MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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9002	NC_010263	TAA	3	9	353923	353931	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932927
9003	NC_010263	AATA	2	8	353949	353956	75 %	25 %	0 %	0 %	165932927
9004	NC_010263	AAG	2	6	354010	354015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932927
9005	NC_010263	TGA	2	6	354047	354052	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932927
9006	NC_010263	GAC	2	6	354115	354120	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9007	NC_010263	TTA	2	6	354138	354143	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9008	NC_010263	GCT	2	6	354171	354176	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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9010	NC_010263	A	6	6	354233	354238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9011	NC_010263	AAG	2	6	354284	354289	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932928
9012	NC_010263	GAT	2	6	354291	354296	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932928
9013	NC_010263	GAC	2	6	354301	354306	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932928
9014	NC_010263	AGC	2	6	354447	354452	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932928
9015	NC_010263	AGC	2	6	354600	354605	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932928
9016	NC_010263	AGTAG	2	10	354607	354616	40 %	20 %	40 %	0 %	165932928
9017	NC_010263	AGT	2	6	354672	354677	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932928
9018	NC_010263	GCA	2	6	354691	354696	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932928
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9021	NC_010263	AG	3	6	354835	354840	50 %	0 %	50 %	0 %	165932928
9022	NC_010263	GTA	2	6	354842	354847	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932928
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9029	NC_010263	GAA	2	6	355018	355023	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932928
9030	NC_010263	T	6	6	355030	355035	0 %	100 %	0 %	0 %	165932928
9031	NC_010263	AAG	2	6	355073	355078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932928
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9034	NC_010263	TTA	2	6	355209	355214	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932928
9035	NC_010263	T	6	6	355238	355243	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9036	NC_010263	CTCG	2	8	355439	355446	0 %	25 %	25 %	50 %	165932929
9037	NC_010263	TA	3	6	355455	355460	50 %	50 %	0 %	0 %	165932929
9038	NC_010263	GTT	2	6	355544	355549	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932929
9039	NC_010263	TA	3	6	355613	355618	50 %	50 %	0 %	0 %	165932929
9040	NC_010263	TCT	2	6	355654	355659	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932929
9041	NC_010263	CTG	2	6	355682	355687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932929
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9058	NC_010263	ATC	2	6	356661	356666	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932929
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9066	NC_010263	TAT	2	6	357228	357233	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9075	NC_010263	CAT	2	6	357610	357615	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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9082	NC_010263	TAAT	2	8	357763	357770	50 %	50 %	0 %	0 %	165932931
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9089	NC_010263	TTA	3	9	358007	358015	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932932
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9091	NC_010263	TTAT	2	8	358106	358113	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
9092	NC_010263	TAA	2	6	358122	358127	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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9102	NC_010263	AAAAC	2	10	358641	358650	80 %	0 %	0 %	20 %	165932933
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9106	NC_010263	GA	3	6	358818	358823	50 %	0 %	50 %	0 %	165932933
9107	NC_010263	AAG	2	6	358828	358833	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932933
9108	NC_010263	GT	3	6	358870	358875	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
9109	NC_010263	GGT	2	6	358888	358893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9110	NC_010263	ATAAA	2	10	358940	358949	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
9111	NC_010263	AG	3	6	359013	359018	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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