MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
6501	NC_010263	CT	3	6	257801	257806	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6502	NC_010263	TTG	3	9	257807	257815	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6503	NC_010263	TGTT	2	8	257828	257835	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6504	NC_010263	TTA	2	6	257844	257849	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6505	NC_010263	GTT	2	6	257894	257899	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6506	NC_010263	ACA	2	6	257914	257919	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6507	NC_010263	GCT	2	6	257923	257928	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6508	NC_010263	GCA	2	6	257944	257949	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6509	NC_010263	TGT	2	6	257959	257964	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6510	NC_010263	AT	3	6	257995	258000	50 %	50 %	0 %	0 %	165932825
6511	NC_010263	TTAT	2	8	258028	258035	25 %	75 %	0 %	0 %	165932825
6512	NC_010263	ATT	2	6	258072	258077	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932825
6513	NC_010263	TCG	2	6	258130	258135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932825
6514	NC_010263	TTC	2	6	258159	258164	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932825
6515	NC_010263	TCT	2	6	258211	258216	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932825
6516	NC_010263	AT	3	6	258227	258232	50 %	50 %	0 %	0 %	165932825
6517	NC_010263	AGC	2	6	258248	258253	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6518	NC_010263	T	6	6	258311	258316	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6519	NC_010263	ATA	2	6	258317	258322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6520	NC_010263	T	6	6	258354	258359	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6521	NC_010263	AGA	2	6	258362	258367	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6522	NC_010263	TGT	2	6	258434	258439	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6523	NC_010263	TTC	2	6	258449	258454	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6524	NC_010263	AAT	2	6	258456	258461	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6525	NC_010263	TTA	2	6	258573	258578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6526	NC_010263	TTGT	2	8	258581	258588	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
6527	NC_010263	AAGA	2	8	258637	258644	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6528	NC_010263	T	6	6	258646	258651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6529	NC_010263	GTATT	2	10	258661	258670	20 %	60 %	20 %	0 %	165932826
6530	NC_010263	A	6	6	258712	258717	100 %	0 %	0 %	0 %	165932826
6531	NC_010263	AGT	2	6	258723	258728	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932826
6532	NC_010263	TA	3	6	258738	258743	50 %	50 %	0 %	0 %	165932826
6533	NC_010263	ATTG	2	8	258761	258768	25 %	50 %	25 %	0 %	165932826
6534	NC_010263	ATTA	2	8	258775	258782	50 %	50 %	0 %	0 %	165932826
6535	NC_010263	TGTA	2	8	258808	258815	25 %	50 %	25 %	0 %	165932826
6536	NC_010263	GCT	2	6	258858	258863	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6537	NC_010263	AG	4	8	258914	258921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6538	NC_010263	TTA	2	6	258924	258929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6539	NC_010263	AT	3	6	258981	258986	50 %	50 %	0 %	0 %	165932827
6540	NC_010263	ATT	2	6	259035	259040	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932827
6541	NC_010263	TGT	2	6	259048	259053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932827
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6543	NC_010263	T	6	6	259083	259088	0 %	100 %	0 %	0 %	165932827
6544	NC_010263	TTC	2	6	259092	259097	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932827
6545	NC_010263	TCT	2	6	259120	259125	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932827
6546	NC_010263	T	7	7	259164	259170	0 %	100 %	0 %	0 %	165932827
6547	NC_010263	CTA	2	6	259172	259177	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932827
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6549	NC_010263	T	6	6	259302	259307	0 %	100 %	0 %	0 %	165932828
6550	NC_010263	AT	3	6	259314	259319	50 %	50 %	0 %	0 %	165932828
6551	NC_010263	GTT	2	6	259351	259356	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932828
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6554	NC_010263	T	7	7	259435	259441	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6555	NC_010263	TAC	2	6	259462	259467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932829
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6557	NC_010263	AAT	2	6	259505	259510	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932829
6558	NC_010263	TCT	3	9	259564	259572	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932829
6559	NC_010263	AT	3	6	259615	259620	50 %	50 %	0 %	0 %	165932829
6560	NC_010263	CGC	2	6	259666	259671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
6561	NC_010263	TAA	3	9	259687	259695	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6562	NC_010263	A	6	6	259771	259776	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6563	NC_010263	TGT	2	6	259777	259782	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6564	NC_010263	TAT	2	6	259789	259794	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
6565	NC_010263	T	6	6	259848	259853	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6566	NC_010263	TA	3	6	259860	259865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6567	NC_010263	TGA	2	6	259878	259883	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6568	NC_010263	AT	3	6	259933	259938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6569	NC_010263	TAA	2	6	260014	260019	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6570	NC_010263	TGAA	2	8	260100	260107	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
6571	NC_010263	ATA	2	6	260247	260252	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6572	NC_010263	GCA	2	6	260271	260276	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6574	NC_010263	TAT	3	9	260425	260433	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6578	NC_010263	TAG	2	6	260632	260637	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6587	NC_010263	TGAT	2	8	260975	260982	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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6593	NC_010263	AT	3	6	261173	261178	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6594	NC_010263	TTG	2	6	261187	261192	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6603	NC_010263	TAG	2	6	261642	261647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6604	NC_010263	TAG	2	6	261690	261695	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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6610	NC_010263	TAA	2	6	261990	261995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6611	NC_010263	GA	3	6	262012	262017	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6612	NC_010263	GAC	2	6	262181	262186	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6618	NC_010263	TCA	2	6	262406	262411	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6619	NC_010263	ATA	2	6	262427	262432	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6621	NC_010263	TAA	2	6	262454	262459	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6622	NC_010263	A	6	6	262461	262466	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6623	NC_010263	TAA	2	6	262483	262488	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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6626	NC_010263	CTTA	2	8	262557	262564	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
6627	NC_010263	TGC	2	6	262575	262580	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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6629	NC_010263	CTG	2	6	262646	262651	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932830
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