MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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130002	NC_011004	GCTC	2	8	5035787	5035794	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
130003	NC_011004	CGT	2	6	5035832	5035837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130004	NC_011004	GCTCA	2	10	5035865	5035874	20 %	20 %	20 %	40 %	192293035
130005	NC_011004	AGC	2	6	5035907	5035912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293035
130006	NC_011004	GGC	2	6	5035942	5035947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293035
130007	NC_011004	CAT	2	6	5035965	5035970	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293035
130008	NC_011004	CGTCAG	2	12	5035990	5036001	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192293035
130009	NC_011004	CGG	2	6	5036073	5036078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293035
130010	NC_011004	GGC	2	6	5036125	5036130	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293035
130011	NC_011004	GCG	2	6	5036135	5036140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293035
130012	NC_011004	TTC	2	6	5036149	5036154	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192293035
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130014	NC_011004	TTGG	2	8	5036312	5036319	0 %	50 %	50 %	0 %	192293036
130015	NC_011004	TCGA	2	8	5036323	5036330	25 %	25 %	25 %	25 %	192293036
130016	NC_011004	CGGG	2	8	5036362	5036369	0 %	0 %	75 %	25 %	192293036
130017	NC_011004	GCA	2	6	5036441	5036446	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293036
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130019	NC_011004	GTG	2	6	5036596	5036601	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293036
130020	NC_011004	GC	3	6	5036626	5036631	0 %	0 %	50 %	50 %	192293036
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130023	NC_011004	AGC	2	6	5036758	5036763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293036
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130025	NC_011004	TCA	2	6	5036783	5036788	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293036
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130030	NC_011004	CGA	2	6	5036985	5036990	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293036
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130038	NC_011004	ACG	2	6	5037163	5037168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293036
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130055	NC_011004	GAGG	2	8	5038000	5038007	25 %	0 %	75 %	0 %	192293037
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130058	NC_011004	GC	4	8	5038068	5038075	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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130062	NC_011004	GAG	2	6	5038322	5038327	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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130099	NC_011004	GCCG	2	8	5039579	5039586	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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130117	NC_011004	TCG	2	6	5040422	5040427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293040
130118	NC_011004	GCCG	2	8	5040496	5040503	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130119	NC_011004	GAG	2	6	5040505	5040510	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130120	NC_011004	CGA	2	6	5040579	5040584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293041
130121	NC_011004	CGCT	2	8	5040603	5040610	0 %	25 %	25 %	50 %	192293041
130122	NC_011004	GTG	2	6	5040677	5040682	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293041
130123	NC_011004	ACA	2	6	5040714	5040719	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192293041
130124	NC_011004	GAAGGC	2	12	5040721	5040732	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	192293041
130125	NC_011004	CGG	2	6	5040739	5040744	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293041
130126	NC_011004	CGG	2	6	5040799	5040804	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293041
130127	NC_011004	ACG	2	6	5040867	5040872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293041
130128	NC_011004	CGC	2	6	5040918	5040923	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293041
130129	NC_011004	GC	3	6	5040978	5040983	0 %	0 %	50 %	50 %	192293041
130130	NC_011004	TTGC	2	8	5041028	5041035	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
130131	NC_011004	AG	3	6	5041044	5041049	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130132	NC_011004	GCG	2	6	5041064	5041069	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130133	NC_011004	GCC	2	6	5041094	5041099	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293042
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130137	NC_011004	CCA	2	6	5041182	5041187	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293042
130138	NC_011004	CGG	2	6	5041247	5041252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293042
130139	NC_011004	GCG	2	6	5041258	5041263	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293042
130140	NC_011004	CGC	2	6	5041284	5041289	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293042
130141	NC_011004	GCA	2	6	5041336	5041341	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293042
130142	NC_011004	CCT	2	6	5041369	5041374	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
130143	NC_011004	CGAG	2	8	5041436	5041443	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
130144	NC_011004	GCC	2	6	5041539	5041544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293043
130145	NC_011004	AGCG	2	8	5041605	5041612	25 %	0 %	50 %	25 %	192293043
130146	NC_011004	CTG	2	6	5041616	5041621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293043
130147	NC_011004	TGC	2	6	5041659	5041664	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293043
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130149	NC_011004	CGG	2	6	5041855	5041860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293043
130150	NC_011004	GGT	2	6	5041865	5041870	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293043
130151	NC_011004	TGC	2	6	5041888	5041893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293043
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130154	NC_011004	CGGC	2	8	5041968	5041975	0 %	0 %	50 %	50 %	192293043
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130160	NC_011004	GCA	2	6	5042331	5042336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293043
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130175	NC_011004	GCCG	2	8	5042904	5042911	0 %	0 %	50 %	50 %	192293044
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130182	NC_011004	AC	3	6	5043248	5043253	50 %	0 %	0 %	50 %	192293044
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130186	NC_011004	CAG	2	6	5043371	5043376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130187	NC_011004	TGA	2	6	5043400	5043405	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130188	NC_011004	TAGT	2	8	5043448	5043455	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
130189	NC_011004	ATC	2	6	5043475	5043480	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130190	NC_011004	GTA	2	6	5043540	5043545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
130191	NC_011004	GAC	2	6	5043603	5043608	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293045
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130193	NC_011004	GCCGGC	2	12	5043748	5043759	0 %	0 %	50 %	50 %	192293045
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130195	NC_011004	CGG	2	6	5043868	5043873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
130196	NC_011004	CCT	2	6	5043951	5043956	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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130198	NC_011004	GC	3	6	5044109	5044114	0 %	0 %	50 %	50 %	192293046
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130201	NC_011004	CTG	2	6	5044226	5044231	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
130202	NC_011004	GC	3	6	5044232	5044237	0 %	0 %	50 %	50 %	192293046
130203	NC_011004	TGC	3	9	5044287	5044295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
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130211	NC_011004	ATC	2	6	5044625	5044630	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293046
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130218	NC_011004	CG	3	6	5044776	5044781	0 %	0 %	50 %	50 %	192293046
130219	NC_011004	GGCT	2	8	5044796	5044803	0 %	25 %	50 %	25 %	192293046
130220	NC_011004	TCC	2	6	5044821	5044826	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192293046
130221	NC_011004	TGC	2	6	5044872	5044877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
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130224	NC_011004	CGCTGG	2	12	5044929	5044940	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192293046
130225	NC_011004	TTCA	2	8	5044946	5044953	25 %	50 %	0 %	25 %	192293046
130226	NC_011004	CCA	2	6	5044968	5044973	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293046
130227	NC_011004	CGGC	2	8	5045001	5045008	0 %	0 %	50 %	50 %	192293046
130228	NC_011004	GGC	2	6	5045023	5045028	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293046
130229	NC_011004	TGG	2	6	5045070	5045075	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192293046
130230	NC_011004	GCT	2	6	5045086	5045091	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
130231	NC_011004	GCT	2	6	5045107	5045112	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
130232	NC_011004	CAT	2	6	5045149	5045154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293046
130233	NC_011004	TCG	2	6	5045157	5045162	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293046
130234	NC_011004	CGGTC	2	10	5045194	5045203	0 %	20 %	40 %	40 %	192293046
130235	NC_011004	CCA	2	6	5045227	5045232	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192293046
130236	NC_011004	CGG	2	6	5045308	5045313	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192293046
130237	NC_011004	GCC	2	6	5045327	5045332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293046
130238	NC_011004	GCA	2	6	5045415	5045420	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293046
130239	NC_011004	GCGG	2	8	5045516	5045523	0 %	0 %	75 %	25 %	192293047
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130241	NC_011004	GGA	2	6	5045546	5045551	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192293047
130242	NC_011004	CGA	2	6	5045612	5045617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293047
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130244	NC_011004	TGC	2	6	5045636	5045641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293047
130245	NC_011004	CGC	2	6	5045642	5045647	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293047
130246	NC_011004	CGA	3	9	5045675	5045683	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293047
130247	NC_011004	CTG	2	6	5045711	5045716	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293047
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130249	NC_011004	GTC	2	6	5045754	5045759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130250	NC_011004	GGA	2	6	5045803	5045808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
130251	NC_011004	CGC	2	6	5045876	5045881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293048
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130254	NC_011004	CGT	2	6	5045929	5045934	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293048
130255	NC_011004	CGC	2	6	5045935	5045940	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293048
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130326	NC_011004	CG	3	6	5048598	5048603	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130327	NC_011004	A	6	6	5048604	5048609	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
130328	NC_011004	AAAC	2	8	5048617	5048624	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130329	NC_011004	AACGGC	2	12	5048651	5048662	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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130334	NC_011004	CGC	2	6	5048861	5048866	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192293051
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130339	NC_011004	GC	3	6	5049147	5049152	0 %	0 %	50 %	50 %	192293051
130340	NC_011004	CGA	2	6	5049284	5049289	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293051
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130342	NC_011004	GCGG	2	8	5049380	5049387	0 %	0 %	75 %	25 %	192293051
130343	NC_011004	AGA	2	6	5049398	5049403	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192293051
130344	NC_011004	TCG	2	6	5049436	5049441	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293051
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130346	NC_011004	CAT	2	6	5049492	5049497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192293051
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130348	NC_011004	TCG	2	6	5049596	5049601	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293051
130349	NC_011004	GCT	2	6	5049629	5049634	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192293051
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130362	NC_011004	GA	3	6	5050216	5050221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
130363	NC_011004	GA	3	6	5050225	5050230	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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130379	NC_011004	TCAA	2	8	5051487	5051494	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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130458	NC_011004	CAG	2	6	5054628	5054633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192293057
130459	NC_011004	TTG	2	6	5054635	5054640	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192293057
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