MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31502	NC_010263	TA	3	6	1238791	1238796	50 %	50 %	0 %	0 %	165933893
31503	NC_010263	ATA	2	6	1238817	1238822	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
31504	NC_010263	AAT	2	6	1238830	1238835	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
31505	NC_010263	T	7	7	1238842	1238848	0 %	100 %	0 %	0 %	165933893
31506	NC_010263	TAATA	2	10	1238899	1238908	60 %	40 %	0 %	0 %	165933893
31507	NC_010263	AAT	2	6	1238920	1238925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933893
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31510	NC_010263	TTA	2	6	1239060	1239065	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933893
31511	NC_010263	AAC	2	6	1239180	1239185	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31512	NC_010263	A	7	7	1239193	1239199	100 %	0 %	0 %	0 %	165933894
31513	NC_010263	T	6	6	1239202	1239207	0 %	100 %	0 %	0 %	165933894
31514	NC_010263	ATT	2	6	1239214	1239219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933894
31515	NC_010263	GAT	2	6	1239256	1239261	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933894
31516	NC_010263	AAG	2	6	1239329	1239334	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933894
31517	NC_010263	ATT	2	6	1239398	1239403	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933894
31518	NC_010263	TCC	2	6	1239405	1239410	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933894
31519	NC_010263	TATGAT	2	12	1239454	1239465	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	165933894
31520	NC_010263	T	6	6	1239510	1239515	0 %	100 %	0 %	0 %	165933894
31521	NC_010263	AGA	2	6	1239519	1239524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933894
31522	NC_010263	CTAT	2	8	1239593	1239600	25 %	50 %	0 %	25 %	165933894
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31526	NC_010263	GAT	2	6	1239736	1239741	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933894
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31531	NC_010263	TAG	2	6	1239855	1239860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31533	NC_010263	ATT	2	6	1239936	1239941	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31534	NC_010263	GGC	2	6	1239961	1239966	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
31535	NC_010263	T	6	6	1240025	1240030	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31536	NC_010263	TCA	2	6	1240065	1240070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933895
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31553	NC_010263	AT	3	6	1240853	1240858	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
31554	NC_010263	AG	3	6	1240866	1240871	50 %	0 %	50 %	0 %	165933895
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31560	NC_010263	GTTA	2	8	1241144	1241151	25 %	50 %	25 %	0 %	165933895
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31565	NC_010263	TA	3	6	1241278	1241283	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
31566	NC_010263	GATA	2	8	1241294	1241301	50 %	25 %	25 %	0 %	165933895
31567	NC_010263	TA	3	6	1241300	1241305	50 %	50 %	0 %	0 %	165933895
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31572	NC_010263	AT	3	6	1241582	1241587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31573	NC_010263	CAAT	2	8	1241632	1241639	50 %	25 %	0 %	25 %	165933896
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31581	NC_010263	TAA	2	6	1241823	1241828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933896
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31588	NC_010263	ATC	2	6	1242144	1242149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933898
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31591	NC_010263	TTG	2	6	1242246	1242251	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933898
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31594	NC_010263	GTTTA	2	10	1242327	1242336	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
31595	NC_010263	T	7	7	1242381	1242387	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31596	NC_010263	A	6	6	1242398	1242403	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31600	NC_010263	AAT	2	6	1242605	1242610	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31601	NC_010263	TAA	2	6	1242630	1242635	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31602	NC_010263	A	6	6	1242649	1242654	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31603	NC_010263	AG	3	6	1242680	1242685	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
31604	NC_010263	GCA	2	6	1242719	1242724	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31605	NC_010263	TA	3	6	1242725	1242730	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31606	NC_010263	AAG	2	6	1242793	1242798	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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31611	NC_010263	ATTTT	2	10	1243087	1243096	20 %	80 %	0 %	0 %	165933900
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31619	NC_010263	TTGA	2	8	1243412	1243419	25 %	50 %	25 %	0 %	165933900
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31852	NC_010263	CAA	2	6	1252378	1252383	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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31856	NC_010263	TAT	2	6	1252503	1252508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31858	NC_010263	T	6	6	1252668	1252673	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31859	NC_010263	CGC	2	6	1252692	1252697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
31860	NC_010263	TATC	2	8	1252710	1252717	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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