MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
18501	NC_010263	GTT	2	6	728748	728753	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
18502	NC_010263	A	6	6	728792	728797	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18503	NC_010263	ATA	2	6	728849	728854	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18504	NC_010263	TAAA	2	8	728888	728895	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
18505	NC_010263	T	6	6	728918	728923	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18506	NC_010263	A	7	7	728968	728974	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18507	NC_010263	GCA	2	6	728986	728991	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
18508	NC_010263	A	6	6	728991	728996	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18509	NC_010263	AATTA	2	10	728998	729007	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
18510	NC_010263	ATTT	2	8	729017	729024	25 %	75 %	0 %	0 %	165933343
18511	NC_010263	CAT	2	6	729040	729045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933343
18512	NC_010263	AGC	2	6	729331	729336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933343
18513	NC_010263	GAT	2	6	729411	729416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933343
18514	NC_010263	AGCAT	2	10	729437	729446	40 %	20 %	20 %	20 %	165933343
18515	NC_010263	ATC	2	6	729448	729453	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933343
18516	NC_010263	TTG	2	6	729576	729581	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933343
18517	NC_010263	T	6	6	729605	729610	0 %	100 %	0 %	0 %	165933343
18518	NC_010263	T	6	6	729663	729668	0 %	100 %	0 %	0 %	165933343
18519	NC_010263	TTC	2	6	729681	729686	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933343
18520	NC_010263	ACAA	2	8	729748	729755	75 %	0 %	0 %	25 %	165933343
18521	NC_010263	CAG	2	6	729786	729791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933343
18522	NC_010263	T	7	7	729855	729861	0 %	100 %	0 %	0 %	165933343
18523	NC_010263	CAAG	2	8	729864	729871	50 %	0 %	25 %	25 %	165933343
18524	NC_010263	ACC	2	6	729904	729909	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933343
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18526	NC_010263	A	6	6	729985	729990	100 %	0 %	0 %	0 %	165933343
18527	NC_010263	GT	3	6	730019	730024	0 %	50 %	50 %	0 %	165933343
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18530	NC_010263	GAT	2	6	730154	730159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933344
18531	NC_010263	CTG	2	6	730181	730186	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933344
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18533	NC_010263	ATT	2	6	730279	730284	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933344
18534	NC_010263	T	6	6	730312	730317	0 %	100 %	0 %	0 %	165933344
18535	NC_010263	TAT	2	6	730413	730418	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933344
18536	NC_010263	T	6	6	730418	730423	0 %	100 %	0 %	0 %	165933344
18537	NC_010263	AAG	2	6	730454	730459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933344
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18542	NC_010263	GTA	2	6	730643	730648	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933344
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18548	NC_010263	A	6	6	730907	730912	100 %	0 %	0 %	0 %	165933344
18549	NC_010263	ATC	2	6	730917	730922	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933344
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18552	NC_010263	T	7	7	731048	731054	0 %	100 %	0 %	0 %	165933344
18553	NC_010263	ATA	2	6	731056	731061	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933344
18554	NC_010263	A	6	6	731104	731109	100 %	0 %	0 %	0 %	165933344
18555	NC_010263	GTT	2	6	731122	731127	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933344
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18557	NC_010263	AGT	2	6	731229	731234	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18560	NC_010263	TAT	2	6	731457	731462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
18561	NC_010263	TAT	2	6	731490	731495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933346
18562	NC_010263	TG	3	6	731508	731513	0 %	50 %	50 %	0 %	165933346
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18565	NC_010263	CAT	2	6	731680	731685	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933346
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18570	NC_010263	CT	3	6	731918	731923	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
18571	NC_010263	T	6	6	731952	731957	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18573	NC_010263	TAC	2	6	732034	732039	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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18575	NC_010263	TAAT	2	8	732063	732070	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18576	NC_010263	AGT	2	6	732128	732133	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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18592	NC_010263	AAT	2	6	732840	732845	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18593	NC_010263	TTA	2	6	732856	732861	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18595	NC_010263	TA	3	6	732917	732922	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18596	NC_010263	T	6	6	732941	732946	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18597	NC_010263	ATA	2	6	733017	733022	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18598	NC_010263	TA	3	6	733049	733054	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18599	NC_010263	AAT	3	9	733110	733118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18601	NC_010263	AAT	2	6	733152	733157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18602	NC_010263	CCGT	2	8	733158	733165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18603	NC_010263	AT	3	6	733166	733171	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18604	NC_010263	A	6	6	733188	733193	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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18607	NC_010263	A	7	7	733411	733417	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18608	NC_010263	AAAC	2	8	733419	733426	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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18610	NC_010263	T	8	8	733543	733550	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
18611	NC_010263	GACAT	2	10	733586	733595	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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19000	NC_010263	AGC	2	6	747665	747670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933368

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