MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
56001	NC_010168	GCTC	2	8	3002819	3002826	0 %	25 %	25 %	50 %	163842100
56002	NC_010168	ACCAT	2	10	3002886	3002895	40 %	20 %	0 %	40 %	163842100
56003	NC_010168	GGC	2	6	3002904	3002909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842100
56004	NC_010168	GCA	2	6	3003015	3003020	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842100
56005	NC_010168	GCC	2	6	3003048	3003053	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842100
56006	NC_010168	ACG	3	9	3003075	3003083	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842100
56007	NC_010168	AGC	2	6	3003095	3003100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842100
56008	NC_010168	GTG	2	6	3003170	3003175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56009	NC_010168	CAG	2	6	3003199	3003204	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56010	NC_010168	CGC	2	6	3003290	3003295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842101
56011	NC_010168	TCG	2	6	3003318	3003323	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842101
56012	NC_010168	TCG	2	6	3003477	3003482	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842101
56013	NC_010168	CAA	2	6	3003605	3003610	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842101
56014	NC_010168	TGG	2	6	3003636	3003641	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842101
56015	NC_010168	TCC	2	6	3003682	3003687	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
56016	NC_010168	CCG	2	6	3003729	3003734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56017	NC_010168	CTT	2	6	3003905	3003910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842102
56018	NC_010168	AGA	2	6	3003959	3003964	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842102
56019	NC_010168	CGG	2	6	3004047	3004052	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842102
56020	NC_010168	CCG	2	6	3004082	3004087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842102
56021	NC_010168	CCG	2	6	3004148	3004153	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842102
56022	NC_010168	CTC	2	6	3004185	3004190	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842102
56023	NC_010168	CAA	2	6	3004230	3004235	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842102
56024	NC_010168	GGT	2	6	3004254	3004259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842102
56025	NC_010168	TGG	2	6	3004329	3004334	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842102
56026	NC_010168	AGTG	2	8	3004407	3004414	25 %	25 %	50 %	0 %	163842102
56027	NC_010168	GAA	2	6	3004468	3004473	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842102
56028	NC_010168	CCG	2	6	3004526	3004531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842102
56029	NC_010168	GT	3	6	3004561	3004566	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56030	NC_010168	CGG	2	6	3004596	3004601	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842103
56031	NC_010168	GTA	2	6	3004624	3004629	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842103
56032	NC_010168	TGG	2	6	3004648	3004653	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842103
56033	NC_010168	GGT	2	6	3004683	3004688	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842103
56034	NC_010168	CTT	2	6	3004725	3004730	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842103
56035	NC_010168	AGG	2	6	3004878	3004883	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842103
56036	NC_010168	TGA	3	9	3004904	3004912	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842103
56037	NC_010168	TCC	2	6	3005022	3005027	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842103
56038	NC_010168	ACCC	2	8	3005060	3005067	25 %	0 %	0 %	75 %	163842103
56039	NC_010168	ATC	2	6	3005092	3005097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842103
56040	NC_010168	CGG	2	6	3005135	3005140	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842103
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56042	NC_010168	GTG	2	6	3005180	3005185	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842103
56043	NC_010168	TCA	2	6	3005357	3005362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842103
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56045	NC_010168	GTA	2	6	3005401	3005406	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842103
56046	NC_010168	GGT	2	6	3005416	3005421	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842103
56047	NC_010168	TCGAC	2	10	3005453	3005462	20 %	20 %	20 %	40 %	163842103
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56049	NC_010168	TCAGC	2	10	3005592	3005601	20 %	20 %	20 %	40 %	163842104
56050	NC_010168	GTT	2	6	3005645	3005650	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842104
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56052	NC_010168	CGC	2	6	3005746	3005751	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842104
56053	NC_010168	CCA	2	6	3005781	3005786	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842104
56054	NC_010168	AC	3	6	3005877	3005882	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56055	NC_010168	CGAA	2	8	3005901	3005908	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56056	NC_010168	AAC	2	6	3005988	3005993	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842105
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56058	NC_010168	CAA	2	6	3006214	3006219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842105
56059	NC_010168	CAGG	2	8	3006286	3006293	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56060	NC_010168	GTG	2	6	3006304	3006309	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56061	NC_010168	CGC	2	6	3006395	3006400	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
56062	NC_010168	GCT	2	6	3006418	3006423	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56063	NC_010168	GCA	3	9	3006493	3006501	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56064	NC_010168	CGCAG	2	10	3006564	3006573	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
56065	NC_010168	TC	3	6	3006579	3006584	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56066	NC_010168	ATCG	2	8	3006669	3006676	25 %	25 %	25 %	25 %	163842106
56067	NC_010168	GCG	2	6	3006725	3006730	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842106
56068	NC_010168	TTC	2	6	3006817	3006822	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842106
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56071	NC_010168	CGC	2	6	3006904	3006909	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842106
56072	NC_010168	GCT	2	6	3006944	3006949	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842106
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56074	NC_010168	AAGC	2	8	3007026	3007033	50 %	0 %	25 %	25 %	163842106
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56078	NC_010168	GCT	2	6	3007263	3007268	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842107
56079	NC_010168	CG	3	6	3007365	3007370	0 %	0 %	50 %	50 %	163842107
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56082	NC_010168	TC	3	6	3007623	3007628	0 %	50 %	0 %	50 %	163842107
56083	NC_010168	TGC	2	6	3007654	3007659	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842107
56084	NC_010168	CTG	2	6	3007705	3007710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842107
56085	NC_010168	CGA	2	6	3007716	3007721	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842107
56086	NC_010168	CGGG	2	8	3007830	3007837	0 %	0 %	75 %	25 %	163842107
56087	NC_010168	ACC	2	6	3007929	3007934	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842107
56088	NC_010168	CG	3	6	3007982	3007987	0 %	0 %	50 %	50 %	163842107
56089	NC_010168	CAA	2	6	3008239	3008244	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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56101	NC_010168	TGA	2	6	3009113	3009118	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56102	NC_010168	TTG	2	6	3009191	3009196	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56103	NC_010168	ACG	2	6	3009220	3009225	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842109
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56110	NC_010168	CG	3	6	3009532	3009537	0 %	0 %	50 %	50 %	163842109
56111	NC_010168	ACCA	2	8	3009563	3009570	50 %	0 %	0 %	50 %	163842109
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56117	NC_010168	CGT	2	6	3009848	3009853	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842109
56118	NC_010168	GTT	2	6	3009861	3009866	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842109
56119	NC_010168	CGG	2	6	3009955	3009960	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842109
56120	NC_010168	TTC	2	6	3009985	3009990	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842109
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56137	NC_010168	CTG	2	6	3010732	3010737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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56147	NC_010168	G	6	6	3011259	3011264	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
56148	NC_010168	AC	3	6	3011282	3011287	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
56149	NC_010168	T	7	7	3011387	3011393	0 %	100 %	0 %	0 %	163842111
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56225	NC_010168	CCA	2	6	3015787	3015792	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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56227	NC_010168	CGG	2	6	3015895	3015900	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842118
56228	NC_010168	TGC	2	6	3015987	3015992	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842118
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56231	NC_010168	TTCGC	2	10	3016143	3016152	0 %	40 %	20 %	40 %	163842118
56232	NC_010168	CGA	2	6	3016223	3016228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56233	NC_010168	CGT	2	6	3016229	3016234	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56234	NC_010168	CG	3	6	3016277	3016282	0 %	0 %	50 %	50 %	163842118
56235	NC_010168	TCGGCA	2	12	3016285	3016296	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56236	NC_010168	CAA	2	6	3016473	3016478	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842118
56237	NC_010168	TGC	2	6	3016491	3016496	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56238	NC_010168	CGA	2	6	3016498	3016503	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56239	NC_010168	GTGC	2	8	3016563	3016570	0 %	25 %	50 %	25 %	163842118
56240	NC_010168	AGC	2	6	3016612	3016617	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842118
56241	NC_010168	ACC	2	6	3016678	3016683	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842118
56242	NC_010168	CGG	2	6	3016712	3016717	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842118
56243	NC_010168	CCG	2	6	3016750	3016755	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842118
56244	NC_010168	GGT	2	6	3016830	3016835	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842118
56245	NC_010168	TCCT	2	8	3016847	3016854	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
56246	NC_010168	AGCA	2	8	3017037	3017044	50 %	0 %	25 %	25 %	163842119
56247	NC_010168	CGAG	2	8	3017054	3017061	25 %	0 %	50 %	25 %	163842119
56248	NC_010168	GCG	2	6	3017297	3017302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842119
56249	NC_010168	AAT	2	6	3017325	3017330	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163842119
56250	NC_010168	TTCGC	2	10	3017357	3017366	0 %	40 %	20 %	40 %	163842119
56251	NC_010168	ACG	2	6	3017388	3017393	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842119
56252	NC_010168	ATC	2	6	3017395	3017400	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842119
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56254	NC_010168	ATGACG	2	12	3017419	3017430	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	163842119
56255	NC_010168	TCC	2	6	3017467	3017472	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842119
56256	NC_010168	CGA	2	6	3017587	3017592	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56257	NC_010168	GA	3	6	3017651	3017656	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
56258	NC_010168	GGCA	2	8	3017689	3017696	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
56259	NC_010168	CGA	2	6	3017705	3017710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56260	NC_010168	GGCT	2	8	3017735	3017742	0 %	25 %	50 %	25 %	163842120
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56264	NC_010168	ATTG	2	8	3017797	3017804	25 %	50 %	25 %	0 %	163842120
56265	NC_010168	CGTC	2	8	3017862	3017869	0 %	25 %	25 %	50 %	163842120
56266	NC_010168	CTT	2	6	3017880	3017885	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842120
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56274	NC_010168	GCCCA	2	10	3018319	3018328	20 %	0 %	20 %	60 %	163842120
56275	NC_010168	GGA	2	6	3018341	3018346	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842120
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56277	NC_010168	GGA	2	6	3018419	3018424	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56278	NC_010168	GAA	2	6	3018445	3018450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842121
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56282	NC_010168	CG	3	6	3018608	3018613	0 %	0 %	50 %	50 %	163842121
56283	NC_010168	GC	3	6	3018630	3018635	0 %	0 %	50 %	50 %	163842121
56284	NC_010168	GGCA	2	8	3018714	3018721	25 %	0 %	50 %	25 %	163842121
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56290	NC_010168	TCCGC	2	10	3019019	3019028	0 %	20 %	20 %	60 %	163842121
56291	NC_010168	GAT	2	6	3019065	3019070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842121
56292	NC_010168	CAT	2	6	3019092	3019097	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842121
56293	NC_010168	CCTTCC	2	12	3019169	3019180	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163842121
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56295	NC_010168	GTG	2	6	3019296	3019301	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
56296	NC_010168	CTT	2	6	3019330	3019335	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842122
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56299	NC_010168	CGT	2	6	3019614	3019619	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842122
56300	NC_010168	TGA	2	6	3019649	3019654	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842122
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56304	NC_010168	TGC	2	6	3019830	3019835	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842122
56305	NC_010168	GCCG	2	8	3019872	3019879	0 %	0 %	50 %	50 %	163842122
56306	NC_010168	CAC	2	6	3019949	3019954	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842122
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56310	NC_010168	TGA	2	6	3020204	3020209	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842122
56311	NC_010168	TG	3	6	3020290	3020295	0 %	50 %	50 %	0 %	163842122
56312	NC_010168	ATC	2	6	3020352	3020357	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842122
56313	NC_010168	TGCAAA	2	12	3020365	3020376	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	163842122
56314	NC_010168	GCC	2	6	3020422	3020427	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842123
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56316	NC_010168	GCC	2	6	3020605	3020610	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842124
56317	NC_010168	GCTG	2	8	3020775	3020782	0 %	25 %	50 %	25 %	163842124
56318	NC_010168	CTG	2	6	3020815	3020820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842124
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56320	NC_010168	CAG	2	6	3020834	3020839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842124
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56322	NC_010168	TCG	2	6	3020879	3020884	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842124
56323	NC_010168	TCA	2	6	3020919	3020924	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56324	NC_010168	TTAT	2	8	3020928	3020935	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
56325	NC_010168	ATG	2	6	3020971	3020976	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56326	NC_010168	AGC	2	6	3021032	3021037	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842125
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56328	NC_010168	CCG	2	6	3021123	3021128	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842125
56329	NC_010168	ACGC	2	8	3021134	3021141	25 %	0 %	25 %	50 %	163842125
56330	NC_010168	ACG	3	9	3021192	3021200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842125
56331	NC_010168	ACGG	2	8	3021213	3021220	25 %	0 %	50 %	25 %	163842125
56332	NC_010168	CAC	2	6	3021266	3021271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842125
56333	NC_010168	GCG	2	6	3021297	3021302	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842125
56334	NC_010168	CCA	2	6	3021351	3021356	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842125
56335	NC_010168	CGT	2	6	3021379	3021384	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842125
56336	NC_010168	CCAA	2	8	3021408	3021415	50 %	0 %	0 %	50 %	163842125
56337	NC_010168	GTG	2	6	3021428	3021433	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842125
56338	NC_010168	GTA	2	6	3021458	3021463	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842125
56339	NC_010168	CAC	2	6	3021503	3021508	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842125
56340	NC_010168	TTA	2	6	3021520	3021525	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842125
56341	NC_010168	GCA	3	9	3021546	3021554	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842125
56342	NC_010168	CGA	3	9	3021612	3021620	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842126
56343	NC_010168	AGC	2	6	3021621	3021626	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842126
56344	NC_010168	AAC	2	6	3021666	3021671	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842126
56345	NC_010168	TGC	2	6	3021692	3021697	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842126
56346	NC_010168	GTT	2	6	3021819	3021824	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842126
56347	NC_010168	CGG	2	6	3021835	3021840	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842126
56348	NC_010168	GCA	2	6	3022086	3022091	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842126
56349	NC_010168	TGCC	2	8	3022172	3022179	0 %	25 %	25 %	50 %	163842126
56350	NC_010168	GCC	2	6	3022187	3022192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842126
56351	NC_010168	CCAG	2	8	3022496	3022503	25 %	0 %	25 %	50 %	163842126
56352	NC_010168	CGG	2	6	3022556	3022561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842126
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56466	NC_010168	GAT	2	6	3028881	3028886	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842129
56467	NC_010168	CGC	2	6	3028917	3028922	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842129
56468	NC_010168	ACC	2	6	3029002	3029007	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842129
56469	NC_010168	ATC	2	6	3029014	3029019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842129
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56473	NC_010168	CGG	2	6	3029205	3029210	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842129
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56499	NC_010168	CGGC	2	8	3030325	3030332	0 %	0 %	50 %	50 %	163842130
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