MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 24783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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24502	NC_010997	CAA	2	6	1081473	1081478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895308
24503	NC_010997	GAC	2	6	1081510	1081515	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24504	NC_010997	GAA	2	6	1081518	1081523	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895308
24505	NC_010997	CCA	2	6	1081538	1081543	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895308
24506	NC_010997	GGCG	2	8	1081573	1081580	0 %	0 %	75 %	25 %	190895308
24507	NC_010997	ACT	2	6	1081613	1081618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895308
24508	NC_010997	CGG	2	6	1081626	1081631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895308
24509	NC_010997	TCG	2	6	1081637	1081642	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24510	NC_010997	ACT	2	6	1081706	1081711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895308
24511	NC_010997	TCG	2	6	1081721	1081726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24512	NC_010997	ACG	2	6	1081769	1081774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24513	NC_010997	GCGGCC	2	12	1081786	1081797	0 %	0 %	50 %	50 %	190895308
24514	NC_010997	GAC	2	6	1081800	1081805	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24515	NC_010997	CGG	2	6	1081818	1081823	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895308
24516	NC_010997	CGA	2	6	1081857	1081862	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24517	NC_010997	CCG	2	6	1081907	1081912	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895308
24518	NC_010997	ACCGGC	2	12	1081924	1081935	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190895308
24519	NC_010997	CCT	2	6	1081949	1081954	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190895308
24520	NC_010997	CAAGGA	2	12	1081959	1081970	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	190895308
24521	NC_010997	GCA	3	9	1082031	1082039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24522	NC_010997	CGA	2	6	1082045	1082050	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895308
24523	NC_010997	TCT	2	6	1082078	1082083	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190895308
24524	NC_010997	CAA	2	6	1082094	1082099	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190895308
24525	NC_010997	GCCC	2	8	1082131	1082138	0 %	0 %	25 %	75 %	190895308
24526	NC_010997	CCAGAT	2	12	1082169	1082180	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	190895308
24527	NC_010997	ATG	2	6	1082182	1082187	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190895308
24528	NC_010997	GAA	2	6	1082208	1082213	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895308
24529	NC_010997	GAA	2	6	1082218	1082223	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190895308
24530	NC_010997	GCG	2	6	1082245	1082250	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895308
24531	NC_010997	TGC	2	6	1082275	1082280	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24532	NC_010997	GCC	2	6	1082307	1082312	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
24533	NC_010997	GCG	2	6	1082430	1082435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24534	NC_010997	GCG	3	9	1082455	1082463	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
24535	NC_010997	CCCTG	2	10	1082581	1082590	0 %	20 %	20 %	60 %	190895309
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24537	NC_010997	GCTCG	2	10	1082702	1082711	0 %	20 %	40 %	40 %	190895309
24538	NC_010997	CGC	2	6	1082731	1082736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895309
24539	NC_010997	TCG	2	6	1082770	1082775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895309
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24541	NC_010997	GCCGTC	2	12	1082811	1082822	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190895309
24542	NC_010997	CAC	2	6	1082858	1082863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190895309
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24545	NC_010997	CGG	2	6	1082912	1082917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895309
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24547	NC_010997	GC	3	6	1082956	1082961	0 %	0 %	50 %	50 %	190895309
24548	NC_010997	GTC	2	6	1083078	1083083	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190895309
24549	NC_010997	GCG	2	6	1083090	1083095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895309
24550	NC_010997	CGAT	2	8	1083103	1083110	25 %	25 %	25 %	25 %	190895309
24551	NC_010997	GCC	2	6	1083126	1083131	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190895309
24552	NC_010997	GCA	2	6	1083155	1083160	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895309
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24554	NC_010997	GC	3	6	1083188	1083193	0 %	0 %	50 %	50 %	190895309
24555	NC_010997	ATC	2	6	1083252	1083257	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190895309
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24558	NC_010997	GGC	2	6	1083345	1083350	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190895309
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24591	NC_010997	CG	3	6	1084448	1084453	0 %	0 %	50 %	50 %	190895311
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24597	NC_010997	CCTG	2	8	1084694	1084701	0 %	25 %	25 %	50 %	190895311
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24600	NC_010997	TGCCG	2	10	1084790	1084799	0 %	20 %	40 %	40 %	190895311
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24602	NC_010997	GC	3	6	1084868	1084873	0 %	0 %	50 %	50 %	190895311
24603	NC_010997	AGC	3	9	1084968	1084976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190895311
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24608	NC_010997	GGCT	2	8	1085070	1085077	0 %	25 %	50 %	25 %	190895311
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.