MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
47001	NC_010168	ACC	2	6	2520736	2520741	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47002	NC_010168	GCA	2	6	2520807	2520812	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47003	NC_010168	GGA	2	6	2520820	2520825	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841554
47004	NC_010168	ATG	2	6	2520827	2520832	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841554
47005	NC_010168	GAA	2	6	2520841	2520846	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841554
47006	NC_010168	CGG	2	6	2520902	2520907	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841554
47007	NC_010168	ACA	2	6	2520933	2520938	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841554
47008	NC_010168	TCA	2	6	2520972	2520977	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841554
47009	NC_010168	TAA	2	6	2521025	2521030	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841554
47010	NC_010168	TGC	2	6	2521041	2521046	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47011	NC_010168	CAC	2	6	2521105	2521110	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47012	NC_010168	CTG	2	6	2521136	2521141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47013	NC_010168	GC	3	6	2521148	2521153	0 %	0 %	50 %	50 %	163841554
47014	NC_010168	GGC	2	6	2521154	2521159	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841554
47015	NC_010168	CAC	2	6	2521210	2521215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47016	NC_010168	CCA	2	6	2521236	2521241	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47017	NC_010168	GC	3	6	2521245	2521250	0 %	0 %	50 %	50 %	163841554
47018	NC_010168	GCC	2	6	2521279	2521284	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841554
47019	NC_010168	CACT	2	8	2521439	2521446	25 %	25 %	0 %	50 %	163841554
47020	NC_010168	CGG	2	6	2521471	2521476	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841554
47021	NC_010168	GA	3	6	2521490	2521495	50 %	0 %	50 %	0 %	163841554
47022	NC_010168	GCGG	2	8	2521502	2521509	0 %	0 %	75 %	25 %	163841554
47023	NC_010168	GCG	3	9	2521536	2521544	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841554
47024	NC_010168	GCC	2	6	2521580	2521585	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841554
47025	NC_010168	GGAT	2	8	2521776	2521783	25 %	25 %	50 %	0 %	163841554
47026	NC_010168	CAC	2	6	2521789	2521794	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47027	NC_010168	AAT	2	6	2521823	2521828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841554
47028	NC_010168	GCC	2	6	2521915	2521920	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841554
47029	NC_010168	CAA	2	6	2521938	2521943	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841554
47030	NC_010168	AGG	2	6	2521949	2521954	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841554
47031	NC_010168	AGTG	2	8	2522059	2522066	25 %	25 %	50 %	0 %	163841554
47032	NC_010168	GAC	2	6	2522092	2522097	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47033	NC_010168	GGC	2	6	2522098	2522103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841554
47034	NC_010168	AAAGAT	2	12	2522104	2522115	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	163841554
47035	NC_010168	GCCA	2	8	2522117	2522124	25 %	0 %	25 %	50 %	163841554
47036	NC_010168	CCGG	2	8	2522128	2522135	0 %	0 %	50 %	50 %	163841554
47037	NC_010168	GTCA	2	8	2522143	2522150	25 %	25 %	25 %	25 %	163841554
47038	NC_010168	GA	3	6	2522195	2522200	50 %	0 %	50 %	0 %	163841554
47039	NC_010168	AGGT	2	8	2522213	2522220	25 %	25 %	50 %	0 %	163841554
47040	NC_010168	CA	3	6	2522252	2522257	50 %	0 %	0 %	50 %	163841554
47041	NC_010168	TGC	2	6	2522319	2522324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47042	NC_010168	TAC	2	6	2522365	2522370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841554
47043	NC_010168	CGA	2	6	2522388	2522393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47044	NC_010168	TGT	2	6	2522409	2522414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841554
47045	NC_010168	CCA	2	6	2522489	2522494	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841554
47046	NC_010168	CAAGCG	2	12	2522517	2522528	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841554
47047	NC_010168	ACA	2	6	2522541	2522546	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841554
47048	NC_010168	GCTG	2	8	2522575	2522582	0 %	25 %	50 %	25 %	163841554
47049	NC_010168	GTTT	2	8	2522588	2522595	0 %	75 %	25 %	0 %	163841554
47050	NC_010168	ACA	2	6	2522710	2522715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47051	NC_010168	GGC	2	6	2522798	2522803	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47052	NC_010168	CTT	2	6	2522853	2522858	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841555
47053	NC_010168	CTT	2	6	2522871	2522876	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841555
47054	NC_010168	CTT	2	6	2522886	2522891	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841555
47055	NC_010168	GCAACA	2	12	2522893	2522904	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	163841555
47056	NC_010168	CGGT	2	8	2523004	2523011	0 %	25 %	50 %	25 %	163841555
47057	NC_010168	AGCC	2	8	2523025	2523032	25 %	0 %	25 %	50 %	163841555
47058	NC_010168	TCT	2	6	2523044	2523049	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841555
47059	NC_010168	GCG	2	6	2523055	2523060	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841555
47060	NC_010168	GTT	2	6	2523099	2523104	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841555
47061	NC_010168	CTGG	2	8	2523114	2523121	0 %	25 %	50 %	25 %	163841555
47062	NC_010168	GCA	2	6	2523133	2523138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841555
47063	NC_010168	CGA	2	6	2523146	2523151	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841555
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47066	NC_010168	AG	3	6	2523340	2523345	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47067	NC_010168	GCG	2	6	2523363	2523368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47068	NC_010168	CCTG	2	8	2523383	2523390	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47069	NC_010168	GAA	2	6	2523539	2523544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841556
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47071	NC_010168	T	6	6	2523590	2523595	0 %	100 %	0 %	0 %	163841556
47072	NC_010168	GCA	2	6	2523630	2523635	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841556
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47077	NC_010168	CAA	2	6	2523884	2523889	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841556
47078	NC_010168	CTT	2	6	2523970	2523975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841556
47079	NC_010168	TGA	2	6	2524008	2524013	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841556
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47081	NC_010168	TGGC	2	8	2524086	2524093	0 %	25 %	50 %	25 %	163841556
47082	NC_010168	TGC	2	6	2524110	2524115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841556
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47084	NC_010168	GAT	2	6	2524145	2524150	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841556
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47086	NC_010168	CAT	2	6	2524223	2524228	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841556
47087	NC_010168	GGC	2	6	2524251	2524256	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841556
47088	NC_010168	TCG	2	6	2524284	2524289	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841556
47089	NC_010168	CGA	2	6	2524369	2524374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841556
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47094	NC_010168	GCT	2	6	2524499	2524504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841557
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47098	NC_010168	GC	3	6	2524586	2524591	0 %	0 %	50 %	50 %	163841557
47099	NC_010168	AGC	2	6	2524663	2524668	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841557
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47101	NC_010168	GCT	2	6	2524701	2524706	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841557
47102	NC_010168	ATC	2	6	2524735	2524740	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841557
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47108	NC_010168	GCAC	2	8	2525043	2525050	25 %	0 %	25 %	50 %	163841558
47109	NC_010168	AGGGC	2	10	2525086	2525095	20 %	0 %	60 %	20 %	163841558
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47116	NC_010168	TGA	2	6	2525268	2525273	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841558
47117	NC_010168	ATT	2	6	2525306	2525311	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841558
47118	NC_010168	CGAT	2	8	2525325	2525332	25 %	25 %	25 %	25 %	163841558
47119	NC_010168	GCG	2	6	2525351	2525356	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841558
47120	NC_010168	GC	3	6	2525361	2525366	0 %	0 %	50 %	50 %	163841558
47121	NC_010168	GCC	2	6	2525375	2525380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841558
47122	NC_010168	ACG	2	6	2525418	2525423	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841558
47123	NC_010168	GCTG	2	8	2525508	2525515	0 %	25 %	50 %	25 %	163841559
47124	NC_010168	TGG	2	6	2525570	2525575	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841559
47125	NC_010168	GGTG	2	8	2525583	2525590	0 %	25 %	75 %	0 %	163841559
47126	NC_010168	AAC	2	6	2525609	2525614	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841559
47127	NC_010168	T	6	6	2525650	2525655	0 %	100 %	0 %	0 %	163841559
47128	NC_010168	GAT	2	6	2525706	2525711	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841559
47129	NC_010168	CTG	2	6	2525713	2525718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841559
47130	NC_010168	GTG	2	6	2525722	2525727	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841559
47131	NC_010168	TTGC	2	8	2525743	2525750	0 %	50 %	25 %	25 %	163841559
47132	NC_010168	GC	3	6	2525792	2525797	0 %	0 %	50 %	50 %	163841559
47133	NC_010168	ACG	2	6	2525938	2525943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841559
47134	NC_010168	CAT	2	6	2526004	2526009	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47135	NC_010168	ACG	2	6	2526082	2526087	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841560
47136	NC_010168	GCGCC	2	10	2526144	2526153	0 %	0 %	40 %	60 %	163841560
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47141	NC_010168	TGC	2	6	2526477	2526482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841561
47142	NC_010168	CG	3	6	2526518	2526523	0 %	0 %	50 %	50 %	163841561
47143	NC_010168	GGC	2	6	2526583	2526588	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841561
47144	NC_010168	GAC	2	6	2526635	2526640	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841561
47145	NC_010168	CG	3	6	2526669	2526674	0 %	0 %	50 %	50 %	163841561
47146	NC_010168	ACG	2	6	2526681	2526686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841561
47147	NC_010168	GCG	2	6	2526710	2526715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841561
47148	NC_010168	TTGGA	2	10	2526736	2526745	20 %	40 %	40 %	0 %	163841561
47149	NC_010168	CAC	2	6	2526772	2526777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841561
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47151	NC_010168	AGGC	2	8	2526818	2526825	25 %	0 %	50 %	25 %	163841561
47152	NC_010168	AGC	2	6	2526845	2526850	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841561
47153	NC_010168	TGA	2	6	2526939	2526944	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841561
47154	NC_010168	TTG	2	6	2526995	2527000	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841561
47155	NC_010168	ACCG	2	8	2527195	2527202	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47156	NC_010168	GT	3	6	2527314	2527319	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47157	NC_010168	TGG	2	6	2527410	2527415	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841562
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47172	NC_010168	GGGT	2	8	2528129	2528136	0 %	25 %	75 %	0 %	163841563
47173	NC_010168	GGA	2	6	2528169	2528174	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841563
47174	NC_010168	TCA	3	9	2528284	2528292	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841563
47175	NC_010168	CCT	2	6	2528313	2528318	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841563
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47177	NC_010168	ACC	2	6	2528508	2528513	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841563
47178	NC_010168	CCA	2	6	2528543	2528548	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841563
47179	NC_010168	ACT	2	6	2528565	2528570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841563
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47181	NC_010168	AC	3	6	2528630	2528635	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47182	NC_010168	GCG	2	6	2528660	2528665	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47183	NC_010168	GA	3	6	2528673	2528678	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
47184	NC_010168	ATC	2	6	2528702	2528707	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841564
47185	NC_010168	GTT	2	6	2528818	2528823	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841564
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47187	NC_010168	GC	3	6	2528920	2528925	0 %	0 %	50 %	50 %	163841564
47188	NC_010168	TGAT	2	8	2528928	2528935	25 %	50 %	25 %	0 %	163841564
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47190	NC_010168	CGA	2	6	2529061	2529066	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841564
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47192	NC_010168	T	6	6	2529172	2529177	0 %	100 %	0 %	0 %	163841564
47193	NC_010168	GCC	2	6	2529277	2529282	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841565
47194	NC_010168	CGTG	2	8	2529471	2529478	0 %	25 %	50 %	25 %	163841565
47195	NC_010168	CCA	2	6	2529525	2529530	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841565
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47198	NC_010168	ATTGAT	2	12	2529715	2529726	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	163841565
47199	NC_010168	CAAGC	2	10	2529751	2529760	40 %	0 %	20 %	40 %	163841565
47200	NC_010168	GCA	2	6	2529770	2529775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841565
47201	NC_010168	ACA	2	6	2529803	2529808	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841565
47202	NC_010168	CGC	2	6	2529834	2529839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841565
47203	NC_010168	CAG	2	6	2529841	2529846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841565
47204	NC_010168	GAC	2	6	2529903	2529908	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841565
47205	NC_010168	GAGC	2	8	2529927	2529934	25 %	0 %	50 %	25 %	163841565
47206	NC_010168	CTG	2	6	2530020	2530025	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841565
47207	NC_010168	GGT	2	6	2530068	2530073	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841565
47208	NC_010168	ATC	2	6	2530129	2530134	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841565
47209	NC_010168	TCG	3	9	2530172	2530180	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841565
47210	NC_010168	GATG	2	8	2530183	2530190	25 %	25 %	50 %	0 %	163841565
47211	NC_010168	TAA	2	6	2530236	2530241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841565
47212	NC_010168	GAT	2	6	2530309	2530314	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841565
47213	NC_010168	GAT	2	6	2530386	2530391	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47214	NC_010168	GTT	2	6	2530443	2530448	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841566
47215	NC_010168	GTATC	2	10	2530477	2530486	20 %	40 %	20 %	20 %	163841566
47216	NC_010168	TTG	2	6	2530651	2530656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841566
47217	NC_010168	TTGCC	2	10	2530727	2530736	0 %	40 %	20 %	40 %	163841566
47218	NC_010168	AAC	2	6	2530745	2530750	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841566
47219	NC_010168	TG	3	6	2530771	2530776	0 %	50 %	50 %	0 %	163841566
47220	NC_010168	GTT	2	6	2530779	2530784	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841566
47221	NC_010168	CAA	2	6	2530819	2530824	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841566
47222	NC_010168	GGA	2	6	2530833	2530838	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841566
47223	NC_010168	TCT	2	6	2530890	2530895	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841566
47224	NC_010168	GGAA	2	8	2531012	2531019	50 %	0 %	50 %	0 %	163841566
47225	NC_010168	GAT	2	6	2531089	2531094	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841566
47226	NC_010168	CCA	2	6	2531138	2531143	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841566
47227	NC_010168	TGC	2	6	2531166	2531171	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841566
47228	NC_010168	GCAC	2	8	2531180	2531187	25 %	0 %	25 %	50 %	163841566
47229	NC_010168	TGT	2	6	2531195	2531200	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841566
47230	NC_010168	TAC	2	6	2531476	2531481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841566
47231	NC_010168	TCAA	2	8	2531489	2531496	50 %	25 %	0 %	25 %	163841566
47232	NC_010168	GCTT	2	8	2531627	2531634	0 %	50 %	25 %	25 %	163841566
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47234	NC_010168	GGC	2	6	2531978	2531983	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841567
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47468	NC_010168	GC	3	6	2544015	2544020	0 %	0 %	50 %	50 %	163841582
47469	NC_010168	AGT	2	6	2544100	2544105	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841582
47470	NC_010168	CCAAT	2	10	2544116	2544125	40 %	20 %	0 %	40 %	163841582
47471	NC_010168	TCG	2	6	2544198	2544203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841582
47472	NC_010168	A	6	6	2544267	2544272	100 %	0 %	0 %	0 %	163841582
47473	NC_010168	GCC	2	6	2544409	2544414	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841583
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47475	NC_010168	ATG	2	6	2544494	2544499	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47476	NC_010168	GGT	2	6	2544760	2544765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
47477	NC_010168	TGC	2	6	2544864	2544869	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47478	NC_010168	ATCA	2	8	2544895	2544902	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
47479	NC_010168	CCG	2	6	2544980	2544985	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841584
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47482	NC_010168	CAGT	2	8	2545063	2545070	25 %	25 %	25 %	25 %	163841584
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47490	NC_010168	GGT	2	6	2545572	2545577	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841584
47491	NC_010168	TTGT	2	8	2545585	2545592	0 %	75 %	25 %	0 %	163841584
47492	NC_010168	AGCT	2	8	2545600	2545607	25 %	25 %	25 %	25 %	163841584
47493	NC_010168	GCGTA	2	10	2545620	2545629	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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47497	NC_010168	TGG	3	9	2545837	2545845	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841585
47498	NC_010168	TTC	2	6	2546007	2546012	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841585
47499	NC_010168	GTT	2	6	2546030	2546035	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841585
47500	NC_010168	ACG	2	6	2546126	2546131	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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