MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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22502	NC_010168	CGGG	2	8	1207221	1207228	0 %	0 %	75 %	25 %	163840159
22503	NC_010168	GCA	2	6	1207281	1207286	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840160
22504	NC_010168	GCTC	2	8	1207307	1207314	0 %	25 %	25 %	50 %	163840160
22505	NC_010168	GGC	2	6	1207325	1207330	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840160
22506	NC_010168	ATCC	2	8	1207345	1207352	25 %	25 %	0 %	50 %	163840160
22507	NC_010168	AG	3	6	1207385	1207390	50 %	0 %	50 %	0 %	163840160
22508	NC_010168	CCG	2	6	1207440	1207445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840160
22509	NC_010168	TGA	2	6	1207608	1207613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840160
22510	NC_010168	CGA	2	6	1207707	1207712	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840160
22511	NC_010168	CG	3	6	1207713	1207718	0 %	0 %	50 %	50 %	163840160
22512	NC_010168	GC	3	6	1207758	1207763	0 %	0 %	50 %	50 %	163840160
22513	NC_010168	CGC	2	6	1207777	1207782	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840160
22514	NC_010168	CGG	2	6	1207879	1207884	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840160
22515	NC_010168	TAGC	2	8	1207902	1207909	25 %	25 %	25 %	25 %	163840160
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22517	NC_010168	AGCTC	2	10	1208015	1208024	20 %	20 %	20 %	40 %	163840160
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22520	NC_010168	GCA	2	6	1208193	1208198	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840160
22521	NC_010168	A	6	6	1208222	1208227	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22522	NC_010168	CAGA	2	8	1208243	1208250	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
22523	NC_010168	AGC	2	6	1208331	1208336	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840161
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22528	NC_010168	CGGCT	2	10	1208613	1208622	0 %	20 %	40 %	40 %	163840161
22529	NC_010168	TGG	2	6	1208640	1208645	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840161
22530	NC_010168	GCG	2	6	1208655	1208660	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840161
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22535	NC_010168	GC	3	6	1208982	1208987	0 %	0 %	50 %	50 %	163840162
22536	NC_010168	TTTA	2	8	1209036	1209043	25 %	75 %	0 %	0 %	163840162
22537	NC_010168	GCG	2	6	1209148	1209153	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840162
22538	NC_010168	TCG	2	6	1209247	1209252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840162
22539	NC_010168	AG	3	6	1209314	1209319	50 %	0 %	50 %	0 %	163840162
22540	NC_010168	GCT	2	6	1209517	1209522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840163
22541	NC_010168	ACC	2	6	1209590	1209595	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22542	NC_010168	A	7	7	1209681	1209687	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22543	NC_010168	CGGT	2	8	1209743	1209750	0 %	25 %	50 %	25 %	163840164
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22552	NC_010168	GCT	2	6	1210386	1210391	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840165
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22554	NC_010168	GCG	2	6	1210434	1210439	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840165
22555	NC_010168	AAG	2	6	1210459	1210464	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840165
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22599	NC_010168	CTAC	2	8	1212752	1212759	25 %	25 %	0 %	50 %	163840168
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22608	NC_010168	CG	3	6	1213356	1213361	0 %	0 %	50 %	50 %	163840169
22609	NC_010168	CGGA	2	8	1213394	1213401	25 %	0 %	50 %	25 %	163840169
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22617	NC_010168	ACT	2	6	1214169	1214174	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840171
22618	NC_010168	GTT	2	6	1214194	1214199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840171
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22644	NC_010168	TTCC	2	8	1215662	1215669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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22713	NC_010168	CG	3	6	1219010	1219015	0 %	0 %	50 %	50 %	163840174
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22720	NC_010168	GCA	3	9	1219441	1219449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840174
22721	NC_010168	GCG	2	6	1219453	1219458	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840174
22722	NC_010168	CAG	2	6	1219482	1219487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840174
22723	NC_010168	CGA	2	6	1219497	1219502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840174
22724	NC_010168	GCG	2	6	1219549	1219554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840174
22725	NC_010168	GCTGG	2	10	1219561	1219570	0 %	20 %	60 %	20 %	163840174
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22728	NC_010168	CTG	2	6	1219654	1219659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840174
22729	NC_010168	CG	3	6	1219661	1219666	0 %	0 %	50 %	50 %	163840174
22730	NC_010168	TCG	2	6	1219709	1219714	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840174
22731	NC_010168	GGT	2	6	1219759	1219764	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840174
22732	NC_010168	CGGCAG	2	12	1219772	1219783	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	163840174
22733	NC_010168	CG	3	6	1219806	1219811	0 %	0 %	50 %	50 %	163840174
22734	NC_010168	CGGGC	2	10	1219827	1219836	0 %	0 %	60 %	40 %	163840174
22735	NC_010168	TATTG	2	10	1219897	1219906	20 %	60 %	20 %	0 %	163840174
22736	NC_010168	CA	3	6	1219962	1219967	50 %	0 %	0 %	50 %	163840174
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22833	NC_010168	CCT	2	6	1224739	1224744	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22843	NC_010168	TGA	2	6	1225416	1225421	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840178
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22846	NC_010168	TGG	2	6	1225485	1225490	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840178
22847	NC_010168	ACC	2	6	1225504	1225509	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840178
22848	NC_010168	GTC	2	6	1225549	1225554	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840178
22849	NC_010168	CAA	2	6	1225633	1225638	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840178
22850	NC_010168	CTG	2	6	1225661	1225666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840178
22851	NC_010168	TGA	2	6	1225784	1225789	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840178
22852	NC_010168	AAC	2	6	1225882	1225887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840179
22853	NC_010168	CGC	2	6	1225977	1225982	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840179
22854	NC_010168	GCTGT	2	10	1226020	1226029	0 %	40 %	40 %	20 %	163840179
22855	NC_010168	TTG	2	6	1226063	1226068	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840179
22856	NC_010168	CCG	2	6	1226455	1226460	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840179
22857	NC_010168	GGT	2	6	1226599	1226604	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840179
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22860	NC_010168	TGA	2	6	1226763	1226768	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840179
22861	NC_010168	A	6	6	1226844	1226849	100 %	0 %	0 %	0 %	163840180
22862	NC_010168	TTGC	2	8	1226940	1226947	0 %	50 %	25 %	25 %	163840180
22863	NC_010168	CGAT	2	8	1226964	1226971	25 %	25 %	25 %	25 %	163840180
22864	NC_010168	GCC	3	9	1226972	1226980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840180
22865	NC_010168	CGG	2	6	1227068	1227073	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840180
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22868	NC_010168	CAA	2	6	1227337	1227342	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840180
22869	NC_010168	TCG	2	6	1227343	1227348	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840180
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22872	NC_010168	TGA	2	6	1227473	1227478	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840180
22873	NC_010168	GCC	2	6	1227486	1227491	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840180
22874	NC_010168	GCA	2	6	1227530	1227535	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840180
22875	NC_010168	GC	3	6	1227544	1227549	0 %	0 %	50 %	50 %	163840180
22876	NC_010168	GAC	2	6	1227564	1227569	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840180
22877	NC_010168	CTT	2	6	1227635	1227640	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840181
22878	NC_010168	CGG	2	6	1227790	1227795	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840181
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22880	NC_010168	GAT	2	6	1227869	1227874	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840181
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22883	NC_010168	TCGT	2	8	1228082	1228089	0 %	50 %	25 %	25 %	163840181
22884	NC_010168	GCAA	2	8	1228108	1228115	50 %	0 %	25 %	25 %	163840181
22885	NC_010168	ACG	2	6	1228158	1228163	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840181
22886	NC_010168	CG	3	6	1228186	1228191	0 %	0 %	50 %	50 %	163840181
22887	NC_010168	TAGC	2	8	1228206	1228213	25 %	25 %	25 %	25 %	163840181
22888	NC_010168	CGG	2	6	1228221	1228226	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840181
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22902	NC_010168	ACCG	2	8	1228953	1228960	25 %	0 %	25 %	50 %	163840181
22903	NC_010168	TCA	2	6	1229014	1229019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840181
22904	NC_010168	TGT	2	6	1229026	1229031	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840181
22905	NC_010168	GTGCT	2	10	1229043	1229052	0 %	40 %	40 %	20 %	163840181
22906	NC_010168	CGG	2	6	1229059	1229064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840181
22907	NC_010168	GCT	2	6	1229110	1229115	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840181
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22909	NC_010168	GAGT	2	8	1229166	1229173	25 %	25 %	50 %	0 %	163840181
22910	NC_010168	CGT	2	6	1229189	1229194	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840181
22911	NC_010168	GGC	2	6	1229195	1229200	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840181
22912	NC_010168	CTG	2	6	1229373	1229378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22913	NC_010168	TCA	2	6	1229399	1229404	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840182
22914	NC_010168	TGC	2	6	1229459	1229464	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840182
22915	NC_010168	GATT	2	8	1229495	1229502	25 %	50 %	25 %	0 %	163840182
22916	NC_010168	GGC	2	6	1229522	1229527	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840182
22917	NC_010168	GA	3	6	1229557	1229562	50 %	0 %	50 %	0 %	163840182
22918	NC_010168	AAG	2	6	1229582	1229587	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840182
22919	NC_010168	CGG	2	6	1229609	1229614	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840182
22920	NC_010168	CTG	2	6	1229666	1229671	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840182
22921	NC_010168	ATC	2	6	1229719	1229724	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840182
22922	NC_010168	GCG	2	6	1229727	1229732	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840182
22923	NC_010168	CCG	2	6	1229807	1229812	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840182
22924	NC_010168	CGG	2	6	1229861	1229866	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840182
22925	NC_010168	CTT	2	6	1229882	1229887	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840182
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22928	NC_010168	GTTG	2	8	1230057	1230064	0 %	50 %	50 %	0 %	163840182
22929	NC_010168	TCAT	2	8	1230097	1230104	25 %	50 %	0 %	25 %	163840182
22930	NC_010168	ATGA	2	8	1230126	1230133	50 %	25 %	25 %	0 %	163840182
22931	NC_010168	CAC	2	6	1230189	1230194	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840182
22932	NC_010168	CAA	2	6	1230290	1230295	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840182
22933	NC_010168	TTC	2	6	1230340	1230345	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22934	NC_010168	AAGCT	2	10	1230387	1230396	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
22935	NC_010168	GCT	2	6	1230560	1230565	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22936	NC_010168	TC	3	6	1230664	1230669	0 %	50 %	0 %	50 %	163840183
22937	NC_010168	TAC	2	6	1230746	1230751	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840183
22938	NC_010168	TTCATC	2	12	1230765	1230776	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	163840183
22939	NC_010168	GGC	2	6	1230839	1230844	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840183
22940	NC_010168	AGCA	2	8	1230895	1230902	50 %	0 %	25 %	25 %	163840183
22941	NC_010168	ACGC	2	8	1230905	1230912	25 %	0 %	25 %	50 %	163840183
22942	NC_010168	GTTG	2	8	1230995	1231002	0 %	50 %	50 %	0 %	163840183
22943	NC_010168	A	7	7	1231016	1231022	100 %	0 %	0 %	0 %	163840183
22944	NC_010168	TCTT	2	8	1231031	1231038	0 %	75 %	0 %	25 %	163840183
22945	NC_010168	GAC	2	6	1231062	1231067	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22946	NC_010168	ACGC	2	8	1231089	1231096	25 %	0 %	25 %	50 %	163840183
22947	NC_010168	TGG	2	6	1231159	1231164	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840183
22948	NC_010168	GGTGCT	2	12	1231181	1231192	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	163840183
22949	NC_010168	AGA	2	6	1231204	1231209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840183
22950	NC_010168	CGG	2	6	1231217	1231222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840183
22951	NC_010168	GCGG	2	8	1231338	1231345	0 %	0 %	75 %	25 %	163840183
22952	NC_010168	ATCC	2	8	1231387	1231394	25 %	25 %	0 %	50 %	163840183
22953	NC_010168	TGA	2	6	1231399	1231404	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840183
22954	NC_010168	GCAA	2	8	1231430	1231437	50 %	0 %	25 %	25 %	163840183
22955	NC_010168	ACT	2	6	1231463	1231468	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840183
22956	NC_010168	GA	3	6	1231519	1231524	50 %	0 %	50 %	0 %	163840183
22957	NC_010168	TTG	2	6	1231584	1231589	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840183
22958	NC_010168	CAG	2	6	1231590	1231595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22959	NC_010168	GGC	2	6	1231649	1231654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840183
22960	NC_010168	GCA	2	6	1231769	1231774	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22961	NC_010168	GGC	2	6	1231866	1231871	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840183
22962	NC_010168	GAT	2	6	1232027	1232032	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840183
22963	NC_010168	TCG	2	6	1232104	1232109	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22964	NC_010168	GCT	2	6	1232204	1232209	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840183
22965	NC_010168	GAA	2	6	1232220	1232225	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840183
22966	NC_010168	CAT	2	6	1232309	1232314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840184
22967	NC_010168	TG	3	6	1232317	1232322	0 %	50 %	50 %	0 %	163840184
22968	NC_010168	GTT	2	6	1232325	1232330	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840184
22969	NC_010168	CGT	2	6	1232390	1232395	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22970	NC_010168	CAA	2	6	1232431	1232436	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840184
22971	NC_010168	CGC	2	6	1232500	1232505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840184
22972	NC_010168	GGCTG	2	10	1232571	1232580	0 %	20 %	60 %	20 %	163840184
22973	NC_010168	TGC	2	6	1232612	1232617	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22974	NC_010168	ATT	2	6	1232628	1232633	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840184
22975	NC_010168	TGG	2	6	1232669	1232674	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840184
22976	NC_010168	TGG	2	6	1232685	1232690	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840184
22977	NC_010168	ATGG	2	8	1232742	1232749	25 %	25 %	50 %	0 %	163840184
22978	NC_010168	GCA	2	6	1232856	1232861	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22979	NC_010168	CGA	2	6	1233160	1233165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22980	NC_010168	TG	3	6	1233237	1233242	0 %	50 %	50 %	0 %	163840184
22981	NC_010168	TGG	2	6	1233244	1233249	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840184
22982	NC_010168	CTG	2	6	1233252	1233257	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22983	NC_010168	CAA	2	6	1233271	1233276	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840184
22984	NC_010168	GC	3	6	1233306	1233311	0 %	0 %	50 %	50 %	163840184
22985	NC_010168	CAG	2	6	1233316	1233321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840184
22986	NC_010168	AGT	2	6	1233328	1233333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840184
22987	NC_010168	TGAC	2	8	1233444	1233451	25 %	25 %	25 %	25 %	163840185
22988	NC_010168	AGC	2	6	1233458	1233463	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840185
22989	NC_010168	GCCG	2	8	1233553	1233560	0 %	0 %	50 %	50 %	163840185
22990	NC_010168	TGT	2	6	1233634	1233639	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840185
22991	NC_010168	TCT	2	6	1233645	1233650	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840185
22992	NC_010168	GCT	2	6	1233661	1233666	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840185
22993	NC_010168	CGGT	2	8	1233720	1233727	0 %	25 %	50 %	25 %	163840185
22994	NC_010168	TTG	2	6	1233741	1233746	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840185
22995	NC_010168	CGC	2	6	1233820	1233825	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840185
22996	NC_010168	TGG	2	6	1233904	1233909	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840185
22997	NC_010168	A	6	6	1233925	1233930	100 %	0 %	0 %	0 %	163840186
22998	NC_010168	TCG	2	6	1234021	1234026	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840186
22999	NC_010168	GGA	2	6	1234110	1234115	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840186
23000	NC_010168	CGA	2	6	1234160	1234165	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840186

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