MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
52501	NC_010168	GCA	2	6	2811701	2811706	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52502	NC_010168	CAC	2	6	2811770	2811775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841892
52503	NC_010168	GCA	2	6	2811776	2811781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52504	NC_010168	GCT	2	6	2811814	2811819	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52505	NC_010168	GCA	2	6	2811907	2811912	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52506	NC_010168	TCG	2	6	2812022	2812027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52507	NC_010168	TCGG	2	8	2812118	2812125	0 %	25 %	50 %	25 %	163841892
52508	NC_010168	GCCC	3	12	2812156	2812167	0 %	0 %	25 %	75 %	163841892
52509	NC_010168	CAT	2	6	2812230	2812235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841892
52510	NC_010168	TCG	2	6	2812259	2812264	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841892
52511	NC_010168	GGT	2	6	2812371	2812376	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841892
52512	NC_010168	GCG	2	6	2812667	2812672	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841892
52513	NC_010168	TAC	2	6	2812761	2812766	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841893
52514	NC_010168	CAG	2	6	2812834	2812839	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841893
52515	NC_010168	GGC	2	6	2812913	2812918	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841893
52516	NC_010168	CCA	2	6	2812965	2812970	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841893
52517	NC_010168	GCA	2	6	2813109	2813114	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841893
52518	NC_010168	GAA	2	6	2813189	2813194	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841893
52519	NC_010168	CCA	3	9	2813205	2813213	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841893
52520	NC_010168	ATCG	2	8	2813291	2813298	25 %	25 %	25 %	25 %	163841893
52521	NC_010168	GAA	2	6	2813337	2813342	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841893
52522	NC_010168	CGT	2	6	2813365	2813370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
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52524	NC_010168	GAG	2	6	2813514	2813519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841893
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52531	NC_010168	ATCG	2	8	2814164	2814171	25 %	25 %	25 %	25 %	163841893
52532	NC_010168	CTG	2	6	2814247	2814252	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
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52536	NC_010168	TG	3	6	2814328	2814333	0 %	50 %	50 %	0 %	163841893
52537	NC_010168	TGC	3	9	2814360	2814368	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841893
52538	NC_010168	ACG	2	6	2814435	2814440	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841893
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52540	NC_010168	GAT	2	6	2814557	2814562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52541	NC_010168	CG	3	6	2814725	2814730	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52542	NC_010168	GATC	2	8	2814745	2814752	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
52543	NC_010168	TAC	3	9	2814806	2814814	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52544	NC_010168	GCAT	2	8	2814876	2814883	25 %	25 %	25 %	25 %	163841894
52545	NC_010168	GCCG	2	8	2814908	2814915	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
52546	NC_010168	CAA	2	6	2814963	2814968	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841894
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52549	NC_010168	CGT	2	6	2815180	2815185	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841894
52550	NC_010168	GAA	2	6	2815195	2815200	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841894
52551	NC_010168	TCG	2	6	2815206	2815211	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841894
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52553	NC_010168	GAG	2	6	2815292	2815297	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841894
52554	NC_010168	GC	3	6	2815305	2815310	0 %	0 %	50 %	50 %	163841894
52555	NC_010168	TGCG	2	8	2815311	2815318	0 %	25 %	50 %	25 %	163841894
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52567	NC_010168	AC	3	6	2815919	2815924	50 %	0 %	0 %	50 %	163841894
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52569	NC_010168	CGA	2	6	2815993	2815998	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841894
52570	NC_010168	TGC	2	6	2816013	2816018	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841894
52571	NC_010168	AAAGC	2	10	2816050	2816059	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52572	NC_010168	TGC	2	6	2816155	2816160	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841895
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52596	NC_010168	GTG	2	6	2818235	2818240	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52597	NC_010168	CGT	2	6	2818392	2818397	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52598	NC_010168	TGAG	2	8	2818489	2818496	25 %	25 %	50 %	0 %	163841896
52599	NC_010168	CGG	2	6	2818556	2818561	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841896
52600	NC_010168	GC	3	6	2818572	2818577	0 %	0 %	50 %	50 %	163841896
52601	NC_010168	GCC	2	6	2818599	2818604	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841896
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52605	NC_010168	GGC	2	6	2818747	2818752	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841896
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52607	NC_010168	CACAG	2	10	2818823	2818832	40 %	0 %	20 %	40 %	163841896
52608	NC_010168	CGT	2	6	2818841	2818846	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841896
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52611	NC_010168	CGA	2	6	2818997	2819002	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841896
52612	NC_010168	ATTAG	2	10	2819114	2819123	40 %	40 %	20 %	0 %	163841896
52613	NC_010168	GCC	2	6	2819210	2819215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52614	NC_010168	AGG	2	6	2819224	2819229	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52615	NC_010168	GGCCTA	2	12	2819231	2819242	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52616	NC_010168	GGT	2	6	2819327	2819332	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52617	NC_010168	CAG	2	6	2819618	2819623	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841897
52618	NC_010168	CT	3	6	2819645	2819650	0 %	50 %	0 %	50 %	163841897
52619	NC_010168	CGC	2	6	2819682	2819687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841897
52620	NC_010168	CGA	2	6	2819956	2819961	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841897
52621	NC_010168	AGA	2	6	2819974	2819979	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163841897
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52623	NC_010168	ATC	2	6	2820099	2820104	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841897
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52625	NC_010168	GTC	2	6	2820184	2820189	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841898
52626	NC_010168	T	6	6	2820199	2820204	0 %	100 %	0 %	0 %	163841898
52627	NC_010168	GCA	2	6	2820223	2820228	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841898
52628	NC_010168	CCA	2	6	2820266	2820271	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841898
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52630	NC_010168	T	6	6	2820331	2820336	0 %	100 %	0 %	0 %	163841898
52631	NC_010168	CAG	2	6	2820469	2820474	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841898
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52731	NC_010168	GATTT	2	10	2825000	2825009	20 %	60 %	20 %	0 %	163841902
52732	NC_010168	GCT	2	6	2825010	2825015	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841902
52733	NC_010168	GCC	2	6	2825119	2825124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841902
52734	NC_010168	GCCTTG	2	12	2825270	2825281	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841902
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52740	NC_010168	TATC	2	8	2825558	2825565	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
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52742	NC_010168	GCCA	2	8	2825628	2825635	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
52743	NC_010168	AAT	2	6	2825719	2825724	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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52768	NC_010168	TCT	2	6	2826970	2826975	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52769	NC_010168	TGG	2	6	2827020	2827025	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
52770	NC_010168	GAGG	2	8	2827026	2827033	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
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52800	NC_010168	AGCTG	2	10	2828458	2828467	20 %	20 %	40 %	20 %	163841904
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52802	NC_010168	CCG	2	6	2828512	2828517	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52803	NC_010168	TCGG	2	8	2828587	2828594	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
52804	NC_010168	GAG	2	6	2828655	2828660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163841905
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52820	NC_010168	GCT	2	6	2829695	2829700	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841905
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52830	NC_010168	GAT	2	6	2830258	2830263	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841906
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52833	NC_010168	TAC	2	6	2830300	2830305	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841906
52834	NC_010168	TGT	2	6	2830343	2830348	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163841906
52835	NC_010168	CTG	2	6	2830355	2830360	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841906
52836	NC_010168	CGA	2	6	2830445	2830450	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52837	NC_010168	TAC	2	6	2830455	2830460	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841907
52838	NC_010168	TCT	2	6	2830488	2830493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163841907
52839	NC_010168	CGT	2	6	2830509	2830514	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52840	NC_010168	GC	3	6	2830534	2830539	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
52841	NC_010168	GCA	2	6	2830602	2830607	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52842	NC_010168	GCA	2	6	2830647	2830652	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52843	NC_010168	CGG	2	6	2830732	2830737	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841907
52844	NC_010168	GTG	2	6	2830789	2830794	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163841907
52845	NC_010168	CCG	2	6	2830844	2830849	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841907
52846	NC_010168	CCG	2	6	2830905	2830910	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841907
52847	NC_010168	GATC	2	8	2831002	2831009	25 %	25 %	25 %	25 %	163841907
52848	NC_010168	TGC	2	6	2831028	2831033	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52849	NC_010168	CGC	2	6	2831072	2831077	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841907
52850	NC_010168	CG	3	6	2831098	2831103	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
52851	NC_010168	GGGC	2	8	2831165	2831172	0 %	0 %	75 %	25 %	163841907
52852	NC_010168	AGC	2	6	2831222	2831227	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841907
52853	NC_010168	T	6	6	2831245	2831250	0 %	100 %	0 %	0 %	163841907
52854	NC_010168	GC	3	6	2831362	2831367	0 %	0 %	50 %	50 %	163841907
52855	NC_010168	CAA	2	6	2831401	2831406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841907
52856	NC_010168	AGC	2	6	2831444	2831449	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52857	NC_010168	TCA	2	6	2831584	2831589	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841908
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52859	NC_010168	TCA	2	6	2831638	2831643	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841908
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52866	NC_010168	CGG	2	6	2831947	2831952	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841908
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52883	NC_010168	GTAAT	2	10	2832913	2832922	40 %	40 %	20 %	0 %	163841910
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52908	NC_010168	GT	3	6	2833843	2833848	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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52928	NC_010168	CCG	2	6	2834645	2834650	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
52929	NC_010168	ATG	2	6	2834655	2834660	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52930	NC_010168	TA	4	8	2834684	2834691	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52931	NC_010168	AT	3	6	2834698	2834703	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52932	NC_010168	TTCGGA	2	12	2834740	2834751	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52933	NC_010168	CAA	2	6	2834794	2834799	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52934	NC_010168	CTG	2	6	2834833	2834838	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52935	NC_010168	T	6	6	2834866	2834871	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52936	NC_010168	ACAA	2	8	2834983	2834990	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
52937	NC_010168	GGC	2	6	2835035	2835040	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163841913
52938	NC_010168	AGACCG	2	12	2835133	2835144	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841913
52939	NC_010168	GCT	2	6	2835257	2835262	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841913
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52941	NC_010168	CA	3	6	2835383	2835388	50 %	0 %	0 %	50 %	163841913
52942	NC_010168	TCG	2	6	2835460	2835465	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841913
52943	NC_010168	TCA	3	9	2835476	2835484	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841913
52944	NC_010168	CAAG	2	8	2835485	2835492	50 %	0 %	25 %	25 %	163841913
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52946	NC_010168	CGC	2	6	2835574	2835579	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841914
52947	NC_010168	TGA	2	6	2835640	2835645	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163841914
52948	NC_010168	AAC	2	6	2835685	2835690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841914
52949	NC_010168	TCC	2	6	2835963	2835968	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841915
52950	NC_010168	AGCG	2	8	2836013	2836020	25 %	0 %	50 %	25 %	163841915
52951	NC_010168	TCC	2	6	2836038	2836043	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841915
52952	NC_010168	CGT	2	6	2836081	2836086	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841915
52953	NC_010168	AGCA	2	8	2836094	2836101	50 %	0 %	25 %	25 %	163841915
52954	NC_010168	CCA	2	6	2836144	2836149	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841915
52955	NC_010168	CTC	2	6	2836157	2836162	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841915
52956	NC_010168	ATT	2	6	2836238	2836243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163841915
52957	NC_010168	TCACCT	2	12	2836260	2836271	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
52958	NC_010168	ACC	2	6	2836334	2836339	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841916
52959	NC_010168	CG	3	6	2836400	2836405	0 %	0 %	50 %	50 %	163841916
52960	NC_010168	CAG	2	6	2836501	2836506	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841916
52961	NC_010168	GCTC	2	8	2836629	2836636	0 %	25 %	25 %	50 %	163841916
52962	NC_010168	ACC	2	6	2836681	2836686	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841916
52963	NC_010168	GCC	2	6	2836762	2836767	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841916
52964	NC_010168	CCT	2	6	2837020	2837025	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163841917
52965	NC_010168	CGGG	2	8	2837045	2837052	0 %	0 %	75 %	25 %	163841917
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52971	NC_010168	ACT	2	6	2837385	2837390	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52972	NC_010168	TAC	2	6	2837404	2837409	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163841918
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52974	NC_010168	GC	3	6	2837431	2837436	0 %	0 %	50 %	50 %	163841918
52975	NC_010168	GATA	2	8	2837462	2837469	50 %	25 %	25 %	0 %	163841918
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52977	NC_010168	GCTC	2	8	2837534	2837541	0 %	25 %	25 %	50 %	163841918
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52992	NC_010168	GCC	2	6	2838349	2838354	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163841919
52993	NC_010168	ACG	2	6	2838396	2838401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163841919
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52998	NC_010168	CGT	2	6	2838630	2838635	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163841919
52999	NC_010168	AAC	2	6	2838682	2838687	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163841919
53000	NC_010168	ACC	2	6	2838712	2838717	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163841919

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