MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
12001	NC_011004	GTT	2	6	463112	463117	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
12002	NC_011004	GC	3	6	463187	463192	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12003	NC_011004	TCCA	2	8	463233	463240	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12004	NC_011004	GCC	2	6	463289	463294	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12005	NC_011004	GCG	2	6	463318	463323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12006	NC_011004	GCC	2	6	463329	463334	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288864
12007	NC_011004	CTT	2	6	463337	463342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288864
12008	NC_011004	CGA	2	6	463345	463350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288864
12009	NC_011004	TCA	2	6	463369	463374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288864
12010	NC_011004	GGC	2	6	463385	463390	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288864
12011	NC_011004	GAA	2	6	463595	463600	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288864
12012	NC_011004	GCC	2	6	463679	463684	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288864
12013	NC_011004	GAG	2	6	463718	463723	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288864
12014	NC_011004	TCTGC	2	10	463840	463849	0 %	40 %	20 %	40 %	192288864
12015	NC_011004	CATC	2	8	463855	463862	25 %	25 %	0 %	50 %	192288864
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12017	NC_011004	GCC	2	6	463931	463936	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288864
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12019	NC_011004	CTT	2	6	463964	463969	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288864
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12021	NC_011004	GGTT	2	8	464043	464050	0 %	50 %	50 %	0 %	192288864
12022	NC_011004	GC	4	8	464084	464091	0 %	0 %	50 %	50 %	192288864
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12047	NC_011004	CGGC	2	8	465289	465296	0 %	0 %	50 %	50 %	192288864
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12053	NC_011004	TTG	2	6	465417	465422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288864
12054	NC_011004	GCA	2	6	465424	465429	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288864
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12057	NC_011004	GTC	2	6	465515	465520	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288864
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12361	NC_011004	CGA	2	6	477166	477171	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288873
12362	NC_011004	TCG	2	6	477174	477179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
12363	NC_011004	TCT	2	6	477211	477216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288873
12364	NC_011004	GGC	2	6	477229	477234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288873
12365	NC_011004	GATGTC	2	12	477260	477271	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	192288873
12366	NC_011004	TCG	2	6	477381	477386	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288873
12367	NC_011004	CGGC	2	8	477406	477413	0 %	0 %	50 %	50 %	192288873
12368	NC_011004	ATG	2	6	477459	477464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288873
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12370	NC_011004	GTTC	2	8	477484	477491	0 %	50 %	25 %	25 %	192288873
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12392	NC_011004	CGC	2	6	478199	478204	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288873
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12408	NC_011004	CCGCG	2	10	478990	478999	0 %	0 %	40 %	60 %	192288874
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12411	NC_011004	GCG	2	6	479150	479155	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
12412	NC_011004	CGA	2	6	479165	479170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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12414	NC_011004	A	6	6	479181	479186	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12415	NC_011004	T	6	6	479257	479262	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12416	NC_011004	CGC	2	6	479327	479332	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
12417	NC_011004	GATG	2	8	479401	479408	25 %	25 %	50 %	0 %	192288875
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12420	NC_011004	CTG	2	6	479562	479567	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288875
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12433	NC_011004	GAT	2	6	480272	480277	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288875
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12440	NC_011004	CTTC	2	8	480522	480529	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
12441	NC_011004	GAT	2	6	480608	480613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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12460	NC_011004	ATC	2	6	481575	481580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288877
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12463	NC_011004	CGC	2	6	481704	481709	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288877
12464	NC_011004	CGC	2	6	481747	481752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288877
12465	NC_011004	GGAT	2	8	481768	481775	25 %	25 %	50 %	0 %	192288877
12466	NC_011004	GCCG	2	8	481797	481804	0 %	0 %	50 %	50 %	192288877
12467	NC_011004	CAG	2	6	481815	481820	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288877
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12469	NC_011004	GCA	2	6	482072	482077	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288877
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12471	NC_011004	GAA	2	6	482133	482138	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288877
12472	NC_011004	ACG	2	6	482158	482163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288877
12473	NC_011004	GCC	2	6	482249	482254	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288877
12474	NC_011004	TCGA	2	8	482340	482347	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12475	NC_011004	TCGTC	2	10	482353	482362	0 %	40 %	20 %	40 %	192288878
12476	NC_011004	CG	4	8	482368	482375	0 %	0 %	50 %	50 %	192288878
12477	NC_011004	CGA	2	6	482386	482391	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288878
12478	NC_011004	CGA	2	6	482395	482400	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288878
12479	NC_011004	TGC	2	6	482401	482406	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288878
12480	NC_011004	GCCGTT	2	12	482513	482524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288878
12481	NC_011004	GCC	2	6	482531	482536	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288878
12482	NC_011004	GCC	2	6	482543	482548	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288878
12483	NC_011004	AAG	2	6	482556	482561	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288878
12484	NC_011004	CTG	2	6	482591	482596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288878
12485	NC_011004	ATG	2	6	482700	482705	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288878
12486	NC_011004	TCAC	2	8	482769	482776	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
12487	NC_011004	GTC	2	6	482842	482847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12488	NC_011004	TAT	2	6	482963	482968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288879
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12490	NC_011004	CAT	2	6	483004	483009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288879
12491	NC_011004	TCG	2	6	483060	483065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288879
12492	NC_011004	CGAGGC	2	12	483105	483116	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192288879
12493	NC_011004	CGA	2	6	483126	483131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288879
12494	NC_011004	TCCG	2	8	483132	483139	0 %	25 %	25 %	50 %	192288879
12495	NC_011004	GATC	2	8	483144	483151	25 %	25 %	25 %	25 %	192288879
12496	NC_011004	GC	3	6	483206	483211	0 %	0 %	50 %	50 %	192288879
12497	NC_011004	CTG	2	6	483220	483225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288879
12498	NC_011004	CGT	2	6	483264	483269	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288879
12499	NC_011004	GTT	2	6	483298	483303	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288879
12500	NC_011004	GCA	2	6	483351	483356	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288879

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