MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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28502	NC_010263	AGA	3	9	1120069	1120077	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933775
28503	NC_010263	TAT	2	6	1120135	1120140	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933775
28504	NC_010263	AGA	2	6	1120150	1120155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933775
28505	NC_010263	ATA	2	6	1120263	1120268	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933775
28506	NC_010263	TAT	2	6	1120416	1120421	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933775
28507	NC_010263	CAA	2	6	1120458	1120463	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933775
28508	NC_010263	TAA	3	9	1120477	1120485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933775
28509	NC_010263	ACAA	2	8	1120536	1120543	75 %	0 %	0 %	25 %	165933775
28510	NC_010263	TAG	2	6	1120560	1120565	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933775
28511	NC_010263	ATTT	2	8	1120588	1120595	25 %	75 %	0 %	0 %	165933775
28512	NC_010263	A	6	6	1120672	1120677	100 %	0 %	0 %	0 %	165933775
28513	NC_010263	GAAAAA	2	12	1120694	1120705	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	165933775
28514	NC_010263	T	6	6	1120710	1120715	0 %	100 %	0 %	0 %	165933775
28515	NC_010263	AGA	2	6	1120732	1120737	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933775
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28517	NC_010263	AGG	2	6	1120750	1120755	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165933775
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28519	NC_010263	ATT	2	6	1120810	1120815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933775
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28521	NC_010263	TA	3	6	1120866	1120871	50 %	50 %	0 %	0 %	165933775
28522	NC_010263	TGA	2	6	1120879	1120884	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933775
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28524	NC_010263	TAA	2	6	1120936	1120941	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933775
28525	NC_010263	GCA	2	6	1120970	1120975	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933775
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28530	NC_010263	TTTA	2	8	1121144	1121151	25 %	75 %	0 %	0 %	165933775
28531	NC_010263	TAAT	2	8	1121196	1121203	50 %	50 %	0 %	0 %	165933775
28532	NC_010263	ATT	2	6	1121210	1121215	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933775
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28534	NC_010263	AAGC	2	8	1121263	1121270	50 %	0 %	25 %	25 %	165933775
28535	NC_010263	AGG	2	6	1121403	1121408	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165933775
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28537	NC_010263	AAC	2	6	1121436	1121441	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933775
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28539	NC_010263	TA	3	6	1121475	1121480	50 %	50 %	0 %	0 %	165933775
28540	NC_010263	TAT	2	6	1121526	1121531	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28541	NC_010263	A	8	8	1121539	1121546	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28542	NC_010263	AAT	2	6	1121587	1121592	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28543	NC_010263	TTA	2	6	1121593	1121598	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28544	NC_010263	AAC	2	6	1121610	1121615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28545	NC_010263	A	7	7	1121641	1121647	100 %	0 %	0 %	0 %	165933776
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28551	NC_010263	T	6	6	1121908	1121913	0 %	100 %	0 %	0 %	165933776
28552	NC_010263	AGA	2	6	1121929	1121934	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933776
28553	NC_010263	TAG	2	6	1121944	1121949	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933776
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28563	NC_010263	TCAA	2	8	1122493	1122500	50 %	25 %	0 %	25 %	165933776
28564	NC_010263	GA	3	6	1122516	1122521	50 %	0 %	50 %	0 %	165933776
28565	NC_010263	T	7	7	1122529	1122535	0 %	100 %	0 %	0 %	165933776
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28590	NC_010263	A	6	6	1124030	1124035	100 %	0 %	0 %	0 %	165933776
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28602	NC_010263	CTA	2	6	1124928	1124933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933776
28603	NC_010263	GAGG	2	8	1125080	1125087	25 %	0 %	75 %	0 %	165933776
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28610	NC_010263	AAAG	2	8	1125219	1125226	75 %	0 %	25 %	0 %	165933777
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