MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
58501	NC_010168	TGC	2	6	3137770	3137775	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58502	NC_010168	CGT	2	6	3137878	3137883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58503	NC_010168	ACG	2	6	3137910	3137915	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58504	NC_010168	CGG	2	6	3137947	3137952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842258
58505	NC_010168	ACC	2	6	3137955	3137960	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842258
58506	NC_010168	TAG	2	6	3138018	3138023	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842258
58507	NC_010168	CGG	2	6	3138025	3138030	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842258
58508	NC_010168	TGC	2	6	3138042	3138047	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58509	NC_010168	GTC	2	6	3138060	3138065	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58510	NC_010168	CTG	2	6	3138134	3138139	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58511	NC_010168	TGGAC	2	10	3138159	3138168	20 %	20 %	40 %	20 %	163842258
58512	NC_010168	ACG	2	6	3138221	3138226	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58513	NC_010168	GCCG	2	8	3138238	3138245	0 %	0 %	50 %	50 %	163842258
58514	NC_010168	CGA	2	6	3138286	3138291	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842258
58515	NC_010168	CG	4	8	3138314	3138321	0 %	0 %	50 %	50 %	163842258
58516	NC_010168	C	6	6	3138361	3138366	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
58517	NC_010168	GCAG	2	8	3138468	3138475	25 %	0 %	50 %	25 %	163842259
58518	NC_010168	GCA	2	6	3138504	3138509	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58519	NC_010168	CCACC	2	10	3138512	3138521	20 %	0 %	0 %	80 %	163842259
58520	NC_010168	CTG	2	6	3138532	3138537	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58521	NC_010168	CCG	3	9	3138547	3138555	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842259
58522	NC_010168	GGC	2	6	3138613	3138618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842259
58523	NC_010168	GAC	2	6	3138829	3138834	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58524	NC_010168	GC	3	6	3138841	3138846	0 %	0 %	50 %	50 %	163842259
58525	NC_010168	CAA	2	6	3138875	3138880	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842259
58526	NC_010168	TGC	2	6	3138900	3138905	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58527	NC_010168	CAG	2	6	3138907	3138912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58528	NC_010168	ATC	2	6	3138933	3138938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842259
58529	NC_010168	ACG	2	6	3139067	3139072	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58530	NC_010168	GGC	2	6	3139088	3139093	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842259
58531	NC_010168	CTC	2	6	3139142	3139147	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842259
58532	NC_010168	CCG	2	6	3139194	3139199	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842259
58533	NC_010168	CAG	2	6	3139205	3139210	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58534	NC_010168	CAGC	2	8	3139213	3139220	25 %	0 %	25 %	50 %	163842259
58535	NC_010168	ACC	2	6	3139244	3139249	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842259
58536	NC_010168	CGT	2	6	3139375	3139380	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58537	NC_010168	GC	3	6	3139388	3139393	0 %	0 %	50 %	50 %	163842259
58538	NC_010168	GCG	2	6	3139398	3139403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842259
58539	NC_010168	GCA	2	6	3139440	3139445	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58540	NC_010168	CGT	2	6	3139606	3139611	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58541	NC_010168	ACAT	2	8	3139718	3139725	50 %	25 %	0 %	25 %	163842259
58542	NC_010168	CCAC	2	8	3139770	3139777	25 %	0 %	0 %	75 %	163842259
58543	NC_010168	GAGCT	2	10	3139782	3139791	20 %	20 %	40 %	20 %	163842259
58544	NC_010168	CTG	2	6	3139831	3139836	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842259
58545	NC_010168	CTG	2	6	3139898	3139903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842260
58546	NC_010168	ATC	2	6	3139921	3139926	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842260
58547	NC_010168	TGCTG	2	10	3140049	3140058	0 %	40 %	40 %	20 %	163842260
58548	NC_010168	GTT	2	6	3140062	3140067	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842260
58549	NC_010168	CTA	2	6	3140217	3140222	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842260
58550	NC_010168	CCA	2	6	3140235	3140240	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842260
58551	NC_010168	AGCCA	2	10	3140291	3140300	40 %	0 %	20 %	40 %	163842260
58552	NC_010168	GATC	2	8	3140407	3140414	25 %	25 %	25 %	25 %	163842260
58553	NC_010168	GCCG	2	8	3140461	3140468	0 %	0 %	50 %	50 %	163842260
58554	NC_010168	CCAG	2	8	3140519	3140526	25 %	0 %	25 %	50 %	163842260
58555	NC_010168	CGT	2	6	3140654	3140659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842260
58556	NC_010168	AAACAG	2	12	3140662	3140673	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	163842260
58557	NC_010168	TAA	2	6	3140731	3140736	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163842260
58558	NC_010168	GCA	2	6	3140756	3140761	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842260
58559	NC_010168	CTGC	2	8	3140872	3140879	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
58560	NC_010168	AGA	2	6	3140952	3140957	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58561	NC_010168	GTT	2	6	3141019	3141024	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58562	NC_010168	CAG	2	6	3141075	3141080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58563	NC_010168	GC	3	6	3141247	3141252	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58564	NC_010168	GC	3	6	3141301	3141306	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
58565	NC_010168	CGT	2	6	3141308	3141313	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58566	NC_010168	CGT	2	6	3141319	3141324	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58567	NC_010168	AGC	2	6	3141332	3141337	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58568	NC_010168	GCG	2	6	3141347	3141352	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
58569	NC_010168	GCT	2	6	3141356	3141361	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58570	NC_010168	TGTGA	2	10	3141377	3141386	20 %	40 %	40 %	0 %	163842261
58571	NC_010168	CCT	2	6	3141396	3141401	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842261
58572	NC_010168	ATG	2	6	3141428	3141433	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842261
58573	NC_010168	TCA	2	6	3141488	3141493	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842261
58574	NC_010168	GAA	2	6	3141502	3141507	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842261
58575	NC_010168	GAG	2	6	3141521	3141526	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842261
58576	NC_010168	CCT	2	6	3141554	3141559	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842261
58577	NC_010168	GCA	2	6	3141561	3141566	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842261
58578	NC_010168	GAA	2	6	3141619	3141624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842261
58579	NC_010168	CAA	2	6	3141648	3141653	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842261
58580	NC_010168	AAT	2	6	3141684	3141689	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58581	NC_010168	TGT	2	6	3141877	3141882	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
58582	NC_010168	CTG	2	6	3141930	3141935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
58583	NC_010168	TGCC	2	8	3142121	3142128	0 %	25 %	25 %	50 %	163842262
58584	NC_010168	AAG	2	6	3142172	3142177	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842262
58585	NC_010168	AAT	2	6	3142193	3142198	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163842262
58586	NC_010168	CCA	2	6	3142206	3142211	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842262
58587	NC_010168	CGT	2	6	3142314	3142319	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842262
58588	NC_010168	CGA	2	6	3142410	3142415	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842262
58589	NC_010168	CAGC	2	8	3142431	3142438	25 %	0 %	25 %	50 %	163842262
58590	NC_010168	CGA	2	6	3142448	3142453	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842262
58591	NC_010168	CACGG	2	10	3142643	3142652	20 %	0 %	40 %	40 %	163842262
58592	NC_010168	CAT	2	6	3142662	3142667	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842262
58593	NC_010168	T	6	6	3142686	3142691	0 %	100 %	0 %	0 %	163842263
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58596	NC_010168	GAG	2	6	3142808	3142813	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842263
58597	NC_010168	ACC	2	6	3142833	3142838	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842263
58598	NC_010168	GC	3	6	3142873	3142878	0 %	0 %	50 %	50 %	163842263
58599	NC_010168	TCG	2	6	3142947	3142952	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842263
58600	NC_010168	CTT	2	6	3142976	3142981	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842263
58601	NC_010168	GTG	2	6	3143207	3143212	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842263
58602	NC_010168	TCG	2	6	3143243	3143248	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842263
58603	NC_010168	CGT	2	6	3143266	3143271	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842263
58604	NC_010168	GCA	2	6	3143434	3143439	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842263
58605	NC_010168	TTAG	2	8	3143508	3143515	25 %	50 %	25 %	0 %	163842263
58606	NC_010168	CAG	2	6	3143533	3143538	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842263
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58616	NC_010168	GAA	2	6	3144291	3144296	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842264
58617	NC_010168	GCGG	2	8	3144303	3144310	0 %	0 %	75 %	25 %	163842264
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58732	NC_010168	CTT	2	6	3150076	3150081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842269
58733	NC_010168	ACTG	2	8	3150094	3150101	25 %	25 %	25 %	25 %	163842269
58734	NC_010168	GAA	2	6	3150130	3150135	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842269
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58741	NC_010168	A	6	6	3150485	3150490	100 %	0 %	0 %	0 %	163842269
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58834	NC_010168	CA	3	6	3154829	3154834	50 %	0 %	0 %	50 %	163842275
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58838	NC_010168	GC	3	6	3155051	3155056	0 %	0 %	50 %	50 %	163842276

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