MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
3501	NC_010263	TCTT	2	8	138428	138435	0 %	75 %	0 %	25 %	165932714
3502	NC_010263	ATT	2	6	138493	138498	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932714
3503	NC_010263	AT	3	6	138508	138513	50 %	50 %	0 %	0 %	165932714
3504	NC_010263	T	6	6	138554	138559	0 %	100 %	0 %	0 %	165932714
3505	NC_010263	TTTAGT	2	12	138573	138584	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	165932714
3506	NC_010263	CCA	2	6	138588	138593	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932714
3507	NC_010263	TATT	2	8	138596	138603	25 %	75 %	0 %	0 %	165932714
3508	NC_010263	ATG	2	6	138633	138638	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3509	NC_010263	TGC	2	6	138683	138688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932714
3510	NC_010263	CTC	2	6	138748	138753	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932714
3511	NC_010263	ATT	2	6	138790	138795	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932714
3512	NC_010263	TGG	2	6	138841	138846	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932714
3513	NC_010263	AGA	2	6	138938	138943	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932714
3514	NC_010263	TAA	2	6	138995	139000	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3515	NC_010263	GAT	2	6	139008	139013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3516	NC_010263	AGT	2	6	139196	139201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3517	NC_010263	GTTA	2	8	139271	139278	25 %	50 %	25 %	0 %	165932714
3518	NC_010263	TAG	2	6	139313	139318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3519	NC_010263	AGCT	2	8	139321	139328	25 %	25 %	25 %	25 %	165932714
3520	NC_010263	TGC	2	6	139334	139339	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932714
3521	NC_010263	TAA	2	6	139364	139369	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3522	NC_010263	GCAA	2	8	139385	139392	50 %	0 %	25 %	25 %	165932714
3523	NC_010263	TGC	2	6	139430	139435	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932714
3524	NC_010263	G	6	6	139442	139447	0 %	0 %	100 %	0 %	165932714
3525	NC_010263	AGG	2	6	139466	139471	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932714
3526	NC_010263	GGA	2	6	139500	139505	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932714
3527	NC_010263	ATA	2	6	139546	139551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3528	NC_010263	TCT	2	6	139590	139595	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932714
3529	NC_010263	AGT	2	6	139623	139628	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3530	NC_010263	TGT	2	6	139643	139648	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932714
3531	NC_010263	CTC	2	6	139651	139656	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932714
3532	NC_010263	CAC	2	6	139678	139683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932714
3533	NC_010263	CAC	2	6	139720	139725	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932714
3534	NC_010263	ATA	2	6	139747	139752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3535	NC_010263	A	6	6	139764	139769	100 %	0 %	0 %	0 %	165932714
3536	NC_010263	ATA	2	6	139777	139782	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3537	NC_010263	TAG	2	6	139969	139974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932714
3538	NC_010263	GGA	3	9	139980	139988	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932714
3539	NC_010263	AAG	2	6	140002	140007	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932714
3540	NC_010263	GAG	2	6	140008	140013	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932714
3541	NC_010263	ACG	2	6	140024	140029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932714
3542	NC_010263	GCG	2	6	140068	140073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932714
3543	NC_010263	A	8	8	140083	140090	100 %	0 %	0 %	0 %	165932714
3544	NC_010263	ATA	2	6	140092	140097	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932714
3545	NC_010263	TAT	2	6	140133	140138	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3546	NC_010263	TAGC	2	8	140162	140169	25 %	25 %	25 %	25 %	165932715
3547	NC_010263	TA	3	6	140248	140253	50 %	50 %	0 %	0 %	165932715
3548	NC_010263	GTTTT	2	10	140316	140325	0 %	80 %	20 %	0 %	165932715
3549	NC_010263	GTA	3	9	140339	140347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932715
3550	NC_010263	ATA	2	6	140411	140416	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932715
3551	NC_010263	A	6	6	140467	140472	100 %	0 %	0 %	0 %	165932715
3552	NC_010263	CCT	3	9	140560	140568	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932715
3553	NC_010263	TTAA	2	8	140629	140636	50 %	50 %	0 %	0 %	165932715
3554	NC_010263	TAA	2	6	140676	140681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932715
3555	NC_010263	T	6	6	140686	140691	0 %	100 %	0 %	0 %	165932715
3556	NC_010263	TGC	2	6	140742	140747	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932715
3557	NC_010263	T	6	6	140812	140817	0 %	100 %	0 %	0 %	165932715
3558	NC_010263	A	6	6	140858	140863	100 %	0 %	0 %	0 %	165932715
3559	NC_010263	TAA	2	6	140876	140881	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932715
3560	NC_010263	TTG	2	6	140891	140896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932715
3561	NC_010263	GTG	2	6	140933	140938	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932715
3562	NC_010263	AGC	2	6	140994	140999	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932715
3563	NC_010263	GAT	2	6	141015	141020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932715
3564	NC_010263	GCA	2	6	141028	141033	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932715
3565	NC_010263	GATT	2	8	141108	141115	25 %	50 %	25 %	0 %	165932715
3566	NC_010263	TTA	2	6	141126	141131	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3567	NC_010263	CTTGG	2	10	141133	141142	0 %	40 %	40 %	20 %	165932715
3568	NC_010263	TAA	2	6	141207	141212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932715
3569	NC_010263	T	6	6	141289	141294	0 %	100 %	0 %	0 %	165932715
3570	NC_010263	TTA	2	6	141329	141334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3571	NC_010263	GCA	2	6	141340	141345	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932715
3572	NC_010263	TTA	2	6	141389	141394	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3573	NC_010263	ATT	2	6	141398	141403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3574	NC_010263	AT	3	6	141435	141440	50 %	50 %	0 %	0 %	165932715
3575	NC_010263	ATTC	2	8	141450	141457	25 %	50 %	0 %	25 %	165932715
3576	NC_010263	GTAT	2	8	141508	141515	25 %	50 %	25 %	0 %	165932715
3577	NC_010263	TAA	2	6	141563	141568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932715
3578	NC_010263	TATG	2	8	141570	141577	25 %	50 %	25 %	0 %	165932715
3579	NC_010263	TGT	2	6	141786	141791	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932715
3580	NC_010263	T	6	6	141836	141841	0 %	100 %	0 %	0 %	165932715
3581	NC_010263	ATT	2	6	141928	141933	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932715
3582	NC_010263	AAAG	2	8	141942	141949	75 %	0 %	25 %	0 %	165932715
3583	NC_010263	AGC	2	6	141951	141956	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932715
3584	NC_010263	TGC	2	6	141969	141974	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932715
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3587	NC_010263	TAG	2	6	142136	142141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932716
3588	NC_010263	GCA	2	6	142165	142170	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932716
3589	NC_010263	GCT	2	6	142205	142210	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932716
3590	NC_010263	AGG	2	6	142236	142241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932716
3591	NC_010263	AAT	2	6	142251	142256	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932716
3592	NC_010263	TAATGC	2	12	142272	142283	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	165932716
3593	NC_010263	TGT	2	6	142307	142312	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932716
3594	NC_010263	TAG	2	6	142379	142384	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932716
3595	NC_010263	GGTC	2	8	142413	142420	0 %	25 %	50 %	25 %	165932716
3596	NC_010263	TA	3	6	142441	142446	50 %	50 %	0 %	0 %	165932716
3597	NC_010263	AAT	2	6	142534	142539	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932716
3598	NC_010263	TC	3	6	142547	142552	0 %	50 %	0 %	50 %	165932716
3599	NC_010263	TAA	2	6	142553	142558	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932716
3600	NC_010263	A	6	6	142566	142571	100 %	0 %	0 %	0 %	165932716
3601	NC_010263	AATG	2	8	142573	142580	50 %	25 %	25 %	0 %	165932716
3602	NC_010263	ACT	2	6	142714	142719	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932716
3603	NC_010263	TCT	2	6	142873	142878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932716
3604	NC_010263	GAT	2	6	142957	142962	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932716
3605	NC_010263	ACA	2	6	142988	142993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165932716
3606	NC_010263	ATT	2	6	143001	143006	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932716
3607	NC_010263	TCC	2	6	143049	143054	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932716
3608	NC_010263	AAAGAT	2	12	143095	143106	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165932716
3609	NC_010263	CGG	2	6	143183	143188	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932716
3610	NC_010263	AGG	2	6	143196	143201	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932716
3611	NC_010263	AT	3	6	143221	143226	50 %	50 %	0 %	0 %	165932716
3612	NC_010263	ATGA	2	8	143230	143237	50 %	25 %	25 %	0 %	165932716
3613	NC_010263	TTG	2	6	143288	143293	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932716
3614	NC_010263	TAAAGA	2	12	143319	143330	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	165932716
3615	NC_010263	TA	3	6	143342	143347	50 %	50 %	0 %	0 %	165932716
3616	NC_010263	TA	4	8	143352	143359	50 %	50 %	0 %	0 %	165932716
3617	NC_010263	TAG	2	6	143430	143435	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932716
3618	NC_010263	GGA	2	6	143446	143451	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932716
3619	NC_010263	TGA	2	6	143517	143522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932716
3620	NC_010263	CAT	2	6	143541	143546	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932716
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3622	NC_010263	TAA	2	6	143685	143690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932716
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