MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14501	NC_010263	T	8	8	569016	569023	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14502	NC_010263	A	6	6	569024	569029	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14503	NC_010263	CTT	2	6	569046	569051	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14504	NC_010263	T	7	7	569102	569108	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14505	NC_010263	ATA	2	6	569171	569176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14506	NC_010263	TA	3	6	569188	569193	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14507	NC_010263	AT	3	6	569247	569252	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14508	NC_010263	AATT	2	8	569272	569279	50 %	50 %	0 %	0 %	165933166
14509	NC_010263	TTGTTA	2	12	569310	569321	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	165933166
14510	NC_010263	A	6	6	569365	569370	100 %	0 %	0 %	0 %	165933166
14511	NC_010263	TA	4	8	569449	569456	50 %	50 %	0 %	0 %	165933166
14512	NC_010263	A	6	6	569564	569569	100 %	0 %	0 %	0 %	165933166
14513	NC_010263	ATG	2	6	569586	569591	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933166
14514	NC_010263	ATA	2	6	569595	569600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933166
14515	NC_010263	TGAT	2	8	569685	569692	25 %	50 %	25 %	0 %	165933166
14516	NC_010263	A	6	6	569766	569771	100 %	0 %	0 %	0 %	165933166
14517	NC_010263	TTG	2	6	569772	569777	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933166
14518	NC_010263	ATT	2	6	569800	569805	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933166
14519	NC_010263	ATA	2	6	569844	569849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933166
14520	NC_010263	G	6	6	569874	569879	0 %	0 %	100 %	0 %	165933166
14521	NC_010263	GCTT	2	8	569890	569897	0 %	50 %	25 %	25 %	165933166
14522	NC_010263	TGC	2	6	569923	569928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933166
14523	NC_010263	AGA	2	6	569998	570003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933166
14524	NC_010263	TAATA	2	10	570010	570019	60 %	40 %	0 %	0 %	165933166
14525	NC_010263	ATT	2	6	570057	570062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933166
14526	NC_010263	AAT	2	6	570069	570074	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933166
14527	NC_010263	GTA	2	6	570087	570092	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933167
14528	NC_010263	ATA	2	6	570129	570134	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933167
14529	NC_010263	A	6	6	570137	570142	100 %	0 %	0 %	0 %	165933167
14530	NC_010263	AGC	2	6	570200	570205	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933167
14531	NC_010263	CAAG	2	8	570213	570220	50 %	0 %	25 %	25 %	165933167
14532	NC_010263	A	8	8	570240	570247	100 %	0 %	0 %	0 %	165933167
14533	NC_010263	ATT	2	6	570264	570269	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933167
14534	NC_010263	TTA	2	6	570354	570359	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933167
14535	NC_010263	TAC	2	6	570366	570371	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933167
14536	NC_010263	AGTA	2	8	570437	570444	50 %	25 %	25 %	0 %	165933167
14537	NC_010263	TAT	2	6	570512	570517	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933167
14538	NC_010263	AGCAG	2	10	570563	570572	40 %	0 %	40 %	20 %	165933167
14539	NC_010263	AGT	2	6	570605	570610	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933167
14540	NC_010263	GAT	2	6	570750	570755	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933167
14541	NC_010263	TGA	2	6	570824	570829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933167
14542	NC_010263	ATA	2	6	570859	570864	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933167
14543	NC_010263	AATT	2	8	570985	570992	50 %	50 %	0 %	0 %	165933167
14544	NC_010263	GCA	2	6	571053	571058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933167
14545	NC_010263	AAGAA	2	10	571085	571094	80 %	0 %	20 %	0 %	165933167
14546	NC_010263	GCA	2	6	571098	571103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933167
14547	NC_010263	AAG	2	6	571114	571119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933167
14548	NC_010263	A	6	6	571146	571151	100 %	0 %	0 %	0 %	165933167
14549	NC_010263	TTA	2	6	571173	571178	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933167
14550	NC_010263	AAT	3	9	571185	571193	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933167
14551	NC_010263	TGG	2	6	571270	571275	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933167
14552	NC_010263	AGA	2	6	571280	571285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933167
14553	NC_010263	TTG	2	6	571332	571337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14554	NC_010263	GTC	2	6	571352	571357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14555	NC_010263	GAG	2	6	571363	571368	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
14556	NC_010263	A	7	7	571401	571407	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14557	NC_010263	TCA	2	6	571440	571445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14558	NC_010263	CAA	2	6	571490	571495	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14559	NC_010263	A	6	6	571528	571533	100 %	0 %	0 %	0 %	165933168
14560	NC_010263	CAAAAA	2	12	571535	571546	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	165933168
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14562	NC_010263	TTA	2	6	571601	571606	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933168
14563	NC_010263	A	6	6	571682	571687	100 %	0 %	0 %	0 %	165933168
14564	NC_010263	ATA	2	6	571763	571768	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933168
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14566	NC_010263	TGC	2	6	571816	571821	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933168
14567	NC_010263	GAG	2	6	571895	571900	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165933168
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14570	NC_010263	TTA	2	6	572063	572068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933168
14571	NC_010263	TCGGAT	2	12	572156	572167	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	165933168
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14574	NC_010263	ATA	2	6	572496	572501	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933168
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14576	NC_010263	GAAAT	2	10	572599	572608	60 %	20 %	20 %	0 %	165933168
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14582	NC_010263	GA	3	6	573032	573037	50 %	0 %	50 %	0 %	165933169
14583	NC_010263	GAT	2	6	573061	573066	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933169
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14588	NC_010263	AG	3	6	573256	573261	50 %	0 %	50 %	0 %	165933169
14589	NC_010263	A	6	6	573273	573278	100 %	0 %	0 %	0 %	165933169
14590	NC_010263	ATT	2	6	573306	573311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933169
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14593	NC_010263	CGA	2	6	573456	573461	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933169
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14599	NC_010263	GCT	2	6	573673	573678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933169
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14602	NC_010263	A	6	6	573908	573913	100 %	0 %	0 %	0 %	165933169
14603	NC_010263	TTA	2	6	573971	573976	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933169
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14607	NC_010263	AG	3	6	574089	574094	50 %	0 %	50 %	0 %	165933169
14608	NC_010263	ATA	3	9	574121	574129	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933169
14609	NC_010263	AG	3	6	574135	574140	50 %	0 %	50 %	0 %	165933169
14610	NC_010263	ATG	2	6	574187	574192	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933169
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14617	NC_010263	T	7	7	574371	574377	0 %	100 %	0 %	0 %	165933169
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14992	NC_010263	TTTTA	2	10	590097	590106	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
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