MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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30502	NC_010263	TAT	2	6	1199639	1199644	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933855
30503	NC_010263	GAC	2	6	1199684	1199689	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933855
30504	NC_010263	TACC	2	8	1199698	1199705	25 %	25 %	0 %	50 %	165933855
30505	NC_010263	TTC	2	6	1199715	1199720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933855
30506	NC_010263	TTC	2	6	1199733	1199738	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933855
30507	NC_010263	TTCC	2	8	1199744	1199751	0 %	50 %	0 %	50 %	165933855
30508	NC_010263	CCG	2	6	1199764	1199769	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933855
30509	NC_010263	AAT	2	6	1199796	1199801	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933855
30510	NC_010263	AT	3	6	1199814	1199819	50 %	50 %	0 %	0 %	165933855
30511	NC_010263	TCA	2	6	1199827	1199832	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933855
30512	NC_010263	TAT	2	6	1199897	1199902	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933855
30513	NC_010263	TGA	2	6	1199908	1199913	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933855
30514	NC_010263	TCA	2	6	1199929	1199934	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933855
30515	NC_010263	C	8	8	1199999	1200006	0 %	0 %	0 %	100 %	165933855
30516	NC_010263	TC	3	6	1200072	1200077	0 %	50 %	0 %	50 %	165933855
30517	NC_010263	AATA	2	8	1200105	1200112	75 %	25 %	0 %	0 %	165933855
30518	NC_010263	TTTA	2	8	1200120	1200127	25 %	75 %	0 %	0 %	165933855
30519	NC_010263	TCT	2	6	1200133	1200138	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933855
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30521	NC_010263	TTAA	2	8	1200295	1200302	50 %	50 %	0 %	0 %	165933855
30522	NC_010263	TAT	2	6	1200342	1200347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933855
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30528	NC_010263	T	7	7	1200751	1200757	0 %	100 %	0 %	0 %	165933855
30529	NC_010263	CGG	2	6	1200777	1200782	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933855
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30535	NC_010263	ACCC	2	8	1201152	1201159	25 %	0 %	0 %	75 %	165933855
30536	NC_010263	ATA	2	6	1201166	1201171	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933855
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30542	NC_010263	TCACT	2	10	1201508	1201517	20 %	40 %	0 %	40 %	165933855
30543	NC_010263	T	6	6	1201535	1201540	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30544	NC_010263	A	6	6	1201541	1201546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30545	NC_010263	GTA	2	6	1201550	1201555	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30546	NC_010263	TTTTA	2	10	1201566	1201575	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
30547	NC_010263	TAAA	2	8	1201623	1201630	75 %	25 %	0 %	0 %	165933856
30548	NC_010263	A	8	8	1201687	1201694	100 %	0 %	0 %	0 %	165933856
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30551	NC_010263	AGT	2	6	1201777	1201782	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933856
30552	NC_010263	TGT	2	6	1201807	1201812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933856
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30554	NC_010263	ATT	2	6	1201945	1201950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933856
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30556	NC_010263	GAC	2	6	1202048	1202053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933856
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30564	NC_010263	GGAT	2	8	1202310	1202317	25 %	25 %	50 %	0 %	165933857
30565	NC_010263	TA	3	6	1202398	1202403	50 %	50 %	0 %	0 %	165933857
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30605	NC_010263	T	6	6	1203923	1203928	0 %	100 %	0 %	0 %	165933861
30606	NC_010263	T	6	6	1203947	1203952	0 %	100 %	0 %	0 %	165933861
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30612	NC_010263	ATT	2	6	1204115	1204120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933861
30613	NC_010263	ATT	2	6	1204183	1204188	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30614	NC_010263	TAAT	2	8	1204222	1204229	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30615	NC_010263	AGA	2	6	1204286	1204291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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30617	NC_010263	TGC	2	6	1204369	1204374	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30618	NC_010263	T	7	7	1204549	1204555	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30619	NC_010263	ATA	2	6	1204558	1204563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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30983	NC_010263	TAT	2	6	1218559	1218564	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933876
30984	NC_010263	CAT	2	6	1218644	1218649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30985	NC_010263	GCA	2	6	1218655	1218660	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30987	NC_010263	CAG	2	6	1218923	1218928	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30990	NC_010263	TAAAA	2	10	1219023	1219032	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30991	NC_010263	CTG	2	6	1219196	1219201	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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30993	NC_010263	TGCT	2	8	1219317	1219324	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
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