MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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29002	NC_010263	AT	3	6	1140465	1140470	50 %	50 %	0 %	0 %	165933791
29003	NC_010263	AATT	2	8	1140498	1140505	50 %	50 %	0 %	0 %	165933791
29004	NC_010263	ATCT	2	8	1140523	1140530	25 %	50 %	0 %	25 %	165933791
29005	NC_010263	CTT	2	6	1140531	1140536	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933791
29006	NC_010263	TAAA	2	8	1140556	1140563	75 %	25 %	0 %	0 %	165933791
29007	NC_010263	GCTT	2	8	1140652	1140659	0 %	50 %	25 %	25 %	165933791
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29012	NC_010263	AAG	2	6	1140943	1140948	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933791
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29014	NC_010263	TGC	2	6	1141000	1141005	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933791
29015	NC_010263	T	6	6	1141057	1141062	0 %	100 %	0 %	0 %	165933791
29016	NC_010263	CAT	2	6	1141122	1141127	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933791
29017	NC_010263	CTA	2	6	1141266	1141271	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933791
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29019	NC_010263	TAG	2	6	1141380	1141385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933791
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29036	NC_010263	GCTTT	2	10	1142089	1142098	0 %	60 %	20 %	20 %	165933791
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29039	NC_010263	TTTA	2	8	1142185	1142192	25 %	75 %	0 %	0 %	165933791
29040	NC_010263	TAT	2	6	1142214	1142219	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933791
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29042	NC_010263	CAT	3	9	1142295	1142303	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29047	NC_010263	T	6	6	1142467	1142472	0 %	100 %	0 %	0 %	165933792
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29052	NC_010263	ATC	2	6	1142658	1142663	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933792
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29055	NC_010263	GCTT	2	8	1142724	1142731	0 %	50 %	25 %	25 %	165933792
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29059	NC_010263	TAC	2	6	1142804	1142809	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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29091	NC_010263	T	6	6	1144267	1144272	0 %	100 %	0 %	0 %	165933793
29092	NC_010263	A	6	6	1144281	1144286	100 %	0 %	0 %	0 %	165933793
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29095	NC_010263	TA	3	6	1144367	1144372	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29096	NC_010263	A	6	6	1144389	1144394	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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29102	NC_010263	CTCC	2	8	1144577	1144584	0 %	25 %	0 %	75 %	165933794
29103	NC_010263	GTA	2	6	1144601	1144606	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933794
29104	NC_010263	ATTT	2	8	1144614	1144621	25 %	75 %	0 %	0 %	165933794
29105	NC_010263	CTA	2	6	1144706	1144711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933794
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29109	NC_010263	ATCCGA	2	12	1144763	1144774	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	165933794
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29111	NC_010263	ATC	2	6	1144806	1144811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933794
29112	NC_010263	TGT	2	6	1144837	1144842	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933794
29113	NC_010263	AT	3	6	1144884	1144889	50 %	50 %	0 %	0 %	165933794
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29117	NC_010263	AAT	2	6	1145043	1145048	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933794
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29480	NC_010263	GTAA	2	8	1159922	1159929	50 %	25 %	25 %	0 %	165933810
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