MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
13001	NC_010263	TTG	2	6	510722	510727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13002	NC_010263	AATTA	2	10	510821	510830	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
13003	NC_010263	GCT	2	6	510836	510841	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
13004	NC_010263	TTC	2	6	510863	510868	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13005	NC_010263	AGA	3	9	510896	510904	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13006	NC_010263	TGT	2	6	510942	510947	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13007	NC_010263	TGAA	2	8	511003	511010	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
13008	NC_010263	GTA	2	6	511131	511136	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933098
13009	NC_010263	ATTT	2	8	511170	511177	25 %	75 %	0 %	0 %	165933098
13010	NC_010263	ATA	2	6	511191	511196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933098
13011	NC_010263	TTGTTA	2	12	511205	511216	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	165933098
13012	NC_010263	CCT	2	6	511242	511247	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165933098
13013	NC_010263	TAT	2	6	511263	511268	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933098
13014	NC_010263	AAC	2	6	511272	511277	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933098
13015	NC_010263	ATT	2	6	511307	511312	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13016	NC_010263	TA	3	6	511341	511346	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13017	NC_010263	CTT	2	6	511399	511404	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13018	NC_010263	T	6	6	511407	511412	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13019	NC_010263	AAAT	2	8	511421	511428	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13020	NC_010263	CTT	2	6	511479	511484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13021	NC_010263	CAT	2	6	511555	511560	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13022	NC_010263	TTTCA	2	10	511568	511577	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
13023	NC_010263	T	6	6	511603	511608	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13024	NC_010263	TC	3	6	511613	511618	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13025	NC_010263	TGT	2	6	511648	511653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13026	NC_010263	A	6	6	511659	511664	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13027	NC_010263	TGA	2	6	511747	511752	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13028	NC_010263	ATT	2	6	511761	511766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13029	NC_010263	TTA	2	6	511795	511800	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13030	NC_010263	TTC	2	6	511803	511808	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13031	NC_010263	ATT	2	6	511809	511814	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13032	NC_010263	ATT	2	6	511858	511863	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13033	NC_010263	TCT	2	6	511864	511869	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13034	NC_010263	TTG	2	6	511890	511895	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13035	NC_010263	GT	3	6	511899	511904	0 %	50 %	50 %	0 %	165933099
13036	NC_010263	T	6	6	511918	511923	0 %	100 %	0 %	0 %	165933099
13037	NC_010263	T	6	6	511937	511942	0 %	100 %	0 %	0 %	165933099
13038	NC_010263	AAC	2	6	511982	511987	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933099
13039	NC_010263	TTC	2	6	511988	511993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933099
13040	NC_010263	T	6	6	512184	512189	0 %	100 %	0 %	0 %	165933100
13041	NC_010263	AAAT	2	8	512190	512197	75 %	25 %	0 %	0 %	165933100
13042	NC_010263	TTG	3	9	512249	512257	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933100
13043	NC_010263	TTA	2	6	512296	512301	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933100
13044	NC_010263	ATT	2	6	512357	512362	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933100
13045	NC_010263	T	6	6	512373	512378	0 %	100 %	0 %	0 %	165933100
13046	NC_010263	TAAA	2	8	512381	512388	75 %	25 %	0 %	0 %	165933100
13047	NC_010263	TTA	2	6	512395	512400	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933100
13048	NC_010263	ATTC	2	8	512410	512417	25 %	50 %	0 %	25 %	165933100
13049	NC_010263	TAA	2	6	512442	512447	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13050	NC_010263	TAA	2	6	512492	512497	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13051	NC_010263	AAT	2	6	512542	512547	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13052	NC_010263	ATTT	2	8	512559	512566	25 %	75 %	0 %	0 %	165933101
13053	NC_010263	T	6	6	512582	512587	0 %	100 %	0 %	0 %	165933101
13054	NC_010263	CTT	2	6	512662	512667	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933101
13055	NC_010263	ATA	2	6	512676	512681	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933101
13056	NC_010263	ATA	2	6	512804	512809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933101
13057	NC_010263	CAA	2	6	512833	512838	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933101
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13059	NC_010263	ATT	2	6	512868	512873	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933101
13060	NC_010263	T	6	6	512872	512877	0 %	100 %	0 %	0 %	165933101
13061	NC_010263	CCG	2	6	512979	512984	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933101
13062	NC_010263	TGA	2	6	513050	513055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933101
13063	NC_010263	CTTT	2	8	513102	513109	0 %	75 %	0 %	25 %	165933101
13064	NC_010263	T	6	6	513176	513181	0 %	100 %	0 %	0 %	165933101
13065	NC_010263	TGC	2	6	513188	513193	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933101
13066	NC_010263	ATA	2	6	513204	513209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933101
13067	NC_010263	TAA	2	6	513271	513276	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933101
13068	NC_010263	ACC	2	6	513455	513460	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165933101
13069	NC_010263	TGT	2	6	513495	513500	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933101
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13071	NC_010263	AT	3	6	513635	513640	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13072	NC_010263	TAA	2	6	513683	513688	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13073	NC_010263	A	8	8	513696	513703	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13074	NC_010263	TAA	2	6	513728	513733	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13075	NC_010263	A	6	6	514007	514012	100 %	0 %	0 %	0 %	165933102
13076	NC_010263	TAG	2	6	514043	514048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933102
13077	NC_010263	ATT	2	6	514057	514062	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13078	NC_010263	TAA	2	6	514157	514162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933103
13079	NC_010263	A	6	6	514172	514177	100 %	0 %	0 %	0 %	165933103
13080	NC_010263	AG	3	6	514179	514184	50 %	0 %	50 %	0 %	165933103
13081	NC_010263	AT	3	6	514189	514194	50 %	50 %	0 %	0 %	165933103
13082	NC_010263	AAG	2	6	514202	514207	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933103
13083	NC_010263	AT	3	6	514222	514227	50 %	50 %	0 %	0 %	165933103
13084	NC_010263	A	6	6	514248	514253	100 %	0 %	0 %	0 %	165933103
13085	NC_010263	TAG	2	6	514275	514280	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933103
13086	NC_010263	ATA	2	6	514297	514302	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933103
13087	NC_010263	TTA	2	6	514352	514357	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13088	NC_010263	ATT	2	6	514384	514389	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933104
13089	NC_010263	TA	3	6	514414	514419	50 %	50 %	0 %	0 %	165933104
13090	NC_010263	AGT	2	6	514484	514489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933104
13091	NC_010263	A	6	6	514603	514608	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13092	NC_010263	T	7	7	514613	514619	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13093	NC_010263	T	7	7	514627	514633	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13094	NC_010263	AATA	2	8	514634	514641	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
13095	NC_010263	TTG	2	6	514693	514698	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13096	NC_010263	ATT	3	9	514763	514771	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13097	NC_010263	CAA	2	6	514838	514843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13098	NC_010263	GCAA	2	8	514927	514934	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
13099	NC_010263	ATC	2	6	514970	514975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933105
13100	NC_010263	TTA	2	6	514976	514981	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933105
13101	NC_010263	ATA	2	6	515016	515021	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13102	NC_010263	ATA	2	6	515030	515035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13103	NC_010263	TATG	2	8	515067	515074	25 %	50 %	25 %	0 %	165933105
13104	NC_010263	TGAAT	2	10	515100	515109	40 %	40 %	20 %	0 %	165933105
13105	NC_010263	AT	3	6	515195	515200	50 %	50 %	0 %	0 %	165933105
13106	NC_010263	CCG	2	6	515264	515269	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	165933105
13107	NC_010263	TGAA	2	8	515346	515353	50 %	25 %	25 %	0 %	165933105
13108	NC_010263	CAT	2	6	515377	515382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933105
13109	NC_010263	ACT	2	6	515431	515436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933105
13110	NC_010263	ACTA	2	8	515449	515456	50 %	25 %	0 %	25 %	165933105
13111	NC_010263	A	7	7	515475	515481	100 %	0 %	0 %	0 %	165933105
13112	NC_010263	AAG	2	6	515590	515595	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933105
13113	NC_010263	ATT	2	6	515627	515632	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933105
13114	NC_010263	AT	3	6	515661	515666	50 %	50 %	0 %	0 %	165933105
13115	NC_010263	TAA	2	6	515772	515777	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13116	NC_010263	TAA	2	6	515827	515832	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13117	NC_010263	ATAA	2	8	515854	515861	75 %	25 %	0 %	0 %	165933105
13118	NC_010263	A	6	6	515905	515910	100 %	0 %	0 %	0 %	165933105
13119	NC_010263	CTT	2	6	515928	515933	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933105
13120	NC_010263	ATA	2	6	516005	516010	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13121	NC_010263	ATA	2	6	516015	516020	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933105
13122	NC_010263	ATT	2	6	516041	516046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933105
13123	NC_010263	GAA	2	6	516066	516071	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933105
13124	NC_010263	TTAA	2	8	516086	516093	50 %	50 %	0 %	0 %	165933105
13125	NC_010263	TCGGGA	2	12	516095	516106	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	165933105
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13127	NC_010263	AAATA	2	10	516127	516136	80 %	20 %	0 %	0 %	165933105
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13499	NC_010263	GTA	2	6	531201	531206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933121
13500	NC_010263	TAT	2	6	531209	531214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding

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