
133001	NC_011004	CG	3	6	5153171	5153176	0 %	0 %	50 %	50 %	192293148
133002	NC_011004	CTGG	2	8	5153225	5153232	0 %	25 %	50 %	25 %	192293148
133003	NC_011004	CGC	2	6	5153252	5153257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133004	NC_011004	CGC	2	6	5153266	5153271	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133005	NC_011004	ATGC	2	8	5153276	5153283	25 %	25 %	25 %	25 %	192293148
133006	NC_011004	CGC	2	6	5153300	5153305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133007	NC_011004	CGC	2	6	5153339	5153344	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133008	NC_011004	CTG	2	6	5153348	5153353	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
133009	NC_011004	TCG	2	6	5153401	5153406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
133010	NC_011004	GCC	2	6	5153414	5153419	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133011	NC_011004	CGT	2	6	5153434	5153439	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
133012	NC_011004	CGC	2	6	5153456	5153461	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293148
133013	NC_011004	CTGG	2	8	5153498	5153505	0 %	25 %	50 %	25 %	192293148
133014	NC_011004	ACC	2	6	5153529	5153534	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293148
133015	NC_011004	GCGG	2	8	5153561	5153568	0 %	0 %	75 %	25 %	192293148
133016	NC_011004	TGG	2	6	5153575	5153580	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293148
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133021	NC_011004	GCG	2	6	5153691	5153696	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293148
133022	NC_011004	TCG	2	6	5153697	5153702	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
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133027	NC_011004	CGGTCG	2	12	5153857	5153868	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192293148
133028	NC_011004	CTG	2	6	5153888	5153893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
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133032	NC_011004	GCT	2	6	5153962	5153967	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293148
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133034	NC_011004	GC	3	6	5154018	5154023	0 %	0 %	50 %	50 %	192293148
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133038	NC_011004	GCGG	2	8	5154172	5154179	0 %	0 %	75 %	25 %	192293148
133039	NC_011004	CGA	2	6	5154217	5154222	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293148
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133047	NC_011004	TCT	2	6	5154634	5154639	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293148
133048	NC_011004	CAT	2	6	5154719	5154724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293148
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133050	NC_011004	CG	3	6	5154844	5154849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133051	NC_011004	ATC	2	6	5154913	5154918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133052	NC_011004	CAAA	2	8	5154957	5154964	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133053	NC_011004	C	6	6	5154971	5154976	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
133054	NC_011004	GTC	2	6	5154999	5155004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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133082	NC_011004	GC	3	6	5156165	5156170	0 %	0 %	50 %	50 %	192293149
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133115	NC_011004	CGG	2	6	5157804	5157809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293150
133116	NC_011004	GAGCTT	2	12	5157844	5157855	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192293150
133117	NC_011004	CG	3	6	5157871	5157876	0 %	0 %	50 %	50 %	192293150
133118	NC_011004	GGA	2	6	5157946	5157951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293150
133119	NC_011004	GCG	2	6	5157957	5157962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293150
133120	NC_011004	GCT	2	6	5158043	5158048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133121	NC_011004	ACG	2	6	5158144	5158149	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133122	NC_011004	GAAC	2	8	5158166	5158173	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133123	NC_011004	CG	3	6	5158176	5158181	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133124	NC_011004	CG	3	6	5158199	5158204	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133125	NC_011004	GCT	2	6	5158264	5158269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133126	NC_011004	TGC	2	6	5158314	5158319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133127	NC_011004	CGT	3	9	5158378	5158386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133128	NC_011004	ACT	2	6	5158414	5158419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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133130	NC_011004	GCC	2	6	5158489	5158494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133131	NC_011004	CCGC	2	8	5158508	5158515	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
133132	NC_011004	GCC	2	6	5158519	5158524	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133133	NC_011004	GCC	3	9	5158534	5158542	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
133134	NC_011004	ATC	2	6	5158595	5158600	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133135	NC_011004	GAAG	2	8	5158640	5158647	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
133136	NC_011004	AC	3	6	5158682	5158687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
133137	NC_011004	AAC	2	6	5158708	5158713	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133138	NC_011004	TCG	2	6	5158828	5158833	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293151
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133221	NC_011004	GC	3	6	5162135	5162140	0 %	0 %	50 %	50 %	192293155
133222	NC_011004	CGAGC	2	10	5162144	5162153	20 %	0 %	40 %	40 %	192293155
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133232	NC_011004	CCA	2	6	5162610	5162615	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293155
133233	NC_011004	CTC	2	6	5162636	5162641	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133234	NC_011004	ATC	2	6	5162663	5162668	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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133329	NC_011004	A	6	6	5166856	5166861	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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133331	NC_011004	CGGC	2	8	5166889	5166896	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133332	NC_011004	CTG	2	6	5166905	5166910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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133338	NC_011004	GGT	2	6	5167091	5167096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293159
133339	NC_011004	TCA	2	6	5167108	5167113	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293159
133340	NC_011004	TCC	2	6	5167116	5167121	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133341	NC_011004	CGACG	2	10	5167191	5167200	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
133342	NC_011004	CAA	2	6	5167243	5167248	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133343	NC_011004	TTC	2	6	5167339	5167344	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293160
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133462	NC_011004	GCCGC	2	10	5171365	5171374	0 %	0 %	40 %	60 %	192293164
133463	NC_011004	TCG	2	6	5171384	5171389	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133464	NC_011004	GATG	2	8	5171448	5171455	25 %	25 %	50 %	0 %	192293164
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133466	NC_011004	CGC	2	6	5171550	5171555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133467	NC_011004	CGA	2	6	5171607	5171612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133468	NC_011004	GCG	2	6	5171658	5171663	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293164
133469	NC_011004	CCA	2	6	5171667	5171672	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293164
133470	NC_011004	AGG	2	6	5171684	5171689	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293164
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133473	NC_011004	GCC	2	6	5171779	5171784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133474	NC_011004	CCA	2	6	5171820	5171825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293164
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133479	NC_011004	GCA	2	6	5171928	5171933	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133480	NC_011004	GCC	2	6	5171995	5172000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133481	NC_011004	AG	3	6	5172029	5172034	50 %	0 %	50 %	0 %	192293164
133482	NC_011004	CAG	2	6	5172073	5172078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133483	NC_011004	TTC	2	6	5172101	5172106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293164
133484	NC_011004	GCTG	2	8	5172249	5172256	0 %	25 %	50 %	25 %	192293164
133485	NC_011004	GAT	2	6	5172262	5172267	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293164
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133488	NC_011004	ATG	2	6	5172359	5172364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293164
133489	NC_011004	AGC	2	6	5172383	5172388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133490	NC_011004	GCCG	2	8	5172442	5172449	0 %	0 %	50 %	50 %	192293164
133491	NC_011004	CCG	2	6	5172452	5172457	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133492	NC_011004	GCC	2	6	5172472	5172477	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133493	NC_011004	AGC	2	6	5172479	5172484	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133494	NC_011004	CCG	2	6	5172497	5172502	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293164
133495	NC_011004	ACC	2	6	5172503	5172508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293164
133496	NC_011004	GCG	2	6	5172509	5172514	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293164
133497	NC_011004	GCGATC	2	12	5172545	5172556	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293164
133498	NC_011004	GCT	2	6	5172747	5172752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
133499	NC_011004	GCG	2	6	5172782	5172787	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293165
133500	NC_011004	CGC	2	6	5172806	5172811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293165

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