MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 plasmid pB

Total Repeats: 8729

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5001	NC_010996	CTG	2	6	245916	245921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894195
5002	NC_010996	GAT	2	6	245984	245989	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894195
5003	NC_010996	TAG	2	6	245995	246000	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894195
5004	NC_010996	TGG	2	6	246079	246084	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894195
5005	NC_010996	TGA	2	6	246114	246119	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894195
5006	NC_010996	GAA	2	6	246182	246187	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894195
5007	NC_010996	CAG	2	6	246194	246199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894195
5008	NC_010996	GAG	2	6	246215	246220	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894195
5009	NC_010996	TTC	2	6	246231	246236	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894195
5010	NC_010996	CGA	2	6	246241	246246	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894195
5011	NC_010996	GAA	2	6	246251	246256	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894195
5012	NC_010996	GAA	2	6	246314	246319	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190894195
5013	NC_010996	AG	3	6	246325	246330	50 %	0 %	50 %	0 %	190894195
5014	NC_010996	AAGC	2	8	246331	246338	50 %	0 %	25 %	25 %	190894195
5015	NC_010996	AGC	2	6	246363	246368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894195
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5017	NC_010996	GCC	2	6	246395	246400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894195
5018	NC_010996	GC	3	6	246438	246443	0 %	0 %	50 %	50 %	190894195
5019	NC_010996	GCTG	2	8	246514	246521	0 %	25 %	50 %	25 %	190894195
5020	NC_010996	AGG	2	6	246540	246545	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894195
5021	NC_010996	GCCG	2	8	246563	246570	0 %	0 %	50 %	50 %	190894195
5022	NC_010996	GGGGC	2	10	246638	246647	0 %	0 %	80 %	20 %	190894195
5023	NC_010996	CCG	2	6	246667	246672	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894195
5024	NC_010996	GTG	2	6	246683	246688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894195
5025	NC_010996	GATC	2	8	246694	246701	25 %	25 %	25 %	25 %	190894195
5026	NC_010996	GTA	2	6	246740	246745	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894195
5027	NC_010996	GTC	2	6	246841	246846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894195
5028	NC_010996	GC	3	6	246883	246888	0 %	0 %	50 %	50 %	190894195
5029	NC_010996	GGT	2	6	246913	246918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190894195
5030	NC_010996	GAT	2	6	246935	246940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894195
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5032	NC_010996	CGG	2	6	247108	247113	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894195
5033	NC_010996	CGA	2	6	247129	247134	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894195
5034	NC_010996	GGA	2	6	247151	247156	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190894195
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5036	NC_010996	TCC	2	6	247294	247299	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894195
5037	NC_010996	CG	3	6	247386	247391	0 %	0 %	50 %	50 %	190894195
5038	NC_010996	CGCC	2	8	247395	247402	0 %	0 %	25 %	75 %	190894195
5039	NC_010996	TAA	2	6	247406	247411	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	190894195
5040	NC_010996	GCCG	2	8	247426	247433	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5041	NC_010996	TCA	2	6	247472	247477	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5042	NC_010996	CCG	2	6	247493	247498	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5043	NC_010996	GCG	2	6	247528	247533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190894196
5044	NC_010996	CTT	2	6	247548	247553	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894196
5045	NC_010996	TGC	2	6	247580	247585	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190894196
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5048	NC_010996	GCA	2	6	247681	247686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190894196
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5050	NC_010996	GTC	2	6	247806	247811	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5051	NC_010996	ATC	2	6	247849	247854	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5052	NC_010996	TCCA	2	8	247919	247926	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5053	NC_010996	A	7	7	248003	248009	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5054	NC_010996	AAG	2	6	248157	248162	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5055	NC_010996	GC	3	6	248225	248230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5056	NC_010996	CCA	2	6	248269	248274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
5057	NC_010996	CTG	2	6	248349	248354	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5058	NC_010996	GCG	2	6	248380	248385	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5059	NC_010996	CAA	2	6	248389	248394	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5060	NC_010996	AAG	2	6	248400	248405	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5061	NC_010996	CGC	2	6	248434	248439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5062	NC_010996	GGCCA	2	10	248524	248533	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
5063	NC_010996	ACCT	2	8	248539	248546	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
5064	NC_010996	GCG	2	6	248687	248692	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5065	NC_010996	GAG	3	9	248696	248704	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5066	NC_010996	CAA	2	6	248728	248733	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5067	NC_010996	TAT	2	6	248807	248812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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5070	NC_010996	CCG	2	6	249039	249044	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5071	NC_010996	ATTG	2	8	249073	249080	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
5072	NC_010996	GGAGA	2	10	249164	249173	40 %	0 %	60 %	0 %	190894197
5073	NC_010996	CCT	2	6	249219	249224	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190894197
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5075	NC_010996	ATG	2	6	249338	249343	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894197
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5079	NC_010996	G	6	6	249479	249484	0 %	0 %	100 %	0 %	190894197
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5084	NC_010996	CGTGC	2	10	249595	249604	0 %	20 %	40 %	40 %	190894197
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5099	NC_010996	TCT	2	6	250475	250480	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190894198
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5102	NC_010996	GC	3	6	250665	250670	0 %	0 %	50 %	50 %	190894198
5103	NC_010996	TAG	2	6	250675	250680	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190894198
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5107	NC_010996	TGC	2	6	250878	250883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5108	NC_010996	AAG	2	6	250899	250904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5109	NC_010996	T	6	6	250952	250957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5110	NC_010996	GGC	2	6	251030	251035	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5111	NC_010996	TTGAG	2	10	251049	251058	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
5112	NC_010996	CTTT	2	8	251098	251105	0 %	75 %	0 %	25 %	190894199
5113	NC_010996	GCC	2	6	251169	251174	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190894199
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5120	NC_010996	AG	3	6	251408	251413	50 %	0 %	50 %	0 %	190894199
5121	NC_010996	ACGC	2	8	251483	251490	25 %	0 %	25 %	50 %	190894199
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5124	NC_010996	AAGGG	2	10	251982	251991	40 %	0 %	60 %	0 %	190894200
5125	NC_010996	GAG	2	6	252034	252039	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5126	NC_010996	CAG	2	6	252046	252051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5127	NC_010996	GCG	2	6	252052	252057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5128	NC_010996	CGGTT	2	10	252073	252082	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5129	NC_010996	GCG	2	6	252170	252175	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
5130	NC_010996	CTT	2	6	252196	252201	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5131	NC_010996	GTG	2	6	252211	252216	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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5133	NC_010996	CCG	2	6	252300	252305	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5134	NC_010996	CGGTG	2	10	252405	252414	0 %	20 %	60 %	20 %	190894201
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5232	NC_010996	GC	3	6	257561	257566	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5233	NC_010996	CTTC	2	8	257626	257633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5234	NC_010996	CTA	2	6	257789	257794	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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5239	NC_010996	CCG	2	6	258128	258133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5240	NC_010996	TGA	2	6	258152	258157	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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5242	NC_010996	GGCG	2	8	258220	258227	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5243	NC_010996	ATGCG	2	10	258287	258296	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
5244	NC_010996	CTG	2	6	258298	258303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5245	NC_010996	GAG	2	6	258305	258310	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5246	NC_010996	GGT	2	6	258328	258333	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
5247	NC_010996	CGA	2	6	258360	258365	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5248	NC_010996	TCG	2	6	258380	258385	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5249	NC_010996	CGA	2	6	258524	258529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5251	NC_010996	GCT	2	6	258613	258618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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5253	NC_010996	TTGC	2	8	258673	258680	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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5498	NC_010996	CCG	2	6	271223	271228	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
5499	NC_010996	TCA	2	6	271276	271281	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5500	NC_010996	GCT	2	6	271297	271302	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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