MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pC

Total Repeats: 24783

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010997	GCT	2	6	559842	559847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894849
13002	NC_010997	GC	3	6	559850	559855	0 %	0 %	50 %	50 %	190894849
13003	NC_010997	TCC	2	6	559868	559873	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894849
13004	NC_010997	AGA	2	6	559880	559885	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894849
13005	NC_010997	TTC	2	6	559900	559905	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894849
13006	NC_010997	GTCGCC	2	12	559942	559953	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	190894849
13007	NC_010997	GTC	2	6	559954	559959	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894849
13008	NC_010997	GAA	2	6	560028	560033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894849
13009	NC_010997	GGC	2	6	560046	560051	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894849
13010	NC_010997	GAA	2	6	560097	560102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894849
13011	NC_010997	CGA	2	6	560234	560239	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894849
13012	NC_010997	GGC	2	6	560311	560316	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894849
13013	NC_010997	CTCGTC	2	12	560332	560343	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190894849
13014	NC_010997	TTC	2	6	560413	560418	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894849
13015	NC_010997	CCG	2	6	560448	560453	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894849
13016	NC_010997	GGA	2	6	560460	560465	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894849
13017	NC_010997	TCC	2	6	560509	560514	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894850
13018	NC_010997	TCA	2	6	560527	560532	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894850
13019	NC_010997	GGT	2	6	560540	560545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894850
13020	NC_010997	ACA	2	6	560695	560700	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894850
13021	NC_010997	ATC	2	6	560715	560720	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894850
13022	NC_010997	GCT	2	6	560726	560731	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894850
13023	NC_010997	GCC	2	6	560754	560759	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894850
13024	NC_010997	CCA	2	6	560818	560823	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894850
13025	NC_010997	CTG	2	6	560862	560867	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894850
13026	NC_010997	CAA	2	6	560885	560890	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894850
13027	NC_010997	CTGC	2	8	560909	560916	0 %	25 %	25 %	50 %	190894850
13028	NC_010997	CCGA	2	8	560970	560977	25 %	0 %	25 %	50 %	190894850
13029	NC_010997	GGC	2	6	560987	560992	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894850
13030	NC_010997	GC	3	6	560991	560996	0 %	0 %	50 %	50 %	190894850
13031	NC_010997	TGC	2	6	561037	561042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894850
13032	NC_010997	GAT	2	6	561116	561121	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894850
13033	NC_010997	GGC	2	6	561209	561214	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894850
13034	NC_010997	CGT	2	6	561218	561223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894850
13035	NC_010997	TCG	2	6	561241	561246	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894850
13036	NC_010997	CTT	2	6	561266	561271	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894850
13037	NC_010997	CGC	2	6	561366	561371	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894851
13038	NC_010997	CAA	2	6	561447	561452	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894851
13039	NC_010997	CCG	2	6	561461	561466	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894851
13040	NC_010997	GCG	2	6	561530	561535	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894851
13041	NC_010997	TGC	2	6	561552	561557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13042	NC_010997	TCCT	2	8	561574	561581	0 %	50 %	0 %	50 %	190894851
13043	NC_010997	ATC	2	6	561611	561616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894851
13044	NC_010997	CCT	2	6	561641	561646	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894851
13045	NC_010997	CGC	2	6	561651	561656	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894851
13046	NC_010997	GGC	2	6	561690	561695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894851
13047	NC_010997	GCC	2	6	561703	561708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894851
13048	NC_010997	CAT	2	6	561792	561797	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894851
13049	NC_010997	CTG	2	6	561805	561810	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13050	NC_010997	CAG	2	6	561834	561839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13051	NC_010997	ACG	2	6	561889	561894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13052	NC_010997	GCGCG	2	10	561969	561978	0 %	0 %	60 %	40 %	190894851
13053	NC_010997	GAC	2	6	561997	562002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13054	NC_010997	GAG	2	6	562072	562077	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894851
13055	NC_010997	GCT	2	6	562098	562103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13056	NC_010997	GCCG	2	8	562125	562132	0 %	0 %	50 %	50 %	190894851
13057	NC_010997	CG	3	6	562181	562186	0 %	0 %	50 %	50 %	190894851
13058	NC_010997	TCG	2	6	562238	562243	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13059	NC_010997	GCC	2	6	562252	562257	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894851
13060	NC_010997	GGCGC	2	10	562275	562284	0 %	0 %	60 %	40 %	190894851
13061	NC_010997	TGC	2	6	562346	562351	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894851
13062	NC_010997	GAA	2	6	562365	562370	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894851
13063	NC_010997	GT	3	6	562410	562415	0 %	50 %	50 %	0 %	190894851
13064	NC_010997	ATT	3	9	562427	562435	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894851
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13067	NC_010997	CGT	2	6	562551	562556	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894852
13068	NC_010997	TCA	2	6	562592	562597	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894852
13069	NC_010997	CGA	2	6	562628	562633	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894852
13070	NC_010997	GAT	2	6	562641	562646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894852
13071	NC_010997	GAG	2	6	562657	562662	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894852
13072	NC_010997	CGG	2	6	562668	562673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894852
13073	NC_010997	CGG	2	6	562686	562691	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894852
13074	NC_010997	ACG	2	6	562703	562708	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894852
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13077	NC_010997	CAGCGC	2	12	562912	562923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	190894852
13078	NC_010997	CGA	2	6	562971	562976	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894852
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13083	NC_010997	TGC	2	6	563222	563227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894852
13084	NC_010997	CGA	2	6	563231	563236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894852
13085	NC_010997	TCCG	2	8	563354	563361	0 %	25 %	25 %	50 %	190894852
13086	NC_010997	GCC	2	6	563379	563384	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894852
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13088	NC_010997	GT	3	6	563501	563506	0 %	50 %	50 %	0 %	190894852
13089	NC_010997	CGC	2	6	563507	563512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894852
13090	NC_010997	GAG	2	6	563533	563538	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894852
13091	NC_010997	TCG	2	6	563546	563551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894852
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13099	NC_010997	GC	3	6	563935	563940	0 %	0 %	50 %	50 %	190894853
13100	NC_010997	GCC	2	6	563973	563978	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894853
13101	NC_010997	GC	3	6	563980	563985	0 %	0 %	50 %	50 %	190894853
13102	NC_010997	GCA	2	6	564003	564008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894853
13103	NC_010997	TCG	2	6	564025	564030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894853
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13105	NC_010997	CGCC	2	8	564134	564141	0 %	0 %	25 %	75 %	190894853
13106	NC_010997	CGC	2	6	564173	564178	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894853
13107	NC_010997	TGGC	2	8	564183	564190	0 %	25 %	50 %	25 %	190894853
13108	NC_010997	CGC	2	6	564269	564274	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894853
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13112	NC_010997	GCA	2	6	564460	564465	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894854
13113	NC_010997	TGGGAC	2	12	564502	564513	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190894854
13114	NC_010997	CAG	2	6	564607	564612	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894854
13115	NC_010997	CGG	2	6	564633	564638	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894854
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13118	NC_010997	GAG	2	6	564775	564780	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894854
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13231	NC_010997	GACGTG	2	12	570072	570083	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	190894857
13232	NC_010997	ATGA	2	8	570143	570150	50 %	25 %	25 %	0 %	190894857
13233	NC_010997	CGG	2	6	570151	570156	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894857
13234	NC_010997	ATT	2	6	570185	570190	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	190894857
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13331	NC_010997	GC	3	6	574261	574266	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
13332	NC_010997	CCCG	2	8	574276	574283	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
13333	NC_010997	TCCGG	2	10	574294	574303	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
13334	NC_010997	AAC	2	6	574311	574316	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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13337	NC_010997	GGA	2	6	574336	574341	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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13344	NC_010997	ATC	2	6	574622	574627	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894864
13345	NC_010997	GCC	2	6	574652	574657	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894864
13346	NC_010997	GCT	2	6	574712	574717	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894865
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13350	NC_010997	GC	3	6	574842	574847	0 %	0 %	50 %	50 %	190894865
13351	NC_010997	CAC	2	6	574972	574977	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894865
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13354	NC_010997	TCG	2	6	575088	575093	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894865
13355	NC_010997	CAA	2	6	575125	575130	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894865
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13359	NC_010997	GTC	2	6	575273	575278	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894865
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