MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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20117	NC_010168	TCG	3	9	1079620	1079628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20118	NC_010168	GCT	2	6	1079630	1079635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20119	NC_010168	GCCA	2	8	1079820	1079827	25 %	0 %	25 %	50 %	163840012
20120	NC_010168	CGA	2	6	1079893	1079898	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20121	NC_010168	ACG	2	6	1079905	1079910	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20122	NC_010168	AAG	2	6	1079944	1079949	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840012
20123	NC_010168	CTG	2	6	1079972	1079977	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20124	NC_010168	GCC	3	9	1079997	1080005	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840012
20125	NC_010168	GGC	2	6	1080021	1080026	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840012
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20127	NC_010168	GCC	2	6	1080063	1080068	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840012
20128	NC_010168	GC	3	6	1080106	1080111	0 %	0 %	50 %	50 %	163840012
20129	NC_010168	GGT	2	6	1080117	1080122	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840012
20130	NC_010168	T	6	6	1080140	1080145	0 %	100 %	0 %	0 %	163840012
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20132	NC_010168	CTT	2	6	1080291	1080296	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840012
20133	NC_010168	TGC	2	6	1080318	1080323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20134	NC_010168	TCG	2	6	1080361	1080366	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20135	NC_010168	ATG	2	6	1080367	1080372	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840012
20136	NC_010168	CAG	2	6	1080380	1080385	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20137	NC_010168	TGC	2	6	1080417	1080422	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20138	NC_010168	CGG	2	6	1080431	1080436	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840012
20139	NC_010168	CTG	2	6	1080481	1080486	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840012
20140	NC_010168	CTA	2	6	1080524	1080529	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20141	NC_010168	GCCGC	2	10	1080545	1080554	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
20142	NC_010168	CGC	2	6	1080624	1080629	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
20143	NC_010168	GAC	2	6	1080640	1080645	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20144	NC_010168	GAGCA	2	10	1080798	1080807	40 %	0 %	40 %	20 %	163840013
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20146	NC_010168	GAG	2	6	1080852	1080857	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163840013
20147	NC_010168	AACA	2	8	1080858	1080865	75 %	0 %	0 %	25 %	163840013
20148	NC_010168	TGG	2	6	1080879	1080884	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840013
20149	NC_010168	GCA	2	6	1080933	1080938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840013
20150	NC_010168	TCA	2	6	1081016	1081021	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840013
20151	NC_010168	ACCG	2	8	1081097	1081104	25 %	0 %	25 %	50 %	163840013
20152	NC_010168	CAGC	2	8	1081119	1081126	25 %	0 %	25 %	50 %	163840013
20153	NC_010168	TGC	2	6	1081156	1081161	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840013
20154	NC_010168	GCGG	2	8	1081200	1081207	0 %	0 %	75 %	25 %	163840013
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20165	NC_010168	ATT	2	6	1081617	1081622	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163840013
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20169	NC_010168	CAT	2	6	1081901	1081906	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840013
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20172	NC_010168	CTT	2	6	1081936	1081941	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840013
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20175	NC_010168	ATC	2	6	1082262	1082267	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840013
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20178	NC_010168	CAG	2	6	1082354	1082359	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840013
20179	NC_010168	TCA	2	6	1082440	1082445	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840013
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20185	NC_010168	GAA	2	6	1082644	1082649	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840014
20186	NC_010168	CGGTTT	2	12	1082659	1082670	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	163840014
20187	NC_010168	CTG	2	6	1082754	1082759	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840014
20188	NC_010168	AGTG	2	8	1082806	1082813	25 %	25 %	50 %	0 %	163840014
20189	NC_010168	CAC	2	6	1082820	1082825	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840014
20190	NC_010168	TGC	2	6	1082826	1082831	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840014
20191	NC_010168	GCCGA	2	10	1082839	1082848	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
20192	NC_010168	ACA	2	6	1082854	1082859	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
20193	NC_010168	GC	4	8	1082884	1082891	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20194	NC_010168	CCA	2	6	1082993	1082998	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840015
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20196	NC_010168	CAAT	2	8	1083047	1083054	50 %	25 %	0 %	25 %	163840015
20197	NC_010168	AGA	2	6	1083082	1083087	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840015
20198	NC_010168	TGA	2	6	1083099	1083104	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840015
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20203	NC_010168	CGG	2	6	1083430	1083435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840015
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20209	NC_010168	AGCC	2	8	1083627	1083634	25 %	0 %	25 %	50 %	163840015
20210	NC_010168	AGC	2	6	1083716	1083721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840015
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20216	NC_010168	GACC	2	8	1084056	1084063	25 %	0 %	25 %	50 %	163840015
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20219	NC_010168	GCCG	2	8	1084181	1084188	0 %	0 %	50 %	50 %	163840016
20220	NC_010168	CG	3	6	1084192	1084197	0 %	0 %	50 %	50 %	163840016
20221	NC_010168	ACA	2	6	1084216	1084221	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163840016
20222	NC_010168	AAT	2	6	1084255	1084260	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163840016
20223	NC_010168	CGG	2	6	1084274	1084279	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840016
20224	NC_010168	CCG	2	6	1084375	1084380	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840016
20225	NC_010168	CCAAG	2	10	1084415	1084424	40 %	0 %	20 %	40 %	163840016
20226	NC_010168	GC	3	6	1084437	1084442	0 %	0 %	50 %	50 %	163840016
20227	NC_010168	TGC	2	6	1084469	1084474	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840016
20228	NC_010168	CGG	2	6	1084616	1084621	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20229	NC_010168	ATG	2	6	1084657	1084662	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20230	NC_010168	ATG	2	6	1084711	1084716	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20231	NC_010168	CAC	2	6	1084727	1084732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20232	NC_010168	GT	3	6	1084760	1084765	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
20233	NC_010168	CGG	2	6	1084795	1084800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840017
20234	NC_010168	GTA	2	6	1084823	1084828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840017
20235	NC_010168	TGG	2	6	1084847	1084852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840017
20236	NC_010168	GGT	2	6	1084882	1084887	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840017
20237	NC_010168	CTT	2	6	1084924	1084929	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163840017
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20261	NC_010168	CGG	2	6	1086289	1086294	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
20262	NC_010168	CCA	2	6	1086326	1086331	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
20263	NC_010168	AAGC	2	8	1086356	1086363	50 %	0 %	25 %	25 %	163840020
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20348	NC_010168	CGA	2	6	1091572	1091577	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840027
20349	NC_010168	CAAG	2	8	1091596	1091603	50 %	0 %	25 %	25 %	163840027
20350	NC_010168	ATCA	2	8	1091691	1091698	50 %	25 %	0 %	25 %	163840027
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20353	NC_010168	GCAGC	2	10	1092111	1092120	20 %	0 %	40 %	40 %	163840028
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20364	NC_010168	GCCA	2	8	1092936	1092943	25 %	0 %	25 %	50 %	163840030
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20432	NC_010168	GCC	2	6	1097127	1097132	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163840035
20433	NC_010168	CGT	2	6	1097174	1097179	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840035
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20444	NC_010168	AAT	2	6	1097914	1097919	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163840035
20445	NC_010168	CGA	2	6	1097941	1097946	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
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20449	NC_010168	GAA	2	6	1098187	1098192	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840036
20450	NC_010168	ACG	2	6	1098237	1098242	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
20451	NC_010168	GCTG	2	8	1098277	1098284	0 %	25 %	50 %	25 %	163840036
20452	NC_010168	GC	4	8	1098313	1098320	0 %	0 %	50 %	50 %	163840036
20453	NC_010168	GAA	2	6	1098326	1098331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163840036
20454	NC_010168	GGC	2	6	1098356	1098361	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840036
20455	NC_010168	ACT	2	6	1098387	1098392	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840036
20456	NC_010168	TGG	2	6	1098426	1098431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840036
20457	NC_010168	ACCAA	2	10	1098440	1098449	60 %	0 %	0 %	40 %	163840036
20458	NC_010168	TGC	2	6	1098496	1098501	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840036
20459	NC_010168	GCA	2	6	1098597	1098602	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
20460	NC_010168	GC	3	6	1098646	1098651	0 %	0 %	50 %	50 %	163840036
20461	NC_010168	CGG	2	6	1098706	1098711	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840036
20462	NC_010168	ACG	2	6	1098755	1098760	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
20463	NC_010168	GAT	2	6	1098788	1098793	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840036
20464	NC_010168	GGT	2	6	1098826	1098831	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840036
20465	NC_010168	CAC	2	6	1098832	1098837	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163840036
20466	NC_010168	GC	4	8	1098859	1098866	0 %	0 %	50 %	50 %	163840036
20467	NC_010168	CCT	2	6	1098878	1098883	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163840036
20468	NC_010168	ACG	2	6	1098889	1098894	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
20469	NC_010168	TGT	2	6	1098943	1098948	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163840036
20470	NC_010168	CTG	2	6	1098999	1099004	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840036
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20475	NC_010168	CGA	2	6	1099231	1099236	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163840036
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20481	NC_010168	TGA	2	6	1099344	1099349	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163840036
20482	NC_010168	ACT	2	6	1099352	1099357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840036
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20485	NC_010168	ATC	2	6	1099469	1099474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163840037
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20489	NC_010168	GGC	3	9	1099647	1099655	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840037
20490	NC_010168	GTG	2	6	1099732	1099737	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840037
20491	NC_010168	TGG	2	6	1099805	1099810	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163840037
20492	NC_010168	GCG	3	9	1099820	1099828	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163840037
20493	NC_010168	TGC	2	6	1099845	1099850	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163840037
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