MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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31002	NC_010263	T	6	6	1219699	1219704	0 %	100 %	0 %	0 %	165933877
31003	NC_010263	AAT	2	6	1219716	1219721	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933877
31004	NC_010263	TAA	2	6	1219814	1219819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933877
31005	NC_010263	TTGC	2	8	1219820	1219827	0 %	50 %	25 %	25 %	165933877
31006	NC_010263	TCT	2	6	1219833	1219838	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933877
31007	NC_010263	TCA	2	6	1219857	1219862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933877
31008	NC_010263	CTA	2	6	1219879	1219884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933877
31009	NC_010263	ATTA	2	8	1219904	1219911	50 %	50 %	0 %	0 %	165933877
31010	NC_010263	A	7	7	1219958	1219964	100 %	0 %	0 %	0 %	165933877
31011	NC_010263	ATT	2	6	1219968	1219973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933877
31012	NC_010263	TA	3	6	1220002	1220007	50 %	50 %	0 %	0 %	165933877
31013	NC_010263	ATTA	2	8	1220021	1220028	50 %	50 %	0 %	0 %	165933877
31014	NC_010263	ATTT	2	8	1220050	1220057	25 %	75 %	0 %	0 %	165933877
31015	NC_010263	TAT	2	6	1220063	1220068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933877
31016	NC_010263	TTA	2	6	1220071	1220076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933877
31017	NC_010263	ATC	2	6	1220139	1220144	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933877
31018	NC_010263	CTA	2	6	1220149	1220154	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933877
31019	NC_010263	ATA	3	9	1220285	1220293	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933877
31020	NC_010263	GCT	2	6	1220364	1220369	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933877
31021	NC_010263	TTA	2	6	1220382	1220387	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933877
31022	NC_010263	TA	3	6	1220396	1220401	50 %	50 %	0 %	0 %	165933877
31023	NC_010263	T	6	6	1220428	1220433	0 %	100 %	0 %	0 %	165933877
31024	NC_010263	GAA	2	6	1220682	1220687	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933877
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31029	NC_010263	CTT	2	6	1220770	1220775	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933877
31030	NC_010263	CTA	2	6	1220776	1220781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933877
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31033	NC_010263	T	6	6	1220930	1220935	0 %	100 %	0 %	0 %	165933877
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31037	NC_010263	TAA	2	6	1221112	1221117	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933877
31038	NC_010263	TCTT	2	8	1221143	1221150	0 %	75 %	0 %	25 %	165933877
31039	NC_010263	T	7	7	1221154	1221160	0 %	100 %	0 %	0 %	165933877
31040	NC_010263	ATA	2	6	1221170	1221175	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933877
31041	NC_010263	TAAT	2	8	1221187	1221194	50 %	50 %	0 %	0 %	165933877
31042	NC_010263	TAG	2	6	1221196	1221201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933877
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31046	NC_010263	T	7	7	1221429	1221435	0 %	100 %	0 %	0 %	165933877
31047	NC_010263	TTC	2	6	1221452	1221457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31048	NC_010263	TAA	3	9	1221470	1221478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31049	NC_010263	ACA	2	6	1221511	1221516	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933878
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31052	NC_010263	TC	3	6	1221661	1221666	0 %	50 %	0 %	50 %	165933878
31053	NC_010263	CT	3	6	1221814	1221819	0 %	50 %	0 %	50 %	165933878
31054	NC_010263	TCA	2	6	1221824	1221829	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933878
31055	NC_010263	AT	3	6	1221839	1221844	50 %	50 %	0 %	0 %	165933878
31056	NC_010263	AAGC	2	8	1221846	1221853	50 %	0 %	25 %	25 %	165933878
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31063	NC_010263	TGC	2	6	1222124	1222129	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933878
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31068	NC_010263	T	6	6	1222342	1222347	0 %	100 %	0 %	0 %	165933878
31069	NC_010263	TAT	3	9	1222355	1222363	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31071	NC_010263	TTAA	2	8	1222405	1222412	50 %	50 %	0 %	0 %	165933879
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31091	NC_010263	T	7	7	1223096	1223102	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31092	NC_010263	TAA	2	6	1223118	1223123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933881
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31098	NC_010263	A	7	7	1223622	1223628	100 %	0 %	0 %	0 %	165933881
31099	NC_010263	T	6	6	1223656	1223661	0 %	100 %	0 %	0 %	165933881
31100	NC_010263	CAA	3	9	1223688	1223696	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933881
31101	NC_010263	TA	3	6	1223796	1223801	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31102	NC_010263	ATA	2	6	1223826	1223831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31103	NC_010263	CAT	2	6	1223868	1223873	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31104	NC_010263	AGC	2	6	1223904	1223909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31105	NC_010263	CTA	2	6	1223966	1223971	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31106	NC_010263	TAA	2	6	1224002	1224007	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31107	NC_010263	TAT	2	6	1224030	1224035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31108	NC_010263	ATC	2	6	1224169	1224174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31109	NC_010263	TAC	2	6	1224191	1224196	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31110	NC_010263	T	6	6	1224381	1224386	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31111	NC_010263	TTCT	2	8	1224409	1224416	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
31112	NC_010263	AT	3	6	1224418	1224423	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31113	NC_010263	TAA	2	6	1224437	1224442	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31114	NC_010263	TCC	2	6	1224464	1224469	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31115	NC_010263	GGCA	2	8	1224492	1224499	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31116	NC_010263	GCT	2	6	1224517	1224522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31118	NC_010263	ACT	2	6	1224567	1224572	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31119	NC_010263	GCT	2	6	1224587	1224592	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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31121	NC_010263	CCT	2	6	1224640	1224645	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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31361	NC_010263	TGC	2	6	1233281	1233286	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933888
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31480	NC_010263	TCG	2	6	1237975	1237980	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933892
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