MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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21002	NC_010168	CCGTT	2	10	1128107	1128116	0 %	40 %	20 %	40 %	163840068
21003	NC_010168	CTG	2	6	1128259	1128264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840068
21004	NC_010168	TCGCC	2	10	1128378	1128387	0 %	20 %	20 %	60 %	163840068
21005	NC_010168	GCT	2	6	1128442	1128447	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840068
21006	NC_010168	GCT	2	6	1128454	1128459	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840068
21007	NC_010168	TGG	3	9	1128499	1128507	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840068
21008	NC_010168	CTG	2	6	1128590	1128595	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840068
21009	NC_010168	TGA	2	6	1128652	1128657	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840068
21010	NC_010168	GCGTG	2	10	1128670	1128679	0 %	20 %	60 %	20 %	163840068
21011	NC_010168	CGC	2	6	1128706	1128711	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840068
21012	NC_010168	GTTCA	2	10	1128714	1128723	20 %	40 %	20 %	20 %	163840068
21013	NC_010168	TCG	2	6	1128747	1128752	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840069
21014	NC_010168	CGGG	2	8	1128776	1128783	0 %	0 %	75 %	25 %	163840069
21015	NC_010168	CGG	2	6	1128794	1128799	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840069
21016	NC_010168	CAT	2	6	1128902	1128907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840069
21017	NC_010168	TGG	2	6	1128915	1128920	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840069
21018	NC_010168	GAT	2	6	1128933	1128938	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840069
21019	NC_010168	GCC	2	6	1129008	1129013	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840069
21020	NC_010168	AGT	2	6	1129344	1129349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840069
21021	NC_010168	AAC	2	6	1129430	1129435	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840069
21022	NC_010168	TGG	2	6	1129462	1129467	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840069
21023	NC_010168	TGC	2	6	1129502	1129507	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840069
21024	NC_010168	GC	4	8	1129521	1129528	0 %	0 %	50 %	50 %	163840069
21025	NC_010168	CGG	2	6	1129556	1129561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840069
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21027	NC_010168	GAG	2	6	1129704	1129709	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840069
21028	NC_010168	ATG	2	6	1129804	1129809	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840069
21029	NC_010168	CCG	2	6	1129834	1129839	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840069
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21031	NC_010168	CTTC	2	8	1129967	1129974	0 %	50 %	0 %	50 %	163840070
21032	NC_010168	GGT	2	6	1129975	1129980	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840070
21033	NC_010168	GCG	2	6	1130031	1130036	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840070
21034	NC_010168	CGG	2	6	1130073	1130078	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840070
21035	NC_010168	CAT	2	6	1130180	1130185	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840070
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21038	NC_010168	TGA	2	6	1130425	1130430	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840070
21039	NC_010168	TGC	2	6	1130535	1130540	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840070
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21041	NC_010168	CGT	2	6	1130713	1130718	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840070
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21050	NC_010168	TGC	2	6	1131344	1131349	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840071
21051	NC_010168	GGC	2	6	1131474	1131479	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840071
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21053	NC_010168	CGC	2	6	1131609	1131614	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840071
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21063	NC_010168	GCG	2	6	1132202	1132207	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840071
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21068	NC_010168	GCC	2	6	1132676	1132681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840072
21069	NC_010168	TACCCG	2	12	1132717	1132728	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	163840072
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21071	NC_010168	TGA	2	6	1132830	1132835	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840072
21072	NC_010168	CGT	2	6	1132885	1132890	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840072
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21086	NC_010168	GCC	2	6	1133903	1133908	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840072
21087	NC_010168	GCT	2	6	1133909	1133914	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840072
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21089	NC_010168	ATTG	2	8	1134064	1134071	25 %	50 %	25 %	0 %	163840072
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21091	NC_010168	AAACC	2	10	1134151	1134160	60 %	0 %	0 %	40 %	163840072
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21099	NC_010168	GC	3	6	1134565	1134570	0 %	0 %	50 %	50 %	163840073
21100	NC_010168	CCGG	2	8	1134573	1134580	0 %	0 %	50 %	50 %	163840073
21101	NC_010168	CGT	2	6	1134593	1134598	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840073
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21109	NC_010168	GCA	2	6	1135091	1135096	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840073
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21114	NC_010168	CTG	3	9	1135218	1135226	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840073
21115	NC_010168	GTT	2	6	1135248	1135253	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840073
21116	NC_010168	TTC	2	6	1135264	1135269	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840073
21117	NC_010168	TGC	2	6	1135414	1135419	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840074
21118	NC_010168	TCA	2	6	1135431	1135436	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840074
21119	NC_010168	GTT	2	6	1135457	1135462	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840074
21120	NC_010168	GA	3	6	1135635	1135640	50 %	0 %	50 %	0 %	163840074
21121	NC_010168	GTT	2	6	1135648	1135653	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840074
21122	NC_010168	CTT	2	6	1135691	1135696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840074
21123	NC_010168	GTT	2	6	1135751	1135756	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840074
21124	NC_010168	CCG	2	6	1135824	1135829	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840074
21125	NC_010168	GCC	2	6	1135847	1135852	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840074
21126	NC_010168	CAT	2	6	1136029	1136034	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840074
21127	NC_010168	CGC	2	6	1136035	1136040	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840074
21128	NC_010168	TGC	2	6	1136059	1136064	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840074
21129	NC_010168	CGC	2	6	1136116	1136121	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840074
21130	NC_010168	TGA	2	6	1136122	1136127	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840074
21131	NC_010168	GGA	2	6	1136192	1136197	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840074
21132	NC_010168	CGC	2	6	1136335	1136340	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840075
21133	NC_010168	GGC	2	6	1136353	1136358	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840075
21134	NC_010168	GGT	2	6	1136398	1136403	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840075
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21138	NC_010168	TGA	2	6	1136640	1136645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840075
21139	NC_010168	GA	3	6	1136744	1136749	50 %	0 %	50 %	0 %	163840075
21140	NC_010168	CGG	2	6	1136796	1136801	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840075
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21142	NC_010168	GCT	2	6	1136902	1136907	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840075
21143	NC_010168	GC	3	6	1136952	1136957	0 %	0 %	50 %	50 %	163840075
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21145	NC_010168	GC	3	6	1136987	1136992	0 %	0 %	50 %	50 %	163840075
21146	NC_010168	CGG	2	6	1136994	1136999	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840075
21147	NC_010168	GTC	2	6	1137014	1137019	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840075
21148	NC_010168	TC	3	6	1137025	1137030	0 %	50 %	0 %	50 %	163840075
21149	NC_010168	CGA	2	6	1137046	1137051	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840075
21150	NC_010168	ATG	2	6	1137056	1137061	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840075
21151	NC_010168	TCAA	2	8	1137125	1137132	50 %	25 %	0 %	25 %	163840075
21152	NC_010168	GAT	2	6	1137136	1137141	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840075
21153	NC_010168	TGAT	2	8	1137160	1137167	25 %	50 %	25 %	0 %	163840075
21154	NC_010168	CAT	2	6	1137181	1137186	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840075
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21156	NC_010168	TTG	2	6	1137350	1137355	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840076
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21184	NC_010168	GCTTGC	2	12	1138833	1138844	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840077
21185	NC_010168	GGC	2	6	1138957	1138962	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840077
21186	NC_010168	TGA	2	6	1138977	1138982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840077
21187	NC_010168	GCTG	2	8	1138995	1139002	0 %	25 %	50 %	25 %	163840077
21188	NC_010168	GCA	2	6	1139157	1139162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840077
21189	NC_010168	GAT	2	6	1139165	1139170	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840077
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21212	NC_010168	AAAG	2	8	1140715	1140722	75 %	0 %	25 %	0 %	163840078
21213	NC_010168	TGC	2	6	1140740	1140745	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840078
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21217	NC_010168	TGG	2	6	1140881	1140886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21218	NC_010168	GGC	2	6	1140903	1140908	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
21219	NC_010168	ATT	2	6	1140942	1140947	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
21220	NC_010168	AAAGG	2	10	1140987	1140996	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
21221	NC_010168	AAGTTG	2	12	1141059	1141070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840079
21222	NC_010168	AGCT	2	8	1141086	1141093	25 %	25 %	25 %	25 %	163840079
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21228	NC_010168	CG	3	6	1141272	1141277	0 %	0 %	50 %	50 %	163840079
21229	NC_010168	GCG	2	6	1141296	1141301	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840079
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21345	NC_010168	GC	3	6	1147545	1147550	0 %	0 %	50 %	50 %	163840087
21346	NC_010168	TCG	2	6	1147574	1147579	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21347	NC_010168	AGGCA	2	10	1147586	1147595	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
21348	NC_010168	GGC	2	6	1147668	1147673	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840088
21349	NC_010168	GGC	2	6	1147680	1147685	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840088
21350	NC_010168	CCGCG	2	10	1147742	1147751	0 %	0 %	40 %	60 %	163840088
21351	NC_010168	CTG	2	6	1147811	1147816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840088
21352	NC_010168	GC	3	6	1147838	1147843	0 %	0 %	50 %	50 %	163840088
21353	NC_010168	CGG	2	6	1148001	1148006	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840088
21354	NC_010168	T	6	6	1148061	1148066	0 %	100 %	0 %	0 %	163840088
21355	NC_010168	CGC	2	6	1148141	1148146	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840088
21356	NC_010168	T	6	6	1148204	1148209	0 %	100 %	0 %	0 %	163840088
21357	NC_010168	GAT	2	6	1148225	1148230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840088
21358	NC_010168	TTTGC	2	10	1148240	1148249	0 %	60 %	20 %	20 %	163840088
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21362	NC_010168	AG	3	6	1148492	1148497	50 %	0 %	50 %	0 %	163840088
21363	NC_010168	TTG	2	6	1148512	1148517	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840088
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21369	NC_010168	GT	3	6	1148810	1148815	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21370	NC_010168	CGG	2	6	1148845	1148850	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840089
21371	NC_010168	GTA	2	6	1148873	1148878	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840089
21372	NC_010168	TGG	2	6	1148897	1148902	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840089
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21411	NC_010168	ACT	2	6	1151012	1151017	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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21414	NC_010168	GCA	2	6	1151240	1151245	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840093
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21427	NC_010168	GAA	2	6	1151847	1151852	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21428	NC_010168	GTT	2	6	1151883	1151888	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840094
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21446	NC_010168	ATC	2	6	1152726	1152731	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840095
21447	NC_010168	CGG	2	6	1152847	1152852	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840095
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21450	NC_010168	TGC	2	6	1153069	1153074	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840095
21451	NC_010168	GGC	2	6	1153099	1153104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840095
21452	NC_010168	CTG	2	6	1153118	1153123	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840095
21453	NC_010168	GGAT	2	8	1153142	1153149	25 %	25 %	50 %	0 %	163840095
21454	NC_010168	CTG	2	6	1153154	1153159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840095
21455	NC_010168	GGT	2	6	1153177	1153182	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840095
21456	NC_010168	CGG	2	6	1153226	1153231	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840095
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21459	NC_010168	CGAA	2	8	1153434	1153441	50 %	0 %	25 %	25 %	163840096
21460	NC_010168	GC	3	6	1153446	1153451	0 %	0 %	50 %	50 %	163840096
21461	NC_010168	CGC	2	6	1153500	1153505	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840096
21462	NC_010168	CGGCT	2	10	1153511	1153520	0 %	20 %	40 %	40 %	163840096
21463	NC_010168	ACT	2	6	1153694	1153699	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840096
21464	NC_010168	GGGC	2	8	1153795	1153802	0 %	0 %	75 %	25 %	163840097
21465	NC_010168	GTG	2	6	1153894	1153899	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840097
21466	NC_010168	GCC	2	6	1153920	1153925	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840097
21467	NC_010168	AGCTCA	2	12	1154022	1154033	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163840097
21468	NC_010168	TC	3	6	1154046	1154051	0 %	50 %	0 %	50 %	163840097
21469	NC_010168	A	6	6	1154080	1154085	100 %	0 %	0 %	0 %	163840097
21470	NC_010168	ATG	2	6	1154095	1154100	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840097
21471	NC_010168	GGAA	2	8	1154208	1154215	50 %	0 %	50 %	0 %	163840098
21472	NC_010168	TG	3	6	1154277	1154282	0 %	50 %	50 %	0 %	163840098
21473	NC_010168	GTG	2	6	1154289	1154294	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840098
21474	NC_010168	CGA	2	6	1154324	1154329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840098
21475	NC_010168	CGA	2	6	1154333	1154338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840098
21476	NC_010168	TGA	2	6	1154374	1154379	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840098
21477	NC_010168	GCT	2	6	1154399	1154404	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840098
21478	NC_010168	CAG	2	6	1154508	1154513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840099
21479	NC_010168	TCG	2	6	1154514	1154519	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840099
21480	NC_010168	GTTG	2	8	1154527	1154534	0 %	50 %	50 %	0 %	163840099
21481	NC_010168	TTA	2	6	1154540	1154545	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840099
21482	NC_010168	TTC	2	6	1154583	1154588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840099
21483	NC_010168	TTGA	2	8	1154603	1154610	25 %	50 %	25 %	0 %	163840099
21484	NC_010168	GCC	2	6	1154615	1154620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840099
21485	NC_010168	AGGA	2	8	1154661	1154668	50 %	0 %	50 %	0 %	163840099
21486	NC_010168	ATTG	2	8	1154686	1154693	25 %	50 %	25 %	0 %	163840099
21487	NC_010168	TTC	2	6	1154731	1154736	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840099
21488	NC_010168	GCCGAT	2	12	1154785	1154796	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163840099
21489	NC_010168	TGC	2	6	1154842	1154847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840099
21490	NC_010168	AAC	2	6	1154882	1154887	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840100
21491	NC_010168	TCT	2	6	1154914	1154919	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840100
21492	NC_010168	GGT	2	6	1154987	1154992	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840100
21493	NC_010168	GTA	2	6	1155039	1155044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840100
21494	NC_010168	TGC	2	6	1155047	1155052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840100
21495	NC_010168	CGT	2	6	1155215	1155220	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840100
21496	NC_010168	GCT	2	6	1155378	1155383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21497	NC_010168	GAT	2	6	1155412	1155417	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21498	NC_010168	GTG	2	6	1155434	1155439	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
21499	NC_010168	TA	3	6	1155483	1155488	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21500	NC_010168	GCC	2	6	1155528	1155533	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840101

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