MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia rickettsii str. Iowa chromosome

Total Repeats: 32257

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
5501	NC_010263	GTCAA	2	10	218994	219003	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
5502	NC_010263	TAT	2	6	219013	219018	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5503	NC_010263	TAAA	2	8	219019	219026	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
5504	NC_010263	AATTA	2	10	219084	219093	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
5505	NC_010263	ATT	2	6	219113	219118	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932783
5506	NC_010263	TAA	2	6	219140	219145	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932783
5507	NC_010263	AAAAGC	2	12	219173	219184	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	165932783
5508	NC_010263	T	6	6	219222	219227	0 %	100 %	0 %	0 %	165932783
5509	NC_010263	AGTA	2	8	219233	219240	50 %	25 %	25 %	0 %	165932783
5510	NC_010263	GTTT	2	8	219241	219248	0 %	75 %	25 %	0 %	165932783
5511	NC_010263	TAG	2	6	219254	219259	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932783
5512	NC_010263	TAA	2	6	219280	219285	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932783
5513	NC_010263	AT	3	6	219470	219475	50 %	50 %	0 %	0 %	165932783
5514	NC_010263	ATA	2	6	219495	219500	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932783
5515	NC_010263	TGG	2	6	219566	219571	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	165932783
5516	NC_010263	TAG	2	6	219580	219585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932783
5517	NC_010263	AAAT	2	8	219641	219648	75 %	25 %	0 %	0 %	165932783
5518	NC_010263	TTC	2	6	219667	219672	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932783
5519	NC_010263	TAT	2	6	219686	219691	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932783
5520	NC_010263	CAG	2	6	219693	219698	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932783
5521	NC_010263	AG	3	6	219763	219768	50 %	0 %	50 %	0 %	165932783
5522	NC_010263	AGC	2	6	219791	219796	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932783
5523	NC_010263	AAGT	2	8	219815	219822	50 %	25 %	25 %	0 %	165932783
5524	NC_010263	AAAT	2	8	219895	219902	75 %	25 %	0 %	0 %	165932783
5525	NC_010263	GAA	2	6	219912	219917	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932783
5526	NC_010263	GAA	2	6	219945	219950	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932783
5527	NC_010263	AAG	2	6	219952	219957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932783
5528	NC_010263	TAA	2	6	219980	219985	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932783
5529	NC_010263	GGA	2	6	220023	220028	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	165932783
5530	NC_010263	TA	3	6	220029	220034	50 %	50 %	0 %	0 %	165932783
5531	NC_010263	TTTA	3	12	220104	220115	25 %	75 %	0 %	0 %	165932784
5532	NC_010263	T	7	7	220153	220159	0 %	100 %	0 %	0 %	165932784
5533	NC_010263	AT	3	6	220322	220327	50 %	50 %	0 %	0 %	165932784
5534	NC_010263	CAT	2	6	220330	220335	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932784
5535	NC_010263	ATT	2	6	220418	220423	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932784
5536	NC_010263	AAT	2	6	220430	220435	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932784
5537	NC_010263	GT	3	6	220530	220535	0 %	50 %	50 %	0 %	165932784
5538	NC_010263	AAGGC	2	10	220538	220547	40 %	0 %	40 %	20 %	165932784
5539	NC_010263	TGC	2	6	220574	220579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	165932785
5540	NC_010263	TTTCTT	2	12	220623	220634	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	165932785
5541	NC_010263	TTTTCT	2	12	220643	220654	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	165932785
5542	NC_010263	AT	3	6	220656	220661	50 %	50 %	0 %	0 %	165932785
5543	NC_010263	TCA	2	6	220719	220724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932785
5544	NC_010263	TGC	2	6	220755	220760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5545	NC_010263	CT	3	6	220783	220788	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
5546	NC_010263	TAT	2	6	220812	220817	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
5547	NC_010263	T	6	6	220819	220824	0 %	100 %	0 %	0 %	319717302
5548	NC_010263	AT	3	6	220842	220847	50 %	50 %	0 %	0 %	319717302
5549	NC_010263	ATC	2	6	220913	220918	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319717302
5550	NC_010263	ATG	2	6	220958	220963	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319717302
5551	NC_010263	A	6	6	221058	221063	100 %	0 %	0 %	0 %	319717302
5552	NC_010263	TAA	2	6	221102	221107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319717302
5553	NC_010263	AATA	2	8	221130	221137	75 %	25 %	0 %	0 %	319717302
5554	NC_010263	ATT	2	6	221164	221169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
5555	NC_010263	GGT	2	6	221183	221188	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	319717302
5556	NC_010263	A	6	6	221307	221312	100 %	0 %	0 %	0 %	319717302
5557	NC_010263	AAT	3	9	221314	221322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	319717302
5558	NC_010263	AGA	2	6	221352	221357	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	319717302
5559	NC_010263	TCA	2	6	221377	221382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	319717302
5560	NC_010263	TAT	2	6	221406	221411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
5561	NC_010263	GGAG	2	8	221421	221428	25 %	0 %	75 %	0 %	319717302
5562	NC_010263	ATG	2	6	221438	221443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	319717302
5563	NC_010263	CTT	2	6	221452	221457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	319717302
5564	NC_010263	AT	3	6	221498	221503	50 %	50 %	0 %	0 %	319717302
5565	NC_010263	CAG	2	6	221516	221521	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	319717302
5566	NC_010263	TTA	2	6	221548	221553	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	319717302
5567	NC_010263	GCT	2	6	221642	221647	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5568	NC_010263	TA	3	6	221750	221755	50 %	50 %	0 %	0 %	165932787
5569	NC_010263	AAT	2	6	221768	221773	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
5570	NC_010263	AAATTA	2	12	221802	221813	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
5571	NC_010263	AAT	2	6	221814	221819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
5572	NC_010263	AGA	2	6	221849	221854	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932787
5573	NC_010263	TAA	2	6	221855	221860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932787
5574	NC_010263	AGT	2	6	221867	221872	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932787
5575	NC_010263	ATT	2	6	221882	221887	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932787
5576	NC_010263	TATT	2	8	221893	221900	25 %	75 %	0 %	0 %	165932787
5577	NC_010263	TTG	2	6	221939	221944	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5578	NC_010263	TG	3	6	221943	221948	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5579	NC_010263	TAT	2	6	222014	222019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5580	NC_010263	CAA	2	6	222085	222090	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5581	NC_010263	AAT	2	6	222102	222107	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5582	NC_010263	CTA	2	6	222132	222137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5583	NC_010263	TAT	2	6	222143	222148	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5584	NC_010263	TTA	2	6	222157	222162	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
5585	NC_010263	CTT	2	6	222166	222171	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932788
5586	NC_010263	AT	3	6	222181	222186	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
5587	NC_010263	TCC	2	6	222229	222234	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	165932788
5588	NC_010263	AGC	3	9	222262	222270	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932788
5589	NC_010263	GCA	2	6	222314	222319	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	165932788
5590	NC_010263	AGT	2	6	222322	222327	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	165932788
5591	NC_010263	TAT	2	6	222364	222369	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
5592	NC_010263	CTT	2	6	222372	222377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932788
5593	NC_010263	CTA	2	6	222417	222422	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
5594	NC_010263	ATA	2	6	222425	222430	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
5595	NC_010263	TAAT	2	8	222441	222448	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
5596	NC_010263	TAA	2	6	222459	222464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
5597	NC_010263	AG	3	6	222507	222512	50 %	0 %	50 %	0 %	165932788
5598	NC_010263	ACC	2	6	222520	222525	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	165932788
5599	NC_010263	TAA	2	6	222556	222561	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
5600	NC_010263	CT	3	6	222652	222657	0 %	50 %	0 %	50 %	165932788
5601	NC_010263	TA	3	6	222676	222681	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
5602	NC_010263	CAT	2	6	222744	222749	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	165932788
5603	NC_010263	AGA	2	6	222775	222780	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	165932788
5604	NC_010263	ATT	2	6	222799	222804	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
5605	NC_010263	T	6	6	222831	222836	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
5606	NC_010263	ATT	3	9	222871	222879	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
5607	NC_010263	T	6	6	222878	222883	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
5608	NC_010263	TTG	2	6	222988	222993	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932788
5609	NC_010263	TTG	2	6	223156	223161	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	165932788
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5611	NC_010263	T	6	6	223346	223351	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
5612	NC_010263	GAAT	2	8	223356	223363	50 %	25 %	25 %	0 %	165932788
5613	NC_010263	AT	3	6	223413	223418	50 %	50 %	0 %	0 %	165932788
5614	NC_010263	T	6	6	223437	223442	0 %	100 %	0 %	0 %	165932788
5615	NC_010263	CTT	2	6	223446	223451	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	165932788
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5621	NC_010263	TAA	2	6	223563	223568	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	165932788
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5625	NC_010263	TAT	2	6	223707	223712	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	165932788
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