MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
16501	NC_010263	A	6	6	650018	650023	100 %	0 %	0 %	0 %	165933253
16502	NC_010263	GCA	2	6	650043	650048	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933253
16503	NC_010263	TAAT	2	8	650064	650071	50 %	50 %	0 %	0 %	165933253
16504	NC_010263	GAA	2	6	650080	650085	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933253
16505	NC_010263	CTA	2	6	650113	650118	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933253
16506	NC_010263	ATA	2	6	650128	650133	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933253
16507	NC_010263	CTTGC	2	10	650173	650182	0 %	40 %	20 %	40 %	165933253
16508	NC_010263	ATCTC	2	10	650258	650267	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
16509	NC_010263	CGA	2	6	650326	650331	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16510	NC_010263	GCT	2	6	650374	650379	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
16511	NC_010263	ACT	2	6	650398	650403	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933254
16512	NC_010263	CTTA	2	8	650423	650430	25 %	50 %	0 %	25 %	165933254
16513	NC_010263	ATT	2	6	650453	650458	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933254
16514	NC_010263	GCG	3	9	650483	650491	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933254
16515	NC_010263	TAA	2	6	650504	650509	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933254
16516	NC_010263	ATT	2	6	650561	650566	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933254
16517	NC_010263	TGCAC	2	10	650592	650601	20 %	20 %	20 %	40 %	165933254
16518	NC_010263	TAAT	2	8	650638	650645	50 %	50 %	0 %	0 %	165933254
16519	NC_010263	TGT	2	6	650646	650651	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933254
16520	NC_010263	GTA	2	6	650661	650666	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933254
16521	NC_010263	AT	3	6	650692	650697	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16522	NC_010263	AAG	2	6	650714	650719	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933255
16523	NC_010263	TTAAA	2	10	650727	650736	60 %	40 %	0 %	0 %	165933255
16524	NC_010263	GCAA	2	8	650780	650787	50 %	0 %	25 %	25 %	165933255
16525	NC_010263	TGC	2	6	650907	650912	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933255
16526	NC_010263	CT	3	6	650935	650940	0 %	50 %	0 %	50 %	165933255
16527	NC_010263	TAAA	2	8	650982	650989	75 %	25 %	0 %	0 %	165933255
16528	NC_010263	GTC	2	6	651049	651054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933255
16529	NC_010263	TCT	2	6	651137	651142	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933255
16530	NC_010263	TCT	2	6	651212	651217	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933255
16531	NC_010263	TA	3	6	651229	651234	50 %	50 %	0 %	0 %	165933255
16532	NC_010263	TCA	2	6	651281	651286	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933255
16533	NC_010263	T	8	8	651340	651347	0 %	100 %	0 %	0 %	165933255
16534	NC_010263	CT	3	6	651349	651354	0 %	50 %	0 %	50 %	165933255
16535	NC_010263	CGG	2	6	651403	651408	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933255
16536	NC_010263	CTT	3	9	651453	651461	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933255
16537	NC_010263	CGC	2	6	651507	651512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933255
16538	NC_010263	TTCC	2	8	651615	651622	0 %	50 %	0 %	50 %	165933255
16539	NC_010263	T	8	8	651672	651679	0 %	100 %	0 %	0 %	165933255
16540	NC_010263	AAT	2	6	651735	651740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933255
16541	NC_010263	AT	3	6	651790	651795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16542	NC_010263	AAT	2	6	651828	651833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
16543	NC_010263	TTC	2	6	651861	651866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933256
16544	NC_010263	TCA	2	6	651947	651952	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933256
16545	NC_010263	TTA	2	6	651955	651960	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933256
16546	NC_010263	TATTT	2	10	651969	651978	20 %	80 %	0 %	0 %	165933256
16547	NC_010263	TAC	2	6	652017	652022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933256
16548	NC_010263	T	6	6	652080	652085	0 %	100 %	0 %	0 %	165933256
16549	NC_010263	TA	3	6	652095	652100	50 %	50 %	0 %	0 %	165933256
16550	NC_010263	TAA	2	6	652113	652118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
16551	NC_010263	AT	3	6	652133	652138	50 %	50 %	0 %	0 %	165933256
16552	NC_010263	TTA	2	6	652145	652150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933256
16553	NC_010263	TGC	2	6	652211	652216	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933256
16554	NC_010263	TA	3	6	652312	652317	50 %	50 %	0 %	0 %	165933256
16555	NC_010263	T	6	6	652355	652360	0 %	100 %	0 %	0 %	165933256
16556	NC_010263	TAA	2	6	652371	652376	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
16557	NC_010263	TAC	2	6	652380	652385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933256
16558	NC_010263	AGA	2	6	652389	652394	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933256
16559	NC_010263	TATT	2	8	652440	652447	25 %	75 %	0 %	0 %	165933256
16560	NC_010263	TAA	2	6	652497	652502	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
16561	NC_010263	TTGCA	2	10	652505	652514	20 %	40 %	20 %	20 %	165933256
16562	NC_010263	ACTA	2	8	652548	652555	50 %	25 %	0 %	25 %	165933256
16563	NC_010263	AAT	2	6	652572	652577	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
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16569	NC_010263	CGG	2	6	652916	652921	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933256
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16573	NC_010263	TAA	2	6	652974	652979	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933256
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16580	NC_010263	A	6	6	653435	653440	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16581	NC_010263	A	7	7	653479	653485	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16582	NC_010263	AAAT	2	8	653488	653495	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
16583	NC_010263	TTTAA	2	10	653502	653511	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
16584	NC_010263	AAC	2	6	653590	653595	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16585	NC_010263	TAAT	2	8	653630	653637	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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16589	NC_010263	A	6	6	654006	654011	100 %	0 %	0 %	0 %	165933257
16590	NC_010263	AGA	3	9	654022	654030	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933257
16591	NC_010263	AAAAGA	2	12	654031	654042	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	165933257
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16593	NC_010263	ATA	2	6	654165	654170	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933257
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16600	NC_010263	TA	3	6	654587	654592	50 %	50 %	0 %	0 %	165933257
16601	NC_010263	TGG	2	6	654598	654603	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933257
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16607	NC_010263	ACA	2	6	654761	654766	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933257
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16609	NC_010263	ACA	2	6	654796	654801	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933257
16610	NC_010263	ACC	2	6	654805	654810	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933257
16611	NC_010263	CTA	2	6	654819	654824	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933257
16612	NC_010263	ACCA	2	8	654825	654832	50 %	0 %	0 %	50 %	165933257
16613	NC_010263	TCT	2	6	654883	654888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933257
16614	NC_010263	GCA	2	6	654912	654917	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933257
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16617	NC_010263	AGC	2	6	654997	655002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933257
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16620	NC_010263	A	6	6	655144	655149	100 %	0 %	0 %	0 %	165933257
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16998	NC_010263	CGG	2	6	670256	670261	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165933269
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