MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
22001	NC_010168	TCG	2	6	1182172	1182177	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840133
22002	NC_010168	CAC	2	6	1182180	1182185	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840133
22003	NC_010168	GCC	2	6	1182198	1182203	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840133
22004	NC_010168	ATCT	2	8	1182234	1182241	25 %	50 %	0 %	25 %	163840133
22005	NC_010168	TCAT	2	8	1182277	1182284	25 %	50 %	0 %	25 %	163840133
22006	NC_010168	GTT	2	6	1182370	1182375	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840134
22007	NC_010168	GTC	2	6	1182425	1182430	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840134
22008	NC_010168	AAT	2	6	1182434	1182439	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163840134
22009	NC_010168	CGC	2	6	1182619	1182624	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22010	NC_010168	GAT	2	6	1182665	1182670	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840135
22011	NC_010168	TGC	2	6	1182751	1182756	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840135
22012	NC_010168	TGA	2	6	1182769	1182774	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840135
22013	NC_010168	CGC	2	6	1182781	1182786	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840135
22014	NC_010168	CCG	2	6	1182814	1182819	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840135
22015	NC_010168	CGAA	2	8	1182925	1182932	50 %	0 %	25 %	25 %	163840135
22016	NC_010168	AGT	2	6	1182974	1182979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840135
22017	NC_010168	GT	3	6	1182978	1182983	0 %	50 %	50 %	0 %	163840135
22018	NC_010168	TAA	2	6	1182994	1182999	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163840135
22019	NC_010168	TGG	2	6	1183090	1183095	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840135
22020	NC_010168	TC	3	6	1183129	1183134	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
22021	NC_010168	AT	3	6	1183168	1183173	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22022	NC_010168	GTC	2	6	1183213	1183218	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22023	NC_010168	GCC	2	6	1183248	1183253	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22024	NC_010168	CCA	2	6	1183270	1183275	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22025	NC_010168	GCC	2	6	1183394	1183399	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840136
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22029	NC_010168	CGA	3	9	1183555	1183563	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840136
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22032	NC_010168	GC	3	6	1183724	1183729	0 %	0 %	50 %	50 %	163840136
22033	NC_010168	CTC	2	6	1183787	1183792	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840136
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22039	NC_010168	GCT	2	6	1184254	1184259	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840137
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22042	NC_010168	GTA	2	6	1184318	1184323	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840137
22043	NC_010168	GCGG	2	8	1184371	1184378	0 %	0 %	75 %	25 %	163840137
22044	NC_010168	GCA	2	6	1184449	1184454	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840137
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22052	NC_010168	GCT	2	6	1184863	1184868	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840137
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22054	NC_010168	CG	3	6	1185034	1185039	0 %	0 %	50 %	50 %	163840137
22055	NC_010168	TCA	2	6	1185040	1185045	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840137
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22057	NC_010168	ATC	2	6	1185132	1185137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840137
22058	NC_010168	GTTGC	2	10	1185182	1185191	0 %	40 %	40 %	20 %	163840137
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22061	NC_010168	GCT	2	6	1185316	1185321	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840137
22062	NC_010168	CTT	2	6	1185325	1185330	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840137
22063	NC_010168	CGAAC	2	10	1185378	1185387	40 %	0 %	20 %	40 %	163840137
22064	NC_010168	CAT	2	6	1185410	1185415	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840137
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22100	NC_010168	CGGGCC	2	12	1187226	1187237	0 %	0 %	50 %	50 %	163840137
22101	NC_010168	TGA	2	6	1187248	1187253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840137
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22116	NC_010168	CAC	2	6	1187917	1187922	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840137
22117	NC_010168	GGT	2	6	1187953	1187958	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22118	NC_010168	TACGT	2	10	1188004	1188013	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
22119	NC_010168	GAT	2	6	1188022	1188027	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22120	NC_010168	GGC	2	6	1188044	1188049	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840138
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22122	NC_010168	GGCGC	2	10	1188141	1188150	0 %	0 %	60 %	40 %	163840138
22123	NC_010168	AGCC	2	8	1188165	1188172	25 %	0 %	25 %	50 %	163840138
22124	NC_010168	TGC	2	6	1188210	1188215	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840138
22125	NC_010168	ATC	2	6	1188239	1188244	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840138
22126	NC_010168	G	6	6	1188275	1188280	0 %	0 %	100 %	0 %	163840138
22127	NC_010168	CCT	2	6	1188282	1188287	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840138
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22129	NC_010168	TGC	2	6	1188350	1188355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840138
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22132	NC_010168	GGC	2	6	1188543	1188548	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840138
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22142	NC_010168	TGC	2	6	1189120	1189125	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840139
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22145	NC_010168	TCCT	2	8	1189254	1189261	0 %	50 %	0 %	50 %	163840139
22146	NC_010168	CGG	2	6	1189264	1189269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840139
22147	NC_010168	ACT	2	6	1189309	1189314	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840139
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22149	NC_010168	TCGAT	2	10	1189339	1189348	20 %	40 %	20 %	20 %	163840139
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22152	NC_010168	GAG	2	6	1189551	1189556	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840139
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22184	NC_010168	TCG	2	6	1190913	1190918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840140
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22189	NC_010168	GA	3	6	1191148	1191153	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22190	NC_010168	AAG	2	6	1191286	1191291	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840141
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22197	NC_010168	GAC	2	6	1191471	1191476	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840142
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22213	NC_010168	TGC	2	6	1192222	1192227	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840142
22214	NC_010168	TTG	2	6	1192257	1192262	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840142
22215	NC_010168	GTT	3	9	1192296	1192304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840142
22216	NC_010168	TGG	2	6	1192313	1192318	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840142
22217	NC_010168	TGGCG	2	10	1192325	1192334	0 %	20 %	60 %	20 %	163840142
22218	NC_010168	GAA	2	6	1192353	1192358	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840142
22219	NC_010168	TTG	2	6	1192360	1192365	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840142
22220	NC_010168	AGA	2	6	1192373	1192378	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840142
22221	NC_010168	TGA	2	6	1192454	1192459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840142
22222	NC_010168	GGC	2	6	1192518	1192523	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840142
22223	NC_010168	GGC	2	6	1192581	1192586	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840142
22224	NC_010168	ATGG	2	8	1192605	1192612	25 %	25 %	50 %	0 %	163840142
22225	NC_010168	CAG	2	6	1192674	1192679	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840142
22226	NC_010168	TGT	2	6	1192728	1192733	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840143
22227	NC_010168	T	6	6	1192744	1192749	0 %	100 %	0 %	0 %	163840143
22228	NC_010168	CTG	2	6	1192904	1192909	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840143
22229	NC_010168	CAC	2	6	1193109	1193114	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840143
22230	NC_010168	GTC	2	6	1193135	1193140	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840143
22231	NC_010168	GTT	2	6	1193188	1193193	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840143
22232	NC_010168	GGA	2	6	1193236	1193241	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840143
22233	NC_010168	AGTCC	2	10	1193242	1193251	20 %	20 %	20 %	40 %	163840143
22234	NC_010168	CTA	2	6	1193265	1193270	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840143
22235	NC_010168	CGGC	2	8	1193334	1193341	0 %	0 %	50 %	50 %	163840143
22236	NC_010168	GCG	2	6	1193408	1193413	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840143
22237	NC_010168	TGC	2	6	1193641	1193646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840143
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22239	NC_010168	GA	3	6	1193718	1193723	50 %	0 %	50 %	0 %	163840143
22240	NC_010168	GCTT	2	8	1193798	1193805	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22241	NC_010168	CAT	2	6	1193812	1193817	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
22242	NC_010168	CTG	2	6	1193843	1193848	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22243	NC_010168	ATCA	2	8	1193877	1193884	50 %	25 %	0 %	25 %	163840144
22244	NC_010168	CGT	2	6	1193886	1193891	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840144
22245	NC_010168	GCC	2	6	1193954	1193959	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840144
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22247	NC_010168	TGT	2	6	1194019	1194024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840144
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22251	NC_010168	TGG	2	6	1194184	1194189	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840144
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22267	NC_010168	TTG	2	6	1195344	1195349	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840145
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22274	NC_010168	TCAC	2	8	1195649	1195656	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22275	NC_010168	GGA	2	6	1195664	1195669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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22301	NC_010168	GAT	3	9	1196762	1196770	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840147
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22336	NC_010168	GCG	2	6	1198845	1198850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840151
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22342	NC_010168	ACCGC	2	10	1198977	1198986	20 %	0 %	20 %	60 %	163840150
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22346	NC_010168	GC	3	6	1199167	1199172	0 %	0 %	50 %	50 %	163840150
22347	NC_010168	AGC	2	6	1199188	1199193	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840150
22348	NC_010168	CGGC	2	8	1199463	1199470	0 %	0 %	50 %	50 %	163840152
22349	NC_010168	TGG	2	6	1199540	1199545	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840152
22350	NC_010168	ACG	2	6	1199549	1199554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840152
22351	NC_010168	GGC	3	9	1199568	1199576	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840152
22352	NC_010168	TGG	2	6	1199584	1199589	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840152
22353	NC_010168	CGG	2	6	1199631	1199636	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840152
22354	NC_010168	GCG	2	6	1199653	1199658	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840152
22355	NC_010168	GC	3	6	1199864	1199869	0 %	0 %	50 %	50 %	163840152
22356	NC_010168	CGGC	2	8	1199873	1199880	0 %	0 %	50 %	50 %	163840152
22357	NC_010168	TAAT	2	8	1199913	1199920	50 %	50 %	0 %	0 %	163840152
22358	NC_010168	GC	3	6	1199947	1199952	0 %	0 %	50 %	50 %	163840153
22359	NC_010168	CCG	2	6	1199960	1199965	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840153
22360	NC_010168	GCG	2	6	1200037	1200042	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840153
22361	NC_010168	GCA	2	6	1200071	1200076	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840153
22362	NC_010168	CTG	2	6	1200131	1200136	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22363	NC_010168	ATG	2	6	1200146	1200151	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22364	NC_010168	CAC	2	6	1200210	1200215	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840154
22365	NC_010168	ATCG	2	8	1200217	1200224	25 %	25 %	25 %	25 %	163840154
22366	NC_010168	ACG	2	6	1200242	1200247	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840154
22367	NC_010168	TCG	2	6	1200350	1200355	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840154
22368	NC_010168	CGTCGG	2	12	1200408	1200419	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	163840154
22369	NC_010168	TCA	2	6	1200533	1200538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840154
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22371	NC_010168	TGT	3	9	1200561	1200569	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840154
22372	NC_010168	TGA	2	6	1200570	1200575	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840154
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22374	NC_010168	GCC	2	6	1200613	1200618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840154
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22376	NC_010168	CAC	2	6	1200774	1200779	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840154
22377	NC_010168	GTG	2	6	1200826	1200831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840154
22378	NC_010168	GCAGA	2	10	1200844	1200853	40 %	0 %	40 %	20 %	163840154
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22380	NC_010168	GCC	2	6	1200984	1200989	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840154
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22383	NC_010168	GAT	2	6	1201038	1201043	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840154
22384	NC_010168	TGG	2	6	1201044	1201049	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840154
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22397	NC_010168	ACC	2	6	1201679	1201684	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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22400	NC_010168	CTG	2	6	1201903	1201908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840156
22401	NC_010168	TGC	2	6	1201910	1201915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840156
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22416	NC_010168	GGCT	2	8	1202563	1202570	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
22417	NC_010168	AATG	2	8	1202599	1202606	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
22418	NC_010168	GCC	2	6	1202610	1202615	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
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22430	NC_010168	TA	3	6	1203239	1203244	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22431	NC_010168	CAC	2	6	1203255	1203260	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
22432	NC_010168	GTG	2	6	1203296	1203301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
22433	NC_010168	G	16	16	1203341	1203356	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
22434	NC_010168	TTC	2	6	1203451	1203456	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840159
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22443	NC_010168	CTTCGT	2	12	1204071	1204082	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	163840159
22444	NC_010168	GGT	2	6	1204105	1204110	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840159
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22449	NC_010168	GCGA	2	8	1204337	1204344	25 %	0 %	50 %	25 %	163840159
22450	NC_010168	GCG	2	6	1204355	1204360	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840159
22451	NC_010168	CTG	2	6	1204389	1204394	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840159
22452	NC_010168	ACC	2	6	1204400	1204405	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840159
22453	NC_010168	GAT	2	6	1204502	1204507	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840159
22454	NC_010168	ATC	2	6	1204513	1204518	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840159
22455	NC_010168	TGCC	2	8	1204559	1204566	0 %	25 %	25 %	50 %	163840159
22456	NC_010168	TTC	2	6	1204589	1204594	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840159
22457	NC_010168	GAC	2	6	1204763	1204768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840159
22458	NC_010168	TCA	2	6	1204857	1204862	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840159
22459	NC_010168	CCA	2	6	1204915	1204920	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840159
22460	NC_010168	TCA	2	6	1204988	1204993	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840159
22461	NC_010168	ACG	2	6	1205008	1205013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840159
22462	NC_010168	TTC	2	6	1205032	1205037	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840159
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22464	NC_010168	CG	3	6	1205127	1205132	0 %	0 %	50 %	50 %	163840159
22465	NC_010168	GCG	2	6	1205164	1205169	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840159
22466	NC_010168	CTT	2	6	1205283	1205288	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840159
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22493	NC_010168	AGC	2	6	1207024	1207029	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840159
22494	NC_010168	CGA	2	6	1207034	1207039	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840159
22495	NC_010168	TGT	2	6	1207123	1207128	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840159
22496	NC_010168	GAT	2	6	1207153	1207158	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840159
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