MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
30001	NC_010263	TGCATT	2	12	1181634	1181645	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165933830
30002	NC_010263	GCA	2	6	1181665	1181670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933830
30003	NC_010263	GTA	2	6	1181686	1181691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933830
30004	NC_010263	TAA	2	6	1181696	1181701	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933830
30005	NC_010263	GCA	2	6	1181782	1181787	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30006	NC_010263	TTA	2	6	1181801	1181806	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30007	NC_010263	CCT	2	6	1181809	1181814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30008	NC_010263	GCA	2	6	1181946	1181951	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933831
30009	NC_010263	ATT	2	6	1181957	1181962	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933831
30010	NC_010263	CAA	2	6	1182005	1182010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933831
30011	NC_010263	AGT	2	6	1182071	1182076	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933831
30012	NC_010263	TAA	2	6	1182097	1182102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933831
30013	NC_010263	CAC	2	6	1182136	1182141	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933831
30014	NC_010263	GTAA	2	8	1182143	1182150	50 %	25 %	25 %	0 %	165933831
30015	NC_010263	CAG	2	6	1182175	1182180	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933831
30016	NC_010263	ATT	3	9	1182221	1182229	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933831
30017	NC_010263	ATT	2	6	1182236	1182241	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933831
30018	NC_010263	TGC	2	6	1182248	1182253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933831
30019	NC_010263	ATT	3	9	1182254	1182262	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933831
30020	NC_010263	CTA	2	6	1182300	1182305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933831
30021	NC_010263	GGT	2	6	1182329	1182334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933831
30022	NC_010263	TTG	2	6	1182356	1182361	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933831
30023	NC_010263	T	6	6	1182368	1182373	0 %	100 %	0 %	0 %	165933831
30024	NC_010263	AAT	2	6	1182375	1182380	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933831
30025	NC_010263	T	6	6	1182452	1182457	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30026	NC_010263	TAT	2	6	1182466	1182471	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30027	NC_010263	TAA	2	6	1182475	1182480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30028	NC_010263	GAT	2	6	1182485	1182490	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30029	NC_010263	TTG	2	6	1182535	1182540	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30030	NC_010263	CTG	2	6	1182556	1182561	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
30031	NC_010263	AGGG	2	8	1182594	1182601	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
30032	NC_010263	TAA	2	6	1182667	1182672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30033	NC_010263	CAT	3	9	1182673	1182681	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30034	NC_010263	ATA	2	6	1182686	1182691	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30035	NC_010263	AAT	2	6	1182714	1182719	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
30036	NC_010263	TAAT	2	8	1182786	1182793	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30037	NC_010263	GT	3	6	1182801	1182806	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30038	NC_010263	TTC	2	6	1182827	1182832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30039	NC_010263	ATG	2	6	1182854	1182859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30040	NC_010263	TA	3	6	1182910	1182915	50 %	50 %	0 %	0 %	165933832
30041	NC_010263	CTA	2	6	1182926	1182931	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933832
30042	NC_010263	AT	3	6	1182948	1182953	50 %	50 %	0 %	0 %	165933832
30043	NC_010263	AT	3	6	1183011	1183016	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30044	NC_010263	T	6	6	1183091	1183096	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
30045	NC_010263	CAA	2	6	1183137	1183142	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30046	NC_010263	A	6	6	1183169	1183174	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30047	NC_010263	AAT	2	6	1183192	1183197	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933833
30048	NC_010263	TC	3	6	1183199	1183204	0 %	50 %	0 %	50 %	165933833
30049	NC_010263	GGT	2	6	1183222	1183227	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933833
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30051	NC_010263	T	6	6	1183350	1183355	0 %	100 %	0 %	0 %	165933833
30052	NC_010263	TCA	2	6	1183366	1183371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
30053	NC_010263	CTA	2	6	1183396	1183401	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
30054	NC_010263	TCT	2	6	1183405	1183410	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933833
30055	NC_010263	AT	3	6	1183435	1183440	50 %	50 %	0 %	0 %	165933833
30056	NC_010263	CT	4	8	1183451	1183458	0 %	50 %	0 %	50 %	165933833
30057	NC_010263	ATAA	2	8	1183540	1183547	75 %	25 %	0 %	0 %	165933833
30058	NC_010263	TAA	2	6	1183667	1183672	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933833
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30061	NC_010263	TCA	2	6	1183795	1183800	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
30062	NC_010263	TCA	2	6	1183976	1183981	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
30063	NC_010263	CAT	2	6	1184078	1184083	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
30064	NC_010263	ATCA	2	8	1184109	1184116	50 %	25 %	0 %	25 %	165933833
30065	NC_010263	TTC	2	6	1184130	1184135	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933833
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30067	NC_010263	GGT	2	6	1184199	1184204	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933833
30068	NC_010263	CTA	2	6	1184210	1184215	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933833
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30075	NC_010263	ATTA	2	8	1184526	1184533	50 %	50 %	0 %	0 %	165933833
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30091	NC_010263	TAA	3	9	1184976	1184984	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933833
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30107	NC_010263	ATT	2	6	1185490	1185495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30108	NC_010263	AT	3	6	1185563	1185568	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30109	NC_010263	ACA	2	6	1185588	1185593	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933834
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30112	NC_010263	AATT	2	8	1185617	1185624	50 %	50 %	0 %	0 %	165933834
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30115	NC_010263	T	7	7	1185698	1185704	0 %	100 %	0 %	0 %	165933834
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30485	NC_010263	AGT	2	6	1198983	1198988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933855
30486	NC_010263	TAAT	2	8	1199036	1199043	50 %	50 %	0 %	0 %	165933855
30487	NC_010263	T	6	6	1199063	1199068	0 %	100 %	0 %	0 %	165933855
30488	NC_010263	A	6	6	1199070	1199075	100 %	0 %	0 %	0 %	165933855
30489	NC_010263	GCATC	2	10	1199078	1199087	20 %	20 %	20 %	40 %	165933855
30490	NC_010263	TCA	3	9	1199096	1199104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933855
30491	NC_010263	TATTT	2	10	1199131	1199140	20 %	80 %	0 %	0 %	165933855
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30493	NC_010263	TTA	2	6	1199222	1199227	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933855
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30499	NC_010263	TA	3	6	1199504	1199509	50 %	50 %	0 %	0 %	165933855
30500	NC_010263	ATC	2	6	1199518	1199523	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933855

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