MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
7001	NC_010263	AT	3	6	277150	277155	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7002	NC_010263	TGA	2	6	277161	277166	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7003	NC_010263	CAA	2	6	277169	277174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7004	NC_010263	TAC	2	6	277239	277244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7005	NC_010263	TAT	2	6	277272	277277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7006	NC_010263	TA	3	6	277312	277317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7007	NC_010263	TAT	2	6	277360	277365	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932846
7008	NC_010263	AAG	2	6	277388	277393	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932846
7009	NC_010263	CTT	2	6	277400	277405	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932846
7010	NC_010263	TTA	2	6	277435	277440	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7011	NC_010263	TTG	2	6	277484	277489	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7012	NC_010263	GTC	2	6	277502	277507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7013	NC_010263	AGC	2	6	277514	277519	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7014	NC_010263	TGC	2	6	277559	277564	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7015	NC_010263	A	7	7	277598	277604	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7016	NC_010263	A	6	6	277647	277652	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7017	NC_010263	TAT	2	6	277722	277727	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7018	NC_010263	TAG	2	6	277771	277776	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7019	NC_010263	TAT	2	6	277818	277823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7020	NC_010263	ACC	2	6	277856	277861	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
7021	NC_010263	GGT	2	6	277878	277883	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7022	NC_010263	ATA	2	6	277938	277943	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932847
7023	NC_010263	ATT	2	6	277945	277950	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932847
7024	NC_010263	AGC	2	6	278061	278066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7025	NC_010263	AAT	2	6	278091	278096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7026	NC_010263	AT	3	6	278101	278106	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7027	NC_010263	GTC	2	6	278158	278163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7028	NC_010263	A	6	6	278232	278237	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7029	NC_010263	TA	3	6	278270	278275	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7030	NC_010263	A	6	6	278284	278289	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7031	NC_010263	CAA	2	6	278330	278335	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7032	NC_010263	GCA	2	6	278342	278347	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7033	NC_010263	GAAA	2	8	278401	278408	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
7034	NC_010263	TAT	2	6	278411	278416	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7035	NC_010263	TAT	2	6	278422	278427	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7036	NC_010263	TCT	3	9	278475	278483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932848
7037	NC_010263	AGATG	2	10	278507	278516	40 %	20 %	40 %	0 %	165932848
7038	NC_010263	TATCT	2	10	278521	278530	20 %	60 %	0 %	20 %	165932848
7039	NC_010263	AGTA	2	8	278552	278559	50 %	25 %	25 %	0 %	165932848
7040	NC_010263	CATG	2	8	278618	278625	25 %	25 %	25 %	25 %	165932848
7041	NC_010263	TAA	2	6	278642	278647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932848
7042	NC_010263	GATG	2	8	278798	278805	25 %	25 %	50 %	0 %	165932848
7043	NC_010263	GCG	2	6	278811	278816	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	165932848
7044	NC_010263	GCA	2	6	278817	278822	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932848
7045	NC_010263	GAA	2	6	278922	278927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932848
7046	NC_010263	CGGT	2	8	278989	278996	0 %	25 %	50 %	25 %	165932848
7047	NC_010263	TA	4	8	279052	279059	50 %	50 %	0 %	0 %	165932848
7048	NC_010263	ATA	2	6	279061	279066	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932848
7049	NC_010263	GTT	2	6	279096	279101	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932848
7050	NC_010263	GTA	2	6	279178	279183	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7051	NC_010263	ATT	3	9	279237	279245	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932848
7052	NC_010263	AAGGC	2	10	279270	279279	40 %	0 %	40 %	20 %	165932848
7053	NC_010263	TTG	2	6	279280	279285	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932848
7054	NC_010263	TGA	2	6	279341	279346	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7055	NC_010263	AAAG	2	8	279383	279390	75 %	0 %	25 %	0 %	165932848
7056	NC_010263	AGT	2	6	279404	279409	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7057	NC_010263	TTA	2	6	279457	279462	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932848
7058	NC_010263	TGCT	2	8	279463	279470	0 %	50 %	25 %	25 %	165932848
7059	NC_010263	TGA	2	6	279493	279498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7060	NC_010263	AAG	2	6	279505	279510	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932848
7061	NC_010263	AGT	3	9	279539	279547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7062	NC_010263	TA	3	6	279560	279565	50 %	50 %	0 %	0 %	165932848
7063	NC_010263	ACTA	2	8	279608	279615	50 %	25 %	0 %	25 %	165932848
7064	NC_010263	ATA	2	6	279639	279644	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932848
7065	NC_010263	TAT	2	6	279647	279652	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932848
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7067	NC_010263	TTAAAG	2	12	279955	279966	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	165932848
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7071	NC_010263	TGA	2	6	280154	280159	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7072	NC_010263	GTA	2	6	280186	280191	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7073	NC_010263	TGT	2	6	280204	280209	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932848
7074	NC_010263	TCT	2	6	280210	280215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932848
7075	NC_010263	AGGGTA	2	12	280273	280284	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	165932848
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7082	NC_010263	TAG	2	6	280670	280675	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
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7087	NC_010263	GCGGTA	2	12	280891	280902	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	165932848
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7091	NC_010263	GAT	2	6	281073	281078	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932848
7092	NC_010263	GTCT	2	8	281093	281100	0 %	50 %	25 %	25 %	165932848
7093	NC_010263	CTG	2	6	281116	281121	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932848
7094	NC_010263	AGA	3	9	281126	281134	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932848
7095	NC_010263	TCA	2	6	281265	281270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7096	NC_010263	GAG	2	6	281275	281280	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
7097	NC_010263	TTG	2	6	281284	281289	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7098	NC_010263	CAA	2	6	281362	281367	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7099	NC_010263	AGC	2	6	281377	281382	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7100	NC_010263	ATA	2	6	281409	281414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7101	NC_010263	TTA	2	6	281468	281473	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7102	NC_010263	C	9	9	281499	281507	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
7103	NC_010263	A	9	9	281508	281516	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7104	NC_010263	CT	3	6	281551	281556	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
7105	NC_010263	ATA	2	6	281557	281562	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7106	NC_010263	T	7	7	281604	281610	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7107	NC_010263	ACT	2	6	281611	281616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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7110	NC_010263	TAT	2	6	281738	281743	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932849
7111	NC_010263	TCTA	2	8	281810	281817	25 %	50 %	0 %	25 %	165932849
7112	NC_010263	ATT	2	6	281831	281836	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932849
7113	NC_010263	ATT	2	6	281847	281852	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932849
7114	NC_010263	TGT	2	6	281873	281878	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932849
7115	NC_010263	T	6	6	281908	281913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
7116	NC_010263	ATT	2	6	281917	281922	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7117	NC_010263	TGTT	2	8	281941	281948	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
7118	NC_010263	TA	3	6	281974	281979	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7119	NC_010263	AT	3	6	281981	281986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7120	NC_010263	TTG	2	6	282041	282046	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7121	NC_010263	ATT	2	6	282062	282067	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7122	NC_010263	TAG	2	6	282088	282093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7123	NC_010263	TAT	2	6	282094	282099	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7124	NC_010263	TG	3	6	282123	282128	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7125	NC_010263	ATTGG	2	10	282140	282149	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
7126	NC_010263	TTG	2	6	282188	282193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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