MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 107757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
15001	NC_010994	CGT	2	6	616560	616565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890250
15002	NC_010994	CAC	2	6	616644	616649	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890250
15003	NC_010994	CGA	2	6	616667	616672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890250
15004	NC_010994	GGCC	2	8	616673	616680	0 %	0 %	50 %	50 %	190890250
15005	NC_010994	GAAGAT	2	12	616713	616724	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	190890250
15006	NC_010994	GATCG	2	10	616764	616773	20 %	20 %	40 %	20 %	190890250
15007	NC_010994	GCCTTC	2	12	616863	616874	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	190890250
15008	NC_010994	TCA	2	6	617042	617047	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190890250
15009	NC_010994	TCC	2	6	617078	617083	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15010	NC_010994	GGC	2	6	617222	617227	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15011	NC_010994	AAG	2	6	617231	617236	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15012	NC_010994	GCG	2	6	617261	617266	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15013	NC_010994	GAC	2	6	617308	617313	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15014	NC_010994	TGA	2	6	617394	617399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890251
15015	NC_010994	CGC	2	6	617433	617438	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890251
15016	NC_010994	GCAGGC	2	12	617490	617501	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	190890251
15017	NC_010994	CGA	2	6	617523	617528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15018	NC_010994	CGC	2	6	617535	617540	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890251
15019	NC_010994	GC	3	6	617559	617564	0 %	0 %	50 %	50 %	190890251
15020	NC_010994	CTG	2	6	617569	617574	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15021	NC_010994	TGC	2	6	617610	617615	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15022	NC_010994	CGA	2	6	617622	617627	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15023	NC_010994	GCG	2	6	617685	617690	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890251
15024	NC_010994	TCG	2	6	617699	617704	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15025	NC_010994	ATC	2	6	617705	617710	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190890251
15026	NC_010994	CTT	2	6	617794	617799	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190890251
15027	NC_010994	CAC	2	6	617833	617838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890251
15028	NC_010994	AGC	3	9	617864	617872	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15029	NC_010994	CGG	3	9	618015	618023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890251
15030	NC_010994	GCA	2	6	618027	618032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890251
15031	NC_010994	AAAG	2	8	618036	618043	75 %	0 %	25 %	0 %	190890251
15032	NC_010994	CGG	2	6	618051	618056	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890251
15033	NC_010994	AG	3	6	618058	618063	50 %	0 %	50 %	0 %	190890251
15034	NC_010994	CAC	2	6	618087	618092	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890252
15035	NC_010994	AATA	2	8	618095	618102	75 %	25 %	0 %	0 %	190890252
15036	NC_010994	TCGG	2	8	618103	618110	0 %	25 %	50 %	25 %	190890252
15037	NC_010994	CAC	2	6	618114	618119	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890252
15038	NC_010994	CCAGCA	2	12	618149	618160	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	190890252
15039	NC_010994	GC	3	6	618172	618177	0 %	0 %	50 %	50 %	190890252
15040	NC_010994	CGC	2	6	618185	618190	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890252
15041	NC_010994	CCA	2	6	618239	618244	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890252
15042	NC_010994	CGC	2	6	618285	618290	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890252
15043	NC_010994	TCG	2	6	618299	618304	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890252
15044	NC_010994	GAT	2	6	618321	618326	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890252
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15046	NC_010994	ATC	2	6	618379	618384	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190890252
15047	NC_010994	ATG	2	6	618394	618399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890252
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15049	NC_010994	CGA	2	6	618455	618460	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890252
15050	NC_010994	CGG	2	6	618555	618560	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890252
15051	NC_010994	GCGG	2	8	618567	618574	0 %	0 %	75 %	25 %	190890252
15052	NC_010994	CGC	2	6	618577	618582	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890252
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15055	NC_010994	AGC	2	6	618643	618648	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890252
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15057	NC_010994	AGC	2	6	618682	618687	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890252
15058	NC_010994	GCC	2	6	618723	618728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890252
15059	NC_010994	CGG	2	6	618769	618774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890252
15060	NC_010994	CGA	2	6	618798	618803	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890252
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15062	NC_010994	G	6	6	618844	618849	0 %	0 %	100 %	0 %	190890252
15063	NC_010994	AGA	2	6	618857	618862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190890252
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15065	NC_010994	TGA	2	6	618875	618880	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890252
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15068	NC_010994	ATG	2	6	618943	618948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890252
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15076	NC_010994	TTG	2	6	619344	619349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190890254
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15102	NC_010994	GTT	2	6	620346	620351	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190890254
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15106	NC_010994	CGGC	2	8	620497	620504	0 %	0 %	50 %	50 %	190890254
15107	NC_010994	ATG	2	6	620556	620561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890254
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15111	NC_010994	GGTC	2	8	620644	620651	0 %	25 %	50 %	25 %	190890254
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15119	NC_010994	GC	3	6	620857	620862	0 %	0 %	50 %	50 %	190890254
15120	NC_010994	GTTC	2	8	620881	620888	0 %	50 %	25 %	25 %	190890254
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15124	NC_010994	CGG	2	6	620953	620958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890254
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15151	NC_010994	TCG	2	6	621765	621770	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890254
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15169	NC_010994	GGCC	2	8	622495	622502	0 %	0 %	50 %	50 %	190890254
15170	NC_010994	GCCG	2	8	622511	622518	0 %	0 %	50 %	50 %	190890254
15171	NC_010994	TGAT	2	8	622533	622540	25 %	50 %	25 %	0 %	190890254
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15181	NC_010994	TCT	2	6	623083	623088	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190890254
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15183	NC_010994	CAT	2	6	623175	623180	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15185	NC_010994	ACT	2	6	623272	623277	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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15187	NC_010994	GGC	2	6	623367	623372	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15188	NC_010994	CGCT	2	8	623379	623386	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
15189	NC_010994	CGA	2	6	623392	623397	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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15191	NC_010994	CGG	2	6	623579	623584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890255
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15221	NC_010994	AAGG	2	8	624628	624635	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15222	NC_010994	TCC	2	6	624648	624653	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15223	NC_010994	CG	3	6	624655	624660	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15224	NC_010994	T	6	6	624678	624683	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
15225	NC_010994	GGA	2	6	624778	624783	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15226	NC_010994	ACG	2	6	624839	624844	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890257
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15230	NC_010994	ACG	2	6	624995	625000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890257
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15237	NC_010994	TGC	2	6	625319	625324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890257
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15239	NC_010994	CCG	2	6	625388	625393	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890257
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15241	NC_010994	GCG	2	6	625544	625549	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890257
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15357	NC_010994	CTGCC	2	10	630237	630246	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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15359	NC_010994	GTT	2	6	630329	630334	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
15360	NC_010994	GGCAG	2	10	630386	630395	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15361	NC_010994	CGC	2	6	630479	630484	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15362	NC_010994	CGT	2	6	630523	630528	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15363	NC_010994	GAC	2	6	630533	630538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15364	NC_010994	TCC	2	6	630541	630546	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15365	NC_010994	CGC	2	6	630562	630567	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
15366	NC_010994	TCT	2	6	630589	630594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15367	NC_010994	TTCA	2	8	630669	630676	25 %	50 %	0 %	25 %	190890260
15368	NC_010994	GC	3	6	630725	630730	0 %	0 %	50 %	50 %	190890260
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15371	NC_010994	CG	3	6	630844	630849	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15372	NC_010994	TGC	2	6	630888	630893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15373	NC_010994	ATC	2	6	630951	630956	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15374	NC_010994	TCG	2	6	630990	630995	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15375	NC_010994	CTGG	2	8	631038	631045	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
15376	NC_010994	GCC	2	6	631077	631082	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890261
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15381	NC_010994	TGC	2	6	631261	631266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890261
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15385	NC_010994	CGCC	2	8	631445	631452	0 %	0 %	25 %	75 %	190890261
15386	NC_010994	GGCGA	2	10	631467	631476	20 %	0 %	60 %	20 %	190890261
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15390	NC_010994	ACA	2	6	631579	631584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15391	NC_010994	GAG	3	9	631617	631625	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15392	NC_010994	GAA	2	6	631634	631639	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190890262
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15394	NC_010994	GGA	2	6	631769	631774	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190890262
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15399	NC_010994	CGA	2	6	631934	631939	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890262
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15402	NC_010994	CCGT	2	8	631969	631976	0 %	25 %	25 %	50 %	190890262
15403	NC_010994	GGCA	2	8	631986	631993	25 %	0 %	50 %	25 %	190890262
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15408	NC_010994	TGA	2	6	632210	632215	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890263
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15456	NC_010994	ATT	2	6	633887	633892	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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15473	NC_010994	GC	3	6	634492	634497	0 %	0 %	50 %	50 %	190890265
15474	NC_010994	CG	3	6	634528	634533	0 %	0 %	50 %	50 %	190890266
15475	NC_010994	GC	3	6	634562	634567	0 %	0 %	50 %	50 %	190890266
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15480	NC_010994	CGG	2	6	634756	634761	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890266
15481	NC_010994	CCG	2	6	634806	634811	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190890266
15482	NC_010994	AGC	3	9	634835	634843	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890266
15483	NC_010994	CGGT	2	8	634916	634923	0 %	25 %	50 %	25 %	190890266
15484	NC_010994	GAT	2	6	635025	635030	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890266
15485	NC_010994	GCGAT	2	10	635042	635051	20 %	20 %	40 %	20 %	190890266
15486	NC_010994	CGA	2	6	635052	635057	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890266
15487	NC_010994	CG	3	6	635108	635113	0 %	0 %	50 %	50 %	190890266
15488	NC_010994	ATGCCG	2	12	635150	635161	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190890266
15489	NC_010994	GAT	2	6	635176	635181	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190890266
15490	NC_010994	GCCGC	2	10	635191	635200	0 %	0 %	40 %	60 %	190890266
15491	NC_010994	CG	3	6	635201	635206	0 %	0 %	50 %	50 %	190890266
15492	NC_010994	GCA	2	6	635274	635279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190890266
15493	NC_010994	ACC	2	6	635318	635323	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190890266
15494	NC_010994	GAGGC	2	10	635399	635408	20 %	0 %	60 %	20 %	190890266
15495	NC_010994	TGT	2	6	635511	635516	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	190890266
15496	NC_010994	GGC	2	6	635560	635565	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890266
15497	NC_010994	CGG	3	9	635592	635600	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890266
15498	NC_010994	TCG	2	6	635630	635635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890266
15499	NC_010994	GCG	2	6	635636	635641	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190890266
15500	NC_010994	GCT	2	6	635703	635708	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190890266

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