MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
11001	NC_010263	ATT	2	6	432964	432969	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933012
11002	NC_010263	TCT	2	6	432973	432978	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165933012
11003	NC_010263	ATT	2	6	432987	432992	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933012
11004	NC_010263	AAT	2	6	433001	433006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933012
11005	NC_010263	CAATAA	2	12	433199	433210	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	165933012
11006	NC_010263	ATT	3	9	433212	433220	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933012
11007	NC_010263	T	7	7	433219	433225	0 %	100 %	0 %	0 %	165933012
11008	NC_010263	TA	3	6	433249	433254	50 %	50 %	0 %	0 %	165933012
11009	NC_010263	ATT	2	6	433258	433263	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933012
11010	NC_010263	AAT	2	6	433293	433298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11011	NC_010263	CGT	2	6	433350	433355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933013
11012	NC_010263	CGCTC	2	10	433391	433400	0 %	20 %	20 %	60 %	165933013
11013	NC_010263	TTAA	2	8	433478	433485	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11014	NC_010263	TAT	2	6	433509	433514	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933014
11015	NC_010263	ACA	2	6	433540	433545	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	165933014
11016	NC_010263	A	6	6	433557	433562	100 %	0 %	0 %	0 %	165933014
11017	NC_010263	GAA	2	6	433567	433572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933014
11018	NC_010263	AGC	2	6	433581	433586	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933014
11019	NC_010263	ATA	2	6	433655	433660	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933014
11020	NC_010263	ATT	2	6	433663	433668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933014
11021	NC_010263	ATG	2	6	433819	433824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933014
11022	NC_010263	TTG	2	6	433826	433831	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933014
11023	NC_010263	AT	3	6	433844	433849	50 %	50 %	0 %	0 %	165933014
11024	NC_010263	AAT	2	6	433888	433893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933014
11025	NC_010263	GCA	2	6	433897	433902	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933014
11026	NC_010263	AAT	2	6	433960	433965	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933014
11027	NC_010263	CTG	2	6	433970	433975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933014
11028	NC_010263	TG	3	6	434015	434020	0 %	50 %	50 %	0 %	165933014
11029	NC_010263	ATA	2	6	434033	434038	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933014
11030	NC_010263	CTA	2	6	434065	434070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933015
11031	NC_010263	ACT	2	6	434073	434078	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933015
11032	NC_010263	A	6	6	434082	434087	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11033	NC_010263	TGAA	2	8	434119	434126	50 %	25 %	25 %	0 %	165933015
11034	NC_010263	A	6	6	434160	434165	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11035	NC_010263	GTC	2	6	434194	434199	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933015
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11037	NC_010263	ACG	2	6	434291	434296	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933015
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11039	NC_010263	A	6	6	434422	434427	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11040	NC_010263	GA	3	6	434475	434480	50 %	0 %	50 %	0 %	165933015
11041	NC_010263	TAG	2	6	434494	434499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11042	NC_010263	TAG	2	6	434510	434515	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11043	NC_010263	A	6	6	434539	434544	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11044	NC_010263	TGA	2	6	434561	434566	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11045	NC_010263	GAAATT	2	12	434571	434582	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	165933015
11046	NC_010263	TAC	2	6	434594	434599	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933015
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11050	NC_010263	TAT	3	9	434741	434749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933015
11051	NC_010263	GAA	2	6	434754	434759	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933015
11052	NC_010263	A	6	6	434782	434787	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11053	NC_010263	ATG	2	6	434818	434823	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11054	NC_010263	TGA	2	6	434837	434842	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11055	NC_010263	A	6	6	434879	434884	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11056	NC_010263	AG	3	6	434898	434903	50 %	0 %	50 %	0 %	165933015
11057	NC_010263	ACG	2	6	434940	434945	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165933015
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11059	NC_010263	TATT	2	8	434986	434993	25 %	75 %	0 %	0 %	165933015
11060	NC_010263	TTA	2	6	435030	435035	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933015
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11062	NC_010263	GAT	2	6	435090	435095	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
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11064	NC_010263	ACGT	2	8	435166	435173	25 %	25 %	25 %	25 %	165933015
11065	NC_010263	TGC	2	6	435182	435187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165933015
11066	NC_010263	ATACT	2	10	435265	435274	40 %	40 %	0 %	20 %	165933015
11067	NC_010263	A	7	7	435324	435330	100 %	0 %	0 %	0 %	165933015
11068	NC_010263	GAT	2	6	435339	435344	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
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11070	NC_010263	GTA	2	6	435407	435412	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933015
11071	NC_010263	TCAA	2	8	435419	435426	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
11072	NC_010263	TCA	2	6	435450	435455	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11073	NC_010263	TTA	2	6	435504	435509	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11074	NC_010263	TAG	2	6	435556	435561	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11075	NC_010263	AGT	2	6	435649	435654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933016
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11078	NC_010263	AAG	2	6	435726	435731	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933016
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11080	NC_010263	TTG	2	6	435965	435970	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933016
11081	NC_010263	CTC	2	6	436022	436027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
11082	NC_010263	AAGCT	2	10	436031	436040	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
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11087	NC_010263	ACTA	2	8	436199	436206	50 %	25 %	0 %	25 %	165933017
11088	NC_010263	GTA	2	6	436234	436239	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933017
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11091	NC_010263	GATTT	2	10	436445	436454	20 %	60 %	20 %	0 %	165933018
11092	NC_010263	GAA	2	6	436516	436521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933018
11093	NC_010263	AT	3	6	436527	436532	50 %	50 %	0 %	0 %	165933018
11094	NC_010263	GTT	2	6	436620	436625	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933018
11095	NC_010263	TATGC	2	10	436633	436642	20 %	40 %	20 %	20 %	165933018
11096	NC_010263	TGAA	2	8	436667	436674	50 %	25 %	25 %	0 %	165933018
11097	NC_010263	TAAA	2	8	436679	436686	75 %	25 %	0 %	0 %	165933018
11098	NC_010263	TGCT	2	8	436736	436743	0 %	50 %	25 %	25 %	165933018
11099	NC_010263	TAA	2	6	436815	436820	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933018
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11101	NC_010263	AT	3	6	436968	436973	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
11102	NC_010263	GAT	2	6	436978	436983	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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11104	NC_010263	TTA	2	6	437038	437043	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933019
11105	NC_010263	ATTT	2	8	437076	437083	25 %	75 %	0 %	0 %	165933019
11106	NC_010263	TAA	2	6	437150	437155	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11107	NC_010263	GAA	2	6	437205	437210	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165933020
11108	NC_010263	AT	3	6	437219	437224	50 %	50 %	0 %	0 %	165933020
11109	NC_010263	TAG	2	6	437282	437287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933020
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11111	NC_010263	CTA	2	6	437326	437331	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165933020
11112	NC_010263	A	7	7	437333	437339	100 %	0 %	0 %	0 %	165933020
11113	NC_010263	ATA	2	6	437373	437378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165933020
11114	NC_010263	A	6	6	437426	437431	100 %	0 %	0 %	0 %	165933021
11115	NC_010263	TA	3	6	437481	437486	50 %	50 %	0 %	0 %	165933021
11116	NC_010263	TGT	2	6	437503	437508	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165933021
11117	NC_010263	ATT	2	6	437521	437526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165933021
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11119	NC_010263	GTA	2	6	437567	437572	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165933021
11120	NC_010263	AAGA	2	8	437588	437595	75 %	0 %	25 %	0 %	165933021
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11488	NC_010263	T	6	6	451627	451632	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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11499	NC_010263	A	9	9	451959	451967	100 %	0 %	0 %	0 %	165933034
11500	NC_010263	TA	3	6	451972	451977	50 %	50 %	0 %	0 %	165933034

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