MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 8729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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2002	NC_010996	CTG	2	6	100380	100385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
2003	NC_010996	GTC	2	6	100470	100475	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
2004	NC_010996	TC	3	6	100499	100504	0 %	50 %	0 %	50 %	190894058
2005	NC_010996	CCGG	2	8	100555	100562	0 %	0 %	50 %	50 %	190894058
2006	NC_010996	TCG	2	6	100603	100608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
2007	NC_010996	CCGG	2	8	100644	100651	0 %	0 %	50 %	50 %	190894058
2008	NC_010996	CG	3	6	100658	100663	0 %	0 %	50 %	50 %	190894058
2009	NC_010996	GCC	2	6	100743	100748	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894058
2010	NC_010996	GGCCAG	2	12	100770	100781	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190894058
2011	NC_010996	GC	3	6	100798	100803	0 %	0 %	50 %	50 %	190894058
2012	NC_010996	TCG	2	6	100837	100842	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
2013	NC_010996	CAA	3	9	100844	100852	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894058
2014	NC_010996	TGG	2	6	100876	100881	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894058
2015	NC_010996	TGA	2	6	101002	101007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894058
2016	NC_010996	TGC	2	6	101053	101058	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
2017	NC_010996	GCC	2	6	101112	101117	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894058
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2023	NC_010996	GCT	2	6	101282	101287	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894058
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2025	NC_010996	CGAT	2	8	101341	101348	25 %	25 %	25 %	25 %	190894058
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2052	NC_010996	CGTC	2	8	102401	102408	0 %	25 %	25 %	50 %	190894059
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2063	NC_010996	TGA	2	6	102824	102829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894060
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2122	NC_010996	TTC	2	6	105318	105323	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894063
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2243	NC_010996	GAC	2	6	110189	110194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894066
2244	NC_010996	AAC	2	6	110196	110201	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894066
2245	NC_010996	TC	3	6	110235	110240	0 %	50 %	0 %	50 %	190894067
2246	NC_010996	TGC	2	6	110248	110253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894067
2247	NC_010996	GCGG	2	8	110267	110274	0 %	0 %	75 %	25 %	190894067
2248	NC_010996	GCGG	2	8	110303	110310	0 %	0 %	75 %	25 %	190894067
2249	NC_010996	GC	3	6	110320	110325	0 %	0 %	50 %	50 %	190894067
2250	NC_010996	GCC	2	6	110376	110381	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894067
2251	NC_010996	GTC	2	6	110391	110396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894067
2252	NC_010996	GTG	2	6	110413	110418	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894067
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2256	NC_010996	CGC	2	6	110552	110557	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894067
2257	NC_010996	AGC	2	6	110609	110614	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894067
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2260	NC_010996	TTC	2	6	110671	110676	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894068
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2262	NC_010996	CCG	2	6	110772	110777	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894068
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2264	NC_010996	CTG	2	6	110950	110955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894068
2265	NC_010996	CGG	2	6	111011	111016	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894068
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2267	NC_010996	TGC	3	9	111115	111123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894068
2268	NC_010996	TGG	2	6	111135	111140	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894068
2269	NC_010996	ACG	2	6	111222	111227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894068
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2271	NC_010996	CGGC	2	8	111309	111316	0 %	0 %	50 %	50 %	190894068
2272	NC_010996	CCGC	2	8	111388	111395	0 %	0 %	25 %	75 %	190894068
2273	NC_010996	AGG	2	6	111503	111508	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2274	NC_010996	GATGAC	2	12	111562	111573	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
2275	NC_010996	CGT	2	6	111591	111596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894069
2276	NC_010996	GAG	2	6	111604	111609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894069
2277	NC_010996	GCAG	2	8	111654	111661	25 %	0 %	50 %	25 %	190894069
2278	NC_010996	GAA	2	6	111738	111743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894069
2279	NC_010996	TCA	2	6	111746	111751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894069
2280	NC_010996	ACC	2	6	111752	111757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894069
2281	NC_010996	GA	3	6	111765	111770	50 %	0 %	50 %	0 %	190894069
2282	NC_010996	ACATC	2	10	111772	111781	40 %	20 %	0 %	40 %	190894069
2283	NC_010996	GGGCC	2	10	111786	111795	0 %	0 %	60 %	40 %	190894069
2284	NC_010996	CTGT	2	8	111954	111961	0 %	50 %	25 %	25 %	190894069
2285	NC_010996	GCG	2	6	112030	112035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894070
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2291	NC_010996	TCC	2	6	112274	112279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2292	NC_010996	CTC	3	9	112308	112316	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2293	NC_010996	CTC	3	9	112346	112354	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2294	NC_010996	CCT	2	6	112394	112399	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2295	NC_010996	GTC	2	6	112487	112492	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2296	NC_010996	AGC	2	6	112514	112519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2297	NC_010996	GC	3	6	112625	112630	0 %	0 %	50 %	50 %	190894071
2298	NC_010996	TGC	2	6	112636	112641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894071
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2301	NC_010996	ATG	2	6	112809	112814	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894071
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2307	NC_010996	CAC	2	6	113152	113157	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2308	NC_010996	TC	3	6	113181	113186	0 %	50 %	0 %	50 %	190894072
2309	NC_010996	CCA	2	6	113241	113246	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190894072
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2311	NC_010996	AACCC	2	10	113409	113418	40 %	0 %	0 %	60 %	190894072
2312	NC_010996	ACA	2	6	113485	113490	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894072
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2316	NC_010996	ATT	2	6	113747	113752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2317	NC_010996	CCAG	2	8	113803	113810	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
2318	NC_010996	CAACG	2	10	113852	113861	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2319	NC_010996	GGA	2	6	113914	113919	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894074
2320	NC_010996	ATC	2	6	113953	113958	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894074
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2322	NC_010996	CG	3	6	114060	114065	0 %	0 %	50 %	50 %	190894074
2323	NC_010996	TTC	2	6	114102	114107	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894074
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2328	NC_010996	CAC	2	6	114345	114350	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2329	NC_010996	GTC	2	6	114499	114504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894075
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2332	NC_010996	AGGC	2	8	114655	114662	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2333	NC_010996	CGACGT	2	12	114665	114676	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2334	NC_010996	GC	4	8	114701	114708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2335	NC_010996	AG	3	6	114798	114803	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2336	NC_010996	AG	3	6	114810	114815	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
2337	NC_010996	GAA	2	6	114872	114877	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2338	NC_010996	GCC	2	6	114910	114915	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2339	NC_010996	CCGGA	2	10	114917	114926	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2340	NC_010996	CTG	2	6	114950	114955	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2341	NC_010996	GGT	2	6	115022	115027	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2342	NC_010996	TCG	2	6	115047	115052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2343	NC_010996	CGG	2	6	115086	115091	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2344	NC_010996	GC	3	6	115158	115163	0 %	0 %	50 %	50 %	190894076
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2348	NC_010996	CT	3	6	115367	115372	0 %	50 %	0 %	50 %	190894076
2349	NC_010996	GAA	2	6	115386	115391	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894076
2350	NC_010996	TCG	2	6	115441	115446	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894076
2351	NC_010996	CGTC	2	8	115483	115490	0 %	25 %	25 %	50 %	190894076
2352	NC_010996	GAG	2	6	115575	115580	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894076
2353	NC_010996	CG	3	6	115602	115607	0 %	0 %	50 %	50 %	190894076
2354	NC_010996	CAG	2	6	115629	115634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894076
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2358	NC_010996	GATG	2	8	115763	115770	25 %	25 %	50 %	0 %	190894076
2359	NC_010996	GCA	2	6	115771	115776	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894076
2360	NC_010996	TCT	2	6	115826	115831	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894076
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2362	NC_010996	CAA	2	6	115991	115996	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190894076
2363	NC_010996	CAA	2	6	116102	116107	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2364	NC_010996	CT	3	6	116109	116114	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
2365	NC_010996	TGC	2	6	116140	116145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2366	NC_010996	GAA	2	6	116173	116178	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2367	NC_010996	CGT	2	6	116195	116200	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2368	NC_010996	GC	3	6	116208	116213	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2369	NC_010996	ACT	2	6	116263	116268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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2490	NC_010996	TCTCC	2	10	122751	122760	0 %	40 %	0 %	60 %	190894083
2491	NC_010996	TCG	2	6	122819	122824	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894083
2492	NC_010996	TCA	2	6	122849	122854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894083
2493	NC_010996	CGC	2	6	122857	122862	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894083
2494	NC_010996	AAATC	2	10	122911	122920	60 %	20 %	0 %	20 %	190894084
2495	NC_010996	TTC	2	6	122974	122979	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894084
2496	NC_010996	CT	4	8	122984	122991	0 %	50 %	0 %	50 %	190894084
2497	NC_010996	ATC	2	6	123026	123031	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190894084
2498	NC_010996	CG	3	6	123038	123043	0 %	0 %	50 %	50 %	190894084
2499	NC_010996	CTT	2	6	123051	123056	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894084
2500	NC_010996	AT	3	6	123134	123139	50 %	50 %	0 %	0 %	190894084

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