MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rhizobium etli CIAT 652 chromosome

Total Repeats: 107757

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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6002	NC_010994	CCGC	2	8	251024	251031	0 %	0 %	25 %	75 %	190889864
6003	NC_010994	CGG	2	6	251063	251068	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889864
6004	NC_010994	CAG	2	6	251073	251078	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889864
6005	NC_010994	TCG	2	6	251083	251088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889864
6006	NC_010994	ATC	2	6	251124	251129	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889864
6007	NC_010994	CCG	2	6	251177	251182	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889864
6008	NC_010994	ATC	2	6	251184	251189	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889864
6009	NC_010994	TCG	2	6	251290	251295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889864
6010	NC_010994	TGA	2	6	251335	251340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889864
6011	NC_010994	TTCCG	2	10	251379	251388	0 %	40 %	20 %	40 %	190889865
6012	NC_010994	TCG	2	6	251435	251440	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6013	NC_010994	TCG	2	6	251459	251464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6014	NC_010994	GCC	2	6	251491	251496	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889865
6015	NC_010994	GCT	2	6	251502	251507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6016	NC_010994	GCG	2	6	251528	251533	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889865
6017	NC_010994	CTA	2	6	251553	251558	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889865
6018	NC_010994	CGA	2	6	251561	251566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889865
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6020	NC_010994	CGG	2	6	251649	251654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889865
6021	NC_010994	GC	3	6	251663	251668	0 %	0 %	50 %	50 %	190889865
6022	NC_010994	TGGCGC	2	12	251672	251683	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	190889865
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6024	NC_010994	CGA	2	6	251810	251815	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6025	NC_010994	GCC	2	6	251836	251841	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889865
6026	NC_010994	CTG	2	6	251854	251859	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6027	NC_010994	GGGC	2	8	251916	251923	0 %	0 %	75 %	25 %	190889865
6028	NC_010994	ATC	2	6	251998	252003	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889865
6029	NC_010994	TCA	2	6	252128	252133	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889865
6030	NC_010994	TGC	2	6	252140	252145	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
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6032	NC_010994	TCG	2	6	252218	252223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6033	NC_010994	GCG	2	6	252224	252229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889865
6034	NC_010994	TCG	2	6	252236	252241	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6035	NC_010994	ATC	2	6	252269	252274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889865
6036	NC_010994	CAT	2	6	252282	252287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889865
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6039	NC_010994	TTTC	2	8	252335	252342	0 %	75 %	0 %	25 %	190889865
6040	NC_010994	GAT	2	6	252366	252371	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889865
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6042	NC_010994	CAG	2	6	252451	252456	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889865
6043	NC_010994	GAG	2	6	252470	252475	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889865
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6052	NC_010994	ATC	2	6	252875	252880	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889866
6053	NC_010994	ATC	2	6	252914	252919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889866
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6055	NC_010994	TGG	2	6	252995	253000	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889866
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6057	NC_010994	TCA	2	6	253173	253178	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889866
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6064	NC_010994	CGGCG	2	10	253530	253539	0 %	0 %	60 %	40 %	190889867
6065	NC_010994	GCCGA	2	10	253612	253621	20 %	0 %	40 %	40 %	190889867
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6094	NC_010994	GAT	2	6	254638	254643	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889868
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6101	NC_010994	GATC	2	8	255056	255063	25 %	25 %	25 %	25 %	190889869
6102	NC_010994	CCGTG	2	10	255122	255131	0 %	20 %	40 %	40 %	190889869
6103	NC_010994	CTG	2	6	255156	255161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889869
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6107	NC_010994	TCA	2	6	255247	255252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889869
6108	NC_010994	GCC	2	6	255294	255299	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889869
6109	NC_010994	CAT	2	6	255302	255307	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889869
6110	NC_010994	CCGG	2	8	255351	255358	0 %	0 %	50 %	50 %	190889869
6111	NC_010994	GCG	2	6	255381	255386	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889869
6112	NC_010994	CAT	2	6	255410	255415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889869
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6116	NC_010994	ATC	2	6	255550	255555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889870
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6120	NC_010994	CGC	3	9	255828	255836	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889870
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6362	NC_010994	GAC	2	6	266137	266142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889882
6363	NC_010994	CGG	2	6	266143	266148	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889882
6364	NC_010994	GAT	2	6	266156	266161	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889882
6365	NC_010994	ATC	2	6	266180	266185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889882
6366	NC_010994	CGG	3	9	266343	266351	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889882
6367	NC_010994	ATC	2	6	266414	266419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889882
6368	NC_010994	CCT	2	6	266424	266429	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889882
6369	NC_010994	CGC	3	9	266431	266439	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889882
6370	NC_010994	CAC	2	6	266494	266499	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889882
6371	NC_010994	CA	3	6	266572	266577	50 %	0 %	0 %	50 %	190889882
6372	NC_010994	AAC	2	6	266579	266584	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889882
6373	NC_010994	CGC	2	6	266587	266592	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889882
6374	NC_010994	GGA	2	6	266608	266613	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889882
6375	NC_010994	TGG	2	6	266616	266621	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889882
6376	NC_010994	GCG	2	6	266653	266658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889882
6377	NC_010994	CAA	2	6	266659	266664	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	190889882
6378	NC_010994	ACG	2	6	266684	266689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889882
6379	NC_010994	ACG	2	6	266693	266698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889882
6380	NC_010994	CAG	2	6	266722	266727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889882
6381	NC_010994	GCGAGA	2	12	266870	266881	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	190889883
6382	NC_010994	GCG	2	6	266951	266956	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6383	NC_010994	CGC	2	6	266961	266966	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889883
6384	NC_010994	GCC	2	6	266968	266973	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889883
6385	NC_010994	TCA	2	6	267005	267010	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889883
6386	NC_010994	CGCTC	2	10	267054	267063	0 %	20 %	20 %	60 %	190889883
6387	NC_010994	ACC	2	6	267082	267087	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	190889883
6388	NC_010994	GTC	2	6	267091	267096	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6389	NC_010994	TCG	2	6	267098	267103	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6390	NC_010994	CTA	2	6	267105	267110	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889883
6391	NC_010994	AT	3	6	267159	267164	50 %	50 %	0 %	0 %	190889883
6392	NC_010994	GCG	2	6	267196	267201	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6393	NC_010994	TCG	2	6	267215	267220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6394	NC_010994	AGCCG	2	10	267228	267237	20 %	0 %	40 %	40 %	190889883
6395	NC_010994	GCA	2	6	267245	267250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6396	NC_010994	TCT	2	6	267326	267331	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889883
6397	NC_010994	CGACCT	2	12	267351	267362	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	190889883
6398	NC_010994	CGA	2	6	267444	267449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6399	NC_010994	CTG	2	6	267466	267471	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6400	NC_010994	GCT	2	6	267495	267500	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6401	NC_010994	CGC	2	6	267501	267506	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889883
6402	NC_010994	GCT	2	6	267513	267518	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6403	NC_010994	GCAGC	2	10	267573	267582	20 %	0 %	40 %	40 %	190889883
6404	NC_010994	GCAT	2	8	267609	267616	25 %	25 %	25 %	25 %	190889883
6405	NC_010994	CGA	2	6	267651	267656	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889883
6406	NC_010994	GGT	2	6	267657	267662	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	190889883
6407	NC_010994	CGG	2	6	267668	267673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6408	NC_010994	TGCGC	2	10	267717	267726	0 %	20 %	40 %	40 %	190889883
6409	NC_010994	GCC	2	6	267747	267752	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889883
6410	NC_010994	GATC	2	8	267828	267835	25 %	25 %	25 %	25 %	190889883
6411	NC_010994	ATC	2	6	267844	267849	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889883
6412	NC_010994	CGC	2	6	267876	267881	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889883
6413	NC_010994	GAT	2	6	267894	267899	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889883
6414	NC_010994	CGG	2	6	267926	267931	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6415	NC_010994	GCG	2	6	267970	267975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6416	NC_010994	GAA	2	6	267987	267992	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889883
6417	NC_010994	GGC	2	6	267994	267999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889883
6418	NC_010994	CCT	2	6	268008	268013	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889883
6419	NC_010994	AGAA	2	8	268033	268040	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6420	NC_010994	CCG	3	9	268106	268114	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
6421	NC_010994	CCGCGC	2	12	268122	268133	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
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6423	NC_010994	CAG	2	6	268187	268192	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6424	NC_010994	CGC	3	9	268197	268205	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
6425	NC_010994	CGCAA	2	10	268218	268227	40 %	0 %	20 %	40 %	190889884
6426	NC_010994	CGA	2	6	268243	268248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6427	NC_010994	CAG	2	6	268265	268270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6428	NC_010994	CGAT	2	8	268293	268300	25 %	25 %	25 %	25 %	190889884
6429	NC_010994	GC	3	6	268332	268337	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6430	NC_010994	CAT	2	6	268366	268371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6431	NC_010994	AGG	2	6	268407	268412	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	190889884
6432	NC_010994	ACG	2	6	268434	268439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6433	NC_010994	GCT	2	6	268465	268470	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6434	NC_010994	GC	3	6	268472	268477	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6435	NC_010994	GAC	2	6	268478	268483	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6436	NC_010994	CAT	2	6	268492	268497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6437	NC_010994	CGG	2	6	268531	268536	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889884
6438	NC_010994	TC	3	6	268582	268587	0 %	50 %	0 %	50 %	190889884
6439	NC_010994	CGGC	2	8	268615	268622	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6440	NC_010994	ACGC	2	8	268650	268657	25 %	0 %	25 %	50 %	190889884
6441	NC_010994	CG	3	6	268671	268676	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6442	NC_010994	CGC	3	9	268689	268697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
6443	NC_010994	TCGA	2	8	268700	268707	25 %	25 %	25 %	25 %	190889884
6444	NC_010994	AAG	2	6	268736	268741	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	190889884
6445	NC_010994	TGC	2	6	268803	268808	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6446	NC_010994	ATC	2	6	268811	268816	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6447	NC_010994	TCA	2	6	268836	268841	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
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6449	NC_010994	CCT	2	6	268873	268878	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	190889884
6450	NC_010994	CGA	2	6	268906	268911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6451	NC_010994	TCA	2	6	268917	268922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6452	NC_010994	CTGCAG	2	12	268943	268954	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6453	NC_010994	CGCC	2	8	268982	268989	0 %	0 %	25 %	75 %	190889884
6454	NC_010994	GGCGAG	2	12	269000	269011	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	190889884
6455	NC_010994	CTGC	2	8	269038	269045	0 %	25 %	25 %	50 %	190889884
6456	NC_010994	CAT	2	6	269062	269067	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6457	NC_010994	ACG	2	6	269127	269132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889884
6458	NC_010994	CG	3	6	269163	269168	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6459	NC_010994	ATCGA	2	10	269183	269192	40 %	20 %	20 %	20 %	190889884
6460	NC_010994	ATC	2	6	269240	269245	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6461	NC_010994	TCA	2	6	269262	269267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6462	NC_010994	GGC	2	6	269272	269277	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889884
6463	NC_010994	GC	3	6	269276	269281	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6464	NC_010994	CGC	2	6	269297	269302	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
6465	NC_010994	TCA	3	9	269343	269351	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889884
6466	NC_010994	GGC	2	6	269393	269398	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889884
6467	NC_010994	CGGC	2	8	269407	269414	0 %	0 %	50 %	50 %	190889884
6468	NC_010994	GCC	3	9	269486	269494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889884
6469	NC_010994	TCG	2	6	269563	269568	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6470	NC_010994	CGC	2	6	269573	269578	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889885
6471	NC_010994	GCG	3	9	269586	269594	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889885
6472	NC_010994	GTCAAG	2	12	269685	269696	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	190889885
6473	NC_010994	GCG	2	6	269729	269734	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889885
6474	NC_010994	A	6	6	269782	269787	100 %	0 %	0 %	0 %	190889885
6475	NC_010994	GGCC	2	8	269825	269832	0 %	0 %	50 %	50 %	190889885
6476	NC_010994	TCA	2	6	269860	269865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889885
6477	NC_010994	CTTCG	2	10	269873	269882	0 %	40 %	20 %	40 %	190889885
6478	NC_010994	TGC	2	6	269884	269889	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6479	NC_010994	TCG	2	6	269893	269898	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6480	NC_010994	TCG	3	9	269902	269910	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6481	NC_010994	CAT	2	6	269914	269919	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889885
6482	NC_010994	CGT	2	6	269942	269947	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6483	NC_010994	GCC	2	6	269995	270000	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889885
6484	NC_010994	TCA	2	6	270040	270045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889885
6485	NC_010994	ATG	2	6	270076	270081	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889885
6486	NC_010994	CGG	2	6	270132	270137	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889885
6487	NC_010994	GCA	2	6	270149	270154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6488	NC_010994	CTT	2	6	270221	270226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	190889885
6489	NC_010994	GGCG	2	8	270254	270261	0 %	0 %	75 %	25 %	190889885
6490	NC_010994	TC	3	6	270287	270292	0 %	50 %	0 %	50 %	190889885
6491	NC_010994	TGC	2	6	270298	270303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6492	NC_010994	TCA	2	6	270367	270372	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889885
6493	NC_010994	GC	3	6	270376	270381	0 %	0 %	50 %	50 %	190889885
6494	NC_010994	TCG	2	6	270391	270396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	190889885
6495	NC_010994	ATG	2	6	270429	270434	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	190889885
6496	NC_010994	CG	3	6	270451	270456	0 %	0 %	50 %	50 %	190889885
6497	NC_010994	TCA	2	6	270463	270468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	190889885
6498	NC_010994	CGG	2	6	270478	270483	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	190889885
6499	NC_010994	GGAA	2	8	270541	270548	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6500	NC_010994	CGC	2	6	270568	270573	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	190889886

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