MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_011004	GCTC	2	8	345179	345186	0 %	25 %	25 %	50 %	192288756
9003	NC_011004	CGG	2	6	345221	345226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288756
9004	NC_011004	CTG	2	6	345243	345248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288756
9005	NC_011004	GGC	2	6	345267	345272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288756
9006	NC_011004	TCG	2	6	345274	345279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288756
9007	NC_011004	CGA	2	6	345302	345307	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288756
9008	NC_011004	ACC	2	6	345310	345315	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288756
9009	NC_011004	CCA	2	6	345332	345337	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288756
9010	NC_011004	GATC	2	8	345338	345345	25 %	25 %	25 %	25 %	192288756
9011	NC_011004	CGC	2	6	345347	345352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288756
9012	NC_011004	GCGCC	2	10	345366	345375	0 %	0 %	40 %	60 %	192288756
9013	NC_011004	CGG	2	6	345407	345412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288756
9014	NC_011004	GC	3	6	345453	345458	0 %	0 %	50 %	50 %	192288756
9015	NC_011004	TCG	2	6	345494	345499	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288756
9016	NC_011004	CG	5	10	345526	345535	0 %	0 %	50 %	50 %	192288757
9017	NC_011004	GCCG	2	8	345552	345559	0 %	0 %	50 %	50 %	192288757
9018	NC_011004	GTC	3	9	345634	345642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288757
9019	NC_011004	TCA	2	6	345645	345650	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288757
9020	NC_011004	GCG	2	6	345669	345674	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288757
9021	NC_011004	CAC	2	6	345679	345684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288757
9022	NC_011004	CGC	2	6	345693	345698	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288757
9023	NC_011004	GCG	2	6	345722	345727	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288757
9024	NC_011004	CCT	2	6	345753	345758	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	192288757
9025	NC_011004	CG	3	6	345795	345800	0 %	0 %	50 %	50 %	192288757
9026	NC_011004	GCGTC	2	10	345870	345879	0 %	20 %	40 %	40 %	192288757
9027	NC_011004	CGC	2	6	345883	345888	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288757
9028	NC_011004	GCG	2	6	345907	345912	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288757
9029	NC_011004	A	9	9	345944	345952	100 %	0 %	0 %	0 %	192288757
9030	NC_011004	CGGT	2	8	345953	345960	0 %	25 %	50 %	25 %	192288757
9031	NC_011004	GCGA	2	8	345971	345978	25 %	0 %	50 %	25 %	192288757
9032	NC_011004	CAAC	2	8	345984	345991	50 %	0 %	0 %	50 %	192288757
9033	NC_011004	GCG	2	6	346077	346082	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288757
9034	NC_011004	CGA	2	6	346314	346319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288757
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9036	NC_011004	GCGG	2	8	346400	346407	0 %	0 %	75 %	25 %	192288757
9037	NC_011004	ACG	2	6	346490	346495	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9038	NC_011004	TGA	2	6	346566	346571	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9039	NC_011004	GGA	2	6	346606	346611	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9040	NC_011004	CCG	2	6	346631	346636	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9041	NC_011004	ATGGC	2	10	346651	346660	20 %	20 %	40 %	20 %	192288758
9042	NC_011004	CA	3	6	346675	346680	50 %	0 %	0 %	50 %	192288758
9043	NC_011004	ACC	2	6	346695	346700	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288758
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9054	NC_011004	GCG	2	6	347079	347084	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288758
9055	NC_011004	GGC	2	6	347087	347092	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288758
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9057	NC_011004	GCCG	2	8	347142	347149	0 %	0 %	50 %	50 %	192288758
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9063	NC_011004	CCAG	2	8	347296	347303	25 %	0 %	25 %	50 %	192288758
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9065	NC_011004	TCG	2	6	347317	347322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288758
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9075	NC_011004	CGCT	2	8	347632	347639	0 %	25 %	25 %	50 %	192288758
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9090	NC_011004	GCG	2	6	348165	348170	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288759
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9092	NC_011004	GCG	2	6	348275	348280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
9093	NC_011004	TTCCC	2	10	348314	348323	0 %	40 %	0 %	60 %	192288760
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9103	NC_011004	CAG	2	6	348832	348837	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288761
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9106	NC_011004	TCG	2	6	348872	348877	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288761
9107	NC_011004	CAGC	2	8	348913	348920	25 %	0 %	25 %	50 %	192288761
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9110	NC_011004	GGC	2	6	348972	348977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288761
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9112	NC_011004	CGGG	2	8	349051	349058	0 %	0 %	75 %	25 %	192288761
9113	NC_011004	GCCTCG	2	12	349133	349144	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	192288761
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9122	NC_011004	AGGCCG	2	12	349842	349853	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	192288762
9123	NC_011004	GCG	2	6	349855	349860	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288762
9124	NC_011004	CGG	2	6	349945	349950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288762
9125	NC_011004	CG	3	6	349954	349959	0 %	0 %	50 %	50 %	192288762
9126	NC_011004	CTT	2	6	349996	350001	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288762
9127	NC_011004	CGCGC	2	10	350072	350081	0 %	0 %	40 %	60 %	192288762
9128	NC_011004	GCA	2	6	350086	350091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288762
9129	NC_011004	ATC	2	6	350198	350203	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288762
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9131	NC_011004	GCC	2	6	350273	350278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288762
9132	NC_011004	CGG	2	6	350311	350316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288762
9133	NC_011004	AGCTC	2	10	350434	350443	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
9134	NC_011004	AAG	2	6	350452	350457	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9135	NC_011004	CCA	2	6	350497	350502	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288763
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9144	NC_011004	CGG	2	6	350944	350949	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288763
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9152	NC_011004	CGC	2	6	351127	351132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288763
9153	NC_011004	GC	3	6	351147	351152	0 %	0 %	50 %	50 %	192288763
9154	NC_011004	TCG	2	6	351156	351161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288763
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9157	NC_011004	GCCGCA	2	12	351240	351251	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
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9160	NC_011004	TCG	2	6	351428	351433	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288764
9161	NC_011004	CCGA	2	8	351586	351593	25 %	0 %	25 %	50 %	192288764
9162	NC_011004	TTC	2	6	351607	351612	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288764
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9180	NC_011004	TGA	2	6	352517	352522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288765
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9203	NC_011004	ACG	2	6	353216	353221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9226	NC_011004	TGC	2	6	354250	354255	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9228	NC_011004	GAT	2	6	354278	354283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9229	NC_011004	GC	4	8	354289	354296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9230	NC_011004	GCCGC	2	10	354308	354317	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
9231	NC_011004	TGCGC	2	10	354320	354329	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
9232	NC_011004	CGC	2	6	354376	354381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9233	NC_011004	GACCC	2	10	354395	354404	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
9234	NC_011004	C	7	7	354402	354408	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
9235	NC_011004	CCG	2	6	354425	354430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9236	NC_011004	CGC	2	6	354498	354503	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
9237	NC_011004	AAG	2	6	354507	354512	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9238	NC_011004	CAC	2	6	354554	354559	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	192288767
9239	NC_011004	ATGG	2	8	354579	354586	25 %	25 %	50 %	0 %	192288767
9240	NC_011004	TCG	2	6	354640	354645	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288767
9241	NC_011004	CGA	2	6	354653	354658	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288767
9242	NC_011004	CTT	2	6	354719	354724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288767
9243	NC_011004	GCC	2	6	354745	354750	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288767
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9489	NC_011004	AGTT	2	8	365074	365081	25 %	50 %	25 %	0 %	192288777
9490	NC_011004	GAG	2	6	365101	365106	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9491	NC_011004	CGA	2	6	365112	365117	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9492	NC_011004	ACT	2	6	365194	365199	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288778
9493	NC_011004	TCA	2	6	365200	365205	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288778
9494	NC_011004	GCC	2	6	365264	365269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288778
9495	NC_011004	GAC	2	6	365276	365281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288778
9496	NC_011004	CGG	2	6	365309	365314	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288778
9497	NC_011004	CGGCG	2	10	365348	365357	0 %	0 %	60 %	40 %	192288778
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9499	NC_011004	CCG	2	6	365370	365375	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288778
9500	NC_011004	TCCG	2	8	365504	365511	0 %	25 %	25 %	50 %	192288778

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