MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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132003	NC_011004	CAT	2	6	5113836	5113841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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132012	NC_011004	G	6	6	5114128	5114133	0 %	0 %	100 %	0 %	192293109
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132116	NC_011004	CGC	2	6	5118354	5118359	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293113
132117	NC_011004	CTCGAC	2	12	5118406	5118417	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192293113
132118	NC_011004	GC	3	6	5118429	5118434	0 %	0 %	50 %	50 %	192293113
132119	NC_011004	GGC	2	6	5118466	5118471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293113
132120	NC_011004	CTG	2	6	5118478	5118483	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293113
132121	NC_011004	ACC	2	6	5118496	5118501	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293113
132122	NC_011004	GCG	2	6	5118523	5118528	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293113
132123	NC_011004	TCGACG	2	12	5118554	5118565	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293113
132124	NC_011004	CGG	2	6	5118591	5118596	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293113
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132126	NC_011004	ACG	3	9	5118605	5118613	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293113
132127	NC_011004	GAA	2	6	5118619	5118624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293113
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132130	NC_011004	GGCG	2	8	5118668	5118675	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132131	NC_011004	GC	3	6	5118691	5118696	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132132	NC_011004	CT	3	6	5118712	5118717	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132133	NC_011004	TCC	2	6	5118729	5118734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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132135	NC_011004	CGGC	2	8	5118776	5118783	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132136	NC_011004	CCA	2	6	5118804	5118809	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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132146	NC_011004	GCC	2	6	5119078	5119083	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293114
132147	NC_011004	TGC	2	6	5119129	5119134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293114
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132151	NC_011004	GC	5	10	5119222	5119231	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132152	NC_011004	GCG	3	9	5119234	5119242	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132154	NC_011004	GAGG	2	8	5119304	5119311	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132155	NC_011004	GTA	2	6	5119337	5119342	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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132157	NC_011004	GTA	2	6	5119513	5119518	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132158	NC_011004	GCG	2	6	5119519	5119524	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132159	NC_011004	CCCCG	2	10	5119589	5119598	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
132160	NC_011004	CGA	2	6	5119599	5119604	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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132192	NC_011004	CT	3	6	5121497	5121502	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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132205	NC_011004	TCAG	2	8	5122012	5122019	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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132221	NC_011004	GA	3	6	5122966	5122971	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132222	NC_011004	CCG	2	6	5123034	5123039	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132223	NC_011004	CGC	2	6	5123050	5123055	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132224	NC_011004	CGG	2	6	5123060	5123065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132225	NC_011004	ATC	2	6	5123225	5123230	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293117
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132229	NC_011004	CGGC	2	8	5123397	5123404	0 %	0 %	50 %	50 %	192293117
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132233	NC_011004	GCC	2	6	5123636	5123641	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293117
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132235	NC_011004	CGC	2	6	5123655	5123660	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293117
132236	NC_011004	CGA	2	6	5123668	5123673	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293117
132237	NC_011004	TCGG	2	8	5123693	5123700	0 %	25 %	50 %	25 %	192293117
132238	NC_011004	AAG	2	6	5123723	5123728	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293117
132239	NC_011004	CCT	2	6	5123812	5123817	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293117
132240	NC_011004	CTG	2	6	5123826	5123831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293117
132241	NC_011004	CCG	2	6	5123879	5123884	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132242	NC_011004	CGATC	2	10	5123967	5123976	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
132243	NC_011004	TTA	2	6	5124037	5124042	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192293118
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132252	NC_011004	TGA	2	6	5124379	5124384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293118
132253	NC_011004	AAC	2	6	5124411	5124416	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293118
132254	NC_011004	AGA	2	6	5124432	5124437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293118
132255	NC_011004	CGGA	2	8	5124472	5124479	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132256	NC_011004	CGC	2	6	5124484	5124489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132257	NC_011004	CCG	2	6	5124564	5124569	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132258	NC_011004	GC	3	6	5124626	5124631	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132259	NC_011004	CT	3	6	5124696	5124701	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
132260	NC_011004	GC	3	6	5124717	5124722	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132261	NC_011004	GGCGC	2	10	5124766	5124775	0 %	0 %	60 %	40 %	192293119
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132264	NC_011004	GC	3	6	5124837	5124842	0 %	0 %	50 %	50 %	192293119
132265	NC_011004	GTC	2	6	5124869	5124874	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293119
132266	NC_011004	CGG	2	6	5125003	5125008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293119
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132272	NC_011004	TCG	2	6	5125104	5125109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293119
132273	NC_011004	TGC	2	6	5125119	5125124	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293119
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132300	NC_011004	GA	3	6	5126308	5126313	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132301	NC_011004	GGA	2	6	5126364	5126369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132302	NC_011004	CCG	2	6	5126417	5126422	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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132304	NC_011004	GAT	2	6	5126437	5126442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
132305	NC_011004	GCG	2	6	5126478	5126483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
132306	NC_011004	GA	3	6	5126507	5126512	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132307	NC_011004	ATC	2	6	5126586	5126591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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132310	NC_011004	CGG	2	6	5126660	5126665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132312	NC_011004	CG	3	6	5126687	5126692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132313	NC_011004	ACCG	2	8	5126731	5126738	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
132314	NC_011004	CAT	2	6	5126753	5126758	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293121
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132339	NC_011004	GCA	2	6	5127947	5127952	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132340	NC_011004	CG	4	8	5127984	5127991	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
132341	NC_011004	GAAG	2	8	5128004	5128011	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
132342	NC_011004	CGC	2	6	5128027	5128032	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132343	NC_011004	CTC	2	6	5128056	5128061	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132344	NC_011004	GGA	2	6	5128072	5128077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
132345	NC_011004	TGGCT	2	10	5128086	5128095	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
132346	NC_011004	TGA	2	6	5128114	5128119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192293122
132347	NC_011004	CGC	2	6	5128224	5128229	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293122
132348	NC_011004	AAC	2	6	5128230	5128235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293122
132349	NC_011004	CTT	2	6	5128277	5128282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293122
132350	NC_011004	CG	3	6	5128303	5128308	0 %	0 %	50 %	50 %	192293122
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132353	NC_011004	GAC	2	6	5128470	5128475	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293122
132354	NC_011004	CGA	2	6	5128490	5128495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293122
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132384	NC_011004	CGGG	2	8	5129553	5129560	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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132444	NC_011004	AGCG	2	8	5131931	5131938	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
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132466	NC_011004	CGG	2	6	5132830	5132835	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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132469	NC_011004	CGG	2	6	5132957	5132962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293128
132470	NC_011004	GGCT	2	8	5132966	5132973	0 %	25 %	50 %	25 %	192293128
132471	NC_011004	CGG	2	6	5132981	5132986	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293128
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132499	NC_011004	CG	3	6	5133929	5133934	0 %	0 %	50 %	50 %	192293129
132500	NC_011004	CCG	2	6	5133971	5133976	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293129

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