MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
14001	NC_010263	ATC	2	6	549673	549678	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933141
14002	NC_010263	AT	3	6	549693	549698	50 %	50 %	0 %	0 %	165933141
14003	NC_010263	CAA	2	6	549755	549760	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933141
14004	NC_010263	AT	3	6	549868	549873	50 %	50 %	0 %	0 %	165933141
14005	NC_010263	ATA	2	6	549911	549916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933141
14006	NC_010263	CCG	3	9	549925	549933	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933141
14007	NC_010263	AAAG	2	8	549942	549949	75 %	0 %	25 %	0 %	165933141
14008	NC_010263	CCA	2	6	549991	549996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933141
14009	NC_010263	ATT	2	6	550015	550020	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933141
14010	NC_010263	AGG	2	6	550209	550214	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165933141
14011	NC_010263	CAA	2	6	550247	550252	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933141
14012	NC_010263	AAAAG	2	10	550270	550279	80 %	0 %	20 %	0 %	165933141
14013	NC_010263	TAG	2	6	550287	550292	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933141
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14015	NC_010263	TA	3	6	550439	550444	50 %	50 %	0 %	0 %	165933141
14016	NC_010263	GCC	2	6	550470	550475	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933141
14017	NC_010263	A	6	6	550583	550588	100 %	0 %	0 %	0 %	165933141
14018	NC_010263	GTG	2	6	550614	550619	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165933141
14019	NC_010263	GTA	2	6	550639	550644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933141
14020	NC_010263	ATT	3	9	550657	550665	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933142
14021	NC_010263	AATCCC	2	12	550732	550743	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	165933142
14022	NC_010263	TCA	2	6	550776	550781	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933142
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14024	NC_010263	ATACT	2	10	550816	550825	40 %	40 %	0 %	20 %	165933142
14025	NC_010263	ATAGCA	2	12	550833	550844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	165933142
14026	NC_010263	CTC	2	6	550879	550884	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933142
14027	NC_010263	AT	3	6	551043	551048	50 %	50 %	0 %	0 %	165933142
14028	NC_010263	A	6	6	551050	551055	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
14029	NC_010263	TAGTTT	2	12	551066	551077	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
14030	NC_010263	CTG	2	6	551116	551121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14031	NC_010263	ATC	2	6	551123	551128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14032	NC_010263	ACT	2	6	551129	551134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14033	NC_010263	TAA	2	6	551135	551140	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14034	NC_010263	TAT	2	6	551204	551209	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14035	NC_010263	TTAG	2	8	551237	551244	25 %	50 %	25 %	0 %	165933143
14036	NC_010263	CTT	2	6	551258	551263	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933143
14037	NC_010263	TACT	2	8	551317	551324	25 %	50 %	0 %	25 %	165933143
14038	NC_010263	GATG	2	8	551353	551360	25 %	25 %	50 %	0 %	165933143
14039	NC_010263	T	6	6	551396	551401	0 %	100 %	0 %	0 %	165933143
14040	NC_010263	GTA	2	6	551517	551522	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933143
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14042	NC_010263	AT	4	8	551633	551640	50 %	50 %	0 %	0 %	165933143
14043	NC_010263	CTA	2	6	551662	551667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933143
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14049	NC_010263	T	6	6	551820	551825	0 %	100 %	0 %	0 %	165933143
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14054	NC_010263	A	6	6	552006	552011	100 %	0 %	0 %	0 %	165933143
14055	NC_010263	CTG	2	6	552106	552111	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933143
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14058	NC_010263	TAA	2	6	552169	552174	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933143
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14060	NC_010263	TAA	2	6	552277	552282	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14061	NC_010263	ATTT	2	8	552369	552376	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
14062	NC_010263	CAG	2	6	552411	552416	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14063	NC_010263	TTTAG	2	10	552458	552467	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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14065	NC_010263	TTG	2	6	552517	552522	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14066	NC_010263	T	6	6	552547	552552	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14067	NC_010263	TAA	2	6	552558	552563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14068	NC_010263	GTAAT	2	10	552640	552649	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14069	NC_010263	CAA	2	6	552656	552661	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14070	NC_010263	CTA	2	6	552666	552671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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14072	NC_010263	ATA	2	6	552720	552725	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14073	NC_010263	TAT	2	6	552748	552753	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14074	NC_010263	TAA	2	6	552788	552793	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14075	NC_010263	ATA	2	6	552824	552829	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
14076	NC_010263	TA	3	6	552836	552841	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14077	NC_010263	TAA	2	6	552845	552850	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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14079	NC_010263	AAGA	2	8	552882	552889	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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14081	NC_010263	TA	3	6	552931	552936	50 %	50 %	0 %	0 %	165933144
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14094	NC_010263	AGT	3	9	553212	553220	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933144
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14105	NC_010263	TCG	2	6	553528	553533	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933144
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14107	NC_010263	ATGCTT	2	12	553610	553621	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	165933144
14108	NC_010263	TAA	2	6	553670	553675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933144
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14110	NC_010263	AATAT	2	10	553757	553766	60 %	40 %	0 %	0 %	165933144
14111	NC_010263	AAT	2	6	553795	553800	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933144
14112	NC_010263	T	7	7	553807	553813	0 %	100 %	0 %	0 %	165933144
14113	NC_010263	CTTA	2	8	553842	553849	25 %	50 %	0 %	25 %	165933144
14114	NC_010263	TTC	2	6	553875	553880	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933144
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14116	NC_010263	TA	3	6	553965	553970	50 %	50 %	0 %	0 %	165933144
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14123	NC_010263	TGT	2	6	554393	554398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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14368	NC_010263	ACATA	2	10	563237	563246	60 %	20 %	0 %	20 %	165933157
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14499	NC_010263	TA	3	6	568879	568884	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14500	NC_010263	ATA	2	6	568965	568970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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