MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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46002	NC_010168	AAT	2	6	2469933	2469938	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841494
46003	NC_010168	CCGGGT	2	12	2469977	2469988	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163841494
46004	NC_010168	CAAC	2	8	2470058	2470065	50 %	0 %	0 %	50 %	163841494
46005	NC_010168	GC	3	6	2470140	2470145	0 %	0 %	50 %	50 %	163841494
46006	NC_010168	TCCG	2	8	2470228	2470235	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
46007	NC_010168	GT	3	6	2470348	2470353	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
46008	NC_010168	CGG	2	6	2470383	2470388	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841496
46009	NC_010168	GTA	2	6	2470411	2470416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841496
46010	NC_010168	TGG	2	6	2470435	2470440	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841496
46011	NC_010168	GGT	2	6	2470470	2470475	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841496
46012	NC_010168	CTT	2	6	2470512	2470517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841496
46013	NC_010168	AGG	2	6	2470665	2470670	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841496
46014	NC_010168	TGA	3	9	2470691	2470699	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841496
46015	NC_010168	TCC	2	6	2470809	2470814	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841496
46016	NC_010168	ACCC	2	8	2470847	2470854	25 %	0 %	0 %	75 %	163841496
46017	NC_010168	ATC	2	6	2470879	2470884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841496
46018	NC_010168	CGG	2	6	2470922	2470927	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841496
46019	NC_010168	GCC	2	6	2470946	2470951	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841496
46020	NC_010168	GTG	2	6	2470967	2470972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841496
46021	NC_010168	TCA	2	6	2471144	2471149	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841496
46022	NC_010168	GTT	2	6	2471151	2471156	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841496
46023	NC_010168	GTA	2	6	2471188	2471193	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841496
46024	NC_010168	GGT	2	6	2471203	2471208	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841496
46025	NC_010168	TCGAC	2	10	2471240	2471249	20 %	20 %	20 %	40 %	163841496
46026	NC_010168	ATT	2	6	2471265	2471270	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841497
46027	NC_010168	A	6	6	2471339	2471344	100 %	0 %	0 %	0 %	163841497
46028	NC_010168	GTT	2	6	2471402	2471407	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841497
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46032	NC_010168	AC	3	6	2471634	2471639	50 %	0 %	0 %	50 %	163841498
46033	NC_010168	CGG	3	9	2471674	2471682	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841498
46034	NC_010168	GCT	2	6	2471775	2471780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841498
46035	NC_010168	CAG	2	6	2471790	2471795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841498
46036	NC_010168	TCT	2	6	2471798	2471803	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841498
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46039	NC_010168	GAA	2	6	2471971	2471976	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841498
46040	NC_010168	GCA	2	6	2471990	2471995	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841498
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46043	NC_010168	CAA	2	6	2472067	2472072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841498
46044	NC_010168	GAA	2	6	2472073	2472078	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841498
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46046	NC_010168	ACCC	2	8	2472133	2472140	25 %	0 %	0 %	75 %	163841498
46047	NC_010168	CGA	2	6	2472164	2472169	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841498
46048	NC_010168	CGA	2	6	2472186	2472191	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841498
46049	NC_010168	CAG	3	9	2472196	2472204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841498
46050	NC_010168	CCG	2	6	2472353	2472358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841498
46051	NC_010168	CCA	2	6	2472374	2472379	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841498
46052	NC_010168	ACC	2	6	2472416	2472421	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841498
46053	NC_010168	TC	3	6	2472447	2472452	0 %	50 %	0 %	50 %	163841498
46054	NC_010168	AAT	2	6	2472503	2472508	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841498
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46057	NC_010168	CG	3	6	2472660	2472665	0 %	0 %	50 %	50 %	163841498
46058	NC_010168	AATC	2	8	2472676	2472683	50 %	25 %	0 %	25 %	163841498
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46070	NC_010168	GCTC	2	8	2473340	2473347	0 %	25 %	25 %	50 %	163841500
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46083	NC_010168	CGA	2	6	2474048	2474053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841502
46084	NC_010168	GCTCA	2	10	2474060	2474069	20 %	20 %	20 %	40 %	163841502
46085	NC_010168	GTT	2	6	2474098	2474103	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841502
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46088	NC_010168	TGA	2	6	2474312	2474317	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841502
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46096	NC_010168	ATG	2	6	2474734	2474739	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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46099	NC_010168	GGCCA	2	10	2475018	2475027	20 %	0 %	40 %	40 %	163841503
46100	NC_010168	GCA	2	6	2475032	2475037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841503
46101	NC_010168	CGC	2	6	2475071	2475076	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841503
46102	NC_010168	TCTGCC	2	12	2475169	2475180	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	163841503
46103	NC_010168	CGG	2	6	2475193	2475198	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46104	NC_010168	ACA	2	6	2475210	2475215	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841504
46105	NC_010168	CGG	2	6	2475234	2475239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841504
46106	NC_010168	CGC	2	6	2475250	2475255	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841504
46107	NC_010168	TCA	2	6	2475264	2475269	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841504
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46109	NC_010168	TTCC	2	8	2475340	2475347	0 %	50 %	0 %	50 %	163841504
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46111	NC_010168	CCA	2	6	2475452	2475457	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841504
46112	NC_010168	GTTCT	2	10	2475577	2475586	0 %	60 %	20 %	20 %	163841504
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46116	NC_010168	ACG	2	6	2475793	2475798	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841504
46117	NC_010168	GTA	2	6	2475817	2475822	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841504
46118	NC_010168	CGC	2	6	2475884	2475889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841504
46119	NC_010168	GCA	2	6	2475932	2475937	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841504
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46121	NC_010168	GCGT	2	8	2476025	2476032	0 %	25 %	50 %	25 %	163841504
46122	NC_010168	CCG	2	6	2476086	2476091	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841504
46123	NC_010168	CGA	2	6	2476230	2476235	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841504
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46128	NC_010168	CCAG	2	8	2476472	2476479	25 %	0 %	25 %	50 %	163841505
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46162	NC_010168	CGG	2	6	2478207	2478212	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841507
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46199	NC_010168	GCG	2	6	2479847	2479852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46200	NC_010168	AAG	2	6	2479922	2479927	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841510
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46212	NC_010168	TGC	2	6	2480552	2480557	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841511
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46216	NC_010168	GTT	2	6	2480769	2480774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841511
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46219	NC_010168	A	6	6	2480993	2480998	100 %	0 %	0 %	0 %	163841511
46220	NC_010168	ACCAA	2	10	2481014	2481023	60 %	0 %	0 %	40 %	163841511
46221	NC_010168	CGG	2	6	2481060	2481065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841511
46222	NC_010168	TGC	2	6	2481101	2481106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841511
46223	NC_010168	CTG	2	6	2481118	2481123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841511
46224	NC_010168	CGG	2	6	2481192	2481197	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841512
46225	NC_010168	AC	3	6	2481208	2481213	50 %	0 %	0 %	50 %	163841512
46226	NC_010168	CGT	2	6	2481218	2481223	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841512
46227	NC_010168	GCT	2	6	2481230	2481235	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841512
46228	NC_010168	AGC	2	6	2481264	2481269	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841512
46229	NC_010168	CGT	2	6	2481307	2481312	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841512
46230	NC_010168	CTT	2	6	2481437	2481442	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841512
46231	NC_010168	GC	4	8	2481482	2481489	0 %	0 %	50 %	50 %	163841512
46232	NC_010168	GAT	2	6	2481515	2481520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841512
46233	NC_010168	GAT	2	6	2481554	2481559	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841512
46234	NC_010168	ACTCA	2	10	2481575	2481584	40 %	20 %	0 %	40 %	163841512
46235	NC_010168	TTG	2	6	2481652	2481657	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841512
46236	NC_010168	GAG	2	6	2481678	2481683	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841512
46237	NC_010168	GCC	2	6	2481684	2481689	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841512
46238	NC_010168	CTT	2	6	2481719	2481724	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841512
46239	NC_010168	TTG	2	6	2481757	2481762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841512
46240	NC_010168	GAAT	2	8	2481794	2481801	50 %	25 %	25 %	0 %	163841512
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46242	NC_010168	CAG	2	6	2481824	2481829	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841512
46243	NC_010168	GGCA	2	8	2481881	2481888	25 %	0 %	50 %	25 %	163841512
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46246	NC_010168	GC	3	6	2482040	2482045	0 %	0 %	50 %	50 %	163841513
46247	NC_010168	GAG	2	6	2482127	2482132	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841513
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46250	NC_010168	CGGC	2	8	2482362	2482369	0 %	0 %	50 %	50 %	163841513
46251	NC_010168	ATC	2	6	2482415	2482420	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841513
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46291	NC_010168	A	7	7	2484457	2484463	100 %	0 %	0 %	0 %	163841516
46292	NC_010168	CGG	2	6	2484473	2484478	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841516
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46300	NC_010168	CTGG	2	8	2484796	2484803	0 %	25 %	50 %	25 %	163841517
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46323	NC_010168	GCA	2	6	2485835	2485840	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46324	NC_010168	T	7	7	2485877	2485883	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46325	NC_010168	CAT	2	6	2485950	2485955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46327	NC_010168	TCA	2	6	2485979	2485984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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46330	NC_010168	GCT	2	6	2486068	2486073	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46331	NC_010168	GCG	2	6	2486081	2486086	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
46332	NC_010168	CGA	2	6	2486134	2486139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841518
46333	NC_010168	CG	3	6	2486150	2486155	0 %	0 %	50 %	50 %	163841518
46334	NC_010168	A	6	6	2486186	2486191	100 %	0 %	0 %	0 %	163841518
46335	NC_010168	TGA	2	6	2486269	2486274	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841518
46336	NC_010168	TAC	2	6	2486309	2486314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841518
46337	NC_010168	GAT	2	6	2486342	2486347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841518
46338	NC_010168	GGC	2	6	2486363	2486368	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841518
46339	NC_010168	AAG	2	6	2486387	2486392	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841518
46340	NC_010168	AAG	2	6	2486414	2486419	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841518
46341	NC_010168	AACTAC	2	12	2486432	2486443	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	163841518
46342	NC_010168	CTT	2	6	2486452	2486457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841518
46343	NC_010168	GCCGA	2	10	2486492	2486501	20 %	0 %	40 %	40 %	163841518
46344	NC_010168	CA	3	6	2486658	2486663	50 %	0 %	0 %	50 %	163841518
46345	NC_010168	AGA	2	6	2486679	2486684	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841518
46346	NC_010168	GCT	2	6	2486716	2486721	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841518
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46348	NC_010168	CGG	2	6	2486877	2486882	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841518
46349	NC_010168	GGT	2	6	2486944	2486949	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841518
46350	NC_010168	TCAG	2	8	2487119	2487126	25 %	25 %	25 %	25 %	163841518
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46352	NC_010168	TGA	2	6	2487167	2487172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841518
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46365	NC_010168	TC	3	6	2487494	2487499	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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46456	NC_010168	TCGAA	2	10	2491653	2491662	40 %	20 %	20 %	20 %	163841525
46457	NC_010168	GAA	2	6	2491731	2491736	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841525
46458	NC_010168	GAC	2	6	2491822	2491827	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841525
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46464	NC_010168	TCG	2	6	2492163	2492168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841525
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46492	NC_010168	CGT	2	6	2493252	2493257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841526
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