MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
48501	NC_010168	GCCC	2	8	2599846	2599853	0 %	0 %	25 %	75 %	163841650
48502	NC_010168	TGG	2	6	2599888	2599893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841650
48503	NC_010168	CGGCA	2	10	2599985	2599994	20 %	0 %	40 %	40 %	163841650
48504	NC_010168	AGA	2	6	2600079	2600084	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841650
48505	NC_010168	GAA	2	6	2600090	2600095	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841650
48506	NC_010168	ACCGA	2	10	2600222	2600231	40 %	0 %	20 %	40 %	163841650
48507	NC_010168	GCG	2	6	2600259	2600264	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841650
48508	NC_010168	TCT	2	6	2600337	2600342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841650
48509	NC_010168	CTT	2	6	2600483	2600488	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841650
48510	NC_010168	GTG	2	6	2600525	2600530	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48511	NC_010168	TGG	2	6	2600573	2600578	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841651
48512	NC_010168	CAAA	2	8	2600654	2600661	75 %	0 %	0 %	25 %	163841651
48513	NC_010168	TGAT	2	8	2600674	2600681	25 %	50 %	25 %	0 %	163841651
48514	NC_010168	TGT	2	6	2600702	2600707	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841651
48515	NC_010168	AGT	2	6	2600714	2600719	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841651
48516	NC_010168	GCA	2	6	2600740	2600745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841651
48517	NC_010168	CGG	2	6	2600753	2600758	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841651
48518	NC_010168	TGC	3	9	2600770	2600778	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841651
48519	NC_010168	TGGC	2	8	2600819	2600826	0 %	25 %	50 %	25 %	163841651
48520	NC_010168	GC	3	6	2600825	2600830	0 %	0 %	50 %	50 %	163841651
48521	NC_010168	GTT	2	6	2600936	2600941	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841651
48522	NC_010168	TTTCG	2	10	2600942	2600951	0 %	60 %	20 %	20 %	163841651
48523	NC_010168	TCG	2	6	2601025	2601030	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841651
48524	NC_010168	AGCT	2	8	2601061	2601068	25 %	25 %	25 %	25 %	163841651
48525	NC_010168	ACT	2	6	2601142	2601147	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841651
48526	NC_010168	GCC	2	6	2601186	2601191	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841651
48527	NC_010168	TGA	2	6	2601232	2601237	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841651
48528	NC_010168	CCA	2	6	2601322	2601327	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841651
48529	NC_010168	GCA	3	9	2601361	2601369	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841651
48530	NC_010168	TCG	2	6	2601429	2601434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841652
48531	NC_010168	CAG	2	6	2601481	2601486	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841652
48532	NC_010168	AAGGC	2	10	2601519	2601528	40 %	0 %	40 %	20 %	163841652
48533	NC_010168	TTCA	2	8	2601811	2601818	25 %	50 %	0 %	25 %	163841652
48534	NC_010168	TGA	2	6	2601909	2601914	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841652
48535	NC_010168	CG	3	6	2601915	2601920	0 %	0 %	50 %	50 %	163841652
48536	NC_010168	ATCG	2	8	2602052	2602059	25 %	25 %	25 %	25 %	163841652
48537	NC_010168	TGG	2	6	2602100	2602105	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841652
48538	NC_010168	CGG	2	6	2602110	2602115	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841652
48539	NC_010168	GGC	2	6	2602121	2602126	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841652
48540	NC_010168	CGC	2	6	2602184	2602189	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841652
48541	NC_010168	ACT	2	6	2602247	2602252	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48542	NC_010168	GAG	2	6	2602260	2602265	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48543	NC_010168	GGCG	2	8	2602400	2602407	0 %	0 %	75 %	25 %	163841653
48544	NC_010168	GCC	2	6	2602425	2602430	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841653
48545	NC_010168	GCAA	2	8	2602451	2602458	50 %	0 %	25 %	25 %	163841653
48546	NC_010168	ATTC	2	8	2602465	2602472	25 %	50 %	0 %	25 %	163841653
48547	NC_010168	TGG	2	6	2602519	2602524	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841653
48548	NC_010168	GTT	2	6	2602539	2602544	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841653
48549	NC_010168	CGA	2	6	2602594	2602599	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841653
48550	NC_010168	GC	3	6	2602602	2602607	0 %	0 %	50 %	50 %	163841653
48551	NC_010168	GC	3	6	2602704	2602709	0 %	0 %	50 %	50 %	163841653
48552	NC_010168	CTG	2	6	2602798	2602803	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841653
48553	NC_010168	CCA	2	6	2602833	2602838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841653
48554	NC_010168	GCA	2	6	2602873	2602878	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841653
48555	NC_010168	CGT	2	6	2603141	2603146	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841653
48556	NC_010168	CTTGG	2	10	2603184	2603193	0 %	40 %	40 %	20 %	163841653
48557	NC_010168	CACGC	2	10	2603204	2603213	20 %	0 %	20 %	60 %	163841653
48558	NC_010168	TCC	2	6	2603218	2603223	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841653
48559	NC_010168	CGG	4	12	2603368	2603379	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841653
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48562	NC_010168	TTCA	2	8	2603627	2603634	25 %	50 %	0 %	25 %	163841654
48563	NC_010168	TGT	2	6	2603658	2603663	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841654
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48565	NC_010168	AT	3	6	2603761	2603766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48566	NC_010168	TGT	2	6	2603774	2603779	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48567	NC_010168	ACG	2	6	2603865	2603870	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841655
48568	NC_010168	CG	3	6	2603939	2603944	0 %	0 %	50 %	50 %	163841656
48569	NC_010168	GGC	2	6	2603959	2603964	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841656
48570	NC_010168	CGT	2	6	2603977	2603982	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841656
48571	NC_010168	GGT	2	6	2603983	2603988	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841656
48572	NC_010168	ACT	2	6	2604063	2604068	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841656
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48574	NC_010168	ACC	2	6	2604116	2604121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841656
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48576	NC_010168	CGT	2	6	2604230	2604235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841656
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48584	NC_010168	GCT	2	6	2604584	2604589	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841657
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48586	NC_010168	CAC	2	6	2604780	2604785	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841657
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48588	NC_010168	GCA	2	6	2604948	2604953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841657
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48590	NC_010168	CGC	2	6	2605163	2605168	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841657
48591	NC_010168	GAC	2	6	2605176	2605181	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841657
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48593	NC_010168	GCC	3	9	2605247	2605255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841657
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48596	NC_010168	CAT	2	6	2605315	2605320	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841657
48597	NC_010168	GCGTA	2	10	2605374	2605383	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
48598	NC_010168	TGA	2	6	2605392	2605397	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841658
48599	NC_010168	GC	3	6	2605452	2605457	0 %	0 %	50 %	50 %	163841658
48600	NC_010168	GCTC	2	8	2605710	2605717	0 %	25 %	25 %	50 %	163841658
48601	NC_010168	GCC	2	6	2605847	2605852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841658
48602	NC_010168	CAC	2	6	2605905	2605910	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841658
48603	NC_010168	ATG	2	6	2605961	2605966	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841658
48604	NC_010168	TCT	2	6	2606020	2606025	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841659
48605	NC_010168	CAC	2	6	2606117	2606122	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841659
48606	NC_010168	GCGCG	2	10	2606164	2606173	0 %	0 %	60 %	40 %	163841659
48607	NC_010168	TGC	2	6	2606199	2606204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841659
48608	NC_010168	CAAT	2	8	2606214	2606221	50 %	25 %	0 %	25 %	163841659
48609	NC_010168	TGC	2	6	2606254	2606259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841659
48610	NC_010168	AGC	2	6	2606429	2606434	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841659
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48612	NC_010168	GCT	2	6	2606472	2606477	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841659
48613	NC_010168	CAG	3	9	2606494	2606502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841659
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48616	NC_010168	GAA	2	6	2606641	2606646	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841659
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48618	NC_010168	AGC	2	6	2606757	2606762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841660
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48621	NC_010168	TCG	2	6	2606878	2606883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841660
48622	NC_010168	ATC	2	6	2606928	2606933	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841660
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48624	NC_010168	GCCGC	2	10	2607007	2607016	0 %	0 %	40 %	60 %	163841660
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48628	NC_010168	CGC	2	6	2607333	2607338	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841660
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48731	NC_010168	CCA	2	6	2612895	2612900	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841667
48732	NC_010168	GCA	2	6	2612904	2612909	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841667
48733	NC_010168	AAC	2	6	2612918	2612923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841667
48734	NC_010168	CGG	2	6	2612976	2612981	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841667
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48738	NC_010168	CAG	2	6	2613243	2613248	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841667
48739	NC_010168	TCA	2	6	2613297	2613302	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841667
48740	NC_010168	GCT	2	6	2613305	2613310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841667
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48743	NC_010168	CTC	2	6	2613447	2613452	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
48744	NC_010168	CAGCT	2	10	2613456	2613465	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48745	NC_010168	ATG	2	6	2613491	2613496	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48746	NC_010168	CGA	2	6	2613579	2613584	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48747	NC_010168	GCC	2	6	2613647	2613652	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
48748	NC_010168	GCG	2	6	2613653	2613658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48749	NC_010168	TCCG	2	8	2613665	2613672	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
48750	NC_010168	GC	3	6	2613732	2613737	0 %	0 %	50 %	50 %	163841668
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48761	NC_010168	CGG	2	6	2614201	2614206	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841668
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48790	NC_010168	GTTA	2	8	2616054	2616061	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
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48842	NC_010168	CGA	2	6	2619010	2619015	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841673
48843	NC_010168	GGC	2	6	2619126	2619131	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841673
48844	NC_010168	TGCGGG	2	12	2619141	2619152	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	163841673
48845	NC_010168	A	6	6	2619219	2619224	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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48847	NC_010168	CTG	2	6	2619312	2619317	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
48848	NC_010168	GT	3	6	2619392	2619397	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
48849	NC_010168	GCG	2	6	2619508	2619513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841674
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48975	NC_010168	TCAG	2	8	2625844	2625851	25 %	25 %	25 %	25 %	163841679
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48999	NC_010168	CAA	2	6	2626651	2626656	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841680
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