MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_011004	TTC	2	6	424448	424453	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288827
11002	NC_011004	GCGACC	2	12	424469	424480	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288827
11003	NC_011004	CCA	2	6	424520	424525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288827
11004	NC_011004	CGG	2	6	424538	424543	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11005	NC_011004	CGC	2	6	424609	424614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288827
11006	NC_011004	GGTC	2	8	424620	424627	0 %	25 %	50 %	25 %	192288827
11007	NC_011004	TTG	2	6	424631	424636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288827
11008	NC_011004	ATC	2	6	424681	424686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288827
11009	NC_011004	GCG	2	6	424724	424729	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11010	NC_011004	CCG	2	6	424730	424735	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288827
11011	NC_011004	CGA	2	6	424773	424778	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11012	NC_011004	GTC	2	6	424780	424785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11013	NC_011004	CG	3	6	424792	424797	0 %	0 %	50 %	50 %	192288827
11014	NC_011004	GCG	3	9	424795	424803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11015	NC_011004	CGG	2	6	424821	424826	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11016	NC_011004	GCGTC	2	10	424827	424836	0 %	20 %	40 %	40 %	192288827
11017	NC_011004	GCC	2	6	424878	424883	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288827
11018	NC_011004	CGAC	2	8	424890	424897	25 %	0 %	25 %	50 %	192288827
11019	NC_011004	GTC	2	6	424918	424923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11020	NC_011004	CGG	2	6	424968	424973	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11021	NC_011004	TGA	2	6	425019	425024	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288827
11022	NC_011004	TCG	2	6	425069	425074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11023	NC_011004	GCC	2	6	425086	425091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288827
11024	NC_011004	CAG	2	6	425119	425124	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11025	NC_011004	GCC	2	6	425129	425134	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288827
11026	NC_011004	GCG	2	6	425227	425232	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
11027	NC_011004	GCA	3	9	425292	425300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288827
11028	NC_011004	CTT	2	6	425322	425327	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288827
11029	NC_011004	GGCT	2	8	425388	425395	0 %	25 %	50 %	25 %	192288827
11030	NC_011004	TCA	2	6	425547	425552	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288827
11031	NC_011004	GC	3	6	425569	425574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11032	NC_011004	GATG	2	8	425622	425629	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11033	NC_011004	CAAC	2	8	425644	425651	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
11034	NC_011004	CG	3	6	425687	425692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11035	NC_011004	GGA	2	6	425839	425844	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288828
11036	NC_011004	CAG	2	6	425845	425850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11037	NC_011004	CGGC	2	8	425931	425938	0 %	0 %	50 %	50 %	192288828
11038	NC_011004	AGT	2	6	426021	426026	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288828
11039	NC_011004	GCA	2	6	426099	426104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11040	NC_011004	CAG	2	6	426139	426144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11041	NC_011004	GCA	2	6	426231	426236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11042	NC_011004	GAT	2	6	426280	426285	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288828
11043	NC_011004	CGGCTT	2	12	426423	426434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11044	NC_011004	TCG	2	6	426446	426451	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11045	NC_011004	GTGG	2	8	426526	426533	0 %	25 %	75 %	0 %	192288828
11046	NC_011004	GTCG	2	8	426550	426557	0 %	25 %	50 %	25 %	192288828
11047	NC_011004	GCC	2	6	426628	426633	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288828
11048	NC_011004	TCG	2	6	426638	426643	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11049	NC_011004	CTG	2	6	426649	426654	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11050	NC_011004	CTTC	2	8	426771	426778	0 %	50 %	0 %	50 %	192288828
11051	NC_011004	GTG	2	6	426824	426829	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288828
11052	NC_011004	GCC	2	6	426844	426849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288828
11053	NC_011004	CGC	2	6	426880	426885	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288828
11054	NC_011004	CGT	2	6	426969	426974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11055	NC_011004	TCG	2	6	426983	426988	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11056	NC_011004	CAG	2	6	427045	427050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288828
11057	NC_011004	CGC	2	6	427051	427056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288828
11058	NC_011004	TGC	2	6	427164	427169	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11059	NC_011004	GC	3	6	427168	427173	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11060	NC_011004	CGG	2	6	427211	427216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
11061	NC_011004	GGC	2	6	427235	427240	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288829
11062	NC_011004	CAGCCG	2	12	427277	427288	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288829
11063	NC_011004	CG	3	6	427304	427309	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11064	NC_011004	AGC	2	6	427377	427382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288829
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11068	NC_011004	GCC	2	6	427485	427490	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288829
11069	NC_011004	CCG	2	6	427510	427515	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288829
11070	NC_011004	GAA	2	6	427571	427576	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288829
11071	NC_011004	TTC	2	6	427584	427589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288829
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11073	NC_011004	CGGC	2	8	427654	427661	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11074	NC_011004	CGGC	2	8	427664	427671	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11075	NC_011004	GCCG	2	8	427706	427713	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11076	NC_011004	CAG	2	6	427730	427735	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288829
11077	NC_011004	CCGG	2	8	427774	427781	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11078	NC_011004	ATC	2	6	427782	427787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288829
11079	NC_011004	GGC	2	6	427895	427900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288829
11080	NC_011004	GGCC	2	8	427915	427922	0 %	0 %	50 %	50 %	192288829
11081	NC_011004	CAGCGC	2	12	427976	427987	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288829
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11084	NC_011004	CGGCG	2	10	428066	428075	0 %	0 %	60 %	40 %	192288830
11085	NC_011004	GCC	2	6	428125	428130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288830
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11088	NC_011004	CCG	2	6	428246	428251	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288830
11089	NC_011004	GC	3	6	428265	428270	0 %	0 %	50 %	50 %	192288830
11090	NC_011004	CAC	3	9	428299	428307	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288830
11091	NC_011004	GCA	2	6	428316	428321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288830
11092	NC_011004	GAAGCC	2	12	428344	428355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288830
11093	NC_011004	CAT	2	6	428356	428361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288830
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11099	NC_011004	GT	3	6	428668	428673	0 %	50 %	50 %	0 %	192288831
11100	NC_011004	GCG	2	6	428769	428774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288831
11101	NC_011004	GTC	2	6	428778	428783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288831
11102	NC_011004	GC	3	6	428812	428817	0 %	0 %	50 %	50 %	192288831
11103	NC_011004	GTC	2	6	428832	428837	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288831
11104	NC_011004	CCG	2	6	428855	428860	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288831
11105	NC_011004	GCGA	2	8	428916	428923	25 %	0 %	50 %	25 %	192288831
11106	NC_011004	AGC	2	6	428950	428955	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288831
11107	NC_011004	GT	3	6	428980	428985	0 %	50 %	50 %	0 %	192288831
11108	NC_011004	CGG	2	6	428987	428992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288831
11109	NC_011004	GGC	2	6	429002	429007	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288831
11110	NC_011004	GCA	2	6	429095	429100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288831
11111	NC_011004	CATCGC	2	12	429115	429126	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192288832
11112	NC_011004	GCGTT	2	10	429134	429143	0 %	40 %	40 %	20 %	192288832
11113	NC_011004	TTTCGG	2	12	429159	429170	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	192288832
11114	NC_011004	GCC	2	6	429188	429193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288832
11115	NC_011004	CG	3	6	429207	429212	0 %	0 %	50 %	50 %	192288832
11116	NC_011004	CGA	2	6	429226	429231	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288832
11117	NC_011004	GC	3	6	429370	429375	0 %	0 %	50 %	50 %	192288832
11118	NC_011004	TCG	2	6	429377	429382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288832
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11120	NC_011004	TCG	2	6	429512	429517	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288832
11121	NC_011004	TCG	2	6	429524	429529	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288832
11122	NC_011004	TCG	2	6	429569	429574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288832
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11132	NC_011004	CTGG	2	8	429889	429896	0 %	25 %	50 %	25 %	192288832
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11142	NC_011004	GCC	2	6	430366	430371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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11144	NC_011004	GTC	2	6	430421	430426	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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11146	NC_011004	GCG	2	6	430469	430474	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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11361	NC_011004	CCGC	2	8	438140	438147	0 %	0 %	25 %	75 %	192288840
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11470	NC_011004	GCG	3	9	442167	442175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288842
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11473	NC_011004	GGC	2	6	442220	442225	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288842
11474	NC_011004	CG	3	6	442264	442269	0 %	0 %	50 %	50 %	192288842
11475	NC_011004	CAGAG	2	10	442308	442317	40 %	0 %	40 %	20 %	192288842
11476	NC_011004	CAG	2	6	442337	442342	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288842
11477	NC_011004	CGA	2	6	442344	442349	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288842
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11479	NC_011004	CTT	2	6	442436	442441	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11480	NC_011004	CCCG	2	8	442473	442480	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11481	NC_011004	CGC	2	6	442587	442592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11482	NC_011004	ACCG	2	8	442712	442719	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11483	NC_011004	A	6	6	442721	442726	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11484	NC_011004	CAGT	2	8	442729	442736	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
11485	NC_011004	TCA	2	6	442806	442811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11486	NC_011004	AGG	2	6	442837	442842	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
11487	NC_011004	AGC	2	6	442875	442880	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11488	NC_011004	T	6	6	442975	442980	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
11489	NC_011004	GATTGC	2	12	442990	443001	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
11490	NC_011004	GGCT	2	8	443021	443028	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
11491	NC_011004	GC	3	6	443032	443037	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
11492	NC_011004	AGA	2	6	443101	443106	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11493	NC_011004	CTG	2	6	443176	443181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288843
11494	NC_011004	CAG	2	6	443182	443187	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288843
11495	NC_011004	CGAACG	2	12	443247	443258	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288843
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11497	NC_011004	TCG	2	6	443318	443323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288843
11498	NC_011004	AC	3	6	443324	443329	50 %	0 %	0 %	50 %	192288843
11499	NC_011004	CGG	2	6	443346	443351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288843
11500	NC_011004	CAA	2	6	443484	443489	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288843

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