MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
10001	NC_011004	GCCG	2	8	383457	383464	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10002	NC_011004	TA	3	6	383519	383524	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10003	NC_011004	GGC	2	6	383555	383560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10004	NC_011004	CG	3	6	383564	383569	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10005	NC_011004	GAG	2	6	383589	383594	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10006	NC_011004	GAA	2	6	383717	383722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288794
10007	NC_011004	GTC	2	6	383738	383743	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10008	NC_011004	CCA	2	6	383818	383823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288794
10009	NC_011004	TGG	2	6	383838	383843	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288794
10010	NC_011004	GGT	2	6	383844	383849	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288794
10011	NC_011004	CGG	2	6	383942	383947	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288794
10012	NC_011004	GCT	2	6	384020	384025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10013	NC_011004	GC	3	6	384038	384043	0 %	0 %	50 %	50 %	192288794
10014	NC_011004	CGT	2	6	384134	384139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10015	NC_011004	CGG	2	6	384173	384178	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288794
10016	NC_011004	GAA	2	6	384200	384205	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288794
10017	NC_011004	CAC	2	6	384215	384220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288794
10018	NC_011004	ACT	2	6	384226	384231	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288794
10019	NC_011004	TGC	2	6	384250	384255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10020	NC_011004	TCT	2	6	384301	384306	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288794
10021	NC_011004	CCGGCA	2	12	384316	384327	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	192288794
10022	NC_011004	CGA	3	9	384368	384376	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10023	NC_011004	GGC	2	6	384414	384419	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288794
10024	NC_011004	CGC	2	6	384470	384475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288794
10025	NC_011004	CGT	2	6	384506	384511	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10026	NC_011004	ATCG	2	8	384522	384529	25 %	25 %	25 %	25 %	192288794
10027	NC_011004	CGA	2	6	384542	384547	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10028	NC_011004	GAA	2	6	384632	384637	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288794
10029	NC_011004	GTG	2	6	384639	384644	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288794
10030	NC_011004	GCC	2	6	384674	384679	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288794
10031	NC_011004	CG	3	6	384814	384819	0 %	0 %	50 %	50 %	192288794
10032	NC_011004	TGC	2	6	384841	384846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10033	NC_011004	CTG	2	6	384875	384880	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288794
10034	NC_011004	CGG	2	6	384902	384907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288794
10035	NC_011004	CG	3	6	384948	384953	0 %	0 %	50 %	50 %	192288794
10036	NC_011004	CCG	2	6	384961	384966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288794
10037	NC_011004	TGGA	2	8	384970	384977	25 %	25 %	50 %	0 %	192288794
10038	NC_011004	GGC	2	6	385091	385096	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288794
10039	NC_011004	ACC	2	6	385104	385109	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288794
10040	NC_011004	AGA	2	6	385135	385140	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288794
10041	NC_011004	CGC	3	9	385181	385189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288794
10042	NC_011004	GCC	2	6	385206	385211	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288794
10043	NC_011004	GC	3	6	385218	385223	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10044	NC_011004	CGA	2	6	385224	385229	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10045	NC_011004	GGC	2	6	385247	385252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10046	NC_011004	GCC	2	6	385260	385265	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10047	NC_011004	TTC	2	6	385275	385280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10048	NC_011004	CAT	2	6	385291	385296	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10049	NC_011004	AT	3	6	385322	385327	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
10050	NC_011004	GAAA	2	8	385404	385411	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
10051	NC_011004	GAA	2	6	385415	385420	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10052	NC_011004	GGA	2	6	385429	385434	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10053	NC_011004	TGG	2	6	385435	385440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10054	NC_011004	GCGG	2	8	385509	385516	0 %	0 %	75 %	25 %	192288795
10055	NC_011004	TCGA	2	8	385531	385538	25 %	25 %	25 %	25 %	192288795
10056	NC_011004	AC	3	6	385550	385555	50 %	0 %	0 %	50 %	192288795
10057	NC_011004	CAG	2	6	385561	385566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10058	NC_011004	TCT	2	6	385581	385586	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10059	NC_011004	GA	3	6	385678	385683	50 %	0 %	50 %	0 %	192288795
10060	NC_011004	TCTA	2	8	385726	385733	25 %	50 %	0 %	25 %	192288795
10061	NC_011004	AAC	2	6	385784	385789	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288795
10062	NC_011004	TCA	2	6	385947	385952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288795
10063	NC_011004	GGT	2	6	385992	385997	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288795
10064	NC_011004	ATC	3	9	386015	386023	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288795
10065	NC_011004	CGA	2	6	386054	386059	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10066	NC_011004	CAA	2	6	386074	386079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288795
10067	NC_011004	CAT	2	6	386081	386086	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288795
10068	NC_011004	GGC	2	6	386184	386189	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288795
10069	NC_011004	GACGAT	2	12	386224	386235	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	192288795
10070	NC_011004	TTC	2	6	386240	386245	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10071	NC_011004	TCT	2	6	386249	386254	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10072	NC_011004	GC	3	6	386265	386270	0 %	0 %	50 %	50 %	192288795
10073	NC_011004	GTCT	2	8	386283	386290	0 %	50 %	25 %	25 %	192288795
10074	NC_011004	AGTT	2	8	386300	386307	25 %	50 %	25 %	0 %	192288795
10075	NC_011004	TCAT	2	8	386332	386339	25 %	50 %	0 %	25 %	192288795
10076	NC_011004	GAT	2	6	386398	386403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288795
10077	NC_011004	GAG	2	6	386417	386422	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288795
10078	NC_011004	GCGTT	2	10	386432	386441	0 %	40 %	40 %	20 %	192288795
10079	NC_011004	CGA	2	6	386445	386450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10080	NC_011004	TCT	2	6	386501	386506	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10081	NC_011004	CGG	2	6	386522	386527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288795
10082	NC_011004	GGA	2	6	386634	386639	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288795
10083	NC_011004	TGG	2	6	386711	386716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288795
10084	NC_011004	TCT	2	6	386796	386801	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10085	NC_011004	GGC	2	6	386820	386825	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288795
10086	NC_011004	ACA	2	6	386866	386871	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288795
10087	NC_011004	TGAA	2	8	386873	386880	50 %	25 %	25 %	0 %	192288795
10088	NC_011004	AGGACG	2	12	386936	386947	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	192288795
10089	NC_011004	ACCC	2	8	386965	386972	25 %	0 %	0 %	75 %	192288795
10090	NC_011004	AAGA	2	8	387007	387014	75 %	0 %	25 %	0 %	192288795
10091	NC_011004	TGC	2	6	387237	387242	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10092	NC_011004	TTGG	2	8	387264	387271	0 %	50 %	50 %	0 %	192288795
10093	NC_011004	CTA	2	6	387391	387396	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288795
10094	NC_011004	GCA	2	6	387468	387473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10095	NC_011004	CTT	2	6	387531	387536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10096	NC_011004	ACTGGC	2	12	387684	387695	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288795
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10098	NC_011004	GGAT	2	8	387704	387711	25 %	25 %	50 %	0 %	192288795
10099	NC_011004	GCT	2	6	387780	387785	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10100	NC_011004	TGTT	2	8	387787	387794	0 %	75 %	25 %	0 %	192288795
10101	NC_011004	GCA	2	6	387847	387852	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10102	NC_011004	TCA	2	6	387881	387886	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288795
10103	NC_011004	CTT	2	6	387889	387894	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10104	NC_011004	TTA	2	6	387919	387924	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	192288795
10105	NC_011004	GCC	2	6	387973	387978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288795
10106	NC_011004	TGGC	2	8	388024	388031	0 %	25 %	50 %	25 %	192288795
10107	NC_011004	TCT	2	6	388181	388186	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288795
10108	NC_011004	A	6	6	388207	388212	100 %	0 %	0 %	0 %	192288795
10109	NC_011004	CGA	2	6	388318	388323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288795
10110	NC_011004	CAC	2	6	388337	388342	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288795
10111	NC_011004	AGC	2	6	388370	388375	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10112	NC_011004	GGC	2	6	388391	388396	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10113	NC_011004	ACC	2	6	388404	388409	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
10114	NC_011004	AGA	2	6	388435	388440	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
10115	NC_011004	CGC	3	9	388481	388489	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10116	NC_011004	GCC	2	6	388506	388511	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10117	NC_011004	GC	3	6	388518	388523	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
10118	NC_011004	CGAT	2	8	388527	388534	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
10119	NC_011004	GGC	2	6	388547	388552	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10120	NC_011004	GCC	2	6	388560	388565	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10121	NC_011004	ACG	2	6	388598	388603	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
10122	NC_011004	GTC	2	6	388639	388644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288796
10123	NC_011004	GCA	2	6	388682	388687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288796
10124	NC_011004	CGA	2	6	388709	388714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288796
10125	NC_011004	GTG	2	6	388834	388839	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288796
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10153	NC_011004	CGC	2	6	389684	389689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10154	NC_011004	TGA	2	6	389764	389769	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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10236	NC_011004	TAA	2	6	392710	392715	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10237	NC_011004	CTCG	2	8	392757	392764	0 %	25 %	25 %	50 %	192288800
10238	NC_011004	GCCA	2	8	392781	392788	25 %	0 %	25 %	50 %	192288800
10239	NC_011004	TTC	2	6	392797	392802	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288800
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10241	NC_011004	GATC	2	8	392865	392872	25 %	25 %	25 %	25 %	192288800
10242	NC_011004	GC	4	8	392941	392948	0 %	0 %	50 %	50 %	192288800
10243	NC_011004	CATGCC	2	12	392983	392994	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	192288800
10244	NC_011004	GC	3	6	393008	393013	0 %	0 %	50 %	50 %	192288800
10245	NC_011004	CAAGGC	2	12	393021	393032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288800
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10247	NC_011004	CGA	2	6	393102	393107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288800
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10250	NC_011004	TCG	2	6	393248	393253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288800
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10261	NC_011004	GCCG	2	8	393568	393575	0 %	0 %	50 %	50 %	192288800
10262	NC_011004	GCA	2	6	393588	393593	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288800
10263	NC_011004	CTG	3	9	393610	393618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288800
10264	NC_011004	CGG	3	9	393661	393669	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10265	NC_011004	CAT	2	6	393767	393772	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288801
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10267	NC_011004	CGT	2	6	394058	394063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288801
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10269	NC_011004	TCA	2	6	394170	394175	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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10272	NC_011004	TCA	2	6	394313	394318	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
10273	NC_011004	GCC	2	6	394352	394357	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288802
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10280	NC_011004	CCAG	2	8	394623	394630	25 %	0 %	25 %	50 %	192288802
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10332	NC_011004	GCCC	2	8	397045	397052	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
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10363	NC_011004	GCT	2	6	398537	398542	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288805
10364	NC_011004	CCT	2	6	398558	398563	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288805
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10367	NC_011004	CGT	2	6	398694	398699	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288805
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10390	NC_011004	CAAG	2	8	399958	399965	50 %	0 %	25 %	25 %	192288806
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10394	NC_011004	CGGC	2	8	400155	400162	0 %	0 %	50 %	50 %	192288806
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10483	NC_011004	GC	3	6	403901	403906	0 %	0 %	50 %	50 %	192288811
10484	NC_011004	CG	3	6	403920	403925	0 %	0 %	50 %	50 %	192288811
10485	NC_011004	CG	3	6	403950	403955	0 %	0 %	50 %	50 %	192288811
10486	NC_011004	CGC	2	6	404014	404019	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288811
10487	NC_011004	CCGGCT	2	12	404109	404120	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288811
10488	NC_011004	CGC	3	9	404122	404130	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288811
10489	NC_011004	CAC	2	6	404158	404163	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288811
10490	NC_011004	GCG	3	9	404195	404203	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288811
10491	NC_011004	GCC	2	6	404267	404272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288811
10492	NC_011004	GCG	2	6	404273	404278	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288811
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10499	NC_011004	GCCG	2	8	404503	404510	0 %	0 %	50 %	50 %	192288811
10500	NC_011004	GAT	2	6	404532	404537	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288811

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