MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
55001	NC_010168	TCG	2	6	2945996	2946001	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842029
55002	NC_010168	ACG	2	6	2946098	2946103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842029
55003	NC_010168	TGA	2	6	2946264	2946269	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842029
55004	NC_010168	GGTT	2	8	2946301	2946308	0 %	50 %	50 %	0 %	163842029
55005	NC_010168	TGCA	2	8	2946316	2946323	25 %	25 %	25 %	25 %	163842029
55006	NC_010168	CGG	2	6	2946394	2946399	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842029
55007	NC_010168	CAG	2	6	2946524	2946529	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842030
55008	NC_010168	AGA	2	6	2946624	2946629	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842030
55009	NC_010168	TGC	2	6	2946641	2946646	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842030
55010	NC_010168	TTGGT	2	10	2946700	2946709	0 %	60 %	40 %	0 %	163842030
55011	NC_010168	GCGA	2	8	2946783	2946790	25 %	0 %	50 %	25 %	163842030
55012	NC_010168	GAA	2	6	2946961	2946966	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842030
55013	NC_010168	GC	3	6	2946977	2946982	0 %	0 %	50 %	50 %	163842030
55014	NC_010168	AAG	2	6	2946992	2946997	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842030
55015	NC_010168	TTC	2	6	2947004	2947009	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842030
55016	NC_010168	CAA	2	6	2947054	2947059	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842030
55017	NC_010168	CTGC	2	8	2947345	2947352	0 %	25 %	25 %	50 %	163842030
55018	NC_010168	TCG	2	6	2947444	2947449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842031
55019	NC_010168	GTTGT	2	10	2947509	2947518	0 %	60 %	40 %	0 %	163842031
55020	NC_010168	CCTG	2	8	2947565	2947572	0 %	25 %	25 %	50 %	163842031
55021	NC_010168	CTGG	2	8	2947648	2947655	0 %	25 %	50 %	25 %	163842032
55022	NC_010168	ATTG	2	8	2947688	2947695	25 %	50 %	25 %	0 %	163842032
55023	NC_010168	GGC	2	6	2947781	2947786	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842032
55024	NC_010168	T	6	6	2947813	2947818	0 %	100 %	0 %	0 %	163842032
55025	NC_010168	T	6	6	2948156	2948161	0 %	100 %	0 %	0 %	163842033
55026	NC_010168	TAA	2	6	2948191	2948196	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	163842033
55027	NC_010168	GGA	2	6	2948224	2948229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842033
55028	NC_010168	GCC	2	6	2948233	2948238	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842033
55029	NC_010168	GCC	2	6	2948273	2948278	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842033
55030	NC_010168	CAC	2	6	2948316	2948321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842033
55031	NC_010168	CGG	2	6	2948451	2948456	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842034
55032	NC_010168	CAG	2	6	2948459	2948464	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842034
55033	NC_010168	GATT	2	8	2948516	2948523	25 %	50 %	25 %	0 %	163842034
55034	NC_010168	TGT	2	6	2948599	2948604	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842034
55035	NC_010168	TAC	2	6	2948642	2948647	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55036	NC_010168	C	6	6	2948657	2948662	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
55037	NC_010168	CAG	2	6	2948750	2948755	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55038	NC_010168	TAGC	2	8	2948765	2948772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55039	NC_010168	G	6	6	2948788	2948793	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
55040	NC_010168	CA	3	6	2948935	2948940	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55041	NC_010168	CGT	2	6	2948967	2948972	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55042	NC_010168	CGT	2	6	2949003	2949008	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55043	NC_010168	GAT	2	6	2949032	2949037	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55044	NC_010168	AAG	2	6	2949234	2949239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842035
55045	NC_010168	ATT	2	6	2949318	2949323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842035
55046	NC_010168	CAT	2	6	2949401	2949406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842035
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55049	NC_010168	CGG	3	9	2949512	2949520	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842035
55050	NC_010168	ACT	2	6	2949521	2949526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842035
55051	NC_010168	GTG	2	6	2949609	2949614	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842035
55052	NC_010168	GGCTG	2	10	2949650	2949659	0 %	20 %	60 %	20 %	163842035
55053	NC_010168	GCG	2	6	2949688	2949693	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842035
55054	NC_010168	GGC	2	6	2949698	2949703	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842035
55055	NC_010168	TTG	2	6	2949711	2949716	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842035
55056	NC_010168	TTG	2	6	2949807	2949812	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842035
55057	NC_010168	CAGAGC	2	12	2949836	2949847	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842035
55058	NC_010168	GCAG	2	8	2949858	2949865	25 %	0 %	50 %	25 %	163842035
55059	NC_010168	TCA	2	6	2949897	2949902	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842035
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55061	NC_010168	GCT	2	6	2950028	2950033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842035
55062	NC_010168	T	6	6	2950151	2950156	0 %	100 %	0 %	0 %	163842035
55063	NC_010168	GGT	2	6	2950214	2950219	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842035
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55070	NC_010168	GGC	2	6	2950511	2950516	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842036
55071	NC_010168	TAT	2	6	2950553	2950558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163842036
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55074	NC_010168	CGA	2	6	2950739	2950744	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55075	NC_010168	CATC	2	8	2950746	2950753	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
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55078	NC_010168	GGT	2	6	2950881	2950886	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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55080	NC_010168	TGCA	2	8	2950916	2950923	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
55081	NC_010168	CAC	2	6	2950980	2950985	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55082	NC_010168	GTT	2	6	2951016	2951021	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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55084	NC_010168	CG	3	6	2951190	2951195	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55085	NC_010168	TCG	2	6	2951268	2951273	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55086	NC_010168	TCA	2	6	2951282	2951287	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55087	NC_010168	TG	3	6	2951313	2951318	0 %	50 %	50 %	0 %	163842037
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55092	NC_010168	GAAT	2	8	2951536	2951543	50 %	25 %	25 %	0 %	163842037
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55094	NC_010168	CG	3	6	2951773	2951778	0 %	0 %	50 %	50 %	163842037
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55101	NC_010168	CGA	2	6	2952140	2952145	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
55102	NC_010168	ACT	2	6	2952220	2952225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842038
55103	NC_010168	TTG	2	6	2952290	2952295	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842038
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55113	NC_010168	CAC	2	6	2953116	2953121	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842038
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55115	NC_010168	ACT	2	6	2953255	2953260	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842038
55116	NC_010168	A	6	6	2953279	2953284	100 %	0 %	0 %	0 %	163842038
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55118	NC_010168	TGA	2	6	2953484	2953489	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842038
55119	NC_010168	GACC	2	8	2953492	2953499	25 %	0 %	25 %	50 %	163842038
55120	NC_010168	CAC	2	6	2953512	2953517	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842038
55121	NC_010168	TCCT	2	8	2953626	2953633	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55122	NC_010168	ATTG	2	8	2953769	2953776	25 %	50 %	25 %	0 %	163842039
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55220	NC_010168	TTC	2	6	2959977	2959982	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55221	NC_010168	CGTCAA	2	12	2960048	2960059	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	163842047
55222	NC_010168	CGT	2	6	2960138	2960143	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842047
55223	NC_010168	GAAGA	2	10	2960158	2960167	60 %	0 %	40 %	0 %	163842047
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55230	NC_010168	GCGA	2	8	2960562	2960569	25 %	0 %	50 %	25 %	163842047
55231	NC_010168	ACG	3	9	2960662	2960670	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842047
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55233	NC_010168	AG	3	6	2960742	2960747	50 %	0 %	50 %	0 %	163842047
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55235	NC_010168	GCA	2	6	2960916	2960921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842047
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55243	NC_010168	TATT	2	8	2961591	2961598	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55331	NC_010168	TC	3	6	2965879	2965884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
55332	NC_010168	TCTGG	2	10	2965894	2965903	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
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55342	NC_010168	AAT	2	6	2966217	2966222	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55345	NC_010168	A	6	6	2966409	2966414	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
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55352	NC_010168	TTGC	2	8	2966793	2966800	0 %	50 %	25 %	25 %	163842054
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55467	NC_010168	TGGC	2	8	2973112	2973119	0 %	25 %	50 %	25 %	163842061
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55469	NC_010168	GAAG	2	8	2973244	2973251	50 %	0 %	50 %	0 %	163842061
55470	NC_010168	ACA	2	6	2973309	2973314	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163842061
55471	NC_010168	ACC	2	6	2973411	2973416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163842061
55472	NC_010168	GAA	2	6	2973579	2973584	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842062
55473	NC_010168	CG	3	6	2973606	2973611	0 %	0 %	50 %	50 %	163842062
55474	NC_010168	TGA	2	6	2973704	2973709	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842062
55475	NC_010168	TGC	2	6	2973748	2973753	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163842062
55476	NC_010168	CGA	2	6	2973758	2973763	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842062
55477	NC_010168	CGCAG	2	10	2973845	2973854	20 %	0 %	40 %	40 %	163842062
55478	NC_010168	GGC	2	6	2973990	2973995	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163842062
55479	NC_010168	GTT	2	6	2974025	2974030	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163842062
55480	NC_010168	TGG	2	6	2974039	2974044	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842062
55481	NC_010168	AGCG	2	8	2974061	2974068	25 %	0 %	50 %	25 %	163842062
55482	NC_010168	CAA	2	6	2974222	2974227	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55483	NC_010168	TAC	2	6	2974283	2974288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842063
55484	NC_010168	CAT	2	6	2974414	2974419	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842063
55485	NC_010168	AGC	3	9	2974551	2974559	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842063
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55487	NC_010168	GA	3	6	2974716	2974721	50 %	0 %	50 %	0 %	163842064
55488	NC_010168	TGG	2	6	2974747	2974752	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163842064
55489	NC_010168	AAG	2	6	2974933	2974938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163842064
55490	NC_010168	CGC	2	6	2974975	2974980	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842064
55491	NC_010168	GTCT	2	8	2975159	2975166	0 %	50 %	25 %	25 %	163842064
55492	NC_010168	GCCG	2	8	2975279	2975286	0 %	0 %	50 %	50 %	163842064
55493	NC_010168	CCGGA	2	10	2975316	2975325	20 %	0 %	40 %	40 %	163842064
55494	NC_010168	GCA	2	6	2975416	2975421	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163842064
55495	NC_010168	GCC	2	6	2975514	2975519	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163842064
55496	NC_010168	GTA	2	6	2975678	2975683	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163842064
55497	NC_010168	TCA	2	6	2975692	2975697	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163842064
55498	NC_010168	AGG	2	6	2975761	2975766	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842064
55499	NC_010168	AGG	2	6	2975782	2975787	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163842064
55500	NC_010168	TTC	2	6	2975834	2975839	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163842064

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