MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10501	NC_011004	CAA	2	6	404662	404667	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10502	NC_011004	CAG	2	6	404734	404739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288812
10503	NC_011004	GCT	3	9	404792	404800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288812
10504	NC_011004	CTG	2	6	404851	404856	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288812
10505	NC_011004	GGC	2	6	404868	404873	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288812
10506	NC_011004	GAA	2	6	404878	404883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288812
10507	NC_011004	GCG	2	6	404884	404889	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288812
10508	NC_011004	CG	3	6	404888	404893	0 %	0 %	50 %	50 %	192288812
10509	NC_011004	CAT	2	6	404947	404952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288812
10510	NC_011004	GC	3	6	404998	405003	0 %	0 %	50 %	50 %	192288812
10511	NC_011004	AGA	2	6	405119	405124	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288812
10512	NC_011004	CTG	3	9	405150	405158	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288812
10513	NC_011004	GCCGC	2	10	405167	405176	0 %	0 %	40 %	60 %	192288812
10514	NC_011004	ACG	2	6	405191	405196	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288812
10515	NC_011004	GCGCC	2	10	405210	405219	0 %	0 %	40 %	60 %	192288812
10516	NC_011004	CGTG	2	8	405240	405247	0 %	25 %	50 %	25 %	192288812
10517	NC_011004	GC	3	6	405304	405309	0 %	0 %	50 %	50 %	192288812
10518	NC_011004	GGC	2	6	405415	405420	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288812
10519	NC_011004	CGG	2	6	405453	405458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288812
10520	NC_011004	CCG	2	6	405532	405537	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10521	NC_011004	GC	4	8	405559	405566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10522	NC_011004	TTG	2	6	405590	405595	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10523	NC_011004	CTTCG	2	10	405673	405682	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
10524	NC_011004	AC	4	8	405712	405719	50 %	0 %	0 %	50 %	192288813
10525	NC_011004	CCG	2	6	405778	405783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10526	NC_011004	ACC	2	6	405789	405794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288813
10527	NC_011004	GATC	2	8	405796	405803	25 %	25 %	25 %	25 %	192288813
10528	NC_011004	AGC	2	6	405804	405809	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288813
10529	NC_011004	GCC	2	6	405843	405848	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10530	NC_011004	GCT	2	6	405859	405864	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288813
10531	NC_011004	GCATCA	2	12	405877	405888	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	192288813
10532	NC_011004	TCGGG	2	10	405898	405907	0 %	20 %	60 %	20 %	192288813
10533	NC_011004	GCCG	2	8	405935	405942	0 %	0 %	50 %	50 %	192288813
10534	NC_011004	CCG	2	6	405976	405981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10535	NC_011004	CGC	2	6	405997	406002	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
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10538	NC_011004	CGC	2	6	406069	406074	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10539	NC_011004	CCA	2	6	406094	406099	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288813
10540	NC_011004	CCG	2	6	406119	406124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10541	NC_011004	CGC	2	6	406153	406158	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10542	NC_011004	GAT	2	6	406231	406236	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288813
10543	NC_011004	CG	3	6	406265	406270	0 %	0 %	50 %	50 %	192288813
10544	NC_011004	CGG	2	6	406318	406323	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288813
10545	NC_011004	CG	3	6	406423	406428	0 %	0 %	50 %	50 %	192288813
10546	NC_011004	ATG	2	6	406437	406442	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288813
10547	NC_011004	AGT	2	6	406546	406551	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288813
10548	NC_011004	CTC	2	6	406577	406582	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288813
10549	NC_011004	GAA	2	6	406628	406633	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288813
10550	NC_011004	GCC	2	6	406646	406651	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288813
10551	NC_011004	CTT	2	6	406682	406687	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288813
10552	NC_011004	CGAT	2	8	406722	406729	25 %	25 %	25 %	25 %	192288813
10553	NC_011004	TGA	2	6	406741	406746	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288813
10554	NC_011004	GCG	2	6	406767	406772	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288813
10555	NC_011004	CGGT	2	8	406776	406783	0 %	25 %	50 %	25 %	192288813
10556	NC_011004	GAT	2	6	406793	406798	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288813
10557	NC_011004	TCA	2	6	406822	406827	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288813
10558	NC_011004	CAGCGT	2	12	406877	406888	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288813
10559	NC_011004	GCGAA	2	10	406906	406915	40 %	0 %	40 %	20 %	192288813
10560	NC_011004	ACG	2	6	406942	406947	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288813
10561	NC_011004	TGG	2	6	406975	406980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288813
10562	NC_011004	CGGCAC	2	12	407127	407138	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10563	NC_011004	CGCCA	2	10	407141	407150	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10564	NC_011004	ACTG	2	8	407152	407159	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10565	NC_011004	CCCG	2	8	407160	407167	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
10566	NC_011004	TCA	2	6	407180	407185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10567	NC_011004	GTCG	2	8	407264	407271	0 %	25 %	50 %	25 %	192288814
10568	NC_011004	GCTGC	2	10	407294	407303	0 %	20 %	40 %	40 %	192288814
10569	NC_011004	GCG	2	6	407304	407309	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288814
10570	NC_011004	CGG	2	6	407324	407329	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288814
10571	NC_011004	TGG	2	6	407330	407335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288814
10572	NC_011004	GTG	2	6	407352	407357	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288814
10573	NC_011004	CCGG	2	8	407391	407398	0 %	0 %	50 %	50 %	192288814
10574	NC_011004	GCT	2	6	407414	407419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288814
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10577	NC_011004	TCG	2	6	407458	407463	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288814
10578	NC_011004	TGC	2	6	407533	407538	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288814
10579	NC_011004	GGC	2	6	407588	407593	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288814
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10581	NC_011004	GCC	2	6	407670	407675	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288814
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10584	NC_011004	GC	5	10	407838	407847	0 %	0 %	50 %	50 %	192288814
10585	NC_011004	GC	3	6	407899	407904	0 %	0 %	50 %	50 %	192288814
10586	NC_011004	CGGT	2	8	407965	407972	0 %	25 %	50 %	25 %	192288814
10587	NC_011004	CGGC	2	8	408055	408062	0 %	0 %	50 %	50 %	192288814
10588	NC_011004	GCACG	2	10	408080	408089	20 %	0 %	40 %	40 %	192288814
10589	NC_011004	GCCG	2	8	408101	408108	0 %	0 %	50 %	50 %	192288814
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10591	NC_011004	CG	3	6	408177	408182	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10592	NC_011004	TGGC	2	8	408237	408244	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
10593	NC_011004	CCG	2	6	408313	408318	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288815
10594	NC_011004	ATG	2	6	408334	408339	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288815
10595	NC_011004	CGG	2	6	408343	408348	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288815
10596	NC_011004	TCAG	2	8	408373	408380	25 %	25 %	25 %	25 %	192288815
10597	NC_011004	GCCG	2	8	408404	408411	0 %	0 %	50 %	50 %	192288815
10598	NC_011004	ACC	2	6	408487	408492	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288815
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10601	NC_011004	TCT	2	6	408751	408756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288815
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10604	NC_011004	ACC	2	6	408861	408866	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288815
10605	NC_011004	GAA	2	6	408878	408883	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288815
10606	NC_011004	GCT	2	6	408884	408889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288815
10607	NC_011004	CGGCGT	2	12	408890	408901	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	192288815
10608	NC_011004	CGA	2	6	408917	408922	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288815
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10615	NC_011004	CGG	2	6	409148	409153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288815
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10617	NC_011004	ACG	2	6	409201	409206	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288815
10618	NC_011004	AGGCG	2	10	409207	409216	20 %	0 %	60 %	20 %	192288815
10619	NC_011004	CGA	2	6	409271	409276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288815
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10741	NC_011004	GCG	2	6	414404	414409	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288818
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10980	NC_011004	TCG	2	6	423452	423457	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288826
10981	NC_011004	CAAGAT	2	12	423487	423498	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	192288826
10982	NC_011004	TCGT	2	8	423506	423513	0 %	50 %	25 %	25 %	192288826
10983	NC_011004	GAGCT	2	10	423623	423632	20 %	20 %	40 %	20 %	192288826
10984	NC_011004	GCCC	2	8	423683	423690	0 %	0 %	25 %	75 %	192288826
10985	NC_011004	GCT	2	6	423709	423714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288826
10986	NC_011004	GCA	2	6	423721	423726	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288826
10987	NC_011004	CCG	2	6	423738	423743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288826
10988	NC_011004	CGT	2	6	423788	423793	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10989	NC_011004	GCG	2	6	423824	423829	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288827
10990	NC_011004	TCA	2	6	423936	423941	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288827
10991	NC_011004	GCA	2	6	423963	423968	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288827
10992	NC_011004	CGCC	2	8	424023	424030	0 %	0 %	25 %	75 %	192288827
10993	NC_011004	TCGG	2	8	424031	424038	0 %	25 %	50 %	25 %	192288827
10994	NC_011004	CGT	2	6	424215	424220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
10995	NC_011004	TCG	2	6	424235	424240	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
10996	NC_011004	CCA	3	9	424281	424289	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288827
10997	NC_011004	GTC	2	6	424300	424305	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288827
10998	NC_011004	ATG	2	6	424355	424360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288827
10999	NC_011004	GCTC	2	8	424373	424380	0 %	25 %	25 %	50 %	192288827
11000	NC_011004	GAA	2	6	424432	424437	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288827

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