MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
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57002	NC_010168	GGT	2	6	3056350	3056355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842158
57003	NC_010168	CCA	2	6	3056385	3056390	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842158
57004	NC_010168	GAA	2	6	3056413	3056418	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842158
57005	NC_010168	CAG	2	6	3056508	3056513	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57006	NC_010168	TTG	2	6	3056542	3056547	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842158
57007	NC_010168	CAGC	2	8	3056591	3056598	25 %	0 %	25 %	50 %	163842158
57008	NC_010168	GTG	2	6	3056615	3056620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842158
57009	NC_010168	GTT	2	6	3056657	3056662	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842158
57010	NC_010168	CAG	2	6	3056689	3056694	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57011	NC_010168	CTG	2	6	3056721	3056726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57012	NC_010168	CAT	2	6	3056797	3056802	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842158
57013	NC_010168	T	7	7	3056910	3056916	0 %	100 %	0 %	0 %	163842158
57014	NC_010168	CAACCG	2	12	3056997	3057008	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	163842158
57015	NC_010168	GTT	2	6	3057048	3057053	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842158
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57017	NC_010168	GCT	2	6	3057198	3057203	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57018	NC_010168	ACT	2	6	3057215	3057220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842158
57019	NC_010168	CCA	3	9	3057332	3057340	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842158
57020	NC_010168	AGC	2	6	3057347	3057352	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57021	NC_010168	CCG	2	6	3057396	3057401	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842158
57022	NC_010168	CCG	2	6	3057437	3057442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842158
57023	NC_010168	GCA	2	6	3057464	3057469	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842158
57024	NC_010168	GCTG	2	8	3057570	3057577	0 %	25 %	50 %	25 %	163842158
57025	NC_010168	CCG	2	6	3057584	3057589	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842158
57026	NC_010168	TCT	2	6	3057600	3057605	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842158
57027	NC_010168	GC	3	6	3057668	3057673	0 %	0 %	50 %	50 %	163842158
57028	NC_010168	ATG	2	6	3057698	3057703	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842158
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57030	NC_010168	ACG	2	6	3057740	3057745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842158
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57032	NC_010168	TTG	2	6	3057757	3057762	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842158
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57042	NC_010168	G	7	7	3058403	3058409	0 %	0 %	100 %	0 %	163842159
57043	NC_010168	TGC	2	6	3058485	3058490	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842159
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57051	NC_010168	CGG	2	6	3058804	3058809	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842159
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57074	NC_010168	ATT	2	6	3059899	3059904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57075	NC_010168	GCA	2	6	3060002	3060007	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842161
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57086	NC_010168	A	7	7	3060568	3060574	100 %	0 %	0 %	0 %	163842161
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57088	NC_010168	TAC	2	6	3060665	3060670	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842162
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57097	NC_010168	ACGTCG	2	12	3061275	3061286	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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57099	NC_010168	GC	3	6	3061376	3061381	0 %	0 %	50 %	50 %	163842163
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57111	NC_010168	ACCC	2	8	3062070	3062077	25 %	0 %	0 %	75 %	163842164
57112	NC_010168	CGG	2	6	3062145	3062150	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842164
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57116	NC_010168	GTT	2	6	3062374	3062379	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842164
57117	NC_010168	GTA	2	6	3062411	3062416	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
57118	NC_010168	GGT	2	6	3062427	3062432	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
57119	NC_010168	TCGAC	2	10	3062464	3062473	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
57120	NC_010168	ATT	2	6	3062489	3062494	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842165
57121	NC_010168	TCAGC	2	10	3062603	3062612	20 %	20 %	20 %	40 %	163842165
57122	NC_010168	GTT	2	6	3062656	3062661	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842165
57123	NC_010168	CACACC	2	12	3062721	3062732	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842165
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57125	NC_010168	CCA	2	6	3062792	3062797	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842165
57126	NC_010168	AC	3	6	3062888	3062893	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57127	NC_010168	TGC	2	6	3062920	3062925	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842166
57128	NC_010168	TGC	2	6	3062932	3062937	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842166
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57130	NC_010168	CGA	2	6	3062964	3062969	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842166
57131	NC_010168	GGT	2	6	3063021	3063026	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842166
57132	NC_010168	TGGCC	2	10	3063070	3063079	0 %	20 %	40 %	40 %	163842166
57133	NC_010168	AC	3	6	3063080	3063085	50 %	0 %	0 %	50 %	163842166
57134	NC_010168	GTC	2	6	3063123	3063128	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842166
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57143	NC_010168	TGA	2	6	3063600	3063605	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842167
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57154	NC_010168	TGA	2	6	3064098	3064103	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57169	NC_010168	CGG	2	6	3065098	3065103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
57170	NC_010168	TGC	2	6	3065158	3065163	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842169
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57214	NC_010168	TAA	2	6	3068217	3068222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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57216	NC_010168	CTG	2	6	3068395	3068400	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57217	NC_010168	ACA	2	6	3068506	3068511	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57218	NC_010168	CACGC	2	10	3068513	3068522	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
57219	NC_010168	GCTGT	2	10	3068549	3068558	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
57220	NC_010168	CGCA	2	8	3068674	3068681	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57221	NC_010168	AGCC	2	8	3068718	3068725	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57222	NC_010168	ACG	2	6	3068837	3068842	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842172
57223	NC_010168	AGC	3	9	3068866	3068874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842172
57224	NC_010168	CAAA	2	8	3068889	3068896	75 %	0 %	0 %	25 %	163842172
57225	NC_010168	CAA	2	6	3068934	3068939	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842172
57226	NC_010168	GCA	2	6	3068948	3068953	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842172
57227	NC_010168	GTA	2	6	3068965	3068970	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842172
57228	NC_010168	AGC	2	6	3069040	3069045	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842172
57229	NC_010168	TGC	2	6	3069047	3069052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842172
57230	NC_010168	GCG	2	6	3069098	3069103	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842172
57231	NC_010168	TTGC	2	8	3069189	3069196	0 %	50 %	25 %	25 %	163842172
57232	NC_010168	GGC	2	6	3069211	3069216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842173
57233	NC_010168	CCA	2	6	3069232	3069237	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842173
57234	NC_010168	CGT	2	6	3069248	3069253	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842173
57235	NC_010168	TTG	2	6	3069261	3069266	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842173
57236	NC_010168	TTTA	2	8	3069282	3069289	25 %	75 %	0 %	0 %	163842173
57237	NC_010168	GAT	2	6	3069313	3069318	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842173
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57240	NC_010168	TGC	2	6	3069443	3069448	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842173
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57250	NC_010168	CGA	2	6	3069877	3069882	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842173
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57262	NC_010168	TTG	2	6	3070502	3070507	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842174
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57270	NC_010168	CGG	2	6	3070890	3070895	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842174
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57275	NC_010168	TAG	2	6	3071225	3071230	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842175
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57305	NC_010168	CAA	2	6	3072816	3072821	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57306	NC_010168	GACC	2	8	3072884	3072891	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57307	NC_010168	ACA	2	6	3072924	3072929	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842179
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57328	NC_010168	GGT	2	6	3074182	3074187	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842180
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57333	NC_010168	CAT	2	6	3074476	3074481	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57334	NC_010168	GAGC	2	8	3074483	3074490	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
57335	NC_010168	GCAAC	2	10	3074646	3074655	40 %	0 %	20 %	40 %	163842181
57336	NC_010168	GTCAAT	2	12	3074817	3074828	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	163842181
57337	NC_010168	ATT	2	6	3074886	3074891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842181
57338	NC_010168	CAAT	2	8	3075076	3075083	50 %	25 %	0 %	25 %	163842181
57339	NC_010168	CAC	2	6	3075101	3075106	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842181
57340	NC_010168	T	6	6	3075158	3075163	0 %	100 %	0 %	0 %	163842181
57341	NC_010168	TG	3	6	3075203	3075208	0 %	50 %	50 %	0 %	163842182
57342	NC_010168	GCA	2	6	3075272	3075277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842182
57343	NC_010168	CCCGGC	2	12	3075286	3075297	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842182
57344	NC_010168	TGA	2	6	3075465	3075470	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842182
57345	NC_010168	GAC	2	6	3075563	3075568	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842182
57346	NC_010168	TGAT	2	8	3075624	3075631	25 %	50 %	25 %	0 %	163842182
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57466	NC_010168	ATA	2	6	3082822	3082827	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
57467	NC_010168	CAT	2	6	3082839	3082844	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57468	NC_010168	AGA	2	6	3082904	3082909	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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57500	NC_010168	GGGT	2	8	3085071	3085078	0 %	25 %	75 %	0 %	163842193

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