MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhodopseudomonas palustris TIE-1 chromosome

Total Repeats: 148541

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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7002	NC_011004	GCA	2	6	267964	267969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288683
7003	NC_011004	GC	3	6	267985	267990	0 %	0 %	50 %	50 %	192288683
7004	NC_011004	ATC	2	6	268007	268012	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288683
7005	NC_011004	GCG	2	6	268025	268030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288683
7006	NC_011004	CGC	2	6	268051	268056	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288683
7007	NC_011004	ACG	2	6	268086	268091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288683
7008	NC_011004	CGC	2	6	268117	268122	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288683
7009	NC_011004	AGA	2	6	268170	268175	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	192288683
7010	NC_011004	CAT	2	6	268189	268194	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288683
7011	NC_011004	TCT	2	6	268219	268224	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	192288683
7012	NC_011004	GTGCAG	2	12	268259	268270	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288683
7013	NC_011004	CAT	2	6	268300	268305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288683
7014	NC_011004	CTCG	2	8	268326	268333	0 %	25 %	25 %	50 %	192288683
7015	NC_011004	GGT	2	6	268348	268353	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288683
7016	NC_011004	GC	3	6	268443	268448	0 %	0 %	50 %	50 %	192288683
7017	NC_011004	TCG	2	6	268514	268519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288683
7018	NC_011004	GAT	2	6	268613	268618	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288683
7019	NC_011004	GCG	4	12	268684	268695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288683
7020	NC_011004	CCGA	2	8	268736	268743	25 %	0 %	25 %	50 %	192288683
7021	NC_011004	GAG	2	6	268748	268753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288683
7022	NC_011004	GCTC	2	8	268764	268771	0 %	25 %	25 %	50 %	192288683
7023	NC_011004	TCG	2	6	268776	268781	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288683
7024	NC_011004	CGC	2	6	268885	268890	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288683
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7032	NC_011004	CG	3	6	269235	269240	0 %	0 %	50 %	50 %	192288684
7033	NC_011004	AAACGC	2	12	269264	269275	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	192288684
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7037	NC_011004	ATCG	2	8	269372	269379	25 %	25 %	25 %	25 %	192288684
7038	NC_011004	CG	4	8	269416	269423	0 %	0 %	50 %	50 %	192288684
7039	NC_011004	GC	4	8	269453	269460	0 %	0 %	50 %	50 %	192288684
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7052	NC_011004	CAT	2	6	269817	269822	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7053	NC_011004	GGCG	2	8	269833	269840	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
7054	NC_011004	GA	3	6	269852	269857	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
7055	NC_011004	GCCC	2	8	269952	269959	0 %	0 %	25 %	75 %	192288685
7056	NC_011004	TCA	2	6	270021	270026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288685
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7059	NC_011004	GAT	2	6	270160	270165	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288685
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7122	NC_011004	GCC	2	6	272039	272044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288687
7123	NC_011004	ACAG	2	8	272056	272063	50 %	0 %	25 %	25 %	192288687
7124	NC_011004	GGT	2	6	272168	272173	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288687
7125	NC_011004	CGA	2	6	272179	272184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288687
7126	NC_011004	CGG	2	6	272209	272214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288687
7127	NC_011004	ACGCC	2	10	272242	272251	20 %	0 %	20 %	60 %	192288687
7128	NC_011004	CGC	3	9	272264	272272	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288687
7129	NC_011004	GC	4	8	272301	272308	0 %	0 %	50 %	50 %	192288687
7130	NC_011004	GAC	2	6	272321	272326	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288687
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7132	NC_011004	GAG	2	6	272375	272380	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	192288687
7133	NC_011004	CGG	2	6	272413	272418	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288687
7134	NC_011004	GGT	2	6	272435	272440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288687
7135	NC_011004	CCAGCA	2	12	272449	272460	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	192288687
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7137	NC_011004	AGC	2	6	272595	272600	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7138	NC_011004	CTT	2	6	272658	272663	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7139	NC_011004	TCA	2	6	272675	272680	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7140	NC_011004	CCCG	2	8	272720	272727	0 %	0 %	25 %	75 %	192288688
7141	NC_011004	GCGAC	2	10	272738	272747	20 %	0 %	40 %	40 %	192288688
7142	NC_011004	GC	3	6	272760	272765	0 %	0 %	50 %	50 %	192288688
7143	NC_011004	TGC	2	6	272795	272800	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288688
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7146	NC_011004	GAC	2	6	272887	272892	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288688
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7150	NC_011004	GTG	2	6	273136	273141	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288688
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7153	NC_011004	ACT	2	6	273233	273238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288688
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7159	NC_011004	CGGCC	2	10	273429	273438	0 %	0 %	40 %	60 %	192288688
7160	NC_011004	CCG	2	6	273463	273468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7161	NC_011004	CGA	2	6	273483	273488	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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7238	NC_011004	GTGACG	2	12	276300	276311	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288690
7239	NC_011004	GGC	2	6	276317	276322	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288690
7240	NC_011004	ACCG	2	8	276353	276360	25 %	0 %	25 %	50 %	192288690
7241	NC_011004	GTG	2	6	276363	276368	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	192288690
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7244	NC_011004	TCG	2	6	276447	276452	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288690
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7368	NC_011004	TCA	2	6	281322	281327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288694
7369	NC_011004	TCA	2	6	281388	281393	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	192288694
7370	NC_011004	GCA	2	6	281481	281486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288694
7371	NC_011004	GC	3	6	281529	281534	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
7372	NC_011004	GAC	2	6	281545	281550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288694
7373	NC_011004	CGT	2	6	281556	281561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288694
7374	NC_011004	TCG	2	6	281585	281590	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288694
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7392	NC_011004	TCGAAA	2	12	282224	282235	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	192288694
7393	NC_011004	GTCGAG	2	12	282253	282264	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	192288694
7394	NC_011004	GC	3	6	282269	282274	0 %	0 %	50 %	50 %	192288694
7395	NC_011004	GTC	2	6	282295	282300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288694
7396	NC_011004	TGA	2	6	282313	282318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7397	NC_011004	ATCC	2	8	282365	282372	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
7398	NC_011004	GGA	2	6	282394	282399	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7399	NC_011004	CG	3	6	282405	282410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7400	NC_011004	GAT	2	6	282430	282435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	192288695
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7487	NC_011004	CG	3	6	285568	285573	0 %	0 %	50 %	50 %	192288697
7488	NC_011004	CGG	2	6	285578	285583	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288697
7489	NC_011004	GTC	2	6	285587	285592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288697
7490	NC_011004	CGCAT	2	10	285597	285606	20 %	20 %	20 %	40 %	192288697
7491	NC_011004	CGCGAT	2	12	285781	285792	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	192288697
7492	NC_011004	GCA	2	6	285811	285816	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288697
7493	NC_011004	AAC	2	6	285945	285950	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	192288697
7494	NC_011004	TTG	2	6	285966	285971	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	192288697
7495	NC_011004	CGC	2	6	285987	285992	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288697
7496	NC_011004	GCA	2	6	286015	286020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	192288697
7497	NC_011004	CTG	2	6	286079	286084	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288697
7498	NC_011004	GCC	2	6	286179	286184	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	192288697
7499	NC_011004	CGG	2	6	286188	286193	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	192288697
7500	NC_011004	TCG	2	6	286199	286204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	192288697

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