MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21502	NC_010263	TGA	2	6	847346	847351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933482
21503	NC_010263	TGA	2	6	847371	847376	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933482
21504	NC_010263	AAT	2	6	847380	847385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933482
21505	NC_010263	GAT	2	6	847438	847443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933482
21506	NC_010263	AAAT	2	8	847536	847543	75 %	25 %	0 %	0 %	165933482
21507	NC_010263	ATAG	2	8	847573	847580	50 %	25 %	25 %	0 %	165933482
21508	NC_010263	TTGC	2	8	847609	847616	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21509	NC_010263	CAA	2	6	847680	847685	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21510	NC_010263	ATTA	2	8	847692	847699	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21511	NC_010263	AAG	2	6	847718	847723	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21512	NC_010263	T	6	6	847730	847735	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21513	NC_010263	A	6	6	847789	847794	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21514	NC_010263	CTT	2	6	847809	847814	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933483
21515	NC_010263	TAA	2	6	847827	847832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21516	NC_010263	AAG	2	6	847941	847946	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933483
21517	NC_010263	ATT	2	6	847950	847955	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21518	NC_010263	GTA	2	6	847969	847974	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933483
21519	NC_010263	CAT	2	6	848030	848035	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933483
21520	NC_010263	AGA	2	6	848098	848103	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933483
21521	NC_010263	ATTC	2	8	848133	848140	25 %	50 %	0 %	25 %	165933483
21522	NC_010263	A	6	6	848153	848158	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21523	NC_010263	GCT	2	6	848176	848181	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933483
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21525	NC_010263	TAA	2	6	848231	848236	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21526	NC_010263	A	6	6	848299	848304	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21527	NC_010263	A	7	7	848403	848409	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21528	NC_010263	TAA	2	6	848453	848458	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21529	NC_010263	TA	3	6	848482	848487	50 %	50 %	0 %	0 %	165933483
21530	NC_010263	CTA	2	6	848492	848497	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933483
21531	NC_010263	TAA	2	6	848516	848521	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21532	NC_010263	TG	3	6	848557	848562	0 %	50 %	50 %	0 %	165933483
21533	NC_010263	A	6	6	848616	848621	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21534	NC_010263	AT	3	6	848746	848751	50 %	50 %	0 %	0 %	165933483
21535	NC_010263	AAT	2	6	848766	848771	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21536	NC_010263	CTA	2	6	848786	848791	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933483
21537	NC_010263	TAG	2	6	848834	848839	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933483
21538	NC_010263	A	8	8	848844	848851	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21539	NC_010263	AAT	2	6	848857	848862	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21540	NC_010263	ATT	3	9	848877	848885	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21541	NC_010263	TAT	2	6	848907	848912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21542	NC_010263	ATT	2	6	848929	848934	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21543	NC_010263	TAC	2	6	848973	848978	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933483
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21545	NC_010263	AAT	3	9	849105	849113	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21546	NC_010263	TAT	2	6	849131	849136	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21547	NC_010263	TAT	2	6	849206	849211	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21548	NC_010263	TAC	2	6	849219	849224	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933483
21549	NC_010263	TAT	2	6	849303	849308	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21550	NC_010263	TAA	2	6	849317	849322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21551	NC_010263	ATT	3	9	849326	849334	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933483
21552	NC_010263	GTA	2	6	849383	849388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933483
21553	NC_010263	CGGCA	2	10	849417	849426	20 %	0 %	40 %	40 %	165933483
21554	NC_010263	TATT	2	8	849427	849434	25 %	75 %	0 %	0 %	165933483
21555	NC_010263	ATA	2	6	849452	849457	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933483
21556	NC_010263	A	6	6	849460	849465	100 %	0 %	0 %	0 %	165933483
21557	NC_010263	TAT	2	6	849508	849513	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933484
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21559	NC_010263	T	6	6	849605	849610	0 %	100 %	0 %	0 %	165933484
21560	NC_010263	ATA	3	9	849647	849655	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933484
21561	NC_010263	TTA	2	6	849665	849670	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933484
21562	NC_010263	AT	3	6	849674	849679	50 %	50 %	0 %	0 %	165933484
21563	NC_010263	TAC	2	6	849706	849711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933484
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21565	NC_010263	TATT	2	8	849748	849755	25 %	75 %	0 %	0 %	165933484
21566	NC_010263	TGAT	2	8	849843	849850	25 %	50 %	25 %	0 %	165933484
21567	NC_010263	ATTT	2	8	849886	849893	25 %	75 %	0 %	0 %	165933484
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21570	NC_010263	ATT	2	6	850071	850076	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933484
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21573	NC_010263	ATTCAT	2	12	850156	850167	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	165933484
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21575	NC_010263	TAATT	2	10	850228	850237	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
21576	NC_010263	AT	3	6	850245	850250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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21578	NC_010263	ATA	2	6	850265	850270	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21579	NC_010263	TTAATA	2	12	850285	850296	50 %	50 %	0 %	0 %	165933485
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21585	NC_010263	A	6	6	850453	850458	100 %	0 %	0 %	0 %	165933485
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21589	NC_010263	ATT	2	6	850550	850555	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933485
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21593	NC_010263	T	6	6	850722	850727	0 %	100 %	0 %	0 %	165933485
21594	NC_010263	AGC	2	6	850736	850741	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933485
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21598	NC_010263	CTT	2	6	850828	850833	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933485
21599	NC_010263	A	8	8	850846	850853	100 %	0 %	0 %	0 %	165933485
21600	NC_010263	CA	3	6	850898	850903	50 %	0 %	0 %	50 %	165933485
21601	NC_010263	TTAACT	2	12	850907	850918	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	165933485
21602	NC_010263	A	6	6	850939	850944	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21603	NC_010263	GCTT	2	8	850945	850952	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21604	NC_010263	ACGGT	2	10	850955	850964	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
21605	NC_010263	TCA	2	6	850968	850973	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21606	NC_010263	TTC	2	6	851047	851052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21607	NC_010263	CAA	2	6	851080	851085	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
21608	NC_010263	AAG	2	6	851220	851225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933486
21609	NC_010263	GAA	2	6	851253	851258	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933486
21610	NC_010263	TA	3	6	851331	851336	50 %	50 %	0 %	0 %	165933486
21611	NC_010263	CAT	2	6	851342	851347	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933486
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21613	NC_010263	ACCT	2	8	851369	851376	25 %	25 %	0 %	50 %	165933486
21614	NC_010263	TGA	2	6	851461	851466	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933486
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21618	NC_010263	TTC	2	6	851614	851619	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933486
21619	NC_010263	AAT	2	6	851631	851636	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933486
21620	NC_010263	GATA	2	8	851651	851658	50 %	25 %	25 %	0 %	165933486
21621	NC_010263	TCA	2	6	851681	851686	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933486
21622	NC_010263	CATC	2	8	851687	851694	25 %	25 %	0 %	50 %	165933486
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21997	NC_010263	GCTT	2	8	865932	865939	0 %	50 %	25 %	25 %	165933497
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21999	NC_010263	AAAG	2	8	866021	866028	75 %	0 %	25 %	0 %	165933497
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