MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Rickettsia massiliae MTU5 chromosome

Total Repeats: 34829

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
31501	NC_009900	ATC	2	6	1230825	1230830	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964950
31502	NC_009900	TGT	2	6	1230856	1230861	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	157964950
31503	NC_009900	AT	3	6	1230903	1230908	50 %	50 %	0 %	0 %	157964950
31504	NC_009900	T	6	6	1230950	1230955	0 %	100 %	0 %	0 %	157964950
31505	NC_009900	TCA	2	6	1230979	1230984	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964950
31506	NC_009900	T	7	7	1231053	1231059	0 %	100 %	0 %	0 %	157964950
31507	NC_009900	AAT	2	6	1231062	1231067	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964950
31508	NC_009900	A	6	6	1231212	1231217	100 %	0 %	0 %	0 %	157964950
31509	NC_009900	CATA	2	8	1231241	1231248	50 %	25 %	0 %	25 %	157964950
31510	NC_009900	ATA	2	6	1231256	1231261	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964950
31511	NC_009900	CAT	2	6	1231269	1231274	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964950
31512	NC_009900	ATTT	2	8	1231428	1231435	25 %	75 %	0 %	0 %	157964950
31513	NC_009900	TTG	2	6	1231468	1231473	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31514	NC_009900	CG	3	6	1231516	1231521	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31515	NC_009900	CA	3	6	1231540	1231545	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
31516	NC_009900	ACA	2	6	1231549	1231554	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31517	NC_009900	TTC	2	6	1231617	1231622	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964951
31518	NC_009900	T	6	6	1231639	1231644	0 %	100 %	0 %	0 %	157964951
31519	NC_009900	T	6	6	1231662	1231667	0 %	100 %	0 %	0 %	157964951
31520	NC_009900	CAT	2	6	1231727	1231732	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964951
31521	NC_009900	TACT	2	8	1231760	1231767	25 %	50 %	0 %	25 %	157964951
31522	NC_009900	TTC	2	6	1231773	1231778	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964951
31523	NC_009900	GAT	2	6	1231790	1231795	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964951
31524	NC_009900	CT	3	6	1231896	1231901	0 %	50 %	0 %	50 %	157964951
31525	NC_009900	TGC	2	6	1231959	1231964	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964951
31526	NC_009900	AT	3	6	1232080	1232085	50 %	50 %	0 %	0 %	157964951
31527	NC_009900	CCTG	2	8	1232098	1232105	0 %	25 %	25 %	50 %	157964951
31528	NC_009900	AGC	2	6	1232163	1232168	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964951
31529	NC_009900	TCT	2	6	1232232	1232237	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964951
31530	NC_009900	TAA	2	6	1232241	1232246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964951
31531	NC_009900	CTTA	2	8	1232274	1232281	25 %	50 %	0 %	25 %	157964951
31532	NC_009900	ATC	2	6	1232283	1232288	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964951
31533	NC_009900	ATAA	2	8	1232289	1232296	75 %	25 %	0 %	0 %	157964951
31534	NC_009900	GTGC	2	8	1232300	1232307	0 %	25 %	50 %	25 %	157964951
31535	NC_009900	TAC	2	6	1232336	1232341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964951
31536	NC_009900	TCT	2	6	1232428	1232433	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964951
31537	NC_009900	T	7	7	1232436	1232442	0 %	100 %	0 %	0 %	157964951
31538	NC_009900	TAA	2	6	1232540	1232545	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964951
31539	NC_009900	ATT	2	6	1232590	1232595	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964951
31540	NC_009900	CT	3	6	1232598	1232603	0 %	50 %	0 %	50 %	157964951
31541	NC_009900	TTCT	2	8	1232675	1232682	0 %	75 %	0 %	25 %	157964951
31542	NC_009900	CAA	2	6	1232768	1232773	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	157964951
31543	NC_009900	CTT	2	6	1232813	1232818	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964951
31544	NC_009900	ATC	2	6	1232856	1232861	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964951
31545	NC_009900	CTA	2	6	1232933	1232938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964951
31546	NC_009900	TTA	2	6	1232996	1233001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964951
31547	NC_009900	GTC	2	6	1233154	1233159	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964951
31548	NC_009900	GAG	2	6	1233165	1233170	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31549	NC_009900	TA	3	6	1233245	1233250	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31550	NC_009900	GCA	2	6	1233260	1233265	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964952
31551	NC_009900	AAT	2	6	1233361	1233366	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964952
31552	NC_009900	CTAT	2	8	1233371	1233378	25 %	50 %	0 %	25 %	157964952
31553	NC_009900	ATA	2	6	1233384	1233389	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964952
31554	NC_009900	T	6	6	1233396	1233401	0 %	100 %	0 %	0 %	157964952
31555	NC_009900	TAT	2	6	1233513	1233518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964952
31556	NC_009900	CTA	2	6	1233525	1233530	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964952
31557	NC_009900	T	6	6	1233557	1233562	0 %	100 %	0 %	0 %	157964952
31558	NC_009900	CAATAA	2	12	1233565	1233576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	157964952
31559	NC_009900	A	6	6	1233575	1233580	100 %	0 %	0 %	0 %	157964952
31560	NC_009900	T	6	6	1233608	1233613	0 %	100 %	0 %	0 %	157964952
31561	NC_009900	CT	3	6	1233673	1233678	0 %	50 %	0 %	50 %	157964952
31562	NC_009900	TTC	2	6	1233721	1233726	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964952
31563	NC_009900	ATCTT	2	10	1233731	1233740	20 %	60 %	0 %	20 %	157964952
31564	NC_009900	TAT	2	6	1233744	1233749	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964952
31565	NC_009900	TTA	2	6	1233761	1233766	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964952
31566	NC_009900	AATTA	2	10	1233790	1233799	60 %	40 %	0 %	0 %	157964952
31567	NC_009900	TA	3	6	1233846	1233851	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31568	NC_009900	CAA	2	6	1233865	1233870	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31569	NC_009900	GAG	2	6	1233891	1233896	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31570	NC_009900	CAC	2	6	1233921	1233926	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31571	NC_009900	GAC	2	6	1233938	1233943	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31572	NC_009900	TA	3	6	1233973	1233978	50 %	50 %	0 %	0 %	157964953
31573	NC_009900	CAT	2	6	1234017	1234022	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964953
31574	NC_009900	TTAA	2	8	1234054	1234061	50 %	50 %	0 %	0 %	157964953
31575	NC_009900	T	6	6	1234084	1234089	0 %	100 %	0 %	0 %	157964953
31576	NC_009900	TTAA	2	8	1234180	1234187	50 %	50 %	0 %	0 %	157964953
31577	NC_009900	CTT	2	6	1234277	1234282	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	157964953
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31579	NC_009900	TTA	2	6	1234342	1234347	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964953
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31584	NC_009900	CTAACT	2	12	1234607	1234618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964953
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31586	NC_009900	TTAA	2	8	1234651	1234658	50 %	50 %	0 %	0 %	157964953
31587	NC_009900	TAA	2	6	1234670	1234675	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964953
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31589	NC_009900	CAG	2	6	1234733	1234738	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964953
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31591	NC_009900	TAT	2	6	1234787	1234792	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	157964953
31592	NC_009900	AAT	2	6	1234833	1234838	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	157964953
31593	NC_009900	TGC	2	6	1234855	1234860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964953
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31598	NC_009900	AGT	2	6	1235050	1235055	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	157964953
31599	NC_009900	TC	3	6	1235087	1235092	0 %	50 %	0 %	50 %	157964953
31600	NC_009900	TA	3	6	1235166	1235171	50 %	50 %	0 %	0 %	157964953
31601	NC_009900	CAG	2	6	1235183	1235188	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	157964953
31602	NC_009900	CCCA	2	8	1235235	1235242	25 %	0 %	0 %	75 %	157964953
31603	NC_009900	T	6	6	1235268	1235273	0 %	100 %	0 %	0 %	157964953
31604	NC_009900	TGC	2	6	1235283	1235288	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964953
31605	NC_009900	TGC	2	6	1235295	1235300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	157964953
31606	NC_009900	ACC	2	6	1235316	1235321	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	157964953
31607	NC_009900	CAT	2	6	1235336	1235341	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	157964953
31608	NC_009900	ATTTT	2	10	1235350	1235359	20 %	80 %	0 %	0 %	157964953
31609	NC_009900	GTTT	2	8	1235370	1235377	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
31610	NC_009900	GCA	2	6	1235422	1235427	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31611	NC_009900	TAC	2	6	1235516	1235521	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31612	NC_009900	CATC	2	8	1235529	1235536	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31613	NC_009900	AAT	2	6	1235565	1235570	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31614	NC_009900	TA	3	6	1235627	1235632	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
31615	NC_009900	TAA	2	6	1235642	1235647	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31616	NC_009900	CATTT	2	10	1235676	1235685	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
31617	NC_009900	TTA	2	6	1235726	1235731	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31618	NC_009900	CTT	2	6	1235764	1235769	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31619	NC_009900	ATA	2	6	1235804	1235809	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31621	NC_009900	TA	3	6	1236018	1236023	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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31990	NC_009900	TATT	2	8	1250226	1250233	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
31991	NC_009900	TGA	2	6	1250241	1250246	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31992	NC_009900	TAT	2	6	1250247	1250252	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31993	NC_009900	CCT	2	6	1250388	1250393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31994	NC_009900	GTG	2	6	1250397	1250402	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31995	NC_009900	CTACC	2	10	1250418	1250427	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31996	NC_009900	ATT	2	6	1250441	1250446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31997	NC_009900	GAA	2	6	1250473	1250478	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31998	NC_009900	TAC	2	6	1250498	1250503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31999	NC_009900	AGA	2	6	1250567	1250572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32000	NC_009900	TAA	2	6	1250579	1250584	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

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