MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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42502	NC_010168	CAG	2	6	2283378	2283383	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841277
42503	NC_010168	A	6	6	2283407	2283412	100 %	0 %	0 %	0 %	163841277
42504	NC_010168	CGA	2	6	2283419	2283424	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841277
42505	NC_010168	TGAC	2	8	2283445	2283452	25 %	25 %	25 %	25 %	163841277
42506	NC_010168	CGG	2	6	2283457	2283462	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841277
42507	NC_010168	GAT	2	6	2283468	2283473	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841277
42508	NC_010168	GATG	2	8	2283611	2283618	25 %	25 %	50 %	0 %	163841277
42509	NC_010168	TCG	2	6	2283628	2283633	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841277
42510	NC_010168	GC	3	6	2283689	2283694	0 %	0 %	50 %	50 %	163841277
42511	NC_010168	TCG	2	6	2283749	2283754	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841278
42512	NC_010168	CAG	2	6	2283774	2283779	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841278
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42514	NC_010168	GAA	2	6	2283799	2283804	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841278
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42532	NC_010168	GAG	2	6	2284946	2284951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42533	NC_010168	CTA	2	6	2285089	2285094	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841279
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42553	NC_010168	GCA	2	6	2286125	2286130	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841281
42554	NC_010168	CGA	2	6	2286159	2286164	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841281
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42556	NC_010168	CGA	2	6	2286246	2286251	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841281
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42560	NC_010168	TAC	2	6	2286471	2286476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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42569	NC_010168	AAACC	2	10	2287038	2287047	60 %	0 %	0 %	40 %	163841282
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42601	NC_010168	GGCCG	2	10	2288862	2288871	0 %	0 %	60 %	40 %	163841285
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42606	NC_010168	GTT	2	6	2289067	2289072	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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42617	NC_010168	GCTG	2	8	2289937	2289944	0 %	25 %	50 %	25 %	163841286
42618	NC_010168	GCA	2	6	2290035	2290040	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841286
42619	NC_010168	CGA	2	6	2290084	2290089	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841286
42620	NC_010168	CAG	2	6	2290147	2290152	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841286
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42630	NC_010168	ACG	2	6	2290345	2290350	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841287
42631	NC_010168	ACG	2	6	2290547	2290552	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841287
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42645	NC_010168	CCCG	2	8	2291663	2291670	0 %	0 %	25 %	75 %	163841287
42646	NC_010168	TGC	2	6	2291771	2291776	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841287
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42650	NC_010168	CCGG	2	8	2291872	2291879	0 %	0 %	50 %	50 %	163841287
42651	NC_010168	TGGCTT	2	12	2291987	2291998	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	163841287
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42696	NC_010168	CGAC	2	8	2294801	2294808	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
42697	NC_010168	AGGCA	2	10	2294839	2294848	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
42698	NC_010168	GCTAA	3	15	2294851	2294865	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
42699	NC_010168	TGATG	2	10	2294874	2294883	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
42700	NC_010168	TCG	2	6	2294885	2294890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42701	NC_010168	CTG	2	6	2294918	2294923	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
42702	NC_010168	TAG	2	6	2295002	2295007	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841289
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42720	NC_010168	ATTT	2	8	2295927	2295934	25 %	75 %	0 %	0 %	163841289
42721	NC_010168	ACCC	2	8	2296012	2296019	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
42722	NC_010168	CAC	2	6	2296034	2296039	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42723	NC_010168	GTG	2	6	2296075	2296080	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42724	NC_010168	TGA	2	6	2296104	2296109	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841290
42725	NC_010168	GCAC	2	8	2296139	2296146	25 %	0 %	25 %	50 %	163841290
42726	NC_010168	CCA	2	6	2296212	2296217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841290
42727	NC_010168	TCA	2	6	2296286	2296291	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841290
42728	NC_010168	GCT	2	6	2296298	2296303	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841290
42729	NC_010168	TCG	2	6	2296353	2296358	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841290
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42731	NC_010168	GCG	2	6	2296395	2296400	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841290
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42838	NC_010168	CCA	2	6	2301752	2301757	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42839	NC_010168	CA	3	6	2301837	2301842	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
42840	NC_010168	GTCCG	2	10	2301883	2301892	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
42841	NC_010168	GAT	2	6	2302011	2302016	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841298
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42846	NC_010168	ACC	2	6	2302113	2302118	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841298
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42848	NC_010168	CTTC	2	8	2302319	2302326	0 %	50 %	0 %	50 %	163841298
42849	NC_010168	AAT	2	6	2302348	2302353	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163841298
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42854	NC_010168	ATC	2	6	2302523	2302528	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42855	NC_010168	CGT	2	6	2302550	2302555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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42857	NC_010168	ACC	3	9	2302714	2302722	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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42953	NC_010168	CA	3	6	2307222	2307227	50 %	0 %	0 %	50 %	163841304
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42962	NC_010168	CGG	2	6	2307587	2307592	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841305
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42997	NC_010168	TTC	2	6	2309397	2309402	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841306
42998	NC_010168	TC	3	6	2309419	2309424	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42999	NC_010168	GA	3	6	2309447	2309452	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
43000	NC_010168	GAA	2	6	2309483	2309488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841307

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