MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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19002	NC_010168	TGC	2	6	1020187	1020192	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839950
19003	NC_010168	GC	3	6	1020191	1020196	0 %	0 %	50 %	50 %	163839950
19004	NC_010168	CGG	2	6	1020223	1020228	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839950
19005	NC_010168	AGT	2	6	1020313	1020318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839950
19006	NC_010168	GCC	2	6	1020641	1020646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839950
19007	NC_010168	GTG	2	6	1020666	1020671	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839950
19008	NC_010168	CTT	2	6	1020715	1020720	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839950
19009	NC_010168	CG	3	6	1020776	1020781	0 %	0 %	50 %	50 %	163839950
19010	NC_010168	GC	3	6	1020933	1020938	0 %	0 %	50 %	50 %	163839950
19011	NC_010168	TTG	2	6	1021035	1021040	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839950
19012	NC_010168	CAG	2	6	1021042	1021047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839950
19013	NC_010168	GGC	2	6	1021058	1021063	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839950
19014	NC_010168	CGC	2	6	1021087	1021092	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839950
19015	NC_010168	GGC	2	6	1021169	1021174	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839950
19016	NC_010168	CTG	2	6	1021214	1021219	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839950
19017	NC_010168	TGGC	2	8	1021330	1021337	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
19018	NC_010168	CAGCG	2	10	1021492	1021501	20 %	0 %	40 %	40 %	163839951
19019	NC_010168	GC	4	8	1021532	1021539	0 %	0 %	50 %	50 %	163839951
19020	NC_010168	CGC	2	6	1021589	1021594	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839951
19021	NC_010168	GCA	2	6	1021611	1021616	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839951
19022	NC_010168	GCG	2	6	1021693	1021698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839951
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19027	NC_010168	GCT	2	6	1021888	1021893	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839951
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19029	NC_010168	GCA	2	6	1022058	1022063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839951
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19031	NC_010168	CTG	2	6	1022162	1022167	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839951
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19034	NC_010168	CGA	2	6	1022338	1022343	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839951
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19038	NC_010168	TAGA	2	8	1022474	1022481	50 %	25 %	25 %	0 %	163839951
19039	NC_010168	TAG	2	6	1022559	1022564	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839951
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19043	NC_010168	TGC	2	6	1023082	1023087	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839952
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19051	NC_010168	GCT	2	6	1023437	1023442	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839952
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19054	NC_010168	CAGCT	2	10	1023547	1023556	20 %	20 %	20 %	40 %	163839953
19055	NC_010168	GGCCGC	2	12	1023568	1023579	0 %	0 %	50 %	50 %	163839953
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19069	NC_010168	AGCTG	2	10	1024174	1024183	20 %	20 %	40 %	20 %	163839954
19070	NC_010168	AGGGA	2	10	1024360	1024369	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
19071	NC_010168	AATG	2	8	1024372	1024379	50 %	25 %	25 %	0 %	163839955
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19085	NC_010168	CGG	2	6	1025098	1025103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839956
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19089	NC_010168	CAG	2	6	1025179	1025184	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839956
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19091	NC_010168	CTG	2	6	1025199	1025204	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839956
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19093	NC_010168	GC	3	6	1025268	1025273	0 %	0 %	50 %	50 %	163839956
19094	NC_010168	TAG	2	6	1025326	1025331	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839956
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19099	NC_010168	TGG	2	6	1025794	1025799	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839958
19100	NC_010168	TGC	2	6	1025910	1025915	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839958
19101	NC_010168	CAATT	2	10	1025920	1025929	40 %	40 %	0 %	20 %	163839958
19102	NC_010168	TGC	2	6	1025934	1025939	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839958
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19111	NC_010168	GTT	2	6	1026513	1026518	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19112	NC_010168	AGC	2	6	1026625	1026630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839959
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19115	NC_010168	ATCCGA	2	12	1026840	1026851	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163839960
19116	NC_010168	TCG	2	6	1026853	1026858	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839960
19117	NC_010168	CTT	2	6	1026861	1026866	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839960
19118	NC_010168	GTC	2	6	1026925	1026930	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839960
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19122	NC_010168	GC	3	6	1027259	1027264	0 %	0 %	50 %	50 %	163839961
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19230	NC_010168	GGC	2	6	1033462	1033467	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839967
19231	NC_010168	GGGC	2	8	1033488	1033495	0 %	0 %	75 %	25 %	163839967
19232	NC_010168	TTG	2	6	1033583	1033588	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839967
19233	NC_010168	GC	3	6	1033737	1033742	0 %	0 %	50 %	50 %	163839967
19234	NC_010168	GAG	2	6	1033766	1033771	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839967
19235	NC_010168	GGC	2	6	1033858	1033863	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839967
19236	NC_010168	AGA	2	6	1033881	1033886	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839967
19237	NC_010168	GC	3	6	1033917	1033922	0 %	0 %	50 %	50 %	163839967
19238	NC_010168	TCGC	2	8	1033942	1033949	0 %	25 %	25 %	50 %	163839967
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19240	NC_010168	GCG	2	6	1034018	1034023	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839967
19241	NC_010168	TCGC	2	8	1034036	1034043	0 %	25 %	25 %	50 %	163839967
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19245	NC_010168	GCT	3	9	1034188	1034196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839967
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19249	NC_010168	GCT	2	6	1034305	1034310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839967
19250	NC_010168	GT	3	6	1034324	1034329	0 %	50 %	50 %	0 %	163839967
19251	NC_010168	CACG	2	8	1034370	1034377	25 %	0 %	25 %	50 %	163839967
19252	NC_010168	TGGC	2	8	1034395	1034402	0 %	25 %	50 %	25 %	163839967
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19256	NC_010168	CTG	2	6	1034474	1034479	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839967
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19259	NC_010168	GCAA	2	8	1034614	1034621	50 %	0 %	25 %	25 %	163839967
19260	NC_010168	TTGG	2	8	1034679	1034686	0 %	50 %	50 %	0 %	163839967
19261	NC_010168	GAG	2	6	1034803	1034808	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839968
19262	NC_010168	GATC	2	8	1034863	1034870	25 %	25 %	25 %	25 %	163839968
19263	NC_010168	GTG	2	6	1034997	1035002	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839968
19264	NC_010168	ACG	2	6	1035006	1035011	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839968
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19266	NC_010168	TGA	2	6	1035039	1035044	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839968
19267	NC_010168	GCA	2	6	1035076	1035081	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839968
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19269	NC_010168	CCTA	2	8	1035185	1035192	25 %	25 %	0 %	50 %	163839968
19270	NC_010168	GC	3	6	1035196	1035201	0 %	0 %	50 %	50 %	163839968
19271	NC_010168	AAG	2	6	1035215	1035220	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839968
19272	NC_010168	CGAA	2	8	1035270	1035277	50 %	0 %	25 %	25 %	163839968
19273	NC_010168	CGGA	2	8	1035283	1035290	25 %	0 %	50 %	25 %	163839968
19274	NC_010168	GCT	2	6	1035379	1035384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839968
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19277	NC_010168	GCG	2	6	1035490	1035495	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839968
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19300	NC_010168	CGG	2	6	1036728	1036733	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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19303	NC_010168	GC	3	6	1037189	1037194	0 %	0 %	50 %	50 %	163839970
19304	NC_010168	CGA	2	6	1037278	1037283	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839970
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19309	NC_010168	TGC	2	6	1037623	1037628	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839970
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19319	NC_010168	TCCT	2	8	1037937	1037944	0 %	50 %	0 %	50 %	163839971
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19327	NC_010168	GCT	2	6	1038373	1038378	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839971
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19329	NC_010168	GCA	2	6	1038505	1038510	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19330	NC_010168	CGT	2	6	1038522	1038527	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19331	NC_010168	TCG	2	6	1038529	1038534	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19332	NC_010168	CTGAT	2	10	1038556	1038565	20 %	40 %	20 %	20 %	163839972
19333	NC_010168	GAAA	2	8	1038581	1038588	75 %	0 %	25 %	0 %	163839972
19334	NC_010168	ACA	2	6	1038632	1038637	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839972
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19336	NC_010168	TGC	3	9	1038659	1038667	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19337	NC_010168	GGC	2	6	1038690	1038695	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839972
19338	NC_010168	CGA	2	6	1038803	1038808	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19339	NC_010168	GTG	2	6	1038813	1038818	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839972
19340	NC_010168	ACG	2	6	1038895	1038900	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839972
19341	NC_010168	GC	3	6	1038949	1038954	0 %	0 %	50 %	50 %	163839972
19342	NC_010168	ATG	2	6	1038975	1038980	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839972
19343	NC_010168	GCT	2	6	1039163	1039168	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839972
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