MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Renibacterium salmoninarum ATCC 33209 chromosome

Total Repeats: 58838

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_010168	GTC	2	6	242775	242780	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839051
4502	NC_010168	CCG	2	6	242803	242808	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839051
4503	NC_010168	GGC	2	6	242825	242830	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839051
4504	NC_010168	CAC	2	6	242868	242873	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839052
4505	NC_010168	CG	3	6	242943	242948	0 %	0 %	50 %	50 %	163839052
4506	NC_010168	ATC	2	6	242962	242967	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839052
4507	NC_010168	TCA	2	6	242995	243000	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839052
4508	NC_010168	CGG	2	6	243082	243087	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839053
4509	NC_010168	TTC	2	6	243210	243215	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839053
4510	NC_010168	AGC	2	6	243228	243233	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4511	NC_010168	TGAG	2	8	243264	243271	25 %	25 %	50 %	0 %	163839053
4512	NC_010168	CCT	2	6	243274	243279	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4513	NC_010168	CCA	2	6	243411	243416	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4514	NC_010168	GTTG	2	8	243419	243426	0 %	50 %	50 %	0 %	163839053
4515	NC_010168	ATC	2	6	243462	243467	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4516	NC_010168	TCGC	3	12	243625	243636	0 %	25 %	25 %	50 %	163839053
4517	NC_010168	GACT	2	8	243637	243644	25 %	25 %	25 %	25 %	163839053
4518	NC_010168	TTG	2	6	243680	243685	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4519	NC_010168	TTG	2	6	243701	243706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4520	NC_010168	CT	3	6	243709	243714	0 %	50 %	0 %	50 %	163839053
4521	NC_010168	TGT	3	9	243735	243743	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839053
4522	NC_010168	CAC	2	6	243762	243767	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4523	NC_010168	ACG	2	6	243786	243791	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4524	NC_010168	TGA	2	6	244006	244011	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839053
4525	NC_010168	ATC	2	6	244014	244019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4526	NC_010168	CAG	2	6	244053	244058	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4527	NC_010168	CAA	4	12	244061	244072	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839053
4528	NC_010168	CAAA	2	8	244120	244127	75 %	0 %	0 %	25 %	163839053
4529	NC_010168	GCCA	2	8	244202	244209	25 %	0 %	25 %	50 %	163839053
4530	NC_010168	ATC	2	6	244230	244235	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839053
4531	NC_010168	CTG	2	6	244251	244256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839053
4532	NC_010168	CCA	2	6	244278	244283	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839053
4533	NC_010168	TCC	2	6	244287	244292	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4534	NC_010168	CTC	2	6	244307	244312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839053
4535	NC_010168	CGC	2	6	244381	244386	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839053
4536	NC_010168	GTC	2	6	244406	244411	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4537	NC_010168	AGCT	2	8	244465	244472	25 %	25 %	25 %	25 %	163839054
4538	NC_010168	TCGA	2	8	244484	244491	25 %	25 %	25 %	25 %	163839054
4539	NC_010168	GCA	2	6	244574	244579	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839054
4540	NC_010168	AGG	2	6	244602	244607	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839054
4541	NC_010168	GAA	2	6	244610	244615	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839054
4542	NC_010168	AATG	2	8	244617	244624	50 %	25 %	25 %	0 %	163839054
4543	NC_010168	TCG	2	6	244652	244657	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839055
4544	NC_010168	GTG	2	6	244690	244695	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4545	NC_010168	GCC	2	6	244759	244764	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4546	NC_010168	CGAT	2	8	244802	244809	25 %	25 %	25 %	25 %	163839055
4547	NC_010168	GCC	3	9	244846	244854	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4548	NC_010168	TAT	2	6	244855	244860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	163839055
4549	NC_010168	GCGG	2	8	244930	244937	0 %	0 %	75 %	25 %	163839055
4550	NC_010168	CCAAA	2	10	244952	244961	60 %	0 %	0 %	40 %	163839055
4551	NC_010168	GTG	2	6	245008	245013	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4552	NC_010168	GCC	2	6	245017	245022	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839055
4553	NC_010168	GCA	2	6	245079	245084	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839055
4554	NC_010168	TGG	2	6	245092	245097	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839055
4555	NC_010168	GAT	2	6	245148	245153	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839055
4556	NC_010168	TCA	2	6	245209	245214	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839055
4557	NC_010168	CTT	2	6	245221	245226	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839055
4558	NC_010168	GA	3	6	245228	245233	50 %	0 %	50 %	0 %	163839055
4559	NC_010168	CAG	2	6	245260	245265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839056
4560	NC_010168	GCC	2	6	245293	245298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839056
4561	NC_010168	ATC	2	6	245308	245313	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839056
4562	NC_010168	GCC	2	6	245347	245352	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839056
4563	NC_010168	AAC	2	6	245356	245361	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839056
4564	NC_010168	GGC	2	6	245442	245447	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839056
4565	NC_010168	GAC	2	6	245509	245514	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839056
4566	NC_010168	TTCAGG	2	12	245594	245605	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	163839056
4567	NC_010168	ATG	2	6	245639	245644	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839056
4568	NC_010168	AAAGA	2	10	245665	245674	80 %	0 %	20 %	0 %	163839056
4569	NC_010168	CGGG	2	8	245715	245722	0 %	0 %	75 %	25 %	163839056
4570	NC_010168	GGGCA	2	10	245737	245746	20 %	0 %	60 %	20 %	163839056
4571	NC_010168	A	6	6	245868	245873	100 %	0 %	0 %	0 %	163839057
4572	NC_010168	GCC	2	6	245955	245960	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839057
4573	NC_010168	AGG	2	6	245986	245991	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839057
4574	NC_010168	GC	3	6	245993	245998	0 %	0 %	50 %	50 %	163839057
4575	NC_010168	GAT	2	6	246141	246146	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839057
4576	NC_010168	CGG	2	6	246194	246199	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839057
4577	NC_010168	CGT	2	6	246212	246217	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839057
4578	NC_010168	CA	3	6	246316	246321	50 %	0 %	0 %	50 %	163839057
4579	NC_010168	CAC	2	6	246362	246367	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839057
4580	NC_010168	GAA	2	6	246420	246425	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839057
4581	NC_010168	TGG	2	6	246531	246536	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839057
4582	NC_010168	ACA	3	9	246559	246567	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839057
4583	NC_010168	GATT	2	8	246578	246585	25 %	50 %	25 %	0 %	163839057
4584	NC_010168	GCC	2	6	246615	246620	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839057
4585	NC_010168	CGT	2	6	246626	246631	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839057
4586	NC_010168	CGC	2	6	246641	246646	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839057
4587	NC_010168	CGC	2	6	246676	246681	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839057
4588	NC_010168	TCG	2	6	246682	246687	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839057
4589	NC_010168	ACA	2	6	246694	246699	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839057
4590	NC_010168	CGCGCC	2	12	246710	246721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4591	NC_010168	TCAT	2	8	246722	246729	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
4592	NC_010168	AAC	2	6	246731	246736	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4593	NC_010168	GC	3	6	246828	246833	0 %	0 %	50 %	50 %	163839058
4594	NC_010168	GAA	2	6	246857	246862	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839058
4595	NC_010168	ACG	2	6	246864	246869	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839058
4596	NC_010168	TTG	2	6	246882	246887	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	163839058
4597	NC_010168	TGG	2	6	246967	246972	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839058
4598	NC_010168	CCAG	2	8	247180	247187	25 %	0 %	25 %	50 %	163839058
4599	NC_010168	ACC	2	6	247257	247262	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839058
4600	NC_010168	AGAA	2	8	247302	247309	75 %	0 %	25 %	0 %	163839058
4601	NC_010168	CTG	2	6	247359	247364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839058
4602	NC_010168	GAT	2	6	247394	247399	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839058
4603	NC_010168	CGA	2	6	247438	247443	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839058
4604	NC_010168	AAG	2	6	247520	247525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	163839058
4605	NC_010168	GC	3	6	247683	247688	0 %	0 %	50 %	50 %	163839058
4606	NC_010168	GCG	2	6	247769	247774	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839058
4607	NC_010168	CGGT	2	8	247825	247832	0 %	25 %	50 %	25 %	163839059
4608	NC_010168	CGT	2	6	247914	247919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839059
4609	NC_010168	GCT	2	6	247966	247971	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839059
4610	NC_010168	AGC	2	6	248003	248008	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839059
4611	NC_010168	TGA	2	6	248091	248096	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839059
4612	NC_010168	GTGC	2	8	248097	248104	0 %	25 %	50 %	25 %	163839059
4613	NC_010168	ACG	2	6	248276	248281	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839059
4614	NC_010168	AGG	2	6	248303	248308	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	163839059
4615	NC_010168	CGG	2	6	248399	248404	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4616	NC_010168	GATC	2	8	248419	248426	25 %	25 %	25 %	25 %	163839060
4617	NC_010168	GGCAA	2	10	248429	248438	40 %	0 %	40 %	20 %	163839060
4618	NC_010168	GC	3	6	248454	248459	0 %	0 %	50 %	50 %	163839060
4619	NC_010168	CTGCT	2	10	248460	248469	0 %	40 %	20 %	40 %	163839060
4620	NC_010168	TGC	2	6	248508	248513	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839060
4621	NC_010168	CTG	2	6	248558	248563	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839060
4622	NC_010168	ACA	2	6	248580	248585	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	163839060
4623	NC_010168	TTC	2	6	248588	248593	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	163839060
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4625	NC_010168	TGG	2	6	248610	248615	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839060
4626	NC_010168	TGG	2	6	248637	248642	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	163839060
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4638	NC_010168	CTG	2	6	249272	249277	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	163839061
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4742	NC_010168	GT	3	6	254617	254622	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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4745	NC_010168	ATG	2	6	254774	254779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839067
4746	NC_010168	ACG	2	6	254780	254785	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839067
4747	NC_010168	TGA	2	6	254847	254852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839067
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4763	NC_010168	CTTCC	2	10	255694	255703	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4764	NC_010168	GCA	2	6	255709	255714	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4765	NC_010168	TCC	2	6	255829	255834	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4766	NC_010168	ACG	3	9	255879	255887	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839069
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4774	NC_010168	CGG	2	6	256217	256222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839069
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4803	NC_010168	GCGTG	2	10	258486	258495	0 %	20 %	60 %	20 %	163839071
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4818	NC_010168	AAGC	2	8	259071	259078	50 %	0 %	25 %	25 %	163839072
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4831	NC_010168	GTTT	2	8	259949	259956	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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4861	NC_010168	TCA	2	6	261829	261834	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	163839077
4862	NC_010168	GTGGGG	2	12	261922	261933	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	163839078
4863	NC_010168	CCA	2	6	261962	261967	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839078
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4865	NC_010168	ACGC	2	8	261998	262005	25 %	0 %	25 %	50 %	163839078
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4989	NC_010168	ACC	2	6	268044	268049	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	163839086
4990	NC_010168	CAGC	2	8	268052	268059	25 %	0 %	25 %	50 %	163839086
4991	NC_010168	AGC	2	6	268095	268100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839087
4992	NC_010168	GCC	2	6	268119	268124	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	163839087
4993	NC_010168	GCG	2	6	268142	268147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839087
4994	NC_010168	GGTG	2	8	268175	268182	0 %	25 %	75 %	0 %	163839087
4995	NC_010168	GCA	2	6	268185	268190	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	163839087
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4997	NC_010168	CCT	2	6	268237	268242	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	163839087
4998	NC_010168	TTGG	2	8	268272	268279	0 %	50 %	50 %	0 %	163839087
4999	NC_010168	GGC	2	6	268299	268304	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	163839087
5000	NC_010168	TGA	2	6	268408	268413	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	163839087

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