MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
2001	NC_010168	T	6	6	111198	111203	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2002	NC_010168	TAA	2	6	111216	111221	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2003	NC_010168	GGA	2	6	111282	111287	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838896
2004	NC_010168	TTTACC	2	12	111594	111605	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	163838896
2005	NC_010168	GATA	2	8	111691	111698	50 %	25 %	25 %	0 %	163838896
2006	NC_010168	GCC	2	6	111705	111710	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838896
2007	NC_010168	TC	3	6	111711	111716	0 %	50 %	0 %	50 %	163838896
2008	NC_010168	CCA	2	6	111847	111852	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838896
2009	NC_010168	GTT	2	6	111858	111863	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838896
2010	NC_010168	ACC	2	6	111872	111877	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838896
2011	NC_010168	CTG	2	6	112019	112024	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2012	NC_010168	GCC	2	6	112119	112124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838896
2013	NC_010168	TTCACC	2	12	112126	112137	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	163838896
2014	NC_010168	CCG	2	6	112144	112149	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838896
2015	NC_010168	TGC	2	6	112179	112184	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2016	NC_010168	AGT	2	6	112202	112207	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838896
2017	NC_010168	CTG	2	6	112280	112285	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2018	NC_010168	TGC	2	6	112379	112384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2019	NC_010168	CAC	2	6	112395	112400	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838896
2020	NC_010168	CCG	2	6	112405	112410	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838896
2021	NC_010168	CCG	2	6	112421	112426	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838896
2022	NC_010168	GTC	2	6	112519	112524	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2023	NC_010168	TAC	2	6	112608	112613	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838896
2024	NC_010168	AAC	2	6	112617	112622	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838896
2025	NC_010168	CCA	2	6	112675	112680	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838896
2026	NC_010168	TCC	2	6	112692	112697	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838896
2027	NC_010168	GCG	2	6	112699	112704	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838896
2028	NC_010168	GAAA	2	8	112733	112740	75 %	0 %	25 %	0 %	163838896
2029	NC_010168	ACC	2	6	112749	112754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838896
2030	NC_010168	CTG	2	6	112774	112779	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838896
2031	NC_010168	GAA	2	6	112801	112806	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838896
2032	NC_010168	A	7	7	112848	112854	100 %	0 %	0 %	0 %	163838896
2033	NC_010168	T	8	8	112886	112893	0 %	100 %	0 %	0 %	163838896
2034	NC_010168	TTTTA	2	10	112905	112914	20 %	80 %	0 %	0 %	163838897
2035	NC_010168	CTG	2	6	112980	112985	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838897
2036	NC_010168	CAAG	2	8	113014	113021	50 %	0 %	25 %	25 %	163838897
2037	NC_010168	CGGCT	2	10	113046	113055	0 %	20 %	40 %	40 %	163838897
2038	NC_010168	GGC	2	6	113090	113095	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838897
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2040	NC_010168	A	6	6	113160	113165	100 %	0 %	0 %	0 %	163838897
2041	NC_010168	GGC	2	6	113182	113187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838897
2042	NC_010168	AACC	2	8	113204	113211	50 %	0 %	0 %	50 %	163838897
2043	NC_010168	CAG	2	6	113316	113321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
2044	NC_010168	CCA	2	6	113371	113376	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2045	NC_010168	GTT	2	6	113464	113469	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838898
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2047	NC_010168	CGC	2	6	113509	113514	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838898
2048	NC_010168	GCG	2	6	113520	113525	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838898
2049	NC_010168	TGAG	2	8	113617	113624	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
2050	NC_010168	CAG	2	6	113667	113672	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838899
2051	NC_010168	TCT	2	6	113683	113688	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838899
2052	NC_010168	TCAG	2	8	113701	113708	25 %	25 %	25 %	25 %	163838899
2053	NC_010168	TTC	2	6	113745	113750	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838899
2054	NC_010168	GTT	2	6	113769	113774	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838899
2055	NC_010168	ACG	2	6	113830	113835	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838899
2056	NC_010168	AAT	2	6	113888	113893	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2057	NC_010168	GTG	2	6	113901	113906	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
2058	NC_010168	TGG	2	6	114017	114022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838900
2059	NC_010168	GCG	2	6	114052	114057	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838900
2060	NC_010168	TGGGTG	2	12	114080	114091	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838900
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2062	NC_010168	GCTGA	2	10	114202	114211	20 %	20 %	40 %	20 %	163838900
2063	NC_010168	AAT	2	6	114320	114325	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163838900
2064	NC_010168	GTCGA	2	10	114341	114350	20 %	20 %	40 %	20 %	163838901
2065	NC_010168	ACC	2	6	114382	114387	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838901
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2067	NC_010168	AAC	2	6	114434	114439	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838901
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2074	NC_010168	GGA	2	6	114776	114781	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163838901
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2088	NC_010168	CAC	2	6	115552	115557	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
2089	NC_010168	GCGT	2	8	115631	115638	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2090	NC_010168	ACA	2	6	115671	115676	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2091	NC_010168	TTC	2	6	115792	115797	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2092	NC_010168	TTC	2	6	115981	115986	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163838903
2093	NC_010168	TTG	2	6	116074	116079	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838903
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2095	NC_010168	GCT	2	6	116105	116110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838903
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2099	NC_010168	TGC	2	6	116292	116297	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838903
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2105	NC_010168	GCG	2	6	116579	116584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838903
2106	NC_010168	TCG	2	6	116602	116607	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838903
2107	NC_010168	GTT	2	6	116636	116641	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838903
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2110	NC_010168	GAT	2	6	116754	116759	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838903
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2112	NC_010168	AGC	2	6	116880	116885	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838903
2113	NC_010168	T	6	6	116928	116933	0 %	100 %	0 %	0 %	163838903
2114	NC_010168	TGG	2	6	116977	116982	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838903
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2118	NC_010168	AGCA	2	8	117081	117088	50 %	0 %	25 %	25 %	163838903
2119	NC_010168	TC	3	6	117101	117106	0 %	50 %	0 %	50 %	163838903
2120	NC_010168	GTA	2	6	117273	117278	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163838903
2121	NC_010168	GAA	2	6	117297	117302	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163838903
2122	NC_010168	GC	3	6	117304	117309	0 %	0 %	50 %	50 %	163838903
2123	NC_010168	TCC	2	6	117316	117321	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163838903
2124	NC_010168	CGC	2	6	117353	117358	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838903
2125	NC_010168	CG	3	6	117480	117485	0 %	0 %	50 %	50 %	163838903
2126	NC_010168	GT	3	6	117492	117497	0 %	50 %	50 %	0 %	163838903
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2132	NC_010168	GC	3	6	117709	117714	0 %	0 %	50 %	50 %	163838903
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2142	NC_010168	GCG	2	6	118267	118272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838903
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2233	NC_010168	GCC	2	6	122818	122823	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2234	NC_010168	GCT	2	6	122971	122976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838909
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2240	NC_010168	CGT	2	6	123262	123267	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838909
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2242	NC_010168	CGG	2	6	123508	123513	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2243	NC_010168	ATT	2	6	123649	123654	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838910
2244	NC_010168	GCC	2	6	123682	123687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838910
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2246	NC_010168	TTG	2	6	123776	123781	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163838910
2247	NC_010168	GCG	2	6	123919	123924	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838910
2248	NC_010168	CAC	2	6	123941	123946	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838910
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2250	NC_010168	GCG	2	6	123962	123967	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838910
2251	NC_010168	CCA	2	6	123983	123988	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838910
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2263	NC_010168	GC	3	6	124418	124423	0 %	0 %	50 %	50 %	163838910
2264	NC_010168	CG	3	6	124449	124454	0 %	0 %	50 %	50 %	163838910
2265	NC_010168	ATC	2	6	124474	124479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838910
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2310	NC_010168	GCTG	2	8	127235	127242	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2311	NC_010168	AACA	2	8	127245	127252	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
2312	NC_010168	TGC	2	6	127259	127264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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2343	NC_010168	GGC	2	6	129040	129045	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838913
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2348	NC_010168	CCG	2	6	129293	129298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
2349	NC_010168	GCG	2	6	129299	129304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
2350	NC_010168	CG	3	6	129303	129308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2351	NC_010168	CG	4	8	129345	129352	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2352	NC_010168	TCA	2	6	129549	129554	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163838914
2353	NC_010168	GGT	2	6	129619	129624	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838914
2354	NC_010168	GGC	2	6	129680	129685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838914
2355	NC_010168	TGC	2	6	129708	129713	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2356	NC_010168	GC	4	8	129712	129719	0 %	0 %	50 %	50 %	163838914
2357	NC_010168	AGCT	2	8	129744	129751	25 %	25 %	25 %	25 %	163838914
2358	NC_010168	CAG	2	6	129821	129826	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2359	NC_010168	CAG	2	6	129924	129929	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2360	NC_010168	GGC	2	6	129971	129976	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838914
2361	NC_010168	TGC	2	6	129985	129990	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2362	NC_010168	ACG	2	6	130270	130275	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2363	NC_010168	CAG	2	6	130327	130332	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838914
2364	NC_010168	GCC	2	6	130361	130366	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838914
2365	NC_010168	GT	3	6	130416	130421	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2366	NC_010168	CAT	2	6	130500	130505	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2367	NC_010168	TGG	2	6	130586	130591	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838915
2368	NC_010168	CGC	2	6	130619	130624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838915
2369	NC_010168	CGTGC	2	10	130686	130695	0 %	20 %	40 %	40 %	163838915
2370	NC_010168	CGA	2	6	130725	130730	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163838915
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2377	NC_010168	AAT	2	6	131049	131054	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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2486	NC_010168	GCGT	2	8	136590	136597	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2487	NC_010168	GCG	2	6	136692	136697	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163838922
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2490	NC_010168	GCC	2	6	136782	136787	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838922
2491	NC_010168	GC	3	6	136792	136797	0 %	0 %	50 %	50 %	163838922
2492	NC_010168	GTG	3	9	136836	136844	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163838922
2493	NC_010168	GCC	2	6	136858	136863	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2494	NC_010168	CAA	2	6	136932	136937	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163838923
2495	NC_010168	CGC	2	6	136941	136946	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2496	NC_010168	CATCG	2	10	136972	136981	20 %	20 %	20 %	40 %	163838923
2497	NC_010168	CGC	2	6	137061	137066	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923
2498	NC_010168	ATT	2	6	137146	137151	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163838923
2499	NC_010168	CCA	2	6	137193	137198	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163838923
2500	NC_010168	GCC	2	6	137248	137253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163838923

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